HHsearch 1.5 NAME c7ux0A_ FAM FILE c7ux0A_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c7ux0A_.a3m DATE Sat Oct 15 12:19:48 2022 LENG 115 match states, 115 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.4216 0.2724 SEQ >ss_dssp CTTSSCGGGCHHHHHHHHHTCCCCCCCCCCCTTCEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTCCTTHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHSTTTCSSEEEEEETTT CCEEEEECCCHHHHC >sa_dssp ABDCCDEECDBECBBEDBCEDEDEDEEECEBDECCABDEAACDAADCBCECBDEBCEEECCEDBEEBBCDADEDBADDBCDDABBDEEBDEDCCCCDBED DEDEEDECCEDDEBE >ss_pred CEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCCCCCHHHCCCCCCCCCCEEEEECCC CCCCEECCCCCCCCC >ss_conf 9354414232220899998768752889886200000000000000011234443334443100023344331023200110036511167414774333 445300114211259 >Consensus cvxcxlpaxdlsgrlarlcsqxkxcgasxxfxafaldevsmnkvtekthrvlrvmeikeavsslpsywswlrktklpeytrealcxpacrgstxlyncst ckxxexscwprkrcf >c7ux0A_ CVFCRLPAHDLSGRLARLCSQQKECGASPDFSAFALDEVSMNKVTEKTHRVLRVMEIKEAVSSLPSYWSWLRKTKLPEYTREALCPPACRGSTTLYNCST CKGTEVSCWPRKRCF >UniRef50_D2HPV5(17-81:188) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Ailuropoda melanoleuca RepID=D2HPV5_AILME E=2e-10 s/c=1.02 id=73% cov=54% CVLCHLPARDLSGRLAQLCSQvevlWKNCGASWSFPAFAL----------------------------------------------ALCAPACRGSTILY NCSTCQEFKAS-------- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * C 1 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1093 0 0 V 2 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 2 0 * * * * * * 1093 0 0 F 3 * * * * 484 * * * * 1811 * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1093 0 0 C 4 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1093 0 0 R 5 * * * * * * 1811 * * * * * * * 484 * * * * * 5 0 * * * * * * 1093 0 0 L 6 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1093 0 0 P 7 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1093 0 0 A 8 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1093 0 0 H 9 * * * * * * 484 * * * * * * * 1811 * * * * * 9 0 * * * * * * 1093 0 0 D 10 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1093 0 0 L 11 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1093 0 0 S 12 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 12 0 * * * * * * 1093 0 0 G 13 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1093 0 0 R 14 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 14 0 * * * * * * 1093 0 0 L 15 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1093 0 0 A 16 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1093 0 0 R 17 * * * * * * * * * * * * * 1811 484 * * * * * 17 0 * * * * * * 1093 0 0 L 18 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1093 0 0 C 19 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1093 0 0 S 20 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 20 0 * * * * * * 1093 0 0 Q 21 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 21 484 1811 * 2000 415 * * 1093 1000 0 Q 22 * * * * * * * * * * * * * 484 * * * * 1811 * 22 0 * * * * * * 1093 0 0 K 23 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1093 0 0 E 24 * * * 484 * * * * * * * 1811 * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1093 0 0 C 25 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1093 0 0 G 26 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1093 0 0 A 27 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1093 0 0 S 28 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 28 0 * * * * * * 1093 0 0 P 29 * * * * * * * * * * * * 484 * * * * * 1811 * 29 0 * * * * * * 1093 0 0 D 30 * * 484 * * * * * * * * * * * * 1811 * * * * 30 0 * * * * * * 1093 0 0 F 31 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1093 0 0 S 32 * * * * * * * * * * * * 1811 * * 484 * * * * 32 0 * * * * * * 1093 0 0 A 33 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1093 0 0 F 34 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1093 0 0 A 35 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1093 0 0 L 36 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 36 484 * 1811 * * * * 1093 0 0 D 37 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * 0 1000 0 1000 E 38 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * 0 1000 0 1000 V 39 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 39 0 * * * * * 0 1000 0 1000 S 40 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 40 0 * * * * * 0 1000 0 1000 M 41 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 41 0 * * * * * 0 1000 0 1000 N 42 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 42 0 * * * * * 0 1000 0 1000 K 43 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * 0 1000 0 1000 V 44 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 44 0 * * * * * 0 1000 0 1000 T 45 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 45 0 * * * * * 0 1000 0 1000 E 46 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * 0 1000 0 1000 K 47 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * 0 1000 0 1000 T 48 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 48 0 * * * * * 0 1000 0 1000 H 49 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * 0 1000 0 1000 R 50 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 50 0 * * * * * 0 1000 0 1000 V 51 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 51 0 * * * * * 0 1000 0 1000 L 52 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * 0 1000 0 1000 R 53 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 53 0 * * * * * 0 1000 0 1000 V 54 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 54 0 * * * * * 0 1000 0 1000 M 55 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 55 0 * * * * * 0 1000 0 1000 E 56 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * 0 1000 0 1000 I 57 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * 0 1000 0 1000 K 58 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * 0 1000 0 1000 E 59 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * 0 1000 0 1000 A 60 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * 0 1000 0 1000 V 61 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 61 0 * * * * * 0 1000 0 1000 S 62 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 62 0 * * * * * 0 1000 0 1000 S 63 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 63 0 * * * * * 0 1000 0 1000 L 64 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * 0 1000 0 1000 P 65 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 65 0 * * * * * 0 1000 0 1000 S 66 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 66 0 * * * * * 0 1000 0 1000 Y 67 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 67 0 * * * * * 0 1000 0 1000 W 68 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 68 0 * * * * * 0 1000 0 1000 S 69 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 69 0 * * * * * 0 1000 0 1000 W 70 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 70 0 * * * * * 0 1000 0 1000 L 71 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * 0 1000 0 1000 R 72 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 72 0 * * * * * 0 1000 0 1000 K 73 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * 0 1000 0 1000 T 74 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 74 0 * * * * * 0 1000 0 1000 K 75 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * 0 1000 0 1000 L 76 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * 0 1000 0 1000 P 77 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 77 0 * * * * * 0 1000 0 1000 E 78 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * 0 1000 0 1000 Y 79 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 79 0 * * * * * 0 1000 0 1000 T 80 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 80 0 * * * * * 0 1000 0 1000 R 81 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 81 0 * * * * * 0 1000 0 1000 E 82 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * 0 * 1000 0 1000 A 83 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1093 0 0 L 84 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1093 0 0 C 85 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1093 0 0 P 86 1811 * * * * * * * * * * * 484 * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1093 0 0 P 87 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1093 0 0 A 88 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1093 0 0 C 89 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1093 0 0 R 90 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 90 0 * * * * * * 1093 0 0 G 91 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1093 0 0 S 92 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 92 0 * * * * * * 1093 0 0 T 93 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 93 0 * * * * * * 1093 0 0 T 94 * * * * * * * 1811 * * * * * * * * 484 * * * 94 0 * * * * * * 1093 0 0 L 95 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1093 0 0 Y 96 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 96 0 * * * * * * 1093 0 0 N 97 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1093 0 0 C 98 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1093 0 0 S 99 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 99 0 * * * * * * 1093 0 0 T 100 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 100 0 * * * * * * 1093 0 0 C 101 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1093 0 0 K 102 * * * * * * * * 484 * * * * 1811 * * * * * * 102 0 * * * * * * 1093 0 0 G 103 * * * 1811 * 484 * * * * * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1093 0 0 T 104 * * * * 1811 * * * * * * * * * * * 484 * * * 104 0 * * * * * * 1093 0 0 E 105 * * * 484 * * * * 1811 * * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1093 0 0 V 106 1811 * * * * * * * * * * * * * * * * 484 * * 106 0 * * * * * * 1093 0 0 S 107 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 107 0 * * * * * * 1093 0 0 C 108 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1000 0 0 W 109 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 109 0 * * * * * * 1000 0 0 P 110 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1000 0 0 R 111 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 111 0 * * * * * * 1000 0 0 K 112 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1000 0 0 R 113 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 113 0 * * * * * * 1000 0 0 C 114 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1000 0 0 F 115 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 115 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //