HHsearch 1.5 NAME c7ekoO_ FAM FILE c7ekoO_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c7ekoO_.a3m DATE Sat Oct 23 08:28:08 2021 LENG 162 match states, 162 columns in multiple alignment FILT 1 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.4482 1.4250 SEQ >ss_dssp CGGGSSSHHHHTSCBCHHHHHHHHHHHHHHHHTTCCEECHHHHHHHHHHCTTSHHHHHHHHHTCCCHHHHHHHHHHHHHTTSCCCCCSCCSSCEECHHHH HHHHHHHHHHHHTTCSSBCHHHHHHHHHTTTTTTTTCGGGTCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCC >sa_dssp EEEDDCECDCEEDECBECACDABDBABDCADECDCBDACABBAAAAAADCDEBCAADBADEBCBEEBECACDDACEBAEEEDCCEEEDEDEECECBDDAC EBCCCADDBBEDBECEDBCACBAAABABEDCBACECBDECEADCDDACECBBEDCEDEBEEE >ss_pred CCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHCCCHHEECCCCHHHHHHHHHHHHCHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCC >ss_conf 9754470233330102678889999976553022023777999996653100229999985083366545887888763105777013323212100223 21110012000016320002678998750003776432455349999998764148602484 >Consensus atataapselddvgvsaaaesiiqyainfarasetyevhswmvlmgilkyetctaakilkslgledlygawnevlwalnvcdglqprsfvtdikfadraf kvitaasdfavwhgkdkmysedvlmalaaggvledlfpdlnlsfervrkavekesgrryqlp >c7ekoO_ ATATAAPSELDDVGVSAAAESIIQYAINFARASETYEVHSWMVLMGILKYETCTAAKILKSLGLEDLYGAWNEVLWALNVCDGLQPRSFVTDIKFADRAF KVITAASDFAVWHGKDKMYSEDVLMALAAGGVLEDLFPDLNLSFERVRKAVEKESGRRYQLP # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * A 1 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 T 2 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 A 3 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 T 4 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 A 5 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 A 6 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 P 7 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 S 8 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 E 9 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 L 10 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 D 11 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 D 12 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 V 13 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 G 14 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 V 15 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 S 16 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 A 17 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 A 18 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 A 19 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 E 20 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 S 21 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 I 22 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 I 23 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 24 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 25 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 25 0 * * * * * * 1000 0 0 A 26 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 I 27 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 N 28 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 F 29 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 A 30 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 R 31 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 A 32 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 S 33 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 E 34 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 T 35 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 36 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 36 0 * * * * * * 1000 0 0 E 37 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 V 38 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 H 39 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 S 40 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 W 41 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 M 42 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 V 43 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 L 44 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 M 45 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 G 46 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 I 47 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 L 48 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 K 49 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 50 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 50 0 * * * * * * 1000 0 0 E 51 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 T 52 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 C 53 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 T 54 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 A 55 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 A 56 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 K 57 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 I 58 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 L 59 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 K 60 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 S 61 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 61 0 * * * * * * 1000 0 0 L 62 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1000 0 0 G 63 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1000 0 0 L 64 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 E 65 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1000 0 0 D 66 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 L 67 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 68 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 68 0 * * * * * * 1000 0 0 G 69 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 A 70 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1000 0 0 W 71 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 71 0 * * * * * * 1000 0 0 N 72 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 E 73 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1000 0 0 V 74 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 74 0 * * * * * * 1000 0 0 L 75 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1000 0 0 W 76 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 76 0 * * * * * * 1000 0 0 A 77 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1000 0 0 L 78 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1000 0 0 N 79 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1000 0 0 V 80 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 80 0 * * * * * * 1000 0 0 C 81 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1000 0 0 D 82 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1000 0 0 G 83 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1000 0 0 L 84 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 85 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 85 0 * * * * * * 1000 0 0 P 86 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1000 0 0 R 87 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 87 0 * * * * * * 1000 0 0 S 88 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 88 0 * * * * * * 1000 0 0 F 89 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1000 0 0 V 90 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 90 0 * * * * * * 1000 0 0 T 91 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 91 0 * * * * * * 1000 0 0 D 92 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1000 0 0 I 93 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1000 0 0 K 94 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1000 0 0 F 95 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1000 0 0 A 96 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1000 0 0 D 97 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1000 0 0 R 98 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 98 0 * * * * * * 1000 0 0 A 99 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1000 0 0 F 100 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1000 0 0 K 101 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1000 0 0 V 102 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 102 0 * * * * * * 1000 0 0 I 103 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1000 0 0 T 104 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 104 0 * * * * * * 1000 0 0 A 105 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1000 0 0 A 106 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1000 0 0 S 107 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 107 0 * * * * * * 1000 0 0 D 108 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1000 0 0 F 109 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1000 0 0 A 110 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1000 0 0 V 111 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 111 0 * * * * * * 1000 0 0 W 112 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 112 0 * * * * * * 1000 0 0 H 113 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1000 0 0 G 114 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1000 0 0 K 115 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1000 0 0 D 116 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1000 0 0 K 117 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1000 0 0 M 118 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 119 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 119 0 * * * * * * 1000 0 0 S 120 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 120 0 * * * * * * 1000 0 0 E 121 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1000 0 0 D 122 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1000 0 0 V 123 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 123 0 * * * * * * 1000 0 0 L 124 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1000 0 0 M 125 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 125 0 * * * * * * 1000 0 0 A 126 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1000 0 0 L 127 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 127 0 * * * * * * 1000 0 0 A 128 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1000 0 0 A 129 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 129 0 * * * * * * 1000 0 0 G 130 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 1000 0 0 G 131 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 131 0 * * * * * * 1000 0 0 V 132 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 132 0 * * * * * * 1000 0 0 L 133 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 1000 0 0 E 134 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 134 0 * * * * * * 1000 0 0 D 135 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 1000 0 0 L 136 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 136 0 * * * * * * 1000 0 0 F 137 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 137 0 * * * * * * 1000 0 0 P 138 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 138 0 * * * * * * 1000 0 0 D 139 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 139 0 * * * * * * 1000 0 0 L 140 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 140 0 * * * * * * 1000 0 0 N 141 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 141 0 * * * * * * 1000 0 0 L 142 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 142 0 * * * * * * 1000 0 0 S 143 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 143 0 * * * * * * 1000 0 0 F 144 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 144 0 * * * * * * 1000 0 0 E 145 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 145 0 * * * * * * 1000 0 0 R 146 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 146 0 * * * * * * 1000 0 0 V 147 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 147 0 * * * * * * 1000 0 0 R 148 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 148 0 * * * * * * 1000 0 0 K 149 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 149 0 * * * * * * 1000 0 0 A 150 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 150 0 * * * * * * 1000 0 0 V 151 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 151 0 * * * * * * 1000 0 0 E 152 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 152 0 * * * * * * 1000 0 0 K 153 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 153 0 * * * * * * 1000 0 0 E 154 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 154 0 * * * * * * 1000 0 0 S 155 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 155 0 * * * * * * 1000 0 0 G 156 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 156 0 * * * * * * 1000 0 0 R 157 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 157 0 * * * * * * 1000 0 0 R 158 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 158 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 159 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 159 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 160 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 160 0 * * * * * * 1000 0 0 L 161 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 161 0 * * * * * * 1000 0 0 P 162 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 162 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //