HHsearch 1.5 NAME c6ywcC_ FAM FILE c6ywcC_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6ywcC_.a3m DATE Sat Oct 10 08:43:30 2020 LENG 58 match states, 58 columns in multiple alignment FILT 1 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.4131 0.8191 SEQ >ss_dssp CCEEEEEEETTEEEEEEEECCCGGGHHHHHHHHHHHCCSCCSCEEEEEETTEEEEECC >sa_dssp EDAEACACCEEDEEDECCCECEDEDBEECBCECCEEDEECEDBCACACCEEEECEDEE >ss_pred CEEEEEECCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCEEEEECC >ss_conf 9024564176302333032075899999999999984149738999804765874249 >Consensus kyfdctvsgergiiktygiqlpeealkehvreyveklregsaititctagdrvfkfkd >c6ywcC_ KYFDCTVSGERGIIKTYGIQLPEEALKEHVREYVEKLREGSAITITCTAGDRVFKFKD # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * K 1 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 2 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 2 0 * * * * * * 1000 0 0 F 3 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 D 4 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 C 5 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 T 6 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 V 7 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 S 8 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 G 9 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 E 10 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 R 11 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 G 12 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 I 13 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 I 14 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 K 15 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 T 16 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 17 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 17 0 * * * * * * 1000 0 0 G 18 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 I 19 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 20 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 L 21 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 P 22 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 E 23 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 E 24 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 A 25 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 L 26 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 K 27 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 E 28 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 H 29 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 V 30 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 R 31 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 E 32 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 33 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 33 0 * * * * * * 1000 0 0 V 34 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 E 35 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 K 36 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 L 37 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 R 38 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 E 39 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 G 40 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 S 41 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 A 42 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 I 43 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 T 44 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 I 45 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 T 46 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 C 47 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 T 48 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 A 49 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 G 50 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 D 51 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 R 52 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 V 53 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 F 54 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 K 55 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 F 56 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 K 57 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 D 58 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //