HHsearch 1.5 NAME c6w3gB_ FAM FILE c6w3gB_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6w3gB_.a3m DATE Sat Apr 18 08:26:40 2020 LENG 107 match states, 107 columns in multiple alignment FILT 1 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.4415 0.8586 SEQ >ss_dssp CHHHHHHHHHHHHHHTCHHHHHHHEEEEEEEEETTEEEESHHHHHHHHHHHHHHSSEEEEEEEEEEEETTEEEEEEEEEEEETTEEEEEEEEEEEECCCE EEEEEEC >sa_dssp EBCDBAECACEBACEBDDDBADCBACDEADABBEECECDCDEEACDBACEACEECECCCBDCCEDEEDEECACABABACBCCEEEDDECDACACAEDDCC ACCADCE >ss_pred CCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHCCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEEECCEEEEEEEEEEECCCCEEEEEEEEEEEEHHH HHHHHCC >ss_conf 9213579999998427754301002785168864500137587899999985023214899878997233799999999714688002469999870455 3222059 >Consensus sarkfadefremmktgdstkadelfdpnvrvevgdkryhgreqavdwirhlvdrydhieiridhitvrgdrisivftvhyekngettydryvmvavdraq ikmlrkg >c6w3gB_ SARKFADEFREMMKTGDSTKADELFDPNVRVEVGDKRYHGREQAVDWIRHLVDRYDHIEIRIDHITVRGDRISIVFTVHYEKNGETTYDRYVMVAVDRAQ IKMLRKG # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * S 1 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 A 2 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 R 3 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 K 4 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 F 5 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 A 6 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 D 7 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 E 8 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 F 9 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 R 10 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 E 11 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 M 12 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 M 13 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 K 14 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 T 15 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 G 16 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 D 17 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 S 18 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 T 19 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 K 20 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 A 21 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 D 22 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 E 23 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 L 24 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 F 25 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 D 26 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 P 27 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 N 28 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 V 29 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 R 30 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 V 31 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 E 32 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 V 33 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 G 34 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 D 35 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 K 36 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 R 37 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 38 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 38 0 * * * * * * 1000 0 0 H 39 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 G 40 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 R 41 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 E 42 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 43 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 A 44 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 V 45 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 D 46 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 W 47 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 I 48 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 R 49 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 H 50 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 L 51 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 V 52 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 D 53 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 R 54 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 55 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 55 0 * * * * * * 1000 0 0 D 56 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 H 57 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 I 58 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 E 59 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 I 60 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 R 61 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 61 0 * * * * * * 1000 0 0 I 62 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1000 0 0 D 63 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1000 0 0 H 64 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 I 65 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1000 0 0 T 66 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 V 67 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 R 68 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 G 69 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 D 70 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1000 0 0 R 71 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 71 0 * * * * * * 1000 0 0 I 72 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 S 73 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 73 0 * * * * * * 1000 0 0 I 74 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1000 0 0 V 75 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 75 0 * * * * * * 1000 0 0 F 76 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1000 0 0 T 77 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 77 0 * * * * * * 1000 0 0 V 78 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 78 0 * * * * * * 1000 0 0 H 79 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 80 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 80 0 * * * * * * 1000 0 0 E 81 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1000 0 0 K 82 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1000 0 0 N 83 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1000 0 0 G 84 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1000 0 0 E 85 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1000 0 0 T 86 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 86 0 * * * * * * 1000 0 0 T 87 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 87 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 88 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 88 0 * * * * * * 1000 0 0 D 89 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1000 0 0 R 90 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 90 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 91 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 91 0 * * * * * * 1000 0 0 V 92 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 92 0 * * * * * * 1000 0 0 M 93 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1000 0 0 V 94 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 94 0 * * * * * * 1000 0 0 A 95 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1000 0 0 V 96 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 96 0 * * * * * * 1000 0 0 D 97 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1000 0 0 R 98 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 98 0 * * * * * * 1000 0 0 A 99 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 100 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 100 0 * * * * * * 1000 0 0 I 101 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1000 0 0 K 102 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1000 0 0 M 103 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1000 0 0 L 104 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1000 0 0 R 105 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 105 0 * * * * * * 1000 0 0 K 106 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1000 0 0 G 107 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 107 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //