HHsearch 1.5 NAME c8fbyB_ FAM FILE c8fbyB_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c8fbyB_.a3m DATE Sat Mar 25 10:39:24 2023 LENG 88 match states, 88 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.3 EVD 0.4347 -0.5954 SEQ >ss_dssp CCSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSCC >sa_dssp EEDDDEEDEDEDEEEDDEEEEECDEDEEEEEEDDEEEEECDEEEEEEDEDEDEEDEEEEEECDCEDEEDEEDDEEDDEEEEDEEEDEE >ss_pred CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >ss_conf 9248999999777699999996451367777656554433312788863235409999999998998999999879999999851387 >Consensus sxqcxxqxkxxnkscxallfxlxxkvktlexeiakekxicskdkesxlxxkrxxeeqlxxcxkxrexqxqexqxxxexlxkvqxlcxp >c8fbyB_ SRQCQEQLKEVNKTCEALLFKLGEKVKTLEMEVAKEKAVCSKDKESLLAGKRQTEEQLEACGKARERQQQEQQVTEENLRKVQSLCIP >UniRef50_Q9BX97(141-227:442) Plasmalemma vesicle-associated protein n=16 Tax=Eutheria RepID=PLVAP_HUMAN E=5e-23 s/c=1.24 id=59% cov=100% -KQCRDQFKDMNKSCDALLFMLNQKVKTLEVEIAKEKTICTKDKESVLLNKRVAEEQLVECVKTRELQHQERQLAKEQLQKVQALCLP # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * S 1 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 R 2 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 2 0 * * * * * * 1322 0 0 Q 3 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 3 0 * * * * * * 1322 0 0 C 4 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1322 0 0 Q 5 * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * 5 0 * * * * * * 1322 0 0 E 6 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1322 0 0 Q 7 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 7 0 * * * * * * 1322 0 0 L 8 * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1322 0 0 K 9 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1322 0 0 E 10 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1322 0 0 V 11 * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * 11 0 * * * * * * 1322 0 0 N 12 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1322 0 0 K 13 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1322 0 0 T 14 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 14 0 * * * * * * 1322 0 0 C 15 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1322 0 0 E 16 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1322 0 0 A 17 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1322 0 0 L 18 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1322 0 0 L 19 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1322 0 0 F 20 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1322 0 0 K 21 * * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1322 0 0 L 22 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1322 0 0 G 23 * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1322 0 0 E 24 * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 24 0 * * * * * * 1322 0 0 K 25 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1322 0 0 V 26 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 26 0 * * * * * * 1322 0 0 K 27 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1322 0 0 T 28 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 28 0 * * * * * * 1322 0 0 L 29 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1322 0 0 E 30 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1322 0 0 M 31 * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * 31 0 * * * * * * 1322 0 0 E 32 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1322 0 0 V 33 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 33 0 * * * * * * 1322 0 0 A 34 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1322 0 0 K 35 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1322 0 0 E 36 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1322 0 0 K 37 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1322 0 0 A 38 1000 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 38 0 * * * * * * 1322 0 0 V 39 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 39 0 * * * * * * 1322 0 0 C 40 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1322 0 0 S 41 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 41 0 * * * * * * 1322 0 0 K 42 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1322 0 0 D 43 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1322 0 0 K 44 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1322 0 0 E 45 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1322 0 0 S 46 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 46 0 * * * * * * 1322 0 0 L 47 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * 47 0 * * * * * * 1322 0 0 L 48 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1322 0 0 A 49 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1322 0 0 G 50 * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1322 0 0 K 51 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1322 0 0 R 52 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 52 0 * * * * * * 1322 0 0 Q 53 * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * 53 0 * * * * * * 1322 0 0 T 54 1000 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 54 0 * * * * * * 1322 0 0 E 55 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1322 0 0 E 56 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1322 0 0 Q 57 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 57 0 * * * * * * 1322 0 0 L 58 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1322 0 0 E 59 * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 59 0 * * * * * * 1322 0 0 A 60 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1322 0 0 C 61 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1322 0 0 G 62 * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 1000 * * 62 0 * * * * * * 1322 0 0 K 63 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1322 0 0 A 64 1000 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 64 0 * * * * * * 1322 0 0 R 65 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 65 0 * * * * * * 1322 0 0 E 66 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1322 0 0 R 67 * * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * 67 0 * * * * * * 1322 0 0 Q 68 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 68 0 * * * * * * 1322 0 0 Q 69 * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * * * * 69 0 * * * * * * 1322 0 0 Q 70 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 70 0 * * * * * * 1322 0 0 E 71 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1322 0 0 Q 72 * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * 72 0 * * * * * * 1322 0 0 Q 73 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 73 0 * * * * * * 1322 0 0 V 74 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * 74 0 * * * * * * 1322 0 0 T 75 1000 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 75 0 * * * * * * 1322 0 0 E 76 * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1322 0 0 E 77 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1322 0 0 N 78 * * * * * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * 78 0 * * * * * * 1322 0 0 L 79 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1322 0 0 R 80 * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * 80 0 * * * * * * 1322 0 0 K 81 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1322 0 0 V 82 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 82 0 * * * * * * 1322 0 0 Q 83 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 83 0 * * * * * * 1322 0 0 S 84 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 84 0 * * * * * * 1322 0 0 L 85 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1322 0 0 C 86 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1322 0 0 I 87 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1322 0 0 P 88 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 88 0 * * 0 * * * 1322 0 0 //