HHsearch 1.5 NAME c6w2qA_ FAM FILE c6w2qA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6w2qA_.a3m DATE Sat Apr 18 08:22:47 2020 LENG 196 match states, 196 columns in multiple alignment FILT 1 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.3513 -4.7016 SEQ >ss_dssp CHHHHHHHHHHTTCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHSTTSHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSSCHHHHHHHHHHHHHHHHHHTCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHT TCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTCCHHHHHHHHHHHHHHHHHC- >sa_dssp EDCCCCDACCDAECEDCDCACCABDBACDBCCEBEEDDCACDACEBACDAACDACEBEDACAABCAADAABBAABDDCDDDABDCACEAADCABDCADEE EDBCCAACACAACAAACAABCCDEECDCDDAAECAACCABEBDDCACEDECDEEDCDDACCCACEBACCAAEECECDCECAEDADDDBDDCCDDE- >ss_pred CHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >ss_conf 9589999998541999789999999999998617760788999999999999975088788999999999999861365189999998766798989741 727899999999999999999743888789999999999999999984286149999999999999999998349987889999999998775319 >Consensus lkellkraeelakspdpedlkeavrlaeevvrerpgseaakkaleiiqeaaellkkspdpeaiiaaarallkiaattgdneaakqaieaaskaaqlaeqr gddelvcealalliaaqvlllkqqgtsdeevaehvartisqlvqrlkrkgasyevikecvqriveeivealkrsgtsedeineivrrvksevertl >c6w2qA_ LKELLKRAEELAKSPDPEDLKEAVRLAEEVVRERPGSEAAKKALEIIQEAAELLKKSPDPEAIIAAARALLKIAATTGDNEAAKQAIEAASKAAQLAEQR GDDELVCEALALLIAAQVLLLKQQGTSDEEVAEHVARTISQLVQRLKRKGASYEVIKECVQRIVEEIVEALKRSGTSEDEINEIVRRVKSEVERTL # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * L 1 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 K 2 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 E 3 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 L 4 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 L 5 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 K 6 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 R 7 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 A 8 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 E 9 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 E 10 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 L 11 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 A 12 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 K 13 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 S 14 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 P 15 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 D 16 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 P 17 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 E 18 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 D 19 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 L 20 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 K 21 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 E 22 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 A 23 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 V 24 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 R 25 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 L 26 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 A 27 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 E 28 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 E 29 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 V 30 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 V 31 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 R 32 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 E 33 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 R 34 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 P 35 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 G 36 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 S 37 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 E 38 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 A 39 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 A 40 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 K 41 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 K 42 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 A 43 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 L 44 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 E 45 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 I 46 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 I 47 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 48 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 E 49 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 A 50 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 A 51 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 E 52 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 L 53 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 L 54 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 K 55 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 K 56 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 S 57 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 P 58 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 D 59 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 P 60 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 E 61 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1000 0 0 A 62 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1000 0 0 I 63 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1000 0 0 I 64 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 A 65 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1000 0 0 A 66 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 A 67 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 R 68 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 A 69 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 L 70 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1000 0 0 L 71 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1000 0 0 K 72 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 I 73 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1000 0 0 A 74 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1000 0 0 A 75 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1000 0 0 T 76 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 76 0 * * * * * * 1000 0 0 T 77 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 77 0 * * * * * * 1000 0 0 G 78 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1000 0 0 D 79 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1000 0 0 N 80 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1000 0 0 E 81 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1000 0 0 A 82 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1000 0 0 A 83 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1000 0 0 K 84 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 85 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 85 0 * * * * * * 1000 0 0 A 86 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1000 0 0 I 87 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1000 0 0 E 88 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1000 0 0 A 89 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1000 0 0 A 90 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1000 0 0 S 91 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 91 0 * * * * * * 1000 0 0 K 92 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1000 0 0 A 93 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1000 0 0 A 94 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 95 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 95 0 * * * * * * 1000 0 0 L 96 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1000 0 0 A 97 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1000 0 0 E 98 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 99 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 99 0 * * * * * * 1000 0 0 R 100 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 100 0 * * * * * * 1000 0 0 G 101 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1000 0 0 D 102 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1000 0 0 D 103 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1000 0 0 E 104 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1000 0 0 L 105 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1000 0 0 V 106 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 106 0 * * * * * * 1000 0 0 C 107 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1000 0 0 E 108 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1000 0 0 A 109 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1000 0 0 L 110 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1000 0 0 A 111 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1000 0 0 L 112 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1000 0 0 L 113 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1000 0 0 I 114 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1000 0 0 A 115 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1000 0 0 A 116 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 117 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 117 0 * * * * * * 1000 0 0 V 118 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 118 0 * * * * * * 1000 0 0 L 119 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1000 0 0 L 120 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1000 0 0 L 121 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1000 0 0 K 122 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 123 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 123 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 124 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 124 0 * * * * * * 1000 0 0 G 125 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 125 0 * * * * * * 1000 0 0 T 126 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 126 0 * * * * * * 1000 0 0 S 127 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 127 0 * * * * * * 1000 0 0 D 128 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1000 0 0 E 129 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 129 0 * * * * * * 1000 0 0 E 130 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 1000 0 0 V 131 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 131 0 * * * * * * 1000 0 0 A 132 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 132 0 * * * * * * 1000 0 0 E 133 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 1000 0 0 H 134 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 134 0 * * * * * * 1000 0 0 V 135 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 135 0 * * * * * * 1000 0 0 A 136 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 136 0 * * * * * * 1000 0 0 R 137 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 137 0 * * * * * * 1000 0 0 T 138 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 138 0 * * * * * * 1000 0 0 I 139 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 139 0 * * * * * * 1000 0 0 S 140 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 140 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 141 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 141 0 * * * * * * 1000 0 0 L 142 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 142 0 * * * * * * 1000 0 0 V 143 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 143 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 144 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 144 0 * * * * * * 1000 0 0 R 145 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 145 0 * * * * * * 1000 0 0 L 146 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 146 0 * * * * * * 1000 0 0 K 147 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 147 0 * * * * * * 1000 0 0 R 148 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 148 0 * * * * * * 1000 0 0 K 149 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 149 0 * * * * * * 1000 0 0 G 150 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 150 0 * * * * * * 1000 0 0 A 151 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 151 0 * * * * * * 1000 0 0 S 152 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 152 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 153 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 153 0 * * * * * * 1000 0 0 E 154 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 154 0 * * * * * * 1000 0 0 V 155 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 155 0 * * * * * * 1000 0 0 I 156 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 156 0 * * * * * * 1000 0 0 K 157 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 157 0 * * * * * * 1000 0 0 E 158 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 158 0 * * * * * * 1000 0 0 C 159 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 159 0 * * * * * * 1000 0 0 V 160 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 160 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 161 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 161 0 * * * * * * 1000 0 0 R 162 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 162 0 * * * * * * 1000 0 0 I 163 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 163 0 * * * * * * 1000 0 0 V 164 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 164 0 * * * * * * 1000 0 0 E 165 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 165 0 * * * * * * 1000 0 0 E 166 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 166 0 * * * * * * 1000 0 0 I 167 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 167 0 * * * * * * 1000 0 0 V 168 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 168 0 * * * * * * 1000 0 0 E 169 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 169 0 * * * * * * 1000 0 0 A 170 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 170 0 * * * * * * 1000 0 0 L 171 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 171 0 * * * * * * 1000 0 0 K 172 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 172 0 * * * * * * 1000 0 0 R 173 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 173 0 * * * * * * 1000 0 0 S 174 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 174 0 * * * * * * 1000 0 0 G 175 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 175 0 * * * * * * 1000 0 0 T 176 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 176 0 * * * * * * 1000 0 0 S 177 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 177 0 * * * * * * 1000 0 0 E 178 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 178 0 * * * * * * 1000 0 0 D 179 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 179 0 * * * * * * 1000 0 0 E 180 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 180 0 * * * * * * 1000 0 0 I 181 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 181 0 * * * * * * 1000 0 0 N 182 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 182 0 * * * * * * 1000 0 0 E 183 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 183 0 * * * * * * 1000 0 0 I 184 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 184 0 * * * * * * 1000 0 0 V 185 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 185 0 * * * * * * 1000 0 0 R 186 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 186 0 * * * * * * 1000 0 0 R 187 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 187 0 * * * * * * 1000 0 0 V 188 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 188 0 * * * * * * 1000 0 0 K 189 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 189 0 * * * * * * 1000 0 0 S 190 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 190 0 * * * * * * 1000 0 0 E 191 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 191 0 * * * * * * 1000 0 0 V 192 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 192 0 * * * * * * 1000 0 0 E 193 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 193 0 * * * * * * 1000 0 0 R 194 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 194 0 * * * * * * 1000 0 0 T 195 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 195 0 * * * * * * 1000 0 0 L 196 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 196 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //