HHsearch 1.5 NAME c7vlmA_ FAM FILE c7vlmA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c7vlmA_.a3m DATE Sat Dec 4 08:53:35 2021 LENG 177 match states, 177 columns in multiple alignment FILT 1 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.3988 -1.1565 SEQ >ss_dssp CBCCCCCEEEEETTEEEEECHHHHHHHTTTCSSEEECCCCCCEEEECSSCEEEECCTTSBCCHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHTCSCEEECTTCHHHHHH HHHHHHHCCTTCEECTTSSCEESCSCCBTTBCCTTCEEEESCCSBSGGGCBSCBSSCCCSSEEEEEETTEEEEEEEC >sa_dssp DEACDEDDECEDEEEEDECADDACEDAEECBECBDABDEDECCBCADEECABACBCEEBCBCDEBADDACEDBECACEABECAECEDBDADEECDCBBDA ACCACEDCDEEBCCBEEDCBABCCEECEEEEBCECBCAAADDBDCEEECECBCBDEEBECBAAADCCEDDACEEDDC >ss_pred CCCCHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCEEEEECCCCCEEEHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCHHHHHH HHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCEEEEECC >ss_conf 9531013555536803201201840121110123330654544201128589954788841000686431568999975202331456663162023456 88875100122235765311013236564527776357304447577677179877747236788418827642319 >Consensus xkidttvtevkengktylrllkgneqlkavsdkavagvnkigsflvrqdnivvfpdnkgefdldffnllndnfetlveyakxadcldiafdineksyfnx ixwlxknidenwsqspygesfysskdidwgykpegslrvsdhwnfgqdgehcptaepvdgwavckfengkyhlikkf >c7vlmA_ XKIDTTVTEVKENGKTYLRLLKGNEQLKAVSDKAVAGVNKIGSFLVRQDNIVVFPDNKGEFDLDFFNLLNDNFETLVEYAKXADCLDIAFDINEKSYFNX IXWLXKNIDENWSQSPYGESFYSSKDIDWGYKPEGSLRVSDHWNFGQDGEHCPTAEPVDGWAVCKFENGKYHLIKKF # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * X 1 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 1 * * * * * * * 0 0 0 K 2 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 I 3 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 D 4 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 T 5 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 T 6 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 V 7 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 T 8 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 E 9 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 V 10 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 K 11 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 E 12 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 N 13 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 G 14 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 K 15 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 T 16 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 17 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 17 0 * * * * * * 1000 0 0 L 18 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 R 19 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 L 20 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 L 21 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 K 22 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 G 23 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 N 24 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 E 25 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 26 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 L 27 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 K 28 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 A 29 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 V 30 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 S 31 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 D 32 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 K 33 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 A 34 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 V 35 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 A 36 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 G 37 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 V 38 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 N 39 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 K 40 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 I 41 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 G 42 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 S 43 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 F 44 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 L 45 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 V 46 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 R 47 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 48 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 D 49 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 N 50 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 I 51 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 V 52 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 V 53 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 F 54 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 P 55 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 D 56 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 N 57 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 K 58 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 G 59 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 E 60 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 F 61 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1000 0 0 D 62 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1000 0 0 L 63 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1000 0 0 D 64 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 F 65 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1000 0 0 F 66 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 N 67 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 L 68 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 L 69 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 N 70 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1000 0 0 D 71 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1000 0 0 N 72 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 F 73 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1000 0 0 E 74 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1000 0 0 T 75 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 75 0 * * * * * * 1000 0 0 L 76 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1000 0 0 V 77 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 77 0 * * * * * * 1000 0 0 E 78 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 79 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 79 0 * * * * * * 1000 0 0 A 80 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1000 0 0 K 81 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1000 0 0 X 82 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 82 * * * * * * * 1000 0 0 A 83 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1000 0 0 D 84 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1000 0 0 C 85 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1000 0 0 L 86 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1000 0 0 D 87 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1000 0 0 I 88 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1000 0 0 A 89 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1000 0 0 F 90 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1000 0 0 D 91 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1000 0 0 I 92 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1000 0 0 N 93 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1000 0 0 E 94 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1000 0 0 K 95 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1000 0 0 S 96 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 96 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 97 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 97 0 * * * * * * 1000 0 0 F 98 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1000 0 0 N 99 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1000 0 0 X 100 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 100 * * * * * * * 1000 0 0 I 101 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1000 0 0 X 102 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 102 * * * * * * * 1000 0 0 W 103 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 103 0 * * * * * * 1000 0 0 L 104 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1000 0 0 X 105 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 105 * * * * * * * 1000 0 0 K 106 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1000 0 0 N 107 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1000 0 0 I 108 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1000 0 0 D 109 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1000 0 0 E 110 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1000 0 0 N 111 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1000 0 0 W 112 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 112 0 * * * * * * 1000 0 0 S 113 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 113 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 114 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 114 0 * * * * * * 1000 0 0 S 115 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 115 0 * * * * * * 1000 0 0 P 116 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 117 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 117 0 * * * * * * 1000 0 0 G 118 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1000 0 0 E 119 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1000 0 0 S 120 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 120 0 * * * * * * 1000 0 0 F 121 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 122 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 122 0 * * * * * * 1000 0 0 S 123 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 123 0 * * * * * * 1000 0 0 S 124 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 124 0 * * * * * * 1000 0 0 K 125 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 125 0 * * * * * * 1000 0 0 D 126 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1000 0 0 I 127 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 127 0 * * * * * * 1000 0 0 D 128 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1000 0 0 W 129 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 129 0 * * * * * * 1000 0 0 G 130 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 131 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 131 0 * * * * * * 1000 0 0 K 132 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 132 0 * * * * * * 1000 0 0 P 133 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 133 0 * * * * * * 1000 0 0 E 134 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 134 0 * * * * * * 1000 0 0 G 135 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 1000 0 0 S 136 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 136 0 * * * * * * 1000 0 0 L 137 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 137 0 * * * * * * 1000 0 0 R 138 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 138 0 * * * * * * 1000 0 0 V 139 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 139 0 * * * * * * 1000 0 0 S 140 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 140 0 * * * * * * 1000 0 0 D 141 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 141 0 * * * * * * 1000 0 0 H 142 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 142 0 * * * * * * 1000 0 0 W 143 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 143 0 * * * * * * 1000 0 0 N 144 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 144 0 * * * * * * 1000 0 0 F 145 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 145 0 * * * * * * 1000 0 0 G 146 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 146 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 147 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 147 0 * * * * * * 1000 0 0 D 148 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 148 0 * * * * * * 1000 0 0 G 149 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 149 0 * * * * * * 1000 0 0 E 150 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 150 0 * * * * * * 1000 0 0 H 151 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 151 0 * * * * * * 1000 0 0 C 152 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 152 0 * * * * * * 1000 0 0 P 153 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 153 0 * * * * * * 1000 0 0 T 154 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 154 0 * * * * * * 1000 0 0 A 155 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 155 0 * * * * * * 1000 0 0 E 156 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 156 0 * * * * * * 1000 0 0 P 157 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 157 0 * * * * * * 1000 0 0 V 158 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 158 0 * * * * * * 1000 0 0 D 159 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 159 0 * * * * * * 1000 0 0 G 160 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 160 0 * * * * * * 1000 0 0 W 161 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 161 0 * * * * * * 1000 0 0 A 162 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 162 0 * * * * * * 1000 0 0 V 163 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 163 0 * * * * * * 1000 0 0 C 164 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 164 0 * * * * * * 1000 0 0 K 165 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 165 0 * * * * * * 1000 0 0 F 166 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 166 0 * * * * * * 1000 0 0 E 167 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 167 0 * * * * * * 1000 0 0 N 168 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 168 0 * * * * * * 1000 0 0 G 169 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 169 0 * * * * * * 1000 0 0 K 170 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 170 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 171 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 171 0 * * * * * * 1000 0 0 H 172 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 172 0 * * * * * * 1000 0 0 L 173 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 173 0 * * * * * * 1000 0 0 I 174 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 174 0 * * * * * * 1000 0 0 K 175 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 175 0 * * * * * * 1000 0 0 K 176 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 176 0 * * * * * * 1000 0 0 F 177 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 177 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //