HHsearch 1.5 NAME c7ny0A_ FAM FILE c7ny0A_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c7ny0A_.a3m DATE Sat Oct 9 09:38:41 2021 LENG 121 match states, 121 columns in multiple alignment FILT 5 out of 9 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.8 EVD 0.4282 -0.5665 SEQ >ss_dssp CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSCCSCGGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTCSSCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSCSSHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >sa_dssp EDECBDEBDECBDDBEDDDEECDECCEEDCEBCDDCDECBCDACECBDEBDEDEEEECDEECCEDBDECBEDBBECBDDCDEECDEEDEEDEEBDCBEEC BDEBDDCCEEADEDBEEDDDE >ss_pred CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >ss_conf 9369999999999999999999510733457899999878898899999998410001345555555220400013211005653430122457889999 999999999999999986419 >Consensus lxxclsqixxGLxxYqxxLxalxgisPelxpxldxLqLDxAdfattixQqMExxxxxxxxxxxlxxlxxxxxxQxxxxaxxxxfaxxfqxxxrxaggvxi aaxlqxFLExAyxxLrhLAxx >c7ny0A_ LAAALAEIYKGLAEYQARLKSLEGISPELGPALDALRLDMADFATTMAQAMEEGLDSLPQSFLLKALEQIRKIQADAAALREKLAATYKGNDRAAAAVEI AAQLEAFLEKAYQILRHLAAA >UniRef50_B4DNY7(61-162:164) cDNA FLJ52903, moderately similar to Granulocyte colony-stimulating factor n=2 Tax=Homo sapiens RepID=B4DNY7_HUMAN E=6e-29 s/c=1.25 id=50% cov=85% LAGCLSQLHSGLFLYQGLLQALEGISPELGPTLDTLQLDVADFATTIWQQMEE-------------LGMAPALQPTQGAM-PAFASAFQ---RRAGGVLV ASHLQSFLEVSYRVLRHLA-- >UniRef50_P09920(108-208:208) Granulocyte colony-stimulating factor n=15 Tax=Theria RepID=CSF3_MOUSE E=5e-26 s/c=1.17 id=40% cov=84% -TQCLSQLHSGLCLYQGLLQALSGISPALAPTLDLLQLDVANFATTIWQQMEN----------LGVAPTVQPTQSAMPAFTSAF-------QRRAGGVLA ISYLQGFLETARLALHHLA-- >UniRef50_Q8MKE0(24-125:127) Granulocyte colony-stimulating factor n=2 Tax=Mammalia RepID=Q8MKE0_HORSE E=2e-24 s/c=1.11 id=43% cov=85% LTGCLSQLHSGLLLYQGLLQALAGISPELAPTLDMLQLDVTDFATNIWQQMED-------------LGVAPVVQPTHGPM-PTFASAFQ---RRAGGVLV ASNLQRFLELAYRGLRYLA-- >UniRef50_P13854(99-199:201) Myelomonocytic growth factor n=2 Tax=Gallus gallus RepID=MGF_CHICK E=2e-24 s/c=1.12 id=25% cov=84% ---CFTQIRAGLHAYHDSLGAVLRLLPNHTTLVETLQLDAANLSSNIQQQMEDLGLDTV---------TLPAEQRSPP---PTFSGPFQ---QQVGGFFI LANFQRFLETAYRALRHLA-- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * L 1 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1445 0 0 A 2 788 * * * * * * * * * * * * * * * 1248 * * * 2 0 * * * * * * 1616 0 0 A 3 1336 * * * * 1402 * * * * * * * 2150 * * * * * * 3 0 * * * * * * 1616 0 0 A 4 1683 538 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1934 0 0 L 5 * * * * 2053 * * * * 398 * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1934 0 0 A 6 1683 * * * * * * * * * * * * * * 1160 2053 * * * 6 0 * * * * * * 1934 0 0 E 7 * * * 1683 * * * * * * * * * 538 * * * * * * 7 0 * * * * * * 1934 0 0 I 8 * * * * * * * 856 * 1160 * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1934 0 0 Y 9 * * * * * * 1160 * * * * * * * 2053 * * * * 1683 9 0 * * * * * * 1934 0 0 K 10 2053 * * * * * * * 1683 * * * * * * 1160 * * * * 10 0 * * * * * * 1934 0 0 G 11 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1934 0 0 L 12 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1934 0 0 A 13 1683 2531 * * 2907 * 2053 * * 2824 * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1934 0 0 E 14 2053 * * 1683 * * * * * 1160 * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1934 0 0 Y 15 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 15 0 * * * * * * 1934 0 0 Q 16 * * * * * * 2053 * * * * * * 398 * * * * * * 16 0 * * * * * * 1934 0 0 A 17 1683 * 2053 * * 1160 * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1934 0 0 R 18 * * * * * * * * * 1160 * * * * 1683 2053 * * * * 18 0 * * * * * * 1934 0 0 L 19 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1934 0 0 K 20 * * * * * 2053 * * 1683 * * * * 1160 * * * * * * 20 0 * * * * * * 1934 0 0 S 21 538 * * * * * * * * * * * * * * 1683 * * * * 21 0 * * * * * * 1934 0 0 L 22 * * * * * * * * * 398 * * * * * * * 2053 * * 22 0 * * * * * * 1934 0 0 E 23 2824 * * 1169 * * * * * 2053 * * * * * 2531 * * * * 23 0 * * * * * * 1934 0 0 G 24 * * * * * 398 * * * * * * * * 2053 * * * * * 24 0 * * * * * * 1934 0 0 I 25 * * * * * * * 398 * 2053 * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1934 0 0 S 26 * * * * * * * * * 2053 * * * * * 398 * * * * 26 0 * * * * * * 1934 0 0 P 27 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1934 0 0 E 28 2531 * * 771 * * * * * * * 2053 * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1934 0 0 L 29 * * * * * * 2053 * * 398 * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1934 0 0 G 30 1670 * * * * 1169 * * * * * * * * * * 2053 * * * 30 0 * * * * * * 1934 0 0 P 31 * * * * * * * * * * * * 398 * * * 2053 * * * 31 0 * * * * * * 1934 0 0 A 32 1683 * * * * * * * * 2053 * * * * * * 1160 * * * 32 0 * * * * * * 1934 0 0 L 33 * * * * * * * * * 398 * * * * * * * 2053 * * 33 0 * * * * * * 1934 0 0 D 34 * * 398 2053 * * * * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1934 0 0 A 35 1683 * * * * * * * * 2531 2824 * * * * * 1418 * * * 35 0 * * * * * * 1934 0 0 L 36 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1934 0 0 R 37 * * * * * * * * * * * * * 538 1683 * * * * * 37 0 * * * * * * 1934 0 0 L 38 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1934 0 0 D 39 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1934 0 0 M 40 2053 * * * * * * * * * 1683 * * * * * * 1160 * * 40 0 * * * * * * 1934 0 0 A 41 220 * * * * * * * * * * * * * * * 2824 * * * 41 0 * * * * * * 1934 0 0 D 42 * * 771 * * * * * * * * 1272 * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1934 0 0 F 43 * * * * 398 * * * * 2053 * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1934 0 0 A 44 398 * * * * * * * * * * * * * * 2053 * * * * 44 0 * * * * * * 1934 0 0 T 45 * * * * * * * * * * * * * * * 2053 398 * * * 45 0 * * * * * * 1934 0 0 T 46 * * * * * * * * * * * 1388 * * * * 695 * * * 46 0 * * * * * * 1934 0 0 M 47 * * * * * * * 538 * * 1683 * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1934 0 0 A 48 1683 * * * * * * * * * * * * 2053 * * * * 1160 * 48 0 * * * * * * 1934 0 0 Q 49 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 49 0 * * * * * * 1934 0 0 A 50 1683 * * * * * * * * * * * * 538 * * * * * * 50 0 * * * * * * 1934 0 0 M 51 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1934 0 0 E 52 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1934 0 0 E 53 * * 1388 1169 * * * * * * * 2531 * * * * * * * * 53 856 * 1160 * * * * 1934 0 0 G 54 * * * * * 825 * * * 1200 * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * 0 1557 0 1319 L 55 * * * * * 1200 * * * 825 * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * 0 1557 0 1319 D 56 * * 825 * * * * * * 1200 * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * 0 1557 0 1319 S 57 * * 1200 * * * * * * * * * * * * 825 * * * * 57 0 * * * * * 0 1557 0 1319 L 58 * * * * * * * * * 825 * * * * * * 1200 * * * 58 0 * * * * * 0 1557 0 1319 P 59 * * * * * * * * * * * * 825 * * * * 1200 * * 59 825 * 1200 * * * 0 1557 0 1319 Q 60 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 60 0 * * * * * 0 1000 0 1612 S 61 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 61 0 * * * * * 0 1000 0 1612 F 62 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * 0 1000 0 1612 L 63 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 63 0 * * * * 1961 428 1000 0 1612 L 64 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * 0 1415 0 1520 K 65 * * * * * 1224 * * 806 * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * 0 1415 0 1520 A 66 806 * * * * * * * * * * * * * * * * 1224 * * 66 0 * * * * 780 1260 1415 0 1520 L 67 2150 * * * * * * * * 368 * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * 0 1616 0 1000 E 68 * * * 1336 * 1402 * * * * * * 2150 * * * * * * * 68 0 * * * * 0 * 1616 0 1000 Q 69 * * * * * * * * * * 2907 * * 1683 * * 1272 2824 * * 69 0 * * * * * * 1934 0 0 I 70 1865 * * * * * * 1683 * 2053 * * * * * * * 2531 * * 70 0 * * * * * * 1934 0 0 R 71 * * * * * * * * * * * * 956 2531 1683 * * * * * 71 0 * * * * * * 1934 0 0 K 72 1418 * * * * * * * 1683 * * * 2531 * * * * 2824 * * 72 0 * * * * * * 1934 0 0 I 73 * * * 2053 * * * 1683 * 2907 * * * * * * 2531 2824 * * 73 0 * * * * * * 1934 0 0 Q 74 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 74 0 * * * * * * 1934 0 0 A 75 1683 * * * * * * * * * * * 1865 * 2053 2531 * * * * 75 0 * * * * * * 1934 0 0 D 76 2531 * 1683 * * * * * * * * * * * * 2053 1865 * * * 76 0 * * * * * * 1934 0 0 A 77 1683 * * * * * 2824 * * * 2531 * 2053 2907 * * * * * * 77 0 * * * * * * 1934 0 0 A 78 1683 * * * * 1865 * * * * * * 1272 * * * * * * * 78 398 * 2053 * * * * 1934 0 0 A 79 314 * * * * * * * * * * * 2354 * * * * * * * 79 0 * * * * * 0 1616 0 1000 L 80 * * * * 2150 * * * * 1336 1402 * * * * * * * * * 80 686 * 1402 * * * 0 1616 0 1000 R 81 * * * * * * * * * * * * * * 806 * 1224 * * * 81 0 * * * * 0 * 1415 0 1520 E 82 * * * 1683 * * * * * * * * 956 * * 2531 * * * * 82 0 * * * * * * 1934 0 0 K 83 1707 * * * * * * * 1683 * * * * * * * 1388 * * * 83 0 * * * * * * 1934 0 0 L 84 * * * * 538 * * * * 1683 * * * * * * * * * * 84 274 * 2531 * * * * 1934 0 0 A 85 461 * * * * * * * * * * * * * * 1869 * * * * 85 0 * * * * * 0 1794 0 1000 A 86 1437 * * * * 1869 * * * * * * * * * 1486 * * * * 86 0 * * * * * 0 1794 0 1000 T 87 1486 * * * * * * * * * * * 1869 * * * 1437 * * * 87 0 * * * * * 0 1794 0 1000 Y 88 * * * * 665 * * * * * * * * * * * * * * 1437 88 0 * * * * * 0 1794 0 1000 K 89 * * * * * * * * 1437 * * * * 665 * * * * * * 89 1437 * 665 * * * 0 1794 0 1000 G 90 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * 0 1000 0 1612 N 91 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 91 0 * * * * 1961 428 1000 0 1612 D 92 * * 806 * * * * * * * * * * 1224 * * * * * * 92 0 * * * * 0 * 1415 0 1520 R 93 * * * * * * * * * * * * * 2053 398 * * * * * 93 0 * * * * * * 1934 0 0 A 94 1683 * * * * * * * * * * * * 2053 1160 * * * * * 94 0 * * * * * * 1934 0 0 A 95 398 * * * * * * * * * * * * * * * * 2053 * * 95 0 * * * * * * 1934 0 0 A 96 1683 * * * * 538 * * * * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1934 0 0 A 97 1683 * * * * 538 * * * * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1934 0 0 V 98 * * * * 2053 * * * * * * * * * * * * 398 * * 98 0 * * * * * * 1934 0 0 E 99 * * * 1683 2053 * * * * 1160 * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1934 0 0 I 100 2531 * * * * * * 856 * * * * * * * * * 1865 * * 100 0 * * * * * * 1934 0 0 A 101 771 * * * * * * 2531 * 2053 * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1934 0 0 A 102 856 * * * * * * * * * * * * * * 1160 * * * * 102 0 * * * * * * 1934 0 0 Q 103 * * * * * * 2907 * * * * 1388 * 1683 * * * * * 2531 103 0 * * * * * * 1934 0 0 L 104 * * * * 2053 * * * * 398 * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1934 0 0 E 105 * * * 1683 * * * * * * * * * 538 * * * * * * 105 0 * * * * * * 1934 0 0 A 106 1683 * * * * 2531 * * * * * * * * 1388 2907 * * * * 106 0 * * * * * * 1934 0 0 F 107 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1934 0 0 L 108 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1934 0 0 E 109 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1934 0 0 K 110 * * * * * * * * 1683 2824 * * * * * * 1272 2907 * * 110 0 * * * * * * 1934 0 0 A 111 206 * * * * * * * * * * * * * * 2907 * * * * 111 0 * * * * * * 1934 0 0 Y 112 * * * * * * * * * * * * * * 2531 * * * * 274 112 0 * * * * * * 1934 0 0 Q 113 * * * * * * * * * 2531 * * * 1683 956 * * * * * 113 0 * * * * * * 1934 0 0 I 114 1272 * * * * 2824 * 1683 * * * * * * * * * 2907 * * 114 0 * * * * * * 1934 0 0 L 115 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1934 0 0 R 116 * * * * * * 2531 * * * * * * * 274 * * * * * 116 0 * * * * * * 1934 0 0 H 117 * * * * * * 220 * * * * * * * * * * * * 2824 117 0 * * * * * * 1934 0 0 L 118 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1934 0 0 A 119 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1934 0 0 A 120 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1000 0 0 A 121 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 121 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //