HHsearch 1.5 NAME c7d1lC_ FAM FILE c7d1lC_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c7d1lC_.a3m DATE Sat Aug 28 08:27:32 2021 LENG 83 match states, 83 columns in multiple alignment FILT 1 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.4736 2.1757 SEQ >ss_dssp CGGGEEEEECSCTTCCHHHHHHHTTTSCEEEEEEEETTEEEEEESSHHHHHHHHHHHTTCEEETTEECEEECSCCCCCSSCCC >sa_dssp EEDCDBEACCACDECEDEBACECAEECECDDCEEEDEDCACACADCDECADDACEDBDDDEDDEECEAEADCECEDEDEEEEE >ss_pred CCCCCEEEECCCCCCHHCCHHHHCCCEEECCEEECCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCCC >ss_conf 97650475067751011025643682233334504664157764010568888751374211545504675676428663469 >Consensus xqenxlkisgypgxlntfgiaqlltpyrvngitxtgaqsavvalenkfqvyqavqdfngkkldrnhklqvsslvvsspavple >c7d1lC_ XQENXLKISGYPGXLNTFGIAQLLTPYRVNGITXTGAQSAVVALENKFQVYQAVQDFNGKKLDRNHKLQVSSLVVSSPAVPLE # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * X 1 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 1 * * * * * * * 0 0 0 Q 2 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 E 3 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 N 4 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 X 5 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 5 * * * * * * * 1000 0 0 L 6 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 K 7 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 I 8 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 S 9 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 G 10 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 11 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 11 0 * * * * * * 1000 0 0 P 12 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 G 13 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 X 14 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 14 * * * * * * * 1000 0 0 L 15 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 N 16 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 T 17 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 F 18 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 G 19 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 I 20 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 A 21 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 22 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 L 23 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 L 24 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 T 25 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 P 26 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 27 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 27 0 * * * * * * 1000 0 0 R 28 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 V 29 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 N 30 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 G 31 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 I 32 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 T 33 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 X 34 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 34 * * * * * * * 1000 0 0 T 35 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 G 36 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 A 37 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 38 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 S 39 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 A 40 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 V 41 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 V 42 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 A 43 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 L 44 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 E 45 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 N 46 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 K 47 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 F 48 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 49 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 V 50 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 51 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 51 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 52 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 A 53 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 V 54 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 55 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 D 56 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 F 57 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 N 58 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 G 59 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 K 60 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 K 61 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1000 0 0 L 62 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1000 0 0 D 63 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1000 0 0 R 64 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 N 65 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1000 0 0 H 66 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 K 67 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 L 68 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 69 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 V 70 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 70 0 * * * * * * 1000 0 0 S 71 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 71 0 * * * * * * 1000 0 0 S 72 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 L 73 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1000 0 0 V 74 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 74 0 * * * * * * 1000 0 0 V 75 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 75 0 * * * * * * 1000 0 0 S 76 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 76 0 * * * * * * 1000 0 0 S 77 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 77 0 * * * * * * 1000 0 0 P 78 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1000 0 0 A 79 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1000 0 0 V 80 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 80 0 * * * * * * 1000 0 0 P 81 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1000 0 0 L 82 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1000 0 0 E 83 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 83 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //