HHsearch 1.5 NAME c7u1tC_ FAM FILE c7u1tC_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c7u1tC_.a3m DATE Sat Feb 25 09:39:12 2023 LENG 176 match states, 176 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.4 EVD 0.4161 -0.1255 SEQ >ss_dssp CCSSCSSSSSSSSCTTCCSCSSSSCSCCSCCTTCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHTCCCCCCSSCCEEEEEEEESSCHHHHHHHHHHHHHHCSSCEECCCE ECCCCCCSTTSCCCCSSCCCSCEEEEEEESCHHHHHHHHHHHHHHHHHCTTGGGGCEEEEEEEEEEECCCCSCCCC >sa_dssp EEECCCEAACCDEDDEDEDDCECEEEEEEDEEEDDDECEEBCECADCADECBDDDECDCDCEECDBCAABCBCCDCEEBADCBCCABDCBAECBDCCDCC DCDDEECEEEDEDCCEEDDBEDCCACABACBCDBADBACDABDDBBEEDEDDCDEBEBDCBECEECDECEEEEECE >ss_pred CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEECCHH HCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCC >ss_conf 9887677876688466886501126513662224788852010899899997310265445676056438885065453344333321024421433022 1755567899989752012246789998767777999999998876368998751089998525787477456899 >Consensus paddpgegpstxpxxxgxxxxrkxggxxgxxxxxxgsnpkxxxxaeglxallxrxhxxrttxegxwxxgvxxxxxskxxlyxlrrxxalaxxxxrxtplx rlpxgxaxgpgpqpgpxxesxxxxfxvfxqtxxfaxxxxdaixdxxxtxpxptxnxxvxxxxfxxgvxlpxxfppm >c7u1tC_ PADDPGEGPSTGPRGQGDGGRRKKGGWFGKHRGQGGSNPKFENIAEGLRALLARSHVERTTDEGTWVAGVFVYGGSKTSLYNLRRGTALAIPQCRLTPLS RLPFGMAPGPGPQPGPLRESIVCYFMVFLQTHIFAEVLKDAIKDLVMTKPAPTCNIRVTVCSFDDGVDLPPWFPPM >UniRef50_Q993H1(144-307:327) ORF39 n=1 Tax=Callitrichine herpesvirus 3 RepID=Q993H1_9GAMA E=9e-32 s/c=0.84 id=49% cov=93% ---------STRPQVPGGATTRKRGGVRGQPAKCHG---KYTTTAEGLTALLNRRHSPRTSNEGRWMNGVMAVNLSKWPLYSLRRALALAANEVRISPLF RLPYGSAFGPGPQPGPILESSTWGFLVFTQTSLFADDIADAIRDYCTTHPGPTRNTQVVLMNFEgSGVPLPMFFPP- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * P 1 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 A 2 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 D 3 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 D 4 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 P 5 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 G 6 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 E 7 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 G 8 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 P 9 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 S 10 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 10 0 * * * * * * 1414 0 0 T 11 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 11 0 * * * * * * 1414 0 0 G 12 * * * * * 974 * * * * * * * * 1026 * * * * * 12 0 * * * * * * 1414 0 0 P 13 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1414 0 0 R 14 * * * * * * * * * * * * * 1026 974 * * * * * 14 0 * * * * * * 1414 0 0 G 15 * * * * * 974 * * * * * * * * * * * 1026 * * 15 0 * * * * * * 1414 0 0 Q 16 * * * * * * * * * * * * 1026 974 * * * * * * 16 0 * * * * * * 1414 0 0 G 17 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1414 0 0 D 18 * * 974 * * 1026 * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1414 0 0 G 19 1026 * * * * 974 * * * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1414 0 0 G 20 * * * * * 974 * * * * * * * * * * 1026 * * * 20 0 * * * * * * 1414 0 0 R 21 * * * * * * * * * * * * * * 974 * 1026 * * * 21 0 * * * * * * 1414 0 0 R 22 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 22 0 * * * * * * 1414 0 0 K 23 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1414 0 0 K 24 * * * * * * * * 974 * * * * * 1026 * * * * * 24 0 * * * * * * 1414 0 0 G 25 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1414 0 0 G 26 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1414 0 0 W 27 * * * * * * * * * * * * * * * * * 1026 974 * 27 0 * * * * * * 1414 0 0 F 28 * * * * 974 * * * * * * * * * 1026 * * * * * 28 0 * * * * * * 1414 0 0 G 29 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1414 0 0 K 30 * * * * * * * * 974 * * * * 1026 * * * * * * 30 0 * * * * * * 1414 0 0 H 31 * * * * * * 974 * * * * * 1026 * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1414 0 0 R 32 1026 * * * * * * * * * * * * * 974 * * * * * 32 0 * * * * * * 1414 0 0 G 33 * * * * * 974 * * 1026 * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1414 0 0 Q 34 * 1026 * * * * * * * * * * * 974 * * * * * * 34 0 * * * * * * 1414 0 0 G 35 * * * * * 974 1026 * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1414 0 0 G 36 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 36 974 * 1026 * * * * 1414 0 0 S 37 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 37 0 * * * * * 0 1000 0 1000 N 38 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 38 0 * * * * * 0 1000 0 1000 P 39 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 39 0 * * * * 0 * 1000 0 1000 K 40 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1414 0 0 F 41 * * * * 974 * * * * * * * * * * * * * * 1026 41 0 * * * * * * 1414 0 0 E 42 * * * 974 * * * * * * * * * * * * 1026 * * * 42 0 * * * * * * 1414 0 0 N 43 * * * * * * * * * * * 974 * * * * 1026 * * * 43 0 * * * * * * 1414 0 0 I 44 * * * * * * * 974 * * * * * * * * 1026 * * * 44 0 * * * * * * 1414 0 0 A 45 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1414 0 0 E 46 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1414 0 0 G 47 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1414 0 0 L 48 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1414 0 0 R 49 * * * * * * * * * * * * * * 974 * 1026 * * * 49 0 * * * * * * 1414 0 0 A 50 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1414 0 0 L 51 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1414 0 0 L 52 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1414 0 0 A 53 974 * * * * * * * * * * 1026 * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1414 0 0 R 54 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 54 0 * * * * * * 1414 0 0 S 55 * * * * * * * * * * * * * * 1026 974 * * * * 55 0 * * * * * * 1414 0 0 H 56 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1414 0 0 V 57 * * * * * * * * * * * * * * * 1026 * 974 * * 57 0 * * * * * * 1414 0 0 E 58 * * * 974 * * * * * * * * 1026 * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1414 0 0 R 59 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 59 0 * * * * * * 1414 0 0 T 60 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 60 0 * * * * * * 1414 0 0 T 61 * * * * * * * * * * * * * * * 1026 974 * * * 61 0 * * * * * * 1414 0 0 D 62 * * 974 * * * * * * * * 1026 * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1414 0 0 E 63 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1414 0 0 G 64 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1414 0 0 T 65 * * * * * * * * * * * * * * 1026 * 974 * * * 65 0 * * * * * * 1414 0 0 W 66 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 66 0 * * * * * * 1414 0 0 V 67 * * * * * * * * * * 1026 * * * * * * 974 * * 67 0 * * * * * * 1414 0 0 A 68 974 * * * * * * * * * * 1026 * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1414 0 0 G 69 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1414 0 0 V 70 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 70 0 * * * * * * 1414 0 0 F 71 * * * * 974 * * * * * 1026 * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1414 0 0 V 72 1026 * * * * * * * * * * * * * * * * 974 * * 72 0 * * * * * * 1414 0 0 Y 73 * * * * * * * * * * * * * * * * * 1026 * 974 73 0 * * * * * * 1414 0 0 G 74 * * * * * 974 * * * * * 1026 * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1414 0 0 G 75 * * * * * 974 * * * 1026 * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1414 0 0 S 76 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 76 0 * * * * * * 1414 0 0 K 77 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1414 0 0 T 78 * * * * * * * * * * * * * * * * 974 * 1026 * 78 0 * * * * * * 1414 0 0 S 79 * * * * * * * * * * * * 1026 * * 974 * * * * 79 0 * * * * * * 1414 0 0 L 80 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1414 0 0 Y 81 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 81 0 * * * * * * 1414 0 0 N 82 * * * * * * * * * * * 974 * * * 1026 * * * * 82 0 * * * * * * 1414 0 0 L 83 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1414 0 0 R 84 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 84 0 * * * * * * 1414 0 0 R 85 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 85 0 * * * * * * 1414 0 0 G 86 1026 * * * * 974 * * * * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1414 0 0 T 87 * * * * * * * * * 1026 * * * * * * 974 * * * 87 0 * * * * * * 1414 0 0 A 88 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1414 0 0 L 89 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1414 0 0 A 90 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1414 0 0 I 91 1026 * * * * * * 974 * * * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1414 0 0 P 92 * * * * * * * * * * * 1026 974 * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1414 0 0 Q 93 * * * 1026 * * * * * * * * * 974 * * * * * * 93 0 * * * * * * 1414 0 0 C 94 * 974 * * * * * * * * * * * * * * * 1026 * * 94 0 * * * * * * 1414 0 0 R 95 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 95 0 * * * * * * 1414 0 0 L 96 * * * * * * * 1026 * 974 * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1414 0 0 T 97 * * * * * * * * * * * * * * * 1026 974 * * * 97 0 * * * * * * 1414 0 0 P 98 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1414 0 0 L 99 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1414 0 0 S 100 * * * * 1026 * * * * * * * * * * 974 * * * * 100 0 * * * * * * 1414 0 0 R 101 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 101 0 * * * * * * 1414 0 0 L 102 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1414 0 0 P 103 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1414 0 0 F 104 * * * * 974 * * * * * * * * * * * * * * 1026 104 0 * * * * * * 1414 0 0 G 105 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1414 0 0 M 106 * * * * * * * * * * 974 * * * * 1026 * * * * 106 0 * * * * * * 1414 0 0 A 107 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1414 0 0 P 108 * * * * 1026 * * * * * * * 974 * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1414 0 0 G 109 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1414 0 0 P 110 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1414 0 0 G 111 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1414 0 0 P 112 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1414 0 0 Q 113 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 113 0 * * * * * * 1414 0 0 P 114 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1414 0 0 G 115 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1414 0 0 P 116 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1414 0 0 L 117 * * * * * * * 1026 * 974 * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1414 0 0 R 118 * * * * * * * * * 1026 * * * * 974 * * * * * 118 0 * * * * * * 1414 0 0 E 119 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1414 0 0 S 120 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 120 0 * * * * * * 1414 0 0 I 121 * * * * * * * 974 * * * * * * * 1026 * * * * 121 0 * * * * * * 1414 0 0 V 122 * * * * * * * * * * * * * * * * 1026 974 * * 122 0 * * * * * * 1414 0 0 C 123 * 974 * * * * * * * * * * * * * * * * 1026 * 123 0 * * * * * * 1414 0 0 Y 124 * * * * * 1026 * * * * * * * * * * * * * 974 124 0 * * * * * * 1414 0 0 F 125 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 125 0 * * * * * * 1414 0 0 M 126 * * * * * * * * * 1026 974 * * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1414 0 0 V 127 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 127 0 * * * * * * 1414 0 0 F 128 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1414 0 0 L 129 * * * * * * * * * 974 * * * * * * 1026 * * * 129 0 * * * * * * 1414 0 0 Q 130 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 130 0 * * * * * * 1414 0 0 T 131 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 131 0 * * * * * * 1414 0 0 H 132 * * * * * * 974 * * * * * * * * 1026 * * * * 132 0 * * * * * * 1414 0 0 I 133 * * * * * * * 974 * 1026 * * * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 1414 0 0 F 134 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 134 0 * * * * * * 1414 0 0 A 135 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 1414 0 0 E 136 * * 1026 974 * * * * * * * * * * * * * * * * 136 0 * * * * * * 1414 0 0 V 137 * * 1026 * * * * * * * * * * * * * * 974 * * 137 0 * * * * * * 1414 0 0 L 138 * * * * * * * 1026 * 974 * * * * * * * * * * 138 0 * * * * * * 1414 0 0 K 139 1026 * * * * * * * 974 * * * * * * * * * * * 139 0 * * * * * * 1414 0 0 D 140 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 140 0 * * * * * * 1414 0 0 A 141 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 141 0 * * * * * * 1414 0 0 I 142 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 142 0 * * * * * * 1414 0 0 K 143 * * * * * * * * 974 * * * * * 1026 * * * * * 143 0 * * * * * * 1414 0 0 D 144 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 144 0 * * * * * * 1414 0 0 L 145 * * * * * * * * * 974 * * * * * * * * * 1026 145 0 * * * * * * 1414 0 0 V 146 * 1026 * * * * * * * * * * * * * * * 974 * * 146 0 * * * * * * 1414 0 0 M 147 * * * * * * * * * * 974 * * * * * 1026 * * * 147 0 * * * * * * 1414 0 0 T 148 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 148 0 * * * * * * 1414 0 0 K 149 * * * * * * 1026 * 974 * * * * * * * * * * * 149 0 * * * * * * 1414 0 0 P 150 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 150 0 * * * * * * 1414 0 0 A 151 974 * * * * 1026 * * * * * * * * * * * * * * 151 0 * * * * * * 1414 0 0 P 152 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 152 0 * * * * * * 1414 0 0 T 153 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 153 0 * * * * * * 1414 0 0 C 154 * 974 * * * * * * * * * * * * 1026 * * * * * 154 0 * * * * * * 1414 0 0 N 155 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 155 0 * * * * * * 1414 0 0 I 156 * * * * * * * 974 * * * * * * * * 1026 * * * 156 0 * * * * * * 1414 0 0 R 157 * * * * * * * * * * * * * 1026 974 * * * * * 157 0 * * * * * * 1414 0 0 V 158 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 158 0 * * * * * * 1414 0 0 T 159 * * * * * * * * * * * * * * * * 974 1026 * * 159 0 * * * * * * 1414 0 0 V 160 * * * * * * * * * 1026 * * * * * * * 974 * * 160 0 * * * * * * 1414 0 0 C 161 * 974 * * * * * * * * 1026 * * * * * * * * * 161 0 * * * * * * 1414 0 0 S 162 * * * * * * * * * * * 1026 * * * 974 * * * * 162 0 * * * * * * 1414 0 0 F 163 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 163 0 * * * * * * 1414 0 0 D 164 * * 974 1026 * * * * * * * * * * * * * * * * 164 974 1026 * 0 * * * 1414 1000 0 D 165 * * 974 * * * * * * * * * * * * 1026 * * * * 165 0 * * * * * * 1414 0 0 G 166 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 166 0 * * * * * * 1414 0 0 V 167 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 167 0 * * * * * * 1414 0 0 D 168 * * 974 * * * * * * * * * 1026 * * * * * * * 168 0 * * * * * * 1414 0 0 L 169 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 169 0 * * * * * * 1414 0 0 P 170 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 170 0 * * * * * * 1414 0 0 P 171 * * * * * * * * * * 1026 * 974 * * * * * * * 171 0 * * * * * * 1414 0 0 W 172 * * * * 1026 * * * * * * * * * * * * * 974 * 172 0 * * * * * * 1414 0 0 F 173 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 173 0 * * * * * * 1414 0 0 P 174 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 174 0 * * * * * * 1414 0 0 P 175 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 175 0 * * * * * * 1414 0 0 M 176 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 176 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //