HHsearch 1.5 NAME c8b1tA_ FAM FILE c8b1tA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c8b1tA_.a3m DATE Sat Dec 31 10:50:48 2022 LENG 47 match states, 47 columns in multiple alignment FILT 1 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.4351 2.0056 SEQ >ss_dssp CCSSSSSCCCCSSHHHHHHHHHHTHHHHHHSCCCCHHHHHHHHHHHC >sa_dssp EBEECBCCCEDEDEEDCEDDDEEDDEDCEEDEECEEEDDDDBDEDDE >ss_pred CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCC >ss_conf 98888531467629999999862205776452345667876664059 >Consensus ygaddprrcsgnsvsevldkfrknydlimslpqetkeekefrhciwl >c8b1tA_ YGADDPRRCSGNSVSEVLDKFRKNYDLIMSLPQETKEEKEFRHCIWL # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * Y 1 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 1 0 * * * * * * 1000 0 0 G 2 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 A 3 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 D 4 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 D 5 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 P 6 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 R 7 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 R 8 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 C 9 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 S 10 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 G 11 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 N 12 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 S 13 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 V 14 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 S 15 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 E 16 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 V 17 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 L 18 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 D 19 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 K 20 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 F 21 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 R 22 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 K 23 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 N 24 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 25 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 25 0 * * * * * * 1000 0 0 D 26 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 L 27 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 I 28 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 M 29 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 S 30 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 L 31 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 P 32 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 33 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 E 34 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 T 35 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 K 36 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 E 37 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 E 38 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 K 39 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 E 40 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 F 41 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 R 42 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 H 43 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 C 44 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 I 45 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 W 46 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 L 47 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 47 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //