HHsearch 1.5 NAME c6ygiA_ FAM FILE c6ygiA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6ygiA_.a3m DATE Sat Sep 5 08:56:32 2020 LENG 148 match states, 148 columns in multiple alignment FILT 1 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.3676 -2.9825 SEQ >ss_dssp CCHHHHHHHCCGGGSCSSSSCCHHHHHHHHHHHHHHHHHTTCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCTTSCHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHTCHHHHHHHHHHHHHHHHSCSTTSCSSCCCTTC >sa_dssp EEEEDAEEDCDBDDBDDECBDEBDDBBEDACECADEDCEEECEDDCBEDACDAADCBDDDCEEADDCCEEADDCEEECEEDCEEEBDDCDDDADEDDDDA CEABBCABCBBCBBEDCDDCABDBAADBDDCDEDDEEECDEEDCEBEE >ss_pred CCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCCCCC >ss_conf 9731556666664076334455899986347620311011002467888998999999999853449999999985227653689999999841188888 998755875422021115679999999999834916535778865469 >Consensus mdinasralanvydlpddffpkiddlvrdakdalepywksdsikkhvliathfvdliedfwqttqgmheiaeslravggsggaeihahlkayakineesl drarrllwwhyncllwgeaqvtnyisrlrtwlstpekyrgrdaptiea >c6ygiA_ MDINASRALANVYDLPDDFFPKIDDLVRDAKDALEPYWKSDSIKKHVLIATHFVDLIEDFWQTTQGMHEIAESLRAVGGSGGAEIHAHLKAYAKINEESL DRARRLLWWHYNCLLWGEAQVTNYISRLRTWLSTPEKYRGRDAPTIEA # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * M 1 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 D 2 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 I 3 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 N 4 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 A 5 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 S 6 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 R 7 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 A 8 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 L 9 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 A 10 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 N 11 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 V 12 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 13 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 13 0 * * * * * * 1000 0 0 D 14 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 L 15 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 P 16 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 D 17 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 D 18 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 F 19 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 F 20 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 P 21 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 K 22 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 I 23 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 D 24 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 D 25 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 L 26 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 V 27 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 R 28 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 D 29 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 A 30 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 K 31 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 D 32 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 A 33 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 L 34 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 E 35 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 P 36 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 37 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 37 0 * * * * * * 1000 0 0 W 38 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 K 39 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 S 40 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 D 41 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 S 42 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 I 43 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 K 44 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 K 45 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 H 46 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 V 47 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 L 48 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 I 49 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 A 50 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 T 51 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 H 52 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 F 53 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 V 54 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 D 55 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 L 56 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 I 57 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 E 58 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 D 59 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 F 60 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 W 61 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 61 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 62 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 62 0 * * * * * * 1000 0 0 T 63 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 63 0 * * * * * * 1000 0 0 T 64 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 65 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 65 0 * * * * * * 1000 0 0 G 66 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 M 67 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 H 68 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 E 69 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 I 70 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1000 0 0 A 71 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1000 0 0 E 72 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 S 73 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 73 0 * * * * * * 1000 0 0 L 74 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1000 0 0 R 75 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 75 0 * * * * * * 1000 0 0 A 76 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1000 0 0 V 77 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 77 0 * * * * * * 1000 0 0 G 78 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1000 0 0 G 79 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1000 0 0 S 80 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 80 0 * * * * * * 1000 0 0 G 81 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1000 0 0 G 82 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1000 0 0 A 83 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1000 0 0 E 84 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1000 0 0 I 85 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1000 0 0 H 86 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1000 0 0 A 87 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1000 0 0 H 88 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1000 0 0 L 89 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1000 0 0 K 90 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1000 0 0 A 91 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 92 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 92 0 * * * * * * 1000 0 0 A 93 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1000 0 0 K 94 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1000 0 0 I 95 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1000 0 0 N 96 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1000 0 0 E 97 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1000 0 0 E 98 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1000 0 0 S 99 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 99 0 * * * * * * 1000 0 0 L 100 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1000 0 0 D 101 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1000 0 0 R 102 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 102 0 * * * * * * 1000 0 0 A 103 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1000 0 0 R 104 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 104 0 * * * * * * 1000 0 0 R 105 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 105 0 * * * * * * 1000 0 0 L 106 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1000 0 0 L 107 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1000 0 0 W 108 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 108 0 * * * * * * 1000 0 0 W 109 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 109 0 * * * * * * 1000 0 0 H 110 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 111 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 111 0 * * * * * * 1000 0 0 N 112 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1000 0 0 C 113 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1000 0 0 L 114 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1000 0 0 L 115 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1000 0 0 W 116 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 116 0 * * * * * * 1000 0 0 G 117 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1000 0 0 E 118 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1000 0 0 A 119 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 120 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 120 0 * * * * * * 1000 0 0 V 121 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 121 0 * * * * * * 1000 0 0 T 122 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 122 0 * * * * * * 1000 0 0 N 123 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 124 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 124 0 * * * * * * 1000 0 0 I 125 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 125 0 * * * * * * 1000 0 0 S 126 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 126 0 * * * * * * 1000 0 0 R 127 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 127 0 * * * * * * 1000 0 0 L 128 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1000 0 0 R 129 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 129 0 * * * * * * 1000 0 0 T 130 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 130 0 * * * * * * 1000 0 0 W 131 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 131 0 * * * * * * 1000 0 0 L 132 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 132 0 * * * * * * 1000 0 0 S 133 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 133 0 * * * * * * 1000 0 0 T 134 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 134 0 * * * * * * 1000 0 0 P 135 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 135 0 * * * * * * 1000 0 0 E 136 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 136 0 * * * * * * 1000 0 0 K 137 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 137 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 138 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 138 0 * * * * * * 1000 0 0 R 139 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 139 0 * * * * * * 1000 0 0 G 140 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 140 0 * * * * * * 1000 0 0 R 141 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 141 0 * * * * * * 1000 0 0 D 142 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 142 0 * * * * * * 1000 0 0 A 143 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 143 0 * * * * * * 1000 0 0 P 144 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 144 0 * * * * * * 1000 0 0 T 145 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 145 0 * * * * * * 1000 0 0 I 146 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 146 0 * * * * * * 1000 0 0 E 147 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 147 0 * * * * * * 1000 0 0 A 148 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 148 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //