HHsearch 1.5 NAME c6w2ew_ FAM FILE c6w2ew_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6w2ew_.a3m DATE Sat Jul 18 08:45:55 2020 LENG 68 match states, 68 columns in multiple alignment FILT 1 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.4551 1.3232 SEQ >ss_dssp CHHHHHHHHHHHHHHHHHTTCCCCCSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGGGCC >sa_dssp EEEEEEEEDEDCEECEDEEEEEEEEEEEEEEEEEEEECEEEEEEDECDEEEEEEEDEEEEDEDEEEEE >ss_pred CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >ss_conf 91567789988888877768999999985558777677999975549999997888998875355209 >Consensus spealelaereaerarserwdrcaqvlknrllrveldgimrdhlaraeeirqdldavvafsdglesmq >c6w2ew_ SPEALELAEREAERARSERWDRCAQVLKNRLLRVELDGIMRDHLARAEEIRQDLDAVVAFSDGLESMQ # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * S 1 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 P 2 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 E 3 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 A 4 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 L 5 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 E 6 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 L 7 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 A 8 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 E 9 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 R 10 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 E 11 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 A 12 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 E 13 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 R 14 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 A 15 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 R 16 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 S 17 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 E 18 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 R 19 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 W 20 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 D 21 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 R 22 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 C 23 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 A 24 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 25 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 V 26 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 L 27 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 K 28 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 N 29 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 R 30 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 L 31 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 L 32 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 R 33 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 V 34 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 E 35 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 L 36 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 D 37 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 G 38 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 I 39 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 M 40 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 R 41 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 D 42 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 H 43 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 L 44 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 A 45 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 R 46 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 A 47 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 E 48 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 E 49 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 I 50 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 R 51 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 52 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 D 53 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 L 54 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 D 55 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 A 56 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 V 57 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 V 58 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 A 59 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 F 60 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 S 61 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 61 0 * * * * * * 1000 0 0 D 62 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1000 0 0 G 63 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1000 0 0 L 64 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 E 65 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1000 0 0 S 66 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 M 67 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 68 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 68 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //