HHsearch 1.5 NAME c7yn3C_ FAM FILE c7yn3C_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c7yn3C_.a3m DATE Sat Aug 5 08:25:19 2023 LENG 76 match states, 76 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.3 EVD 0.4814 2.4711 SEQ >ss_dssp CHHHHHHHHHGGGSSCTTSCCCTTCCSSTTSSSCHHHHHHHHHHHHHHTCCCCGGGCCHHHHSSHHHHHHHHHHHC >sa_dssp ECDECABECADECBEDEECEBDDECDABDDECBEEEBCDEACCCADEDCBEBDEEBCDEECBBCACBABEAAEDCE >ss_pred CHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCC >ss_conf 9389999999864457754346046887665467775999999997401668888987632775588998876409 >Consensus sxlxxvlxllrxxxpsxdteltxdtxlfssxlldslaleexxxaiexrwxpxppxelxxanfxtpaaiaxtiarxs >c7yn3C_ SLLVDVLELLRPLLPSADTELTPDTELFSSQLLDSLALEEIQAAIESRWVPLPPEELTLANFNTPAAIAETIARTS >UniRef50_Q54367(2-78:275) Lincomycin biosynthesis protein lmbN n=2 Tax=Streptomyces lincolnensis RepID=LMBN_STRLN E=1e-25 s/c=1.52 id=66% cov=101% STLDEVLALLRTIAPSGDeTELTADTLLFSSGLLDSLALEELHVAIEERWAPIPPMELARANFDTPAAIAATVARIT # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * S 1 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 1 0 * * * * * * 1256 0 0 L 2 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * 2 0 * * * * * * 1256 0 0 L 3 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1256 0 0 V 4 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 4 0 * * * * * * 1256 0 0 D 5 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1256 0 0 V 6 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 6 0 * * * * * * 1256 0 0 L 7 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1256 0 0 E 8 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1256 0 0 L 9 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1256 0 0 L 10 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1256 0 0 R 11 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 11 0 * * * * * * 1256 0 0 P 12 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * 12 0 * * * * * * 1256 0 0 L 13 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1256 0 0 L 14 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1256 0 0 P 15 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1256 0 0 S 16 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 16 0 * * * * * * 1256 0 0 A 17 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1256 0 0 D 18 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 18 1000 1000 * 0 * * * 1256 1000 0 T 19 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 19 0 * * * * * * 1256 0 0 E 20 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1256 0 0 L 21 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1256 0 0 T 22 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 22 0 * * * * * * 1256 0 0 P 23 1000 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1256 0 0 D 24 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1256 0 0 T 25 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 25 0 * * * * * * 1256 0 0 E 26 * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1256 0 0 L 27 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1256 0 0 F 28 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1256 0 0 S 29 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 29 0 * * * * * * 1256 0 0 S 30 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 30 0 * * * * * * 1256 0 0 Q 31 * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * * * * 31 0 * * * * * * 1256 0 0 L 32 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1256 0 0 L 33 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1256 0 0 D 34 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1256 0 0 S 35 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 35 0 * * * * * * 1256 0 0 L 36 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1256 0 0 A 37 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1256 0 0 L 38 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1256 0 0 E 39 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1256 0 0 E 40 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1256 0 0 I 41 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1256 0 0 Q 42 * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * * * * 42 0 * * * * * * 1256 0 0 A 43 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 43 0 * * * * * * 1256 0 0 A 44 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1256 0 0 I 45 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1256 0 0 E 46 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1256 0 0 S 47 * * * 1000 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 47 0 * * * * * * 1256 0 0 R 48 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 48 0 * * * * * * 1256 0 0 W 49 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 49 0 * * * * * * 1256 0 0 V 50 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 50 0 * * * * * * 1256 0 0 P 51 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1256 0 0 L 52 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1256 0 0 P 53 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1256 0 0 P 54 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1256 0 0 E 55 * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1256 0 0 E 56 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1256 0 0 L 57 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1256 0 0 T 58 1000 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 58 0 * * * * * * 1256 0 0 L 59 * * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * 59 0 * * * * * * 1256 0 0 A 60 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1256 0 0 N 61 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1256 0 0 F 62 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1256 0 0 N 63 * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1256 0 0 T 64 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 64 0 * * * * * * 1256 0 0 P 65 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1256 0 0 A 66 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1256 0 0 A 67 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1256 0 0 I 68 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1256 0 0 A 69 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1256 0 0 E 70 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1256 0 0 T 71 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 71 0 * * * * * * 1256 0 0 I 72 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 72 0 * * * * * * 1256 0 0 A 73 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1256 0 0 R 74 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 74 0 * * * * * * 1256 0 0 T 75 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * 75 0 * * * * * * 1256 0 0 S 76 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 76 0 * * 0 * * * 1256 0 0 //