HHsearch 1.5 NAME c6wkkR_ FAM FILE c6wkkR_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6wkkR_.a3m DATE Sat Jun 13 08:17:44 2020 LENG 150 match states, 150 columns in multiple alignment FILT 1 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.4415 0.7412 SEQ >ss_dssp CCCCCCCBCCSSSCBCCCCCCSSSCCCCEEEEECCTTSCCCCSCSCSSSSSSCCEECTTSEEECSSCCCSSSSCCCCCEECCCSTTCCSSSCSSCEEEEE CSCCCEEBCSSCSSSEEECSSSCEEESCCSSCCCCSCCSSCCCTTCEEC- >sa_dssp EBECECEACBEEDDAEDBDDDEEDDCEDCDBDACCDECEECEDDCCDDAAAAAAACDEEEDABACDCDCEEEECCCCCAAABCEEEBCCAAADCDDABAA CDECABAABDEBDEEACBCDDACADDDECEDCABBEDBEDEBDEDDAAD- >ss_pred CCEEECCHHHCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHEEEECCCEEEEECCCCCCEEEEHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCEEEEEEEEEEEEECCCCCCCEEEEC CCCCEEEEEECCCEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEEC >ss_conf 9225300321064310120122317775200001015704842368854000268676535152221027986654999864100111011236635662 78848999607731233232111124622455423754421103355429 >Consensus pyvrlgyegilngahdidvaglngveqlagkfatigangvklagdngtnavglfredlgdmvnasekasfyfrggeyyvnisrtsltaagiaagdeitcd adgkmikftgtgkalgvvthvgeyragnmyekatqgvtdtdtfigfimyv >c6wkkR_ PYVRLGYEGILNGAHDIDVAGLNGVEQLAGKFATIGANGVKLAGDNGTNAVGLFREDLGDMVNASEKASFYFRGGEYYVNISRTSLTAAGIAAGDEITCD ADGKMIKFTGTGKALGVVTHVGEYRAGNMYEKATQGVTDTDTFIGFIMYV # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * P 1 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 2 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 2 0 * * * * * * 1000 0 0 V 3 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 R 4 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 L 5 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 G 6 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 7 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 7 0 * * * * * * 1000 0 0 E 8 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 G 9 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 I 10 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 L 11 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 N 12 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 G 13 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 A 14 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 H 15 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 D 16 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 I 17 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 D 18 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 V 19 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 A 20 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 G 21 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 L 22 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 N 23 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 G 24 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 V 25 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 E 26 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 27 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 L 28 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 A 29 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 G 30 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 K 31 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 F 32 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 A 33 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 T 34 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 I 35 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 G 36 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 A 37 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 N 38 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 G 39 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 V 40 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 K 41 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 L 42 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 A 43 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 G 44 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 D 45 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 N 46 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 G 47 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 T 48 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 N 49 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 A 50 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 V 51 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 G 52 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 L 53 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 F 54 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 R 55 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 E 56 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 D 57 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 L 58 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 G 59 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 D 60 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 M 61 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1000 0 0 V 62 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 62 0 * * * * * * 1000 0 0 N 63 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1000 0 0 A 64 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 S 65 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 65 0 * * * * * * 1000 0 0 E 66 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 K 67 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 A 68 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 S 69 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 F 70 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 71 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 71 0 * * * * * * 1000 0 0 F 72 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 R 73 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 73 0 * * * * * * 1000 0 0 G 74 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1000 0 0 G 75 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1000 0 0 E 76 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 77 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 77 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 78 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 78 0 * * * * * * 1000 0 0 V 79 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 79 0 * * * * * * 1000 0 0 N 80 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1000 0 0 I 81 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1000 0 0 S 82 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 82 0 * * * * * * 1000 0 0 R 83 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 83 0 * * * * * * 1000 0 0 T 84 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 84 0 * * * * * * 1000 0 0 S 85 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 85 0 * * * * * * 1000 0 0 L 86 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1000 0 0 T 87 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 87 0 * * * * * * 1000 0 0 A 88 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1000 0 0 A 89 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1000 0 0 G 90 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1000 0 0 I 91 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1000 0 0 A 92 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1000 0 0 A 93 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1000 0 0 G 94 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1000 0 0 D 95 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1000 0 0 E 96 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1000 0 0 I 97 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1000 0 0 T 98 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 98 0 * * * * * * 1000 0 0 C 99 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1000 0 0 D 100 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1000 0 0 A 101 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1000 0 0 D 102 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1000 0 0 G 103 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1000 0 0 K 104 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1000 0 0 M 105 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1000 0 0 I 106 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1000 0 0 K 107 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1000 0 0 F 108 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1000 0 0 T 109 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 109 0 * * * * * * 1000 0 0 G 110 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1000 0 0 T 111 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 111 0 * * * * * * 1000 0 0 G 112 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1000 0 0 K 113 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1000 0 0 A 114 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1000 0 0 L 115 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1000 0 0 G 116 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1000 0 0 V 117 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 117 0 * * * * * * 1000 0 0 V 118 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 118 0 * * * * * * 1000 0 0 T 119 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 119 0 * * * * * * 1000 0 0 H 120 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1000 0 0 V 121 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 121 0 * * * * * * 1000 0 0 G 122 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1000 0 0 E 123 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 124 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 124 0 * * * * * * 1000 0 0 R 125 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 125 0 * * * * * * 1000 0 0 A 126 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1000 0 0 G 127 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 127 0 * * * * * * 1000 0 0 N 128 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1000 0 0 M 129 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 129 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 130 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 130 0 * * * * * * 1000 0 0 E 131 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 131 0 * * * * * * 1000 0 0 K 132 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 132 0 * * * * * * 1000 0 0 A 133 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 1000 0 0 T 134 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 134 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 135 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 135 0 * * * * * * 1000 0 0 G 136 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 136 0 * * * * * * 1000 0 0 V 137 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 137 0 * * * * * * 1000 0 0 T 138 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 138 0 * * * * * * 1000 0 0 D 139 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 139 0 * * * * * * 1000 0 0 T 140 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 140 0 * * * * * * 1000 0 0 D 141 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 141 0 * * * * * * 1000 0 0 T 142 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 142 0 * * * * * * 1000 0 0 F 143 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 143 0 * * * * * * 1000 0 0 I 144 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 144 0 * * * * * * 1000 0 0 G 145 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 145 0 * * * * * * 1000 0 0 F 146 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 146 0 * * * * * * 1000 0 0 I 147 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 147 0 * * * * * * 1000 0 0 M 148 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 148 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 149 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 149 0 * * * * * * 1000 0 0 V 150 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 150 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //