HHsearch 1.5 NAME c7wr1D_ FAM FILE c7wr1D_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c7wr1D_.a3m DATE Sat Jan 28 08:51:41 2023 LENG 139 match states, 139 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.5 EVD 0.4049 -0.7743 SEQ >ss_dssp CCHHHHHHTTCHHHHHHHCCSHHHHHHHHHHHHHTTCHHHHHHHHHHSCCCHHHHHHHHTCTTSHHHHHSCHHHHHHSCGGGHHHHHHHHHTTCSCTTCC CSSTTTTCCHHHHHHHHTCHHHHHHHHHTTCCCCCTTCC >sa_dssp EDBBDAADEDDDECADECBEDDECABBAAACAABCDDCEAACCABEECEBDEEBBDDACEBEEADBADDCAABCAAACDCDABEAACCABEEDBBEBCCD AECCCDCBAABCBADEDECEEACDBAEEDDBDDBECEEE >ss_pred CCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCC >ss_conf 9788966432968762012101358999999751544689999875055260133204711126543077889997314870157889972004753123 654133335778775208078999998412011110149 >Consensus isLxdAixaxNxxxixxxVtxKxxAxxAlxxslxxxKxxiAxxLLxxxxFxxxDxAxxxxmknnryxxxxdxxYxLSxxGAxxxvLexFixxGxxxVNxx FqxVNSGdTMLDNAxKxxxxxMxxxLlKxGAilgkrfei >c7wr1D_ ISLEDAIKASNYEEINNKVTDKKMAHQALAYSLGNKKADIALYLLSKFNFTKQDVAEMEKMKNNRYCNLYDVEYLLSKDGANYKVLEYFINNGLVDVNKK FQKVNSGDTMLDNAMKSKDSKMIDFLLKNGAILGKRFEI >UniRef50_Q7NWF2(347-469:487) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Chromobacterium violaceum RepID=Q7NWF2_CHRVO E=1e-10 s/c=0.55 id=33% cov=89% --LKEAVDSVNLPALSGLVSSKGDAVTAMWHAIDKGKDAVAAHLLGNWRFEAGDFASAPP------GFYHELNYALSEHGASVYILDQFLSRGWAAVNAP FEHVNSGETMLDNAVKYGNREMAAALIKHGA-------- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * I 1 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 S 2 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 L 3 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1553 0 0 E 4 * * * 934 * * * * 1069 * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1553 0 0 D 5 * * 934 1069 * * * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1553 0 0 A 6 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1553 0 0 I 7 * * * * * * * 934 * * * * * * * * * 1069 * * 7 0 * * * * * * 1553 0 0 K 8 * * 1069 * * * * * 934 * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1553 0 0 A 9 934 * * * * * * * * * * * * * * 1069 * * * * 9 0 * * * * * * 1553 0 0 S 10 * * * * * * * * * * * * * * * 934 * 1069 * * 10 0 * * * * * * 1553 0 0 N 11 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1553 0 0 Y 12 * * * * * * * * * 1069 * * * * * * * * * 934 12 0 * * * * * * 1553 0 0 E 13 * * * 934 * * * * * * * * 1069 * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1553 0 0 E 14 1069 * * 934 * * * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1553 0 0 I 15 * * * * * * * 934 * 1069 * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1553 0 0 N 16 * * * * * * * * * * * 934 * * * 1069 * * * * 16 0 * * * * * * 1553 0 0 N 17 * * * * * 1069 * * * * * 934 * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1553 0 0 K 18 * * * * * * * * 934 1069 * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1553 0 0 V 19 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 19 0 * * * * * * 1553 0 0 T 20 * * * * * * * * * * * * * * * 1069 934 * * * 20 0 * * * * * * 1553 0 0 D 21 * * 934 * * * * * * * * * * * * 1069 * * * * 21 0 * * * * * * 1553 0 0 K 22 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1553 0 0 K 23 * * * * * 1069 * * 934 * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1553 0 0 M 24 * * 1069 * * * * * * * 934 * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1553 0 0 A 25 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1553 0 0 H 26 * * * * * * 934 * * * * * * * * * * 1069 * * 26 0 * * * * * * 1553 0 0 Q 27 * * * * * * * * * * * * * 934 * * 1069 * * * 27 0 * * * * * * 1553 0 0 A 28 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1553 0 0 L 29 * * * * * * * * * 934 1069 * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1553 0 0 A 30 934 * * * * * * * * * * * * * * * * * 1069 * 30 0 * * * * * * 1553 0 0 Y 31 * * * * * * 1069 * * * * * * * * * * * * 934 31 0 * * * * * * 1553 0 0 S 32 1069 * * * * * * * * * * * * * * 934 * * * * 32 0 * * * * * * 1553 0 0 L 33 * * * * * * * 1069 * 934 * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1553 0 0 G 34 * * 1069 * * 934 * * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1553 0 0 N 35 * * * * * * * * 1069 * * 934 * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1553 0 0 K 36 * * * * * 1069 * * 934 * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1553 0 0 K 37 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1553 0 0 A 38 934 * 1069 * * * * * * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1553 0 0 D 39 1069 * 934 * * * * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1553 0 0 I 40 * * * * * * * 934 * * * * * * * * * 1069 * * 40 0 * * * * * * 1553 0 0 A 41 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1553 0 0 L 42 1069 * * * * * * * * 934 * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1553 0 0 Y 43 * * * * * * 1069 * * * * * * * * * * * * 934 43 0 * * * * * * 1553 0 0 L 44 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1553 0 0 L 45 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1553 0 0 S 46 * * * * * 1069 * * * * * * * * * 934 * * * * 46 0 * * * * * * 1553 0 0 K 47 * * * * * * * * 934 * * 1069 * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1553 0 0 F 48 * * * * 934 * * * * * * * * * * * * * 1069 * 48 0 * * * * * * 1553 0 0 N 49 * * * * * * * * * * * 934 * * 1069 * * * * * 49 0 * * * * * * 1553 0 0 F 50 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1553 0 0 T 51 * * * 1069 * * * * * * * * * * * * 934 * * * 51 0 * * * * * * 1553 0 0 K 52 1069 * * * * * * * 934 * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1553 0 0 Q 53 * * * * * 1069 * * * * * * * 934 * * * * * * 53 0 * * * * * * 1553 0 0 D 54 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1553 0 0 V 55 * * * * 1069 * * * * * * * * * * * * 934 * * 55 0 * * * * * * 1553 0 0 A 56 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1553 0 0 E 57 * * * 934 * * * * * * * * * * * 1069 * * * * 57 0 * * * * * * 1553 0 0 M 58 1069 * * * * * * * * * 934 * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1553 0 0 E 59 * * * 934 * * * * * * * * 1069 * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1553 0 0 K 60 * * * * * * * * 934 * * * 1069 * * * * * * * 60 934 * 1069 * * * * 1553 0 0 M 61 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 61 0 * * * * * 0 1000 0 1000 K 62 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * 0 1000 0 1000 N 63 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 63 0 * * * * * 0 1000 0 1000 N 64 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 64 0 * * * * * 0 1000 0 1000 R 65 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 65 0 * * * * * 0 1000 0 1000 Y 66 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 66 0 * * * * 0 * 1000 0 1000 C 67 * 934 * * * 1069 * * * * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1553 0 0 N 68 * * * * 1069 * * * * * * 934 * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1553 0 0 L 69 * * * * * * * * * 934 * * * * * * * * * 1069 69 0 * * * * * * 1553 0 0 Y 70 * * * * * * 1069 * * * * * * * * * * * * 934 70 0 * * * * * * 1553 0 0 D 71 * * 934 1069 * * * * * * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1553 0 0 V 72 * * * * * * * * * 1069 * * * * * * * 934 * * 72 0 * * * * * * 1553 0 0 E 73 * * * 934 * * * * * * * 1069 * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1553 0 0 Y 74 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 74 0 * * * * * * 1553 0 0 L 75 1069 * * * * * * * * 934 * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1553 0 0 L 76 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1553 0 0 S 77 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 77 0 * * * * * * 1553 0 0 K 78 * * * 1069 * * * * 934 * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1553 0 0 D 79 * * 934 * * * 1069 * * * * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1553 0 0 G 80 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1553 0 0 A 81 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1553 0 0 N 82 * * * * * * * * * * * 934 * * * 1069 * * * * 82 0 * * * * * * 1553 0 0 Y 83 * * * * * * * * * * * * * * * * * 1069 * 934 83 0 * * * * * * 1553 0 0 K 84 * * * * * * * * 934 * * * * * * * * * * 1069 84 0 * * * * * * 1553 0 0 V 85 * * * * * * * 1069 * * * * * * * * * 934 * * 85 0 * * * * * * 1553 0 0 L 86 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1553 0 0 E 87 * * 1069 934 * * * * * * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1553 0 0 Y 88 * * * * * * * * * * * * * 1069 * * * * * 934 88 0 * * * * * * 1553 0 0 F 89 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1553 0 0 I 90 * * * * * * * 934 * 1069 * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1553 0 0 N 91 * * * * * * * * * * * 934 * * * 1069 * * * * 91 0 * * * * * * 1553 0 0 N 92 * * * * * * * * * * * 934 * * 1069 * * * * * 92 0 * * * * * * 1553 0 0 G 93 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1553 0 0 L 94 * * * * * * * * * 934 * * * * * * * * 1069 * 94 0 * * * * * * 1553 0 0 V 95 1069 * * * * * * * * * * * * * * * * 934 * * 95 0 * * * * * * 1553 0 0 D 96 1069 * 934 * * * * * * * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1553 0 0 V 97 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 97 0 * * * * * * 1553 0 0 N 98 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1553 0 0 K 99 1069 * * * * * * * 934 * * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1553 0 0 K 100 * * * * * * * * 934 * * * 1069 * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1553 0 0 F 101 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1553 0 0 Q 102 * * * 1069 * * * * * * * * * 934 * * * * * * 102 0 * * * * * * 1553 0 0 K 103 * * * * * * 1069 * 934 * * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1553 0 0 V 104 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 104 0 * * * * * * 1553 0 0 N 105 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1553 0 0 S 106 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 106 0 * * * * * * 1553 0 0 G 107 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1553 0 0 D 108 * * 934 1069 * * * * * * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1553 0 0 T 109 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 109 0 * * * * * * 1553 0 0 M 110 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1553 0 0 L 111 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1553 0 0 D 112 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1553 0 0 N 113 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1553 0 0 A 114 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1553 0 0 M 115 * * * * * * * * * * 934 * * * * * * 1069 * * 115 0 * * * * * * 1553 0 0 K 116 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1553 0 0 S 117 * * * * * * * * * * * * * * * 934 * * * 1069 117 0 * * * * * * 1553 0 0 K 118 * * * * * 1069 * * 934 * * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1553 0 0 D 119 * * 934 * * * * * * * * 1069 * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1553 0 0 S 120 * * * * * * * * * * * * * * 1069 934 * * * * 120 0 * * * * * * 1553 0 0 K 121 * * * 1069 * * * * 934 * * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1553 0 0 M 122 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1553 0 0 I 123 1069 * * * * * * 934 * * * * * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 1553 0 0 D 124 1069 * 934 * * * * * * * * * * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1553 0 0 F 125 1069 * * * 934 * * * * * * * * * * * * * * * 125 0 * * * * * * 1553 0 0 L 126 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1553 0 0 L 127 * * * * * * * 1069 * 934 * * * * * * * * * * 127 0 * * * * * * 1553 0 0 K 128 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1553 0 0 N 129 * * * * * * 1069 * * * * 934 * * * * * * * * 129 0 * * * * * * 1553 0 0 G 130 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 1553 0 0 A 131 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 131 0 * * * * * * 1553 0 0 I 132 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 132 0 * * * * * * 1000 0 0 L 133 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 1000 0 0 G 134 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 134 0 * * * * * * 1000 0 0 K 135 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 1000 0 0 R 136 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 136 0 * * * * * * 1000 0 0 F 137 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 137 0 * * * * * * 1000 0 0 E 138 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 138 0 * * * * * * 1000 0 0 I 139 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 139 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //