HHsearch 1.5 NAME c7bq9B_ FAM FILE c7bq9B_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c7bq9B_.a3m DATE Sat Jun 27 08:38:46 2020 LENG 153 match states, 153 columns in multiple alignment FILT 1 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.4289 0.7240 SEQ >ss_dssp CCCCSCSSBSSHHHHHHHHCHHHHHHHHHTTCGGGGSCCSSSCCEEEEEECSHHHHHHHHHHHTSSCTHHHHHHHHTTEESSCCCSGGGSCSSCBCTTCB BCCEEEECSSCEEETTTBCEEEECTTCCBCTTCCEEEEEEEESBCCCSSCBCC >sa_dssp EDEEDDEDADDACCAAECDBEDACDAADDCEBDECADEDEEBDAAAAABAEDDECCDEBCECBECEDDEDACDCACBBAACCCACDBEDBEDDBAADCCB CBDCDEEEEECACADDCEABACCBEDBECDEEDDBBBACADDCDBADEDEECE >ss_pred CCCCHHHHHHHHEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHEEEECCCHHHHCCCCCCCEEE EEEEEECCCCEEEEECCCEEEEEHHHCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCC >ss_conf 9730266540011202212831899974122203442112105416883351046789874102469789998777410102117833411233340002 78985212445786169699986210873887527999971688666699999 >Consensus pwpsnmkqfckisvwlqqhdpdlleiinnlcmlgnlsaakykhgvtfiypkqakirdeikkhaysndpsqaiktleslilpfyiptpaeftgeigsytgv klevekteankvilkngeavlvpaadfkpfpdrrlavwimesgsmplegppyk >c7bq9B_ PWPSNMKQFCKISVWLQQHDPDLLEIINNLCMLGNLSAAKYKHGVTFIYPKQAKIRDEIKKHAYSNDPSQAIKTLESLILPFYIPTPAEFTGEIGSYTGV KLEVEKTEANKVILKNGEAVLVPAADFKPFPDRRLAVWIMESGSMPLEGPPYK # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * P 1 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 W 2 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 P 3 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 S 4 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 N 5 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 M 6 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 K 7 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 8 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 F 9 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 C 10 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 K 11 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 I 12 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 S 13 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 V 14 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 W 15 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 L 16 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 17 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 18 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 H 19 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 D 20 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 P 21 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 D 22 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 L 23 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 L 24 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 E 25 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 I 26 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 I 27 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 N 28 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 N 29 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 L 30 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 C 31 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 M 32 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 L 33 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 G 34 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 N 35 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 L 36 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 S 37 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 A 38 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 A 39 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 K 40 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 41 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 41 0 * * * * * * 1000 0 0 K 42 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 H 43 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 G 44 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 V 45 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 T 46 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 F 47 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 I 48 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 49 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 49 0 * * * * * * 1000 0 0 P 50 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 K 51 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 52 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 A 53 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 K 54 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 I 55 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 R 56 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 D 57 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 E 58 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 I 59 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 K 60 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 K 61 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1000 0 0 H 62 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1000 0 0 A 63 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 64 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 64 0 * * * * * * 1000 0 0 S 65 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 65 0 * * * * * * 1000 0 0 N 66 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 D 67 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 P 68 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 S 69 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 70 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 70 0 * * * * * * 1000 0 0 A 71 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1000 0 0 I 72 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 K 73 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1000 0 0 T 74 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 74 0 * * * * * * 1000 0 0 L 75 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1000 0 0 E 76 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1000 0 0 S 77 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 77 0 * * * * * * 1000 0 0 L 78 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1000 0 0 I 79 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1000 0 0 L 80 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1000 0 0 P 81 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1000 0 0 F 82 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 83 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 83 0 * * * * * * 1000 0 0 I 84 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1000 0 0 P 85 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1000 0 0 T 86 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 86 0 * * * * * * 1000 0 0 P 87 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1000 0 0 A 88 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1000 0 0 E 89 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1000 0 0 F 90 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1000 0 0 T 91 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 91 0 * * * * * * 1000 0 0 G 92 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1000 0 0 E 93 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1000 0 0 I 94 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1000 0 0 G 95 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1000 0 0 S 96 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 96 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 97 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 97 0 * * * * * * 1000 0 0 T 98 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 98 0 * * * * * * 1000 0 0 G 99 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1000 0 0 V 100 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 100 0 * * * * * * 1000 0 0 K 101 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1000 0 0 L 102 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1000 0 0 E 103 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1000 0 0 V 104 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 104 0 * * * * * * 1000 0 0 E 105 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1000 0 0 K 106 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1000 0 0 T 107 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 107 0 * * * * * * 1000 0 0 E 108 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1000 0 0 A 109 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1000 0 0 N 110 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1000 0 0 K 111 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1000 0 0 V 112 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 112 0 * * * * * * 1000 0 0 I 113 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1000 0 0 L 114 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1000 0 0 K 115 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1000 0 0 N 116 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1000 0 0 G 117 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1000 0 0 E 118 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1000 0 0 A 119 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1000 0 0 V 120 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 120 0 * * * * * * 1000 0 0 L 121 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1000 0 0 V 122 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 122 0 * * * * * * 1000 0 0 P 123 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 123 0 * * * * * * 1000 0 0 A 124 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1000 0 0 A 125 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 125 0 * * * * * * 1000 0 0 D 126 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1000 0 0 F 127 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 127 0 * * * * * * 1000 0 0 K 128 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1000 0 0 P 129 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 129 0 * * * * * * 1000 0 0 F 130 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 1000 0 0 P 131 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 131 0 * * * * * * 1000 0 0 D 132 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 132 0 * * * * * * 1000 0 0 R 133 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 133 0 * * * * * * 1000 0 0 R 134 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 134 0 * * * * * * 1000 0 0 L 135 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 1000 0 0 A 136 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 136 0 * * * * * * 1000 0 0 V 137 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 137 0 * * * * * * 1000 0 0 W 138 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 138 0 * * * * * * 1000 0 0 I 139 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 139 0 * * * * * * 1000 0 0 M 140 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 140 0 * * * * * * 1000 0 0 E 141 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 141 0 * * * * * * 1000 0 0 S 142 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 142 0 * * * * * * 1000 0 0 G 143 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 143 0 * * * * * * 1000 0 0 S 144 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 144 0 * * * * * * 1000 0 0 M 145 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 145 0 * * * * * * 1000 0 0 P 146 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 146 0 * * * * * * 1000 0 0 L 147 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 147 0 * * * * * * 1000 0 0 E 148 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 148 0 * * * * * * 1000 0 0 G 149 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 149 0 * * * * * * 1000 0 0 P 150 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 150 0 * * * * * * 1000 0 0 P 151 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 151 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 152 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 152 0 * * * * * * 1000 0 0 K 153 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 153 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //