HHsearch 1.5 NAME c7chkB_ FAM FILE c7chkB_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c7chkB_.a3m DATE Sat Nov 7 08:39:40 2020 LENG 147 match states, 147 columns in multiple alignment FILT 1 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.3825 -2.4377 SEQ >ss_dssp CCCCSCEEEEECCTTSSSSSCCEEEECSSSCGGGCCCCSHHHHHHHTCSEEBCCEEEEEEEEESSGGGCCSCCEEEEECCEEEECCSSEEEEEECCCSSS SCEECSCCCCSCEEEECCCCSSEEEEEEEEECCSSCBCCSCCCCCCC >sa_dssp DECEECCCBCDBEEEDBDEDDDCDBCABABCCEDEECDCEAADDABCBBDADABACACADBDBEEEEBCEDDACACCDEEEDDECDCCCADBEBDBECED EDBDACECEDABCADADABDDDBDCACACADBBEECDCCEECEDEEE >ss_pred CEEEEHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCEEEEEECCCEEEEEECCCEEEEEEEEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEEEEE EEEEEEECCCCCEEEEEECCCCCCEEEEEEECCCCCCCCEEEEEECC >ss_conf 9243053413344400265846888507310233402440221212423665789999999983343024557878876876517815779984000111 24334302547269998316774058999735986660114654059 >Consensus sfllnyshcgtlvesslnkggmwcvpvspvnlaaykthnwlhfmasttaywrgtlhyqmrvtykdrnaacrnlvafyttissvmgdsfsvditvpflipt cylqtirgscngciyfhlptksatsvqlwvrpgqdfdfarfrllkag >c7chkB_ SFLLNYSHCGTLVESSLNKGGMWCVPVSPVNLAAYKTHNWLHFMASTTAYWRGTLHYQMRVTYKDRNAACRNLVAFYTTISSVMGDSFSVDITVPFLIPT CYLQTIRGSCNGCIYFHLPTKSATSVQLWVRPGQDFDFARFRLLKAG # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * S 1 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 F 2 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 L 3 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 L 4 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 N 5 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 6 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 6 0 * * * * * * 1000 0 0 S 7 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 H 8 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 C 9 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 G 10 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 T 11 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 L 12 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 V 13 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 E 14 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 S 15 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 S 16 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 L 17 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 N 18 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 K 19 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 G 20 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 G 21 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 M 22 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 W 23 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 C 24 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 V 25 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 P 26 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 V 27 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 S 28 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 P 29 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 V 30 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 N 31 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 L 32 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 A 33 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 A 34 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 35 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 35 0 * * * * * * 1000 0 0 K 36 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 T 37 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 H 38 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 N 39 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 W 40 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 L 41 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 H 42 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 F 43 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 M 44 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 A 45 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 S 46 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 T 47 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 T 48 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 A 49 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 50 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 50 0 * * * * * * 1000 0 0 W 51 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 R 52 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 G 53 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 T 54 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 L 55 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 H 56 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 57 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 57 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 58 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 M 59 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 R 60 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 V 61 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 61 0 * * * * * * 1000 0 0 T 62 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 62 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 63 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 63 0 * * * * * * 1000 0 0 K 64 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 D 65 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1000 0 0 R 66 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 N 67 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 A 68 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 A 69 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 C 70 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1000 0 0 R 71 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 71 0 * * * * * * 1000 0 0 N 72 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 L 73 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1000 0 0 V 74 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 74 0 * * * * * * 1000 0 0 A 75 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1000 0 0 F 76 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 77 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 77 0 * * * * * * 1000 0 0 T 78 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 78 0 * * * * * * 1000 0 0 T 79 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 79 0 * * * * * * 1000 0 0 I 80 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1000 0 0 S 81 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 81 0 * * * * * * 1000 0 0 S 82 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 82 0 * * * * * * 1000 0 0 V 83 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 83 0 * * * * * * 1000 0 0 M 84 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1000 0 0 G 85 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1000 0 0 D 86 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1000 0 0 S 87 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 87 0 * * * * * * 1000 0 0 F 88 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1000 0 0 S 89 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 89 0 * * * * * * 1000 0 0 V 90 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 90 0 * * * * * * 1000 0 0 D 91 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1000 0 0 I 92 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1000 0 0 T 93 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 93 0 * * * * * * 1000 0 0 V 94 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 94 0 * * * * * * 1000 0 0 P 95 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1000 0 0 F 96 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1000 0 0 L 97 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1000 0 0 I 98 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1000 0 0 P 99 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1000 0 0 T 100 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 100 0 * * * * * * 1000 0 0 C 101 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 102 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 102 0 * * * * * * 1000 0 0 L 103 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 104 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 104 0 * * * * * * 1000 0 0 T 105 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 105 0 * * * * * * 1000 0 0 I 106 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1000 0 0 R 107 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 107 0 * * * * * * 1000 0 0 G 108 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1000 0 0 S 109 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 109 0 * * * * * * 1000 0 0 C 110 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1000 0 0 N 111 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1000 0 0 G 112 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1000 0 0 C 113 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1000 0 0 I 114 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 115 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 115 0 * * * * * * 1000 0 0 F 116 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1000 0 0 H 117 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1000 0 0 L 118 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1000 0 0 P 119 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1000 0 0 T 120 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 120 0 * * * * * * 1000 0 0 K 121 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1000 0 0 S 122 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 122 0 * * * * * * 1000 0 0 A 123 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 1000 0 0 T 124 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 124 0 * * * * * * 1000 0 0 S 125 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 125 0 * * * * * * 1000 0 0 V 126 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 126 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 127 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 127 0 * * * * * * 1000 0 0 L 128 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1000 0 0 W 129 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 129 0 * * * * * * 1000 0 0 V 130 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 130 0 * * * * * * 1000 0 0 R 131 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 131 0 * * * * * * 1000 0 0 P 132 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 132 0 * * * * * * 1000 0 0 G 133 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 134 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 134 0 * * * * * * 1000 0 0 D 135 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 1000 0 0 F 136 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 136 0 * * * * * * 1000 0 0 D 137 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 137 0 * * * * * * 1000 0 0 F 138 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 138 0 * * * * * * 1000 0 0 A 139 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 139 0 * * * * * * 1000 0 0 R 140 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 140 0 * * * * * * 1000 0 0 F 141 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 141 0 * * * * * * 1000 0 0 R 142 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 142 0 * * * * * * 1000 0 0 L 143 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 143 0 * * * * * * 1000 0 0 L 144 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 144 0 * * * * * * 1000 0 0 K 145 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 145 0 * * * * * * 1000 0 0 A 146 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 146 0 * * * * * * 1000 0 0 G 147 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 147 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //