HHsearch 1.5 NAME c7rt7H_ FAM FILE c7rt7H_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c7rt7H_.a3m DATE Sat Aug 20 08:48:39 2022 LENG 144 match states, 144 columns in multiple alignment FILT 4 out of 8 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 2.1 EVD 0.4432 1.2414 SEQ >ss_dssp CEEEEEHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCTTCTTSSBCCTTSSTTSHHHHHHHHTTCSCEEEEEEEEEEEECCSSSCCSSCCEEEEEETTSCEEEEECCCCT TSCGGGCCTTCEEEEEEEEEEBSSCCTTSCCCEEEEEEEEEECC >sa_dssp DEDBADADDCCECCDDCBDEBCEDCEDEEDEECCBDCECBCABCEDABDCCEEDDADDDEBDBCADDDCDDEEEDECECCBABADBEEEEECDBCADCBE ECDDECAEEDCDABACBACAADBEDDEEEDECDCDBBBCACBCE >ss_pred CCEEHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCEEEEEEEEECC HHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCC >ss_conf 9310317999742899898877431054454000111101114966741201476204567789999886301124688616999568605632355315 23477630885789998514000473227864777552544149 >Consensus MkxiYxfkxxxKxdpexIxkaxxLtLNxxkpxxGlKgtxGLfgSxEWWxNiexgxipxrxiSGvIxxxyxxGqdxxxxxNtidixxxdgsvxxegxYxxn xxDxxlfxxGkkIxIxYAxdeLKkpxxxGxvnYskivlEmaiSx >c7rt7H_ MKTIYNFKQRIKEDPEYIRKAHELTLNTTKPKAGLKGTYGLLGSKEWWDNLENGSIPQKEISGTIKKVYLTGQDNTEDFNTIDIETENKTLCTEGTYTNK NTDRKHYEAGKKITIKYAFDPLKKPKPNGDIDYSKIVVEILISE >UniRef50_C5CYG6(12-156:161) Putative uncharacterized protein n=3 Tax=Proteobacteria RepID=C5CYG6_VARPS E=6e-27 s/c=0.83 id=38% cov=100% MKRVYLLSEELKADPDRIALAQALTLNAAKPRMGLKGTLGLFGSPEWWANIEQRKMPVRFLSGVIQRAYVVGQDESVVMNNeIELRLDDGSVQAEGIYVS NEDDVNLFRMGHLVEVAYALDELKRqPAADGGVNYSRVTLEMAVS- >UniRef50_C0EMA6(10-158:158) Putative uncharacterized protein n=2 Tax=Neisseria RepID=C0EMA6_NEIFL E=9e-48 s/c=1.28 id=35% cov=100% MYLIYDFKKVMKREKEFIEKTRLLSLN-DESIFGIKKDKGLFASEEWWSNIDSGQIITRSVSGVISSIYEAGMERRNIPNSFSFIDGEGIVRNESMYMMN KSDRHLFCEGKKIVIFYAYNELKKSnQRKGDVidlenNYVEQVIEMAISK >UniRef50_UPI00016A32A8(1-89:91) hypothetical protein BuboB_25259 n=1 Tax=Burkholderia ubonensis Bu RepID=UPI00016A32A8 E=2e-18 s/c=1.05 id=38% cov=57% --------------------------------------------------------------GVVQRAFVAGQDKRAPNNTIDIVLDDGSTYTTGIYVNN KADVELFKPGRRIGIVYALDELKqQPATDGGINYSKIALEMAVS- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * M 1 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1960 0 0 K 2 * * * * * * * * 593 * * * * * * * * * * 1570 2 0 * * * * * * 1960 0 0 T 3 * * * * * * * * * 1570 * * * * 1585 * 1600 * * * 3 0 * * * * * * 1960 0 0 I 4 * * * * * * * 585 * * * * * * * * * 1585 * * 4 0 * * * * * * 1960 0 0 Y 5 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 5 0 * * * * * * 1960 0 0 N 6 * * 1570 * * * * * * 1585 * 1600 * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1960 0 0 F 7 * * * * 585 * * * * 1585 * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1960 0 0 K 8 * * * * * * * * 585 * * * * * * 1585 * * * * 8 0 * * * * * * 1960 0 0 Q 9 * * * 1585 * * * * 1570 * * * * 1600 * * * * * * 9 0 * * * * * * 1960 0 0 R 10 * * * 1585 * * * * * * * * * * 1600 * * 1570 * * 10 0 * * * * * * 1960 0 0 I 11 * * * * * * * 1600 * 1585 1570 * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1960 0 0 K 12 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1960 0 0 E 13 1585 * * 1600 * * * * * * * * * * 1570 * * * * * 13 0 * * * * * * 1960 0 0 D 14 * * 593 1570 * * * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1960 0 0 P 15 * * * * * * * * 1570 * * * 593 * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1960 0 0 E 16 * * 1585 585 * * * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1960 0 0 Y 17 * * * * 1570 * * * * * * * * * 1585 * * * * 1600 17 0 * * * * * * 1960 0 0 I 18 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1960 0 0 R 19 1585 * * 1570 * * * * * * * * * * 1600 * * * * * 19 0 * * * * * * 1960 0 0 K 20 * * * * * * * * 585 1585 * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1960 0 0 A 21 593 * * * * * * * * * * * * * * * 1570 * * * 21 0 * * * * * * 1960 0 0 H 22 * * * * * * 1600 * * * * * * 1585 1570 * * * * * 22 0 * * * * * * 1960 0 0 E 23 1585 * * 1600 * * * * * 1570 * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1960 0 0 L 24 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1960 0 0 T 25 * * * * * * * * * * * * * * * 1570 593 * * * 25 0 * * * * * * 1960 0 0 L 26 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1960 0 0 N 27 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 27 593 * 1570 * * * * 1960 0 0 T 28 1000 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 28 0 * * * * 0 * 1539 0 1000 T 29 1585 * 1570 * * * * * * * * * * * * * 1600 * * * 29 0 * * * * * * 1960 0 0 K 30 * * * 1570 * * * * 593 * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1960 0 0 P 31 * * * * * * * * * * * * 593 * * 1570 * * * * 31 0 * * * * * * 1960 0 0 K 32 * * * * * * * 1570 1600 * * * * * 1585 * * * * * 32 0 * * * * * * 1960 0 0 A 33 1600 * * * 1570 * * * * * 1585 * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1960 0 0 G 34 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1960 0 0 L 35 * * * * * * * 1570 * 593 * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1960 0 0 K 36 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1960 0 0 G 37 * * * * * 593 * * 1570 * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1960 0 0 T 38 * * 1570 * * * * * * * * * * * * * 593 * * * 38 0 * * * * * * 1960 0 0 Y 39 * * * * * * * * 1570 1585 * * * * * * * * * 1600 39 0 * * * * * * 1960 0 0 G 40 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1960 0 0 L 41 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1960 0 0 L 42 * * * * 577 * * * * 1600 * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1960 0 0 G 43 1570 * * * * 593 * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1960 0 0 S 44 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 44 0 * * * * * * 1960 0 0 K 45 * * * 1570 * * * * 1600 * * * 1585 * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1960 0 0 E 46 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1960 0 0 W 47 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 47 0 * * * * * * 1960 0 0 W 48 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 48 0 * * * * * * 1960 0 0 D 49 1585 * 1600 * * * * * * * * * * * * 1570 * * * * 49 0 * * * * * * 1960 0 0 N 50 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1960 0 0 L 51 * * * * * * * 577 * 1600 * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1960 0 0 E 52 * * 1570 593 * * * * * * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1960 0 0 N 53 * * * * * * * * * * * 1600 * 1585 * 1570 * * * * 53 0 * * * * * * 1960 0 0 G 54 * * * * * 585 * * * * * * * * 1585 * * * * * 54 0 * * * * * * 1960 0 0 S 55 * * * * * * * * 1585 * * * * 1570 * 1600 * * * * 55 0 * * * * * * 1960 0 0 I 56 * * * * * * * 585 * * 1585 * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1960 0 0 P 57 * * * * * * * 1570 * * * * 593 * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1960 0 0 Q 58 * * * * * * * * * * * * * 1600 * * 1570 1585 * * 58 0 * * * * * * 1960 0 0 K 59 * * * * * * * * 1600 * * * * * 577 * * * * * 59 0 * * * * * * 1960 0 0 E 60 * * * 1600 1585 * * * * * * * * * * 1570 * * * * 60 0 * * * * * * 1960 0 0 I 61 * * * * * * * 1600 * 1585 * * * * * * * 1570 * * 61 0 * * * * * * 1960 0 0 S 62 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 62 0 * * * * * * 1960 0 0 G 63 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 2181 0 0 T 64 * * * * * * * * * * * * * * * * 1875 459 * * 64 0 * * * * * * 2181 0 0 I 65 * * * * * * * 361 * * * * * * * * * 2177 * * 65 0 * * * * * * 2181 0 0 K 66 * * * * * * * * 1875 * * * * 1130 * 1886 * * * * 66 0 * * * * * * 2181 0 0 K 67 * * * * * * * * 1875 * * * * * 1130 1886 * * * * 67 0 * * * * * * 2181 0 0 V 68 1130 * * * * * * 1886 * * * * * * * * * 1875 * * 68 0 * * * * * * 2181 0 0 Y 69 * * * * 2177 * * * * * * * * * * * * * * 361 69 0 * * * * * * 2181 0 0 L 70 * * * 1886 * * * * * 1875 * * * * * * * 1130 * * 70 0 * * * * * * 2181 0 0 T 71 1024 * * * * * * * * * * * * * * * 1875 2086 * * 71 0 * * * * * * 2181 0 0 G 72 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 2181 0 0 Q 73 * * * * * * * * * * 1886 * * 455 * * * * * * 73 0 * * * * * * 2181 0 0 D 74 * * 455 1886 * * * * * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 2181 0 0 N 75 * * * 2086 * * * * 2177 * * 1875 * * 1886 * * * * * 75 0 * * * * * * 2181 0 0 T 76 * * * * * * * * * * * * * * 1024 2086 1875 * * * 76 0 * * * * * * 2181 0 0 E 77 2177 * * 1875 * * * * * * * 1886 * * * * * 2086 * * 77 0 * * * * * * 2181 0 0 D 78 * * 1875 * * * * 1886 * * * * 2177 * * * * 2086 * * 78 0 * * * * * * 2181 0 0 F 79 * * * * 1875 * * * * * 2086 2177 1886 * * * * * * * 79 0 * * * * * * 2181 0 0 N 80 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 2181 0 0 T 81 * * * * * * * * * * * 2086 * * * 1886 1018 * * * 81 388 2086 * 0 * * * 2181 1000 0 I 82 * * * * 1886 * * 455 * * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 2181 0 0 D 83 * * 1018 2086 * * * * * * * * * * * 1886 * * * * 83 0 * * * * * * 2181 0 0 I 84 * * * * 1886 * * 1018 * 2086 * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 2181 0 0 E 85 * * * 1875 * * * 1886 * * * * * * 2086 * * 2177 * * 85 0 * * * * * * 2181 0 0 T 86 * * 1886 * * * * * * 1130 * * * * * * 1875 * * * 86 0 * * * * * * 2181 0 0 E 87 * * 1130 1875 * 1886 * * * * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 2181 0 0 N 88 * * 1130 1886 * * * * * * * 1875 * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 2181 0 0 K 89 * * * * * 459 * * 1875 * * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 2181 0 0 T 90 * * * * * * * 1886 * * * * * * * 1130 1875 * * * 90 0 * * * * * * 2181 0 0 L 91 * * * * * * * * * 1875 * * * * * * 2177 982 * * 91 0 * * * * * * 2181 0 0 C 92 * 1875 * * * * * * * * * * * 2086 1886 * * * * 2177 92 0 * * * * * * 2181 0 0 T 93 2086 * * * * * * * * * * 1886 * * * * 1018 * * * 93 0 * * * * * * 2181 0 0 E 94 * * * 361 * * * * * * * * * * * * 2177 * * * 94 0 * * * * * * 2181 0 0 G 95 * * * * * 455 * * * * * * * * * 1886 * * * * 95 0 * * * * * * 2181 0 0 T 96 * * * * * * * 1130 * * 1886 * * * * * 1875 * * * 96 0 * * * * * * 2181 0 0 Y 97 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 97 0 * * * * * * 2181 0 0 T 98 * * * * * * * * * * 1886 * * * * * 1875 1130 * * 98 0 * * * * * * 2181 0 0 N 99 * * * * * * * * * * 1886 1018 * * * 2086 * * * * 99 0 * * * * * * 2181 0 0 K 100 * * * * * * * * 1875 * * 459 * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 2181 0 0 N 101 * * * 2086 * * * * 1024 * * 1875 * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 2181 0 0 T 102 2177 * 2086 * * * * * * * * * * * * 1886 1875 * * * 102 0 * * * * * * 2181 0 0 D 103 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 2181 0 0 R 104 * * * * * * * * * * * * * * 880 * * 1130 * * 104 0 * * * * * * 2181 0 0 K 105 * * * 2177 * * 1886 * 1875 * * 2086 * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 2181 0 0 H 106 * * * * * * 1875 * * 459 * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 2181 0 0 Y 107 * * * * 459 * * * * * * * * * * * * * * 1875 107 0 * * * * * * 2181 0 0 E 108 * 1886 * 1875 * * * * 2177 * * * * * 2086 * * * * * 108 0 * * * * * * 2181 0 0 A 109 1875 * * 1886 * * * * * * 2086 * 2177 * * * * * * * 109 0 * * * * * * 2181 0 0 G 110 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 2181 0 0 K 111 * * * * * * 2086 * 880 * * * * * 2177 * * * * * 111 0 * * * * * * 2181 0 0 K 112 * * * * * * * * 880 2086 * * * * 2177 * * * * * 112 0 * * * * * * 2181 0 0 I 113 * * * * * * * 388 * * * * * * * * * 2086 * * 113 0 * * * * * * 2181 0 0 T 114 * * * 2086 * 2177 * * * * * * * * * * 1875 1886 * * 114 0 * * * * * * 2181 0 0 I 115 * * * * * * * 388 * * * * * * * * * 2086 * * 115 0 * * * * * * 2181 0 0 K 116 2086 * * * 1886 * * * 1875 * * * * * * * * 2177 * * 116 0 * * * * * * 2181 0 0 Y 117 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 117 0 * * * * * * 2181 0 0 A 118 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 2181 0 0 F 119 * * * * 1875 * * * * 1130 * * * * * * * * * 1886 119 0 * * * * * * 2181 0 0 D 120 * * 455 * * * * * * * * 1886 * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 2181 0 0 P 121 * * * 459 * * * * * * * * 1875 * * * * * * * 121 0 * * * * * * 2181 0 0 L 122 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 2181 0 0 K 123 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 123 361 2177 * 0 * * * 2181 1000 0 K 124 * * * * * * * * 880 * * * * 2177 2086 * * * * * 124 388 2086 * 0 * * * 2181 1000 0 P 125 * * * * * * * * * * * * 455 * * 1886 * * * * 125 455 1886 * 0 * * * 2181 1000 0 K 126 1130 * * * * * * * 1875 * * * * 1886 * * * * * * 126 0 * * * * * * 2181 0 0 P 127 2086 * * * * * * * * * * * 1875 * 1886 * 2177 * * * 127 0 * * * * * * 2181 0 0 N 128 * * 1130 * * * * * 1886 * * 1875 * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 2181 0 0 G 129 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 129 0 * * * * * * 2181 0 0 D 130 * * 880 * * 1130 * * * * * * * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 2181 0 0 I 131 * * * * * * * 1018 * * * * * * * * * 982 * * 131 455 1886 * 2322 322 * * 2181 1000 0 D 132 * * 1875 * * * * * * * * 459 * * * * * * * * 132 0 * * * * * * 2181 0 0 Y 133 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 133 0 * * * * * * 2181 0 0 S 134 * * * * * * * * * * * * * * * 455 * 1886 * * 134 0 * * * * * * 2181 0 0 K 135 * * * 1886 * * * * 1018 * * * * * 2086 * * * * * 135 0 * * * * * * 2181 0 0 I 136 * * * * * * * 1018 * * * * * 1886 * * * 2086 * * 136 0 * * * * * * 2181 0 0 V 137 2177 * * * * * * * * * * * * * * * 2086 880 * * 137 0 * * * * * * 2181 0 0 V 138 * * * * * * * 1886 * 1130 * * * * * * * 1875 * * 138 0 * * * * * * 2181 0 0 E 139 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 139 0 * * * * * * 2181 0 0 I 140 * * * * * * * 1875 * * 459 * * * * * * * * * 140 0 * * * * * * 2181 0 0 L 141 459 * * * * * * * * 1875 * * * * * * * * * * 141 0 * * * * * * 2181 0 0 I 142 * * * * * * * 880 * * * * * * * * * 1130 * * 142 0 * * * * * * 2181 0 0 S 143 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 143 0 * * * * * * 2181 0 0 E 144 * * * 990 * * * * 1010 * * * * * * * * * * * 144 0 * * 0 * * * 1565 0 0 //