HHsearch 1.5 NAME c7xivB_ FAM FILE c7xivB_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c7xivB_.a3m DATE Sat Jul 2 08:22:27 2022 LENG 125 match states, 125 columns in multiple alignment FILT 4 out of 8 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.8 EVD 0.4633 1.6112 SEQ >ss_dssp CCCHHHHHHHHHHHHTSCCTTCCHHHHHHHHHHHHHHHHHSCGGGHHHHHHHHHHHHTCCHHHHHHHHHHHHHHHHCSTTHHHHHHHHHSCHHHHHHHHH HHHHHHTTSCSCCCHHHHHHHHTTC >sa_dssp EEDEEDBDEDAEDCBEDEBEECDDEDACEBADCBACBBCDBDDEBADCABECBBEDCEDDEEDCEDBCDBADDACEBEECECBDDBCEEDEEDDBCEBAB AAADABCEBEEDEDEEDDEEEEEEE >ss_pred CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHH HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHC >ss_conf 9229999999999967237431089899999999999865438999999985420312541023359999986530358731478861235116999999 9999971287631689999888739 >Consensus xlTLxxLxxxaxxwxxxxixxiddxxLRAlLtLxavxxRKxskSqlsxlcExHxrrExLxQDQxxxvlevYqxlHsDKGGxFEAALWQxWDrxSlxlFix AxLxixxxiPCESSxxVxaxxxxlx >c7xivB_ SLTLNRLCEIAQAWASMTWEDIDDKQLRALLTLSAVLVRKHSKSQLSALCENHVRREALAQDQASIVLEVYQKLHSDKGGKFEAALWQHWDRGSLTLFIH AALRAGTTIPCESSAIVVASIMSLL >UniRef50_B8XCP2(142-265:289) VP30 n=2 Tax=Ebola-like viruses RepID=B8XCP2_9MONO E=2e-36 s/c=1.23 id=58% cov=100% -VTLSMLIETAEYWSKQDIKNIDDSRLRALLTLCAVMTRKFSKSQLSLLCESHLRREGLGQDQSESVLEVYQRLHSDKGGNFEAALWQQWDRQSLIMFIT AFLNIALQLPCESSSVVISGLRMLI >UniRef50_Q1PD56(149-267:281) Minor nucleoprotein VP30 n=15 Tax=Lake Victoria marburgvirus RepID=VP30_MABVA E=1e-20 s/c=0.84 id=42% cov=96% -LTLENLGHILSYLHRSEIGKLDETSLRAALSLTCAGIRKTNRSLINTMTELHINHENLPQDQNGVIKQTYTGIHLDKGGQFEAALWQGWDKRSISLFVQ AALYVMNNIPCESSISVQAS----- >UniRef50_Q77DJ5(142-265:288) Minor nucleoprotein VP30 n=10 Tax=Ebola-like viruses RepID=VP30_EBOZ5 E=7e-52 s/c=1.65 id=60% cov=100% -ITLLTLIKTAEHWARQDIRTIEDSKLRALLTLCAVMTRKFSKSQLSLLCETHLRREGLGQDQAEPVLEVYQRLHSDKGGSFEAALWQQWDRQSLIMFIT AFLNIALQLPCESSAVVVSGLRTLV # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * S 1 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 L 2 * * * * * * * 2227 * 807 * * * * * * * 2218 * * 2 0 * * * * * * 1775 0 0 T 3 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 3 0 * * * * * * 1775 0 0 L 4 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1775 0 0 N 5 * * * 1625 * * * * * 2227 * 2016 * * * 2218 * * * * 5 0 * * * * * * 1775 0 0 R 6 * * * * * * * * * * 2218 1625 * * 2016 * 2227 * * * 6 0 * * * * * * 1775 0 0 L 7 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1775 0 0 C 8 * 2016 * * * 1625 * 1222 * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1775 0 0 E 9 * * * 1113 * * 1625 * 2227 * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1775 0 0 I 10 * * * * * * * 807 * * * * * * * * 1222 * * * 10 0 * * * * * * 1775 0 0 A 11 565 * * * * * * * * 1625 * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1775 0 0 Q 12 * * * 1222 * * * * * * * * * 2016 * 1625 * * * * 12 0 * * * * * * 1775 0 0 A 13 2016 * * * * * 2227 * * * * * * * * * * * * 891 13 0 * * * * * * 1775 0 0 W 14 * * * * * * * * * 1625 * * * * * * * * 565 * 14 0 * * * * * * 1775 0 0 A 15 1118 * * * * * 1625 * * * * * * * * 2218 * * * * 15 0 * * * * * * 1775 0 0 S 16 * * * * * * * * 2218 * * * * * 895 2016 * * * * 16 0 * * * * * * 1775 0 0 M 17 * * * * * * * * * * 2016 * * 1222 * 1625 * * * * 17 0 * * * * * * 1775 0 0 T 18 * * 1222 1625 * * * * * * * * * * * * 2016 * * * 18 0 * * * * * * 1775 0 0 W 19 * * * * * * * 410 * * * * * * * * * * 2016 * 19 0 * * * * * * 1775 0 0 E 20 * * * 2016 * 1625 * * 2218 * * * * * 2227 * * * * * 20 0 * * * * * * 1775 0 0 D 21 * * 2016 * * * * * 1625 * * 2218 * * * * 2227 * * * 21 0 * * * * * * 1775 0 0 I 22 * * * * * * * 565 * 1625 * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1775 0 0 D 23 * * 347 2227 * * * * * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1775 0 0 D 24 * * 565 1625 * * * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1775 0 0 K 25 * * * * * * * * 2016 * * * * * * 1222 1625 * * * 25 0 * * * * * * 1775 0 0 Q 26 * * * * * * * * 2227 * * * * 2016 2218 1625 * * * * 26 0 * * * * * * 1775 0 0 L 27 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1775 0 0 R 28 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 28 0 * * * * * * 1775 0 0 A 29 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1775 0 0 L 30 1625 * * * * * * * * 565 * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1775 0 0 L 31 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1775 0 0 T 32 * * * * * * * * * * * * * * * 1625 565 * * * 32 0 * * * * * * 1775 0 0 L 33 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1775 0 0 S 34 * 1222 * * * * * * * * * * * * * 2016 1625 * * * 34 0 * * * * * * 1775 0 0 A 35 565 1625 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1775 0 0 V 36 1625 * * * * * * * * * * * * * * * * 565 * * 36 0 * * * * * * 1775 0 0 L 37 * * * * * 1625 * * * 2016 1222 * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1775 0 0 V 38 * * * * * * * 1625 * * * * * * * * 1222 2016 * * 38 0 * * * * * * 1775 0 0 R 39 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 39 0 * * * * * * 1775 0 0 K 40 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1775 0 0 H 41 * * * * 1222 * 2016 * * * * * * * * * 1625 * * * 41 0 * * * * * * 1775 0 0 S 42 * * * * * * * * * * * 1625 * * * 565 * * * * 42 0 * * * * * * 1775 0 0 K 43 * * * * * * * * 565 * * * * * 1625 * * * * * 43 0 * * * * * * 1775 0 0 S 44 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 44 0 * * * * * * 1775 0 0 Q 45 * * * * * * * * * 1625 * * * 565 * * * * * * 45 0 * * * * * * 1775 0 0 L 46 * * * * * * * 1625 * 565 * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1775 0 0 S 47 * * * * * * * * * * * 1625 * * * 565 * * * * 47 0 * * * * * * 1775 0 0 A 48 2016 * * * * * * * * 1222 * * * * * * 1625 * * * 48 0 * * * * * * 1775 0 0 L 49 * * * * * * * * * 565 1625 * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1775 0 0 C 50 * 565 * * * * * * * * * * * * * * 1625 * * * 50 0 * * * * * * 1775 0 0 E 51 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1775 0 0 N 52 * * * * * * * * * 1625 * 2016 * * * 2218 2227 * * * 52 0 * * * * * * 1775 0 0 H 53 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1775 0 0 V 54 * * * * * * * 1625 * 1222 * * * * * * * 2016 * * 54 0 * * * * * * 1775 0 0 R 55 * * * * * * * * * * * 1625 * * 565 * * * * * 55 0 * * * * * * 1775 0 0 R 56 * * * * * * 1625 * * * * * * * 565 * * * * * 56 0 * * * * * * 1775 0 0 E 57 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1775 0 0 A 58 2016 * * * * 1222 * * * * * 1625 * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1775 0 0 L 59 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1775 0 0 A 60 2016 * * * * 1222 * * * * * * 1625 * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1775 0 0 Q 61 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 61 0 * * * * * * 1775 0 0 D 62 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1775 0 0 Q 63 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 63 0 * * * * * * 1775 0 0 A 64 1118 * * * * * * * * * * 1625 * * * 2218 * * * * 64 0 * * * * * * 1775 0 0 S 65 * * * 1222 * 1625 * * * * * * * * * 2016 * * * * 65 0 * * * * * * 1775 0 0 I 66 * * * * * * * 2016 * * * * 2227 * * 2218 * 1625 * * 66 0 * * * * * * 1775 0 0 V 67 * * * * * * * 1625 * * * * * * * * * 565 * * 67 0 * * * * * * 1775 0 0 L 68 * * * * * * * * 1625 565 * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1775 0 0 E 69 * * * 565 * * * * * * * * * 1625 * * * * * * 69 0 * * * * * * 1775 0 0 V 70 * * * * * * * * * * * * * * * * 1625 565 * * 70 0 * * * * * * 1775 0 0 Y 71 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 71 0 * * * * * * 1775 0 0 Q 72 * * * * * * * * * * * * * 565 * * 1625 * * * 72 0 * * * * * * 1775 0 0 K 73 * * * * * 1625 * * 2016 * * * * * 1222 * * * * * 73 0 * * * * * * 1775 0 0 L 74 * * * * * * * 1625 * 565 * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1775 0 0 H 75 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1775 0 0 S 76 * * * * * * * * * 1625 * * * * * 565 * * * * 76 0 * * * * * * 1775 0 0 D 77 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1775 0 0 K 78 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1775 0 0 G 79 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1775 0 0 G 80 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1775 0 0 K 81 * * * * * * * * 2016 * * 2218 * 1625 * 2227 * * * * 81 0 * * * * * * 1775 0 0 F 82 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1775 0 0 E 83 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1775 0 0 A 84 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1775 0 0 A 85 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1775 0 0 L 86 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1775 0 0 W 87 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 87 0 * * * * * * 1775 0 0 Q 88 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 88 0 * * * * * * 1775 0 0 H 89 * * * * * 1625 2016 * * * * * * 1222 * * * * * * 89 0 * * * * * * 1775 0 0 W 90 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 90 0 * * * * * * 1775 0 0 D 91 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1775 0 0 R 92 * * * * * * * * 1625 * * * * * 565 * * * * * 92 0 * * * * * * 1775 0 0 G 93 * * * * * 2016 * * * * * * * 1222 1625 * * * * * 93 0 * * * * * * 1775 0 0 S 94 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 94 0 * * * * * * 1775 0 0 L 95 * * * * * * * 1625 * 565 * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1775 0 0 T 96 * * * * * * * 1222 * * * * * * * 1625 2016 * * * 96 0 * * * * * * 1775 0 0 L 97 * * * * * * * * * 807 1222 * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1775 0 0 F 98 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1775 0 0 I 99 * * * * * * * 565 * * * * * * * * * 1625 * * 99 0 * * * * * * 1775 0 0 H 100 * * * * * * 2016 * * * * * * 1625 * * 1222 * * * 100 0 * * * * * * 1775 0 0 A 101 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1775 0 0 A 102 807 * * * 1222 * * * * * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1775 0 0 L 103 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1775 0 0 R 104 * * * * * * * * * * * 1222 * * 2016 * * * * 1625 104 0 * * * * * * 1775 0 0 A 105 2016 * * * * * * 1222 * * * * * * * * * 1625 * * 105 0 * * * * * * 1775 0 0 G 106 1222 * * * * 2016 * * * * 1625 * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1775 0 0 T 107 * * * * * * * * * 1222 * 1625 * * * * 2016 * * * 107 0 * * * * * * 1775 0 0 T 108 * * * * * * * * * * * 1625 * 1222 * * 2016 * * * 108 0 * * * * * * 1775 0 0 I 109 * * * * * * * 807 * 1222 * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1775 0 0 P 110 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1775 0 0 C 111 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1775 0 0 E 112 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1775 0 0 S 113 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 113 0 * * * * * * 1775 0 0 S 114 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 114 0 * * * * * * 1775 0 0 A 115 1118 * * * * * * 1625 * * * * * * * 2218 * * * * 115 0 * * * * * * 1775 0 0 I 116 * * * * * * * 2016 * * * * * * * 1625 * 1222 * * 116 0 * * * * * * 1775 0 0 V 117 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 117 0 * * * * * * 1775 0 0 V 118 * * * * * * * 2218 * * * * * 1625 * * * 1118 * * 118 0 * * * * * * 1775 0 0 A 119 807 * * * * * * * * * * * * * * 1222 * * * * 119 0 * * * * * * 1775 0 0 S 120 * * * * * 1222 * * * * * * * * * 807 * * * * 120 0 * * * * * * 1775 0 0 I 121 * * * * * * * 1415 * 678 * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1386 0 0 M 122 * * * * * * * * * * 1415 * * * 678 * * * * * 122 0 * * * * * * 1386 0 0 S 123 * * * * * * * * * * 1669 * * * * 1415 1687 * * * 123 0 * * * * * * 1386 0 0 L 124 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1386 0 0 L 125 * * * * * * * 1669 * 1415 * * * * * * * 1687 * * 125 0 * * 0 * * * 1386 0 0 //