HHsearch 1.5 NAME c6x0uD_ FAM FILE c6x0uD_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6x0uD_.a3m DATE Sat Jul 25 08:30:15 2020 LENG 158 match states, 158 columns in multiple alignment FILT 3 out of 7 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.6 EVD 0.3853 -1.9404 SEQ >ss_dssp CHHHHHHHHHHHSSCCCCCSSHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCSSHHHHHHHHHHHHTSCHHHHHHHHHHHHHSCCCHHHHHHHTTTTTCSCCCCTTSSCT TSCSSCCCCCCCSSSSTTTSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSSSTTSSCSSTTC >sa_dssp EEEDECDEDBDEEBEEEEDEEDCEDDCEECCEEDEEEEEEEDCDDCBDEDAEECDEEDDCEEAEDDCDDCEEEEEEDEECCEECEEEEEEEEEEEEEEDD EDEEEEEEDDEDEEDECEDEEEDECDEDEEDDEDEDEEDEDEEDEEDEEDEDDEEEEE >ss_pred CHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCC CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC >ss_conf 9889999998753304338999989998658889999851888670899996100035570578999999999976689999999727898179974066 3125898667476778999887765543787766789999999861588889832269 >Consensus sitxlxxxlcxxxlpxxxxkrxxxxxkkxayxxlxsxxfxxpxrnkilMlsFdLRvxGxxxeAdRLEElvExLexvxaVLeLLVxLaGsgPPrDYfxnnk xVgRnvxyxGYdxxdlqvfEadxxxlvxxqExxxxxxiqxTlqxMeAaPGTGLpxxxx >c6x0uD_ SITQLFDDLCEALLPAANRKRAKRSLKKVAYNALFTNLFQLPARNKILMLSFDLRVGGLGPKADRLEELVEELEAVGSVLDLLVQLAGSGPPRDYFLNNK HVGRNVPYSGYDCDDLSVFEMDVQSLISREECLCHSMIQETLQVMEAAPGTGLPTVGL >UniRef50_Q4RSJ3(17-208:1238) Chromosome 13 SCAF15000, whole genome shotgun sequence n=1 Tax=Tetraodon nigroviridis RepID=Q4RSJ3_TETNG E=1e-17 s/c=0.47 id=42% cov=97% SITELMGALCDSSLPQVSWKRRslegvsregfRKAFKKCAYGVLLSKIFlnstngsvstpsataKTPPRNKVLMICFDLRVAGCREEAERLEEQLEKLQe gassglkEVDAVLELLVHLAGSTPPppasfsMDYMRRERPVLRRPEPWGYQSEELQRLEAQAWGLVCGQEWGSLEGMCLTQRMMDAPPGTGL----- >UniRef50_Q9DDA7(1-124:1625) Gamma tubulin ring protein n=7 Tax=Chordata RepID=Q9DDA7_XENLA E=1e-25 s/c=0.94 id=59% cov=70% ------------------------------------------------MLSFNLRICGMSSEADRLEELVEYLEQsngiqisdLHAVLELLVELSGTGPP qllppkRDYFKNNKYVGRNVKYQGYDYYDVQVFEADLGTTVAYQELEISTTIQRTLQIMEAAPGTGLPALSF # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * S 1 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 1 0 * * * * * * 1490 0 0 I 2 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1490 0 0 T 3 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 3 0 * * * * * * 1490 0 0 Q 4 * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 4 0 * * * * * * 1490 0 0 L 5 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1490 0 0 F 6 * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1490 0 0 D 7 * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1490 0 0 D 8 1000 * 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1490 0 0 L 9 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1490 0 0 C 10 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1490 0 0 E 11 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1490 0 0 A 12 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 12 0 * * * * * * 1490 0 0 L 13 * * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * 13 0 * * * * * * 1490 0 0 L 14 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1490 0 0 P 15 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1490 0 0 A 16 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 16 0 * * * * * * 1490 0 0 A 17 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 17 0 * * * * * * 1490 0 0 N 18 * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * 18 0 * * * * * * 1490 0 0 R 19 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * 19 0 * * * * * * 1490 0 0 K 20 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1490 0 0 R 21 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 21 0 * * * * * * 1490 0 0 A 22 1000 * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * * 22 1000 1000 * 3322 152 * * 1490 1000 0 K 23 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 23 0 * * * * * * 1490 0 0 R 24 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 24 0 * * * * * * 1490 0 0 S 25 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 25 0 * * * * * * 1490 0 0 L 26 * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1490 0 0 K 27 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1490 0 0 K 28 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1490 0 0 V 29 * 1000 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 29 0 * * * * * * 1490 0 0 A 30 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1490 0 0 Y 31 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 31 0 * * * * * * 1490 0 0 N 32 * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1490 0 0 A 33 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 33 0 * * * * * * 1490 0 0 L 34 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1490 0 0 F 35 * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1490 0 0 T 36 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 36 0 * * * * * * 1490 0 0 N 37 * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1490 0 0 L 38 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1490 0 0 F 39 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 39 1000 1000 * 3907 100 * * 1490 1000 0 Q 40 * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * 40 0 * * * * * * 1490 0 0 L 41 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * 41 0 * * * * * * 1490 0 0 P 42 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1490 0 0 A 43 1000 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1490 0 0 R 44 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 44 0 * * * * * * 1490 0 0 N 45 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1490 0 0 K 46 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1490 0 0 I 47 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 47 0 * * * * * * 1490 0 0 L 48 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1490 0 0 M 49 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1706 0 0 L 50 * * * * * * * 1454 * 655 * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1706 0 0 S 51 * 1454 * * * * * * * * * * * * * 655 * * * * 51 0 * * * * * * 1706 0 0 F 52 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1706 0 0 D 53 * * 551 * * * * * * * * 1655 * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1706 0 0 L 54 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1706 0 0 R 55 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 55 0 * * * * * * 1706 0 0 V 56 * * * * * * * 1655 * * * * * * * * * 551 * * 56 0 * * * * * * 1706 0 0 G 57 1454 1655 * * * 1655 * * * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1706 0 0 G 58 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1706 0 0 L 59 * 1454 * * * * * * * 1655 1655 * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1706 0 0 G 60 * * * * * 1655 * * * * * * * * 1454 1655 * * * * 60 0 * * * * * * 1706 0 0 P 61 * * * 1454 * * * * * * * * 1655 * * 1655 * * * * 61 0 * * * * * * 1706 0 0 K 62 * * * 551 * * * * 1655 * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1706 0 0 A 63 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1706 0 0 D 64 * * 655 1454 * * * * * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1706 0 0 R 65 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 65 0 * * * * * * 1706 0 0 L 66 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1706 0 0 E 67 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1706 0 0 E 68 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1706 0 0 L 69 * * * * * * * * * 655 * * * 1454 * * * * * * 69 0 * * * * * * 1706 0 0 V 70 * * * * * * * * * 1454 * * * * * * * 655 * * 70 0 * * * * * * 1706 0 0 E 71 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1706 0 0 E 72 * * * 1655 * * * * 1454 * * * * * * * * * * 1655 72 0 * * * * * * 1706 0 0 L 73 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1706 0 0 E 74 * * * 655 * * * * * * * * * 1454 * * * * * * 74 655 1454 * 3000 193 * * 1706 1000 0 A 75 1655 * * 1454 * * * * * * * * * 1655 * * * * * * 75 551 1655 * 3000 193 * * 1706 1000 0 V 76 * * * * * * * * * 1655 * * * * * * * 551 * * 76 0 * * * * * * 1706 0 0 G 77 * * 1454 * * 1655 1655 * * * * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1706 0 0 S 78 551 * * * * * * * * * * * * * * 1655 * * * * 78 0 * * * * * * 1706 0 0 V 79 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 79 0 * * * * * * 1706 0 0 L 80 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1706 0 0 D 81 * * 1655 551 * * * * * * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1706 0 0 L 82 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1706 0 0 L 83 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1706 0 0 V 84 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 84 0 * * * * * * 1706 0 0 Q 85 * * * 1655 * * 1454 * * * * * * 1655 * * * * * * 85 0 * * * * * * 1706 0 0 L 86 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1706 0 0 A 87 551 * * * * * * * * * * * * * * 1655 * * * * 87 0 * * * * * * 1706 0 0 G 88 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1706 0 0 S 89 * * * * * * * * * * * * * * * 551 1655 * * * 89 0 * * * * * * 1706 0 0 G 90 * * * * * 655 * * * * * * * * * * 1454 * * * 90 0 * * * * * * 1706 0 0 P 91 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1706 0 0 P 92 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 92 1655 551 * 2585 263 * * 1706 1490 0 R 93 * * * * * * * * * * 1454 * * * 655 * * * * * 93 0 * * * * * * 1706 0 0 D 94 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1706 0 0 Y 95 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 95 0 * * * * * * 1706 0 0 F 96 * * * * 655 * * * * * 1454 * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1706 0 0 L 97 * * * * * * * * 1655 1655 * * * * 1454 * * * * * 97 0 * * * * * * 1706 0 0 N 98 * * * * * * * * * * * 655 * * 1454 * * * * * 98 0 * * * * * * 1706 0 0 N 99 * * * 1454 * * * * * * * 655 * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1706 0 0 K 100 * * * * * * * * 655 * * * * * 1454 * * * * * 100 0 * * * * * * 1706 0 0 H 101 * * * * * * 1655 * * * * * 1454 * * * * * * 1655 101 0 * * * * * * 1706 0 0 V 102 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 102 0 * * * * * * 1706 0 0 G 103 * * * * * 655 * * * 1454 * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1706 0 0 R 104 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 104 0 * * * * * * 1706 0 0 N 105 * * * * * * * * * * * 655 * * 1454 * * * * * 105 0 * * * * * * 1706 0 0 V 106 * * * * * * * * * * * * 1454 * * * * 655 * * 106 0 * * * * * * 1706 0 0 P 107 * * * 1454 * * * * 1655 * * * 1655 * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1706 0 0 Y 108 * * * * * * * * * * * * 1454 * * * * * * 655 108 0 * * * * * * 1706 0 0 S 109 * * * * * * * * * * * * * 1655 * 1655 * * 1454 * 109 0 * * * * * * 1706 0 0 G 110 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1706 0 0 Y 111 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 111 0 * * * * * * 1706 0 0 D 112 * * 655 * * * * * * * * * * 1454 * * * * * * 112 0 * * * * * * 1706 0 0 C 113 * 1655 * * * * * * * * * * * * * 1454 * * * 1655 113 0 * * * * * * 1706 0 0 D 114 * * 1655 1454 * * * * * * * * * * * * * * * 1655 114 0 * * * * * * 1706 0 0 D 115 * * 655 1454 * * * * * * * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1706 0 0 L 116 * * * * * * * * * 551 * * * * * * * 1655 * * 116 0 * * * * * * 1706 0 0 S 117 * * * * * * * * * * * * * 551 * 1655 * * * * 117 0 * * * * * * 1706 0 0 V 118 * * * * * * * * * * * * * * 1454 * * 655 * * 118 0 * * * * * * 1706 0 0 F 119 * * * * 655 * * * * 1454 * * * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1706 0 0 E 120 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1706 0 0 M 121 551 * * * * * * * * * 1655 * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1706 0 0 D 122 * * 655 * * * * * * * * * * 1454 * * * * * * 122 0 * * * * * * 1706 0 0 V 123 1454 * * * * * * * * 1655 * * * * * * * 1655 * * 123 0 * * * * * * 1706 0 0 Q 124 * * * * * 1655 * * * * * * * 1655 * * * * 1454 * 124 0 * * * * * * 1706 0 0 S 125 * * * * * 1454 * * * * * * * * * 1655 1655 * * * 125 0 * * * * * * 1706 0 0 L 126 * * * * * * * * * 551 * * * * * * 1655 * * * 126 0 * * * * * * 1706 0 0 I 127 * * * * * * * 1655 * * * * * * * * * 551 * * 127 0 * * * * * * 1706 0 0 S 128 1655 1454 * * * * * * * * * * * * * 1655 * * * * 128 0 * * * * * * 1706 0 0 R 129 * * * * * 1454 * * * * * * * * 1655 * * * * 1655 129 0 * * * * * * 1706 0 0 E 130 * * * 1655 * * * * * * * * * 551 * * * * * * 130 0 * * * * * * 1706 0 0 E 131 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 131 0 * * * * * * 1706 0 0 C 132 * 1655 * * * * * * * 1655 * * * * * * * * 1454 * 132 0 * * * * * * 1706 0 0 L 133 * * * 1655 * 1454 * * * 1655 * * * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 1706 0 0 C 134 * 1655 * * * * * 1655 * * * * * * * 1454 * * * * 134 0 * * * * * * 1706 0 0 H 135 * * * * * * 1655 * * 1454 * * * * * 1655 * * * * 135 0 * * * * * * 1706 0 0 S 136 * * * 1454 * * * * * * * * * * * 1655 1655 * * * 136 0 * * * * * * 1706 0 0 M 137 * * * * * 1454 * * * * 1655 * * * * * 1655 * * * 137 0 * * * * * * 1706 0 0 I 138 * * * * * * * 655 * * 1454 * * * * * * * * * 138 0 * * * * * * 1706 0 0 Q 139 * 1454 * * * * * * * * * * * 655 * * * * * * 139 0 * * * * * * 1706 0 0 E 140 * * * 1655 * * * * * 1454 * * * * 1655 * * * * * 140 0 * * * * * * 1706 0 0 T 141 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 141 0 * * * * * * 1706 0 0 L 142 * * * * * * * * * 655 * * * 1454 * * * * * * 142 0 * * * * * * 1706 0 0 Q 143 * * * * * * * * * * * * * 655 1454 * * * * * 143 0 * * * * * * 1706 0 0 V 144 * * * * * * * 1655 * * 1454 * * * * * * 1655 * * 144 0 * * * * * * 1706 0 0 M 145 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 145 0 * * * * * * 1706 0 0 E 146 * * 1454 655 * * * * * * * * * * * * * * * * 146 0 * * * * * * 1706 0 0 A 147 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 147 0 * * * * * * 1706 0 0 A 148 655 * * * * * * * * * * * 1454 * * * * * * * 148 0 * * * * * * 1706 0 0 P 149 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 149 0 * * * * * * 1706 0 0 G 150 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 150 0 * * * * * * 1706 0 0 T 151 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 151 0 * * * * * * 1706 0 0 G 152 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 152 0 * * * * * * 1706 0 0 L 153 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 153 0 * * * * * * 1706 0 0 P 154 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 154 0 * * * * * * 1328 0 0 T 155 1000 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 155 0 * * * * * * 1328 0 0 V 156 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * 156 0 * * * * * * 1328 0 0 G 157 * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * * 157 0 * * * * * * 1328 0 0 L 158 * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * 158 0 * * 0 * * * 1328 0 0 //