HHsearch 1.5 NAME c7a23m_ FAM FILE c7a23m_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c7a23m_.a3m DATE Sat Oct 31 08:31:07 2020 LENG 69 match states, 69 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.5 EVD 0.4142 -0.1821 SEQ >ss_dssp CTTTTTTTSTTSCCCTTHHHHHHHHHHHHHHHTTSSSCCCCCSSSTTCCSHHHHHHHTTTSSCSSTTTC >sa_dssp EEEEDEEDEEEEEEEDDEEDEECEDEDEDEEDEDEEEEEEECEEEDEDDEDCECEECDEEEEBEEEEEE >ss_pred CHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCHHCCC >ss_conf 957999999998329478889999999999999999999740766653343322110676644100029 >Consensus xmefxexxixrxmenpxerdxkxrxhiyxxxexcxkxkexwaxpixpygxwxxxxxnxxxxxdxxxsxx >c7a23m_ IMEFAENLVLRLMENPEERDRKAREHIYEMHERCKKIKEMWALPIRPYGFWTFERHNAQLRWDPQISQV >UniRef50_A9RBY6(4-72:89) Predicted protein n=1 Tax=Physcomitrella patens subsp. patens RepID=A9RBY6_PHYPA E=3e-12 s/c=1.06 id=44% cov=101% MMEFVEHWIRRSMENPDERDAKFRKHVYSTKEQCVKLKESWANPVKPYGSWNTDKNNHKFLQDLTLSRM # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * I 1 * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1465 0 0 M 2 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1465 0 0 E 3 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1465 0 0 F 4 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1465 0 0 A 5 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 5 0 * * * * * * 1465 0 0 E 6 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1465 0 0 N 7 * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1465 0 0 L 8 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 1000 * 8 0 * * * * * * 1465 0 0 V 9 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 9 0 * * * * * * 1465 0 0 L 10 * * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * 10 0 * * * * * * 1465 0 0 R 11 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 11 0 * * * * * * 1465 0 0 L 12 * * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * 12 0 * * * * * * 1465 0 0 M 13 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1465 0 0 E 14 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1465 0 0 N 15 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1465 0 0 P 16 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1465 0 0 E 17 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1465 0 0 E 18 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1465 0 0 R 19 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 19 0 * * * * * * 1465 0 0 D 20 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1465 0 0 R 21 1000 * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * * 21 0 * * * * * * 1465 0 0 K 22 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1465 0 0 A 23 1000 * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1465 0 0 R 24 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 24 0 * * * * * * 1465 0 0 E 25 * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1465 0 0 H 26 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1465 0 0 I 27 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 27 0 * * * * * * 1465 0 0 Y 28 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 28 0 * * * * * * 1465 0 0 E 29 * * * 1000 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 29 0 * * * * * * 1465 0 0 M 30 * * * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * 30 0 * * * * * * 1465 0 0 H 31 * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1465 0 0 E 32 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1465 0 0 R 33 * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * 33 0 * * * * * * 1465 0 0 C 34 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1465 0 0 K 35 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * 35 0 * * * * * * 1465 0 0 K 36 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1465 0 0 I 37 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1465 0 0 K 38 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1465 0 0 E 39 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1465 0 0 M 40 * * * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * 40 0 * * * * * * 1465 0 0 W 41 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 41 0 * * * * * * 1465 0 0 A 42 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1465 0 0 L 43 * * * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1465 0 0 P 44 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1465 0 0 I 45 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 45 0 * * * * * * 1465 0 0 R 46 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 46 0 * * * * * * 1465 0 0 P 47 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1465 0 0 Y 48 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 48 0 * * * * * * 1465 0 0 G 49 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1465 0 0 F 50 * * * * 1000 * * * * * * * * * * 1000 * * * * 50 0 * * * * * * 1465 0 0 W 51 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 51 0 * * * * * * 1465 0 0 T 52 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * 52 0 * * * * * * 1465 0 0 F 53 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 1000 * * * 53 0 * * * * * * 1465 0 0 E 54 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1465 0 0 R 55 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 55 0 * * * * * * 1465 0 0 H 56 * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1465 0 0 N 57 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1465 0 0 A 58 1000 * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1465 0 0 Q 59 * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * 59 0 * * * * * * 1465 0 0 L 60 * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1465 0 0 R 61 * * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * 61 0 * * * * * * 1465 0 0 W 62 * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * 62 0 * * * * * * 1465 0 0 D 63 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1465 0 0 P 64 * * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1465 0 0 Q 65 * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * 65 0 * * * * * * 1465 0 0 I 66 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1465 0 0 S 67 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 67 0 * * * * * * 1465 0 0 Q 68 * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * 68 0 * * * * * * 1465 0 0 V 69 * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * 69 0 * * 0 * * * 1465 0 0 //