HHsearch 1.5 NAME c6wt5A_ FAM FILE c6wt5A_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6wt5A_.a3m DATE Sat Sep 12 08:37:43 2020 LENG 144 match states, 144 columns in multiple alignment FILT 4 out of 8 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 2.3 EVD 0.3878 -1.8859 SEQ >ss_dssp CGGGCCCHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHTSEECCEESEEEEEEEECSSCCSCHHHHHHHHHTTCCCEEEEECCCCEEEEECCCEEEEEECCGGGHHH HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTCGGGEEEEEC >sa_dssp EEEEEEDCACDCADDBADEBACBAABBBEECDAADEEDCEEBCACABBAEEBCEEBDDBAEDBDEECEDEECDBECEECEADBDEDEBCAACBADCACCA CECBDEEEEEDEDCBDDABECACECAEEBAEECEBDECBDCDDD >ss_pred CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCCCEEEEEEEHHHHCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCEEEEEEECCCEEEEEECHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCC >ss_conf 9731104036889999986588999999820200013464307888520552334689999998402822687212158886088448888304788999 99974112479999887899999998766652472458875319 >Consensus xsxIslxPSTxlAlxYfENFvkPvxrxixxxgkxxxxxxxxxtLnIvIPxkLseDlxxxxxxxxxxxxlkexxvexxxRxxnvxxxxlxliDxPtxLsxx xrAIexxvxxxExixxrELenFxxTlxxxxLxDgxdxxxxxxxx >c6wt5A_ DSDINFFPSSTLAAVYYENFIKPTCSHIINNGGLLDYIYKKCTIKIIIPKKLTSDVNSQFQRIKAKIETKELSFEYLPRNINVEDGEVXIIDFPTILSGI NYAISNLLPDYEAILSRELERFVYTLKKIALRDGFDDLIKIVDE >UniRef50_B0PHL7(156-307:328) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Anaerotruncus colihominis DSM 17241 RepID=B0PHL7_9FIRM E=1e-47 s/c=1.25 id=32% cov=93% -SRISMLPSTATALSYFENFVKPVCRHlltenyVLSEGKQLAFNGMKQKLNIVLPQVLSEDLKPRFYELKARAGLQEFQIPGIHRYFTgygrlIGGTLYD LMDMPTCLNVSRKAVElymgkdfiGTVSHMECIFARELENFRATLQ--YLIDGDD-------- >UniRef50_A5KMN9(153-306:323) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Ruminococcus torques ATCC 27756 RepID=A5KMN9_9FIRM E=1e-06 s/c=0.35 id=26% cov=91% ---ISLLPSTSLAVGYFENFLKPVSQAIQKldavciAGKKYDVKNSAKRLEVAIPAKVSEDLRMWSEYVYENHAVEKVTVDSSIRKIGVnidygkleNTG DLTVIDVPLTLSAAYRSVElalgvdyiGIEEIKELAKEKELNNFIKTVNNLILED----------- >UniRef50_C6W705(145-261:306) Nucleotide-binding protein containing TIR-like domain-like protein n=1 Tax=Dyadobacter fermentans DSM 18053 RepID=C6W705_DYAFD E=6e-06 s/c=0.44 id=23% cov=76% --ELGLAPSTILALGYFDNFVLPVSRELMQSEKRSveGLNFADFTLNIVIPDELPNNFQDEVIAYLGTHNLKEMKVETVTRKFNFyldydyaNQESLNLY DLPTTLGALKRAIEMAVPN---------------------------------- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * D 1 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 S 2 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 2 0 * * * * * * 1579 0 0 D 3 * * 1558 1578 * * * * * * * * * * 1619 * * * * * 3 0 * * * * * * 2156 0 0 I 4 * * * * * * * 412 * 2009 * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 2537 0 0 N 5 * * * * * 2009 * * * * * 1956 * * * 1018 * * * * 5 0 * * * * * * 2537 0 0 F 6 * * * * 1956 * * * * 1004 2036 * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 2537 0 0 F 7 2009 * * * 1956 * * * * 1018 * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 2537 0 0 P 8 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 8 0 * * * * * * 2537 0 0 S 9 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 9 0 * * * * * * 2537 0 0 S 10 * * * * * * * * * * * * * * * 1956 430 * * * 10 0 * * * * * * 2537 0 0 T 11 2036 * * * * * * 2009 * * * * * * * 2000 1956 * * * 11 0 * * * * * * 2537 0 0 L 12 * * * * * * * * * 403 * * * * * * 2036 * * * 12 0 * * * * * * 2537 0 0 A 13 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 2537 0 0 A 14 1956 * * * * * * * * 1023 * * * * * * * 2000 * * 14 0 * * * * * * 2537 0 0 V 15 * * * * * 1004 * * * * * * * * * 2036 * 1956 * * 15 0 * * * * * * 2537 0 0 Y 16 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 16 0 * * * * * * 2537 0 0 Y 17 * * * * 430 * * * * * * * * * * * * * * 1956 17 0 * * * * * * 2537 0 0 E 18 * * 2009 412 * * * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 2537 0 0 N 19 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 2537 0 0 F 20 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 2537 0 0 I 21 * * * * * * * 1956 * 2000 * * * * * * * 1023 * * 21 0 * * * * * * 2537 0 0 K 22 * * * * * * * * 412 2009 * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 2537 0 0 P 23 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 23 0 * * * * * * 2537 0 0 T 24 * * * * * * * * * * * * * * * * 1956 430 * * 24 0 * * * * * * 2537 0 0 C 25 * 996 * * * * * * * * * * * * * 1004 * * * * 25 0 * * * * * * 2537 0 0 S 26 * * * * * * * * * * * * * 2000 1023 1956 * * * * 26 0 * * * * * * 2537 0 0 H 27 2000 * * 2009 * * 996 * * * * * * * * * * * * * 27 403 2036 * 2585 263 * * 2537 1000 0 I 28 * * * * * * * 978 * 2009 * * * * * * * 2036 * * 28 0 * * * * * * 2537 0 0 I 29 * * * * * * * 1956 * 2036 2009 * * 2000 * * * * * * 29 0 * * * * * * 2537 0 0 N 30 * * * * * * * * 2000 * * 1956 * 2009 * 2036 * * * * 30 415 2000 * 2585 263 * * 2537 1000 0 N 31 2000 * * 2036 * * * * * * * 1956 * * * 2009 * * * * 31 0 * * * * * * 2537 0 0 G 32 * * * 2009 * 412 * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 2537 0 0 G 33 * * * * * 1956 * * 430 * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 2537 0 0 L 34 * * * * * * * * 2000 1956 * * * 2036 2009 * * * * * 34 0 * * * * * * 2537 0 0 L 35 * * * * * * * * * 996 * * * * * 2009 * * * 2000 35 412 2009 * 1000 1000 * * 2537 1000 0 D 36 2036 * 978 * * 2009 * * * * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 2537 0 0 Y 37 * * * * 2036 * * * * 2009 * * * * * * * 2000 * 1956 37 0 * * * * * * 2537 0 0 I 38 * * * * * * * 1956 2000 * * 1023 * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 2537 0 0 Y 39 * * * * 2009 2036 * * * * * 2000 * * * * * * * 1956 39 0 * * * * * * 2537 0 0 K 40 2009 * * * * * * * 1956 * 2036 * * * * 2000 * * * * 40 0 * * * * * * 2537 0 0 K 41 2000 * 2009 * * * * * 996 * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 2537 0 0 C 42 * 1956 * * 2009 * * * 2000 * * * * 2036 * * * * * * 42 0 * * * * * * 2537 0 0 T 43 * * * * * * * * 2036 * * * * * 2000 * 982 * * * 43 0 * * * * * * 2537 0 0 I 44 * * * * * * * 1956 * 430 * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 2537 0 0 K 45 * * * 2000 * * * * 1956 * * 1023 * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 2537 0 0 I 46 * * * * * * * 415 * * * * * * * * * 2000 * * 46 0 * * * * * * 2537 0 0 I 47 2000 * * * * * * 1956 * * * * * * * * * 1023 * * 47 0 * * * * * * 2537 0 0 I 48 * * * * * * * 403 * 2036 * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 2537 0 0 P 49 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 49 0 * * * * * * 2537 0 0 K 50 2000 * 2009 * * * * * 1956 * * * * 2036 * * * * * * 50 0 * * * * * * 2537 0 0 K 51 * * * 2009 * * * * 978 * * * * * * * * 2036 * * 51 0 * * * * * * 2537 0 0 L 52 * * * * * * * * * 415 * * * * * * * 2000 * * 52 0 * * * * * * 2537 0 0 T 53 * * * * * * * * * * * * 2009 * * 1018 1956 * * * 53 0 * * * * * * 2537 0 0 S 54 * * * 1018 * * * * * * * 2009 * * * 1956 * * * * 54 0 * * * * * * 2537 0 0 D 55 * * 412 * * * * * * * * 2009 * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 2537 0 0 V 56 * * * * 2009 * * * * 1018 * * * * * * * 1956 * * 56 0 * * * * * * 2537 0 0 N 57 * * * * * * * * 2036 * * 1956 * 2009 2000 * * * * * 57 0 * * * * * * 2537 0 0 S 58 * * 2009 * * * * * * * 2000 * 2036 * * 1956 * * * * 58 0 * * * * * * 2537 0 0 Q 59 * * * 2009 * * * * * * * * * 1956 2036 * * * 2000 * 59 0 * * * * * * 2537 0 0 F 60 * * * * 996 * * * * * * * * * * 2000 * 2009 * * 60 0 * * * * * * 2537 0 0 Q 61 * * * 2000 * * * 2009 * * * * * 1956 * * * * * 2036 61 0 * * * * * * 2537 0 0 R 62 2009 * * 2036 * * * * * * * * * * 1956 * * * * 2000 62 0 * * * * * * 2537 0 0 I 63 * * * * * * * 1956 * 2036 * * * * * * * 2000 * 2009 63 0 * * * * * * 2537 0 0 K 64 * * * * * * * * 996 2009 * * * * * * * * * 2000 64 0 * * * * * * 2537 0 0 A 65 996 * * 2000 * 2009 * * * * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 2537 0 0 K 66 * * * * * * * * 1956 * * 2000 * * 2036 * 2009 * * * 66 0 * * * * * * 2537 0 0 I 67 2036 * * * * * 1004 1956 * * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 2537 0 0 E 68 2000 * * 1956 * 2036 * * * * * 2009 * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 2537 0 0 T 69 * * * * * * * * * 1023 * * * * * * 1956 2000 * * 69 0 * * * * * * 2537 0 0 K 70 * * * 2000 * * * * 982 * * * * 2036 * * * * * * 70 0 * * * * * * 2537 0 0 E 71 * * * 415 * * * * 2000 * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 2537 0 0 L 72 * * * * 2036 * * * * 1956 2009 * * * * * * 2000 * * 72 0 * * * * * * 2537 0 0 S 73 * * * * * * * * 2009 * * * * 2036 * 1956 2000 * * * 73 0 * * * * * * 2537 0 0 F 74 * * * * 1956 * * 2036 * * * * * * * * * 1004 * * 74 0 * * * * * * 2537 0 0 E 75 * * 2000 982 * * * * * * * * 2036 * * * * * * * 75 0 * * * * * * 2537 0 0 Y 76 * * * * * 2036 * * * * * * * * * 2000 2009 * * 1956 76 0 * * * * * * 2537 0 0 L 77 * * * * * * * 2036 * 1956 * * * * * 2000 * 2009 * * 77 0 * * * * * * 2537 0 0 P 78 * * * * * * 2036 2000 * * * * 1956 * * * 2009 * * * 78 0 * * * * * * 2537 0 0 R 79 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 79 0 * * * * * * 2537 0 0 N 80 * * * * * * * * 1004 * * 1956 * * * * * * * 2036 80 0 * * * * * * 2537 0 0 I 81 * * * * 1023 * * 978 * * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 2537 0 0 N 82 * * * * * 2000 * * * * * 982 * * * * 2036 * * * 82 403 2036 * 2322 322 * * 2537 1000 0 V 83 * * * * 2009 * * 2036 * * * * * * * * * 978 * * 83 996 1005 * 2911 206 * * 2537 1635 0 E 84 * * * 1956 * 2036 * * * * * 1004 * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 2537 0 0 D 85 * * 1956 * * 2036 * * * * * * * 2009 * * 2000 * * * 85 0 * * * * * * 2537 0 0 G 86 * * * 2009 * 978 * * * * * * * * * * 2036 * * * 86 0 * * * * * * 2537 0 0 E 87 * * 2000 1956 * * * * * 2036 * * * * * 2009 * * * * 87 0 * * * * * * 2537 0 0 V 88 * * * * * * * * * 1004 * * * * * * * 1956 * 2036 88 0 * * * * * * 2537 0 0 X 89 * * 1588 * * * * * * * * 1599 * * * * 1568 * * * 89 0 * * * * * * 2098 0 0 I 90 * * * * * * * 1956 * 1023 * * * * * * * 2000 * * 90 0 * * * * * * 2537 0 0 I 91 * * * * * * * 978 * * 2036 * * * * * * * * 2009 91 0 * * * * * * 2537 0 0 D 92 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 2537 0 0 F 93 * * * * 1956 * * * * 2009 2036 * * * * * * 2000 * * 93 0 * * * * * * 2537 0 0 P 94 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 94 0 * * * * * * 2537 0 0 T 95 * * * * * * * * * 2000 * * * * * * 415 * * * 95 0 * * * * * * 2537 0 0 I 96 * 2036 * * * * * 1956 * * * * * * * * 1004 * * * 96 0 * * * * * * 2537 0 0 L 97 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 2537 0 0 S 98 * * * * * 2009 * * * * * 2036 * * * 978 * * * * 98 0 * * * * * * 2537 0 0 G 99 1004 * * * * 1956 * * * * * * * * * * * 2036 * * 99 0 * * * * * * 2537 0 0 I 100 2000 * * * * * * 1956 * 2009 * * * * * 2036 * * * * 100 0 * * * * * * 2537 0 0 N 101 * * * * * * * * 2009 * * 1956 * * 2036 * * * * 2000 101 0 * * * * * * 2537 0 0 Y 102 * * * * * * * * 2036 * * * * * 1004 * * * * 1956 102 0 * * * * * * 2537 0 0 A 103 415 * * * * * * * * * * * * * * 2000 * * * * 103 0 * * * * * * 2537 0 0 I 104 * * * * * * * 982 * * * * * * * * * 1018 * * 104 0 * * * * * * 2537 0 0 S 105 * * * 430 * * * * * * * * * * * 1956 * * * * 105 982 1018 * 3000 193 * * 2537 1616 0 N 106 * * * * * 1018 * * * * 2009 1956 * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 2537 0 0 L 107 2009 * * * * * * 2000 * 1956 * * * * * * 2036 * * * 107 0 * * * * * * 2537 0 0 L 108 * * * 2000 * * * * * 1956 * * * * * * * 1023 * * 108 0 * * * * * * 2537 0 0 P 109 * * * 2000 * * * * * * * * 982 * * 2036 * * * * 109 0 * * * * * * 2537 0 0 D 110 * * 1956 * * * 2036 2000 * * * 2009 * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 2537 0 0 Y 111 * * * * * * * * 1547 * 1630 * * * * * * * * 1579 111 0 * * * * * * 2105 0 0 E 112 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 2105 0 0 A 113 1579 1630 * * * * * * * 1547 * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 2105 0 0 I 114 1547 * * * * * * 605 * * * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 2105 0 0 L 115 * * * * 1630 * * * 1547 1579 * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 2105 0 0 S 116 1630 * * 1547 * * * * * * * * * * * 1579 * * * * 116 0 * * * * * * 2105 0 0 R 117 * * * * * * * * 1547 * * * * * 605 * * * * * 117 0 * * * * * * 2105 0 0 E 118 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 2105 0 0 L 119 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 2105 0 0 E 120 * * * 605 * * * * * * * 1547 * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 2105 0 0 R 121 * * * * * * * * * * * 588 * * 1579 * * * * * 121 0 * * * * * * 2105 0 0 F 122 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 2105 0 0 V 123 * * * * * * * 1547 * * * * * * 1630 * * 1579 * * 123 0 * * * * * * 2105 0 0 Y 124 1630 * * * * * * * 1547 * * * * * * * * * * 1579 124 0 * * * * * * 2105 0 0 T 125 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 125 0 * * * * * * 2105 0 0 L 126 * * * * * * * * * 605 * * * * * * * 1547 * * 126 0 * * * * * * 2105 0 0 K 127 * * * * * * * * 1579 * * 1547 * 1630 * * * * * * 127 563 * 1630 * * * * 2105 0 0 K 128 * * * * * * * * 1011 * * 989 * * * * * * * * 128 0 * * * * * 0 1659 0 1000 I 129 * * * * * * * 1011 * 989 * * * * * * * * * * 129 0 * * * * 0 * 1659 0 1000 A 130 1579 * * * * * * 1547 * * * * * * * * * * * 1630 130 0 * * * * * * 2105 0 0 L 131 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 131 0 * * * * * * 2105 0 0 R 132 * * * 1547 * * * 1630 * * * * * * 1579 * * * * * 132 0 * * * * * * 2105 0 0 D 133 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 2105 0 0 G 134 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 134 0 * * * * * * 1579 0 0 F 135 * * 1011 * 989 * * * * * * * * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 1579 0 0 D 136 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 136 0 * * * * * * 1579 0 0 D 137 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 137 0 * * * * * * 1000 0 0 L 138 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 138 0 * * * * * * 1000 0 0 I 139 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 139 0 * * * * * * 1000 0 0 K 140 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 140 0 * * * * * * 1000 0 0 I 141 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 141 0 * * * * * * 1000 0 0 V 142 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 142 0 * * * * * * 1000 0 0 D 143 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 143 0 * * * * * * 1000 0 0 E 144 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 144 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //