HHsearch 1.5 NAME c6wc9A_ FAM FILE c6wc9A_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6wc9A_.a3m DATE Sat Apr 18 08:27:55 2020 LENG 367 match states, 367 columns in multiple alignment FILT 211 out of 258 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 5.9 EVD 0.4381 -2.3800 SEQ >ss_dssp CBCCHHHHHHHHHHHHHHHTGGGHHHHTSCSCCSSSCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHBCSBCHHHHHHHHHHHHHHTTHHHHHHH HHHSCSSTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSGGGBCGGGCCCBCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCSCCHHHHHHHSSSCHHHHHHHTHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSBSCBCHHHHHHHHHHHHHHTTHHHHHHHHHSCCSSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTCTTTBCGGG STTCTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTCSSHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHC >sa_dssp EDEBEEBCDDAADCAAEBAADCADCAADBDDCBDEEEDEECEEEADDCDDBACDAADCABEBABDAAEBBCCACDBBEDACECAECAAECACDAAEBBCC BDEDEEEEEAEDDBCEBEECBDEBBDEADDCADEDEDACBEEDDDDBBCEBACDAADCAADCABDAACEBBDEECECEEEDCEEECEECEECADEDCCDC CEACEBADDBBCCADDABDBAAECAEDACEDAAECAADAAACAABAABAABBBCBECDDEEBCCCBADDAADCBCDAADCACCAADCABEDCDDAADDCA 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Transglutaminase-like protein n=2 Tax=Flavobacteriaceae RepID=A9E6I6_9FLAO E=3e-15 s/c=0.44 id=18% cov=49% ---------------------------------------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------SKNRLESLSDAVFAFAATLMVVNL--------------GANADFSSLKEELPM FISFGISFFVMIALWKLHYNFFRRTKYVDNWIIAYNTFFLFMILFYVFPlkslaTAVILKTRMSITELSELFQLYSVGFSLIFLCLVLMYKRAYKKDTKN ENPLILQFYKRHFFIFVLVgLISSVLAYFQLGIKFGLPGIIYSIL---------------------------- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * I 1 * * * * * * * 816 * 3112 * * * * * * * 1661 * * 1 0 * * * * * * 3571 0 0 Q 2 * * * 3359 * * * * * * * * * 1067 * 2297 * 2173 * * 2 0 * * * * * * 3999 0 0 C 3 * 4672 * * * * 4700 * * * * * * * * 239 3739 * * * 3 0 * * * * * * 4912 0 0 S 4 3328 * * * * * 5131 * 2460 4120 4761 * 4418 * * 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