HHsearch 1.5 NAME c8ahlJ_ FAM FILE c8ahlJ_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c8ahlJ_.a3m DATE Sat Aug 19 09:18:41 2023 LENG 120 match states, 120 columns in multiple alignment FILT 3 out of 7 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.4 EVD 0.4748 -0.2439 SEQ >ss_dssp CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHC >sa_dssp EEEEECEEEDEDEEEECECDDEEEDDEDEDEDEDDEEDDDDDEDEEDEDDDEDDDEDEDDDEEDEEDDDDDDEDDEDDDDDDEEEDEDEEDDDEDDEEDD EEEDEDDEDDDDEDEDEEEE >ss_pred CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >ss_conf 9079999999853665787999998777999998878999999886578999999999999999998756555653112302588999999999999999 99878878997533775249 >Consensus vALdRAxeRvraLExEaexxRQRxAgxexARxaAvdRAexLtKaAxaxdKAixRAEeRxxklqakLxAxqxaqdxvrrdsaxHeAkxxxLxxxixxLxxE xaxAegaleaarrdrsrlqm >c8ahlJ_ VALERALDRIRALEEEADGLRQRHAGVDTARATAIERADQLAKSAVAQEKALKRAEERAQQLRARLDAMQEAQDQVRRDSATHEAKIAELQATIERLTSE AALAEGALEAARRDRSRLQM >UniRef50_B4W8D0(318-415:447) Vesicle transport v-SNARE protein n=1 Tax=Brevundimonas sp. BAL3 RepID=B4W8D0_9CAUL E=1e-09 s/c=0.65 id=49% cov=81% VALDRAVERVRALEAETEDARQRQAAMEVARVAAVDRAEALTKAAMAHDKAIARAEERMVKLQSKLAA---AQDE-------HEARVQTLSQQISALREd lESARAEG-------------- >UniRef50_D0XN12(320-415:449) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Brevundimonas subvibrioides ATCC 15264 RepID=D0XN12_9CAUL E=6e-07 s/c=0.58 id=40% cov=81% IALDRAMERVKGLETEAEDARQRLAGMEVARLAAVDRAETLTKAAATHDKAIARAEDRMLKIQAKLAAAQD----------DHHAKAQTLMQQAAALRAE LERARA-------------- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * V 1 * * * * * * * 1747 * * * * * * * * * 510 * * 1 0 * * * * * * 1541 0 0 A 2 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1541 0 0 L 3 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1541 0 0 E 4 * * 787 1249 * * * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1541 0 0 R 5 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 5 0 * * * * * * 1541 0 0 A 6 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1541 0 0 L 7 * * * * * * * * * 1249 1747 * * * * * * 1829 * * 7 0 * * * * * * 1541 0 0 D 8 * * 1249 787 * * * * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1541 0 0 R 9 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 9 0 * * * * * * 1541 0 0 I 10 * * * * * * * 1249 * * * * * * * * * 787 * * 10 0 * * * * * * 1541 0 0 R 11 * * * * * * * * 1747 * * * * * 510 * * * * * 11 0 * * * * * * 1541 0 0 A 12 510 * * * * 1747 * * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1541 0 0 L 13 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1541 0 0 E 14 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1541 0 0 E 15 1829 * * 1249 * * * * * * * * * * * * 1747 * * * 15 0 * * * * * * 1541 0 0 E 16 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1541 0 0 A 17 477 * * * * * * * * * * * * * * * 1829 * * * 17 0 * * * * * * 1541 0 0 D 18 * * 1249 787 * * * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1541 0 0 G 19 * * 787 * * 1249 * * * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1541 0 0 L 20 787 * * * * * * * * 1249 * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1541 0 0 R 21 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 21 0 * * * * * * 1541 0 0 Q 22 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 22 0 * * * * * * 1541 0 0 R 23 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 23 0 * * * * * * 1541 0 0 H 24 * * * * * * 1249 * * 1747 * * * 1829 * * * * * * 24 0 * * * * * * 1541 0 0 A 25 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1541 0 0 G 26 1829 * * * * 477 * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1541 0 0 V 27 * * * * * * * * * * 787 * * * * * * 1249 * * 27 0 * * * * * * 1541 0 0 D 28 * * 1249 787 * * * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1541 0 0 T 29 * * * * * * * * * * * * * * * * 1249 787 * * 29 0 * * * * * * 1541 0 0 A 30 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1541 0 0 R 31 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 31 0 * * * * * * 1541 0 0 A 32 1249 * * * * * * * * 1747 * * * * * * * 1829 * * 32 0 * * * * * * 1541 0 0 T 33 787 * * * * * * * * * * * * * * * 1249 * * * 33 0 * * * * * * 1541 0 0 A 34 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1541 0 0 I 35 * * * * * * * 1249 * * * * * * * * * 787 * * 35 0 * * * * * * 1541 0 0 E 36 * * 787 1249 * * * * * * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1541 0 0 R 37 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 37 0 * * * * * * 1541 0 0 A 38 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1541 0 0 D 39 * * 1249 787 * * * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1541 0 0 Q 40 1829 * * * * * * * * * * * * 1249 * * 1747 * * * 40 0 * * * * * * 1541 0 0 L 41 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1541 0 0 A 42 1249 * * * * * * * * * * * * * * * 787 * * * 42 0 * * * * * * 1541 0 0 K 43 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1541 0 0 S 44 787 * * * * * * * * * * * * * * 1249 * * * * 44 0 * * * * * * 1541 0 0 A 45 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1541 0 0 V 46 1747 * * * * * * * * * 1829 * * * * * * 1249 * * 46 0 * * * * * * 1541 0 0 A 47 510 * * * * * * * * * * * * * * * 1747 * * * 47 0 * * * * * * 1541 0 0 Q 48 * * * * * * 787 * * * * * * 1249 * * * * * * 48 0 * * * * * * 1541 0 0 E 49 * * 787 1249 * * * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1541 0 0 K 50 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1541 0 0 A 51 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1541 0 0 L 52 * * * * * * * 787 * 1249 * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1541 0 0 K 53 787 * * * * * * * 1249 * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1541 0 0 R 54 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 54 0 * * * * * * 1541 0 0 A 55 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1541 0 0 E 56 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1541 0 0 E 57 * * 1747 510 * * * * * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1541 0 0 R 58 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 58 0 * * * * * * 1541 0 0 A 59 1249 * * * * * * * * * 787 * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1541 0 0 Q 60 * * * * * * * * * 1747 * * * 1249 * * * 1829 * * 60 0 * * * * * * 1541 0 0 Q 61 * * * * * * * * 787 * * * * 1249 * * * * * * 61 0 * * * * * * 1541 0 0 L 62 * * * * * * * 1747 * 510 * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1541 0 0 R 63 * * * * * * * * * * * * * 787 1249 * * * * * 63 0 * * * * * * 1541 0 0 A 64 477 * * * * * * * * * * * * * * 1829 * * * * 64 0 * * * * * * 1541 0 0 R 65 * * * * * * * * 787 * * * * * 1249 * * * * * 65 0 * * * * * * 1541 0 0 L 66 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1541 0 0 D 67 787 * 1249 * * * * * * * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1541 0 0 A 68 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 68 477 * 1829 * * * * 1541 0 0 M 69 1143 * * * * * * * * * 870 * * * * * * * * * 69 0 * * * * * 0 1448 0 1000 Q 70 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 70 0 * * * * * 0 1448 0 1000 E 71 * * 1143 870 * * * * * * * * * * * * * * * * 71 870 * 1143 * * 0 * 1448 0 1000 A 72 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * 0 1366 0 1000 Q 73 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 73 0 * * * * * 0 1366 0 1000 D 74 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * 0 1366 0 1000 Q 75 * * * 1143 * * * * * * * * * 870 * * * * * * 75 870 * 1143 * * * 0 1366 0 1000 V 76 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 76 0 * * * * * 0 1000 0 1206 R 77 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 77 0 * * * * * 0 1000 0 1206 R 78 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 78 0 * * * * * 0 1000 0 1206 D 79 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * 0 1000 0 1206 S 80 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 80 0 * * * * * 0 1000 0 1206 A 81 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * 1000 1000 1000 0 1206 T 82 * * 1143 * * * * * * * * * * * * * 870 * * * 82 0 * * * * 0 * 1448 0 1000 H 83 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1541 0 0 E 84 * * * 510 * * 1747 * * * * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1541 0 0 A 85 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1541 0 0 K 86 * * * * * * * * 477 * * * * * 1829 * * * * * 86 0 * * * * * * 1541 0 0 I 87 1747 * * * * * * 1249 * * * * * * * * * 1829 * * 87 0 * * * * * * 1541 0 0 A 88 1249 * * * * * * * * * * * * 787 * * * * * * 88 0 * * * * * * 1541 0 0 E 89 * * * 1249 * * * * * * * * * * * * 787 * * * 89 0 * * * * * * 1541 0 0 L 90 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1541 0 0 Q 91 * * * * * * * * * * 1747 * * 1249 * 1829 * * * * 91 0 * * * * * * 1541 0 0 A 92 1249 * * * * * * * * * * * * 787 * * * * * * 92 0 * * * * * * 1541 0 0 T 93 * * * * * * * * * * * * * 787 * * 1249 * * * 93 0 * * * * * * 1541 0 0 I 94 1747 * * * * * * 510 * * * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1541 0 0 E 95 1747 * * 1249 * * * * * * * * * * * 1829 * * * * 95 0 * * * * * * 1541 0 0 R 96 787 * * * * * * * * * * * * * 1249 * * * * * 96 0 * * * * * * 1541 0 0 L 97 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1541 0 0 T 98 * * * * * * * * * * * * * * 787 * 1249 * * * 98 0 * * * * * * 1541 0 0 S 99 1747 * * 1829 * * * * * * * * * * * 1249 * * * * 99 477 1829 * 1000 1000 * * 1541 1000 0 E 100 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1541 0 0 A 101 1249 * * * * * * * * 1747 * * * * * 1829 * * * * 101 0 * * * * * * 1541 0 0 A 102 510 * * 1747 * * * * * * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1541 0 0 L 103 * * * * * * * * * 1249 * * * * 787 * * * * * 103 0 * * * * * * 1541 0 0 A 104 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1541 0 0 E 105 * * * 510 * * * * * * * * * * 1747 * * * * * 105 0 * * * * * * 1541 0 0 G 106 1747 * * * * 510 * * * * * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1541 0 0 A 107 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1000 0 0 L 108 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1000 0 0 E 109 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1000 0 0 A 110 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1000 0 0 A 111 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1000 0 0 R 112 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 112 0 * * * * * * 1000 0 0 R 113 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 113 0 * * * * * * 1000 0 0 D 114 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1000 0 0 R 115 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 115 0 * * * * * * 1000 0 0 S 116 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 116 0 * * * * * * 1000 0 0 R 117 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 117 0 * * * * * * 1000 0 0 L 118 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 119 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 119 0 * * * * * * 1000 0 0 M 120 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 120 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //