HHsearch 1.5 NAME c6vgaA_ FAM FILE c6vgaA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6vgaA_.a3m DATE Sat Aug 22 08:47:51 2020 LENG 105 match states, 105 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.3 EVD 0.3926 -1.4309 SEQ >ss_dssp CEEEEEEECCCSHHHHHHHHHHHHTTCEEEEECSCHHHHHHHHHHHHHTCSSCEEEEEEEESCCCHHHHHHHHHHHHHHGGGTEEEEEESSHHHHHHHHH HHHHC >sa_dssp EDBAAAABBEDEEBCECAEDCADEBDBDBDDBDDDBCDAAEDACDCBDECEEEBDAAAABCCECEEECEEDBEEBCEDAEECEBDCDEAEDBECACDBAD CBBEE >ss_pred CEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCHHHHHHHHH HHHCC >ss_conf 9699999819678999999876640813897169998999999999851768758999970885633123589999987401004566248578899998 75239 >Consensus mxlxvlivsndkklieearkmaekanlelxtvxgsxexxxxxxxexxxkxxxxvkvlvlitxxxxxdektkakxxaxxxrxxxvrxrxvtspdeakrwik efsee >c6vgaA_ MRLVVLIVSNDKKLIEEARKMAEKANLELITVPGSPEEAIRLAQEIAEKAPGPVKVLVLITGSADPDEKTKAKKAAEEARKWNVRVRTVTSPDEAKRWIK EFSEE >UniRef50_UPI0001BEF2D0(1-99:110) UPI0001BEF2D0 related cluster n=1 Tax=unknown RepID=UPI0001BEF2D0 E=1e-19 s/c=0.98 id=60% cov=95% MLLYVLIISNDKKLIEEARKMAEKANLELRTVK--TEDELKKYLEEFRKESQNIKVLILVSNDEELD---KAKELAQKM-EIDVRTRKVTSPDEAKRWIK EFSEE # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * M 1 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1293 0 0 R 2 * * * * * * * * * 1085 * * * * 920 * * * * * 2 0 * * * * * * 1293 0 0 L 3 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1293 0 0 V 4 * * * * * * * * * * * * * * * * * 920 * 1085 4 0 * * * * * * 1293 0 0 V 5 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 5 0 * * * * * * 1293 0 0 L 6 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1293 0 0 I 7 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1293 0 0 V 8 * * * * * * * 1085 * * * * * * * * * 920 * * 8 0 * * * * * * 1293 0 0 S 9 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 9 0 * * * * * * 1293 0 0 N 10 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1293 0 0 D 11 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1293 0 0 K 12 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1293 0 0 K 13 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1293 0 0 L 14 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1293 0 0 I 15 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1293 0 0 E 16 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1293 0 0 E 17 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1293 0 0 A 18 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1293 0 0 R 19 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 19 0 * * * * * * 1293 0 0 K 20 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1293 0 0 M 21 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1293 0 0 A 22 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1293 0 0 E 23 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1293 0 0 K 24 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1293 0 0 A 25 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1293 0 0 N 26 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1293 0 0 L 27 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1293 0 0 E 28 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1293 0 0 L 29 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1293 0 0 I 30 * * * * * * * 920 * * * * * * 1085 * * * * * 30 0 * * * * * * 1293 0 0 T 31 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 31 0 * * * * * * 1293 0 0 V 32 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 32 0 * * * * * * 1293 0 0 P 33 * * * * * * * * 1085 * * * 920 * * * * * * * 33 920 * 1085 * * * * 1293 0 0 G 34 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * 0 1000 0 1000 S 35 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 35 0 * * * * 0 * 1000 0 1000 P 36 * * * * * * * * * * * * 920 * * * 1085 * * * 36 0 * * * * * * 1293 0 0 E 37 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1293 0 0 E 38 * * 1085 920 * * * * * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1293 0 0 A 39 920 * * 1085 * * * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1293 0 0 I 40 * * * * * * * 920 * 1085 * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1293 0 0 R 41 * * * * * * * * 1085 * * * * * 920 * * * * * 41 0 * * * * * * 1293 0 0 L 42 * * * * * * * * 1085 920 * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1293 0 0 A 43 920 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 1085 43 0 * * * * * * 1293 0 0 Q 44 * * * * * * * * * 1085 * * * 920 * * * * * * 44 0 * * * * * * 1293 0 0 E 45 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1293 0 0 I 46 * * * 1085 * * * 920 * * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1293 0 0 A 47 920 * * * 1085 * * * * * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1293 0 0 E 48 * * * 920 * * * * * * * * * * 1085 * * * * * 48 0 * * * * * * 1293 0 0 K 49 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1293 0 0 A 50 920 * * 1085 * * * * * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1293 0 0 P 51 * * * * * * * * * * * * 920 * * 1085 * * * * 51 0 * * * * * * 1293 0 0 G 52 * * * * * 920 * * * * * * * 1085 * * * * * * 52 0 * * * * * * 1293 0 0 P 53 * * * * * * * * * * * 1085 920 * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1293 0 0 V 54 * * * * * * * 1085 * * * * * * * * * 920 * * 54 0 * * * * * * 1293 0 0 K 55 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1293 0 0 V 56 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 56 0 * * * * * * 1293 0 0 L 57 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1293 0 0 V 58 * * * * * * * 1085 * * * * * * * * * 920 * * 58 0 * * * * * * 1293 0 0 L 59 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1293 0 0 I 60 * * * * * * * 920 * * * * * * * * * 1085 * * 60 0 * * * * * * 1293 0 0 T 61 * * * * * * * * * * * * * * * 1085 920 * * * 61 0 * * * * * * 1293 0 0 G 62 * * * * * 920 * * * * * 1085 * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1293 0 0 S 63 * * 1085 * * * * * * * * * * * * 920 * * * * 63 0 * * * * * * 1293 0 0 A 64 920 * * 1085 * * * * * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1293 0 0 D 65 * * 920 1085 * * * * * * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1293 0 0 P 66 * * * * * * * * * 1085 * * 920 * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1293 0 0 D 67 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 67 920 * 1085 * * * * 1293 0 0 E 68 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * 0 1000 0 1000 K 69 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * 0 1000 0 1000 T 70 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 70 0 * * * * 0 * 1000 0 1000 K 71 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1293 0 0 A 72 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1293 0 0 K 73 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1293 0 0 K 74 * * * 1085 * * * * 920 * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1293 0 0 A 75 920 * * * * * * * * 1085 * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1293 0 0 A 76 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1293 0 0 E 77 * * * 920 * * * * * * * * * 1085 * * * * * * 77 0 * * * * * * 1293 0 0 E 78 * * * 920 * * * * 1085 * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1293 0 0 A 79 920 * * * * * * * * * 1085 * * * * * * * * * 79 920 * 1085 * * * * 1293 0 0 R 80 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 80 0 * * * * 0 * 1000 0 1000 K 81 * * * 1085 * * * * 920 * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1293 0 0 W 82 * * * * * * * 1085 * * * * * * * * * * 920 * 82 0 * * * * * * 1293 0 0 N 83 * * 1085 * * * * * * * * 920 * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1293 0 0 V 84 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 84 0 * * * * * * 1293 0 0 R 85 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 85 0 * * * * * * 1293 0 0 V 86 * * * * * * * * * * * * * * * * 1085 920 * * 86 0 * * * * * * 1293 0 0 R 87 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 87 0 * * * * * * 1293 0 0 T 88 * * * * * * * * 1085 * * * * * * * 920 * * * 88 0 * * * * * * 1293 0 0 V 89 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 89 0 * * * * * * 1293 0 0 T 90 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 90 0 * * * * * * 1293 0 0 S 91 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 91 0 * * * * * * 1293 0 0 P 92 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1293 0 0 D 93 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1293 0 0 E 94 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1293 0 0 A 95 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1293 0 0 K 96 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1293 0 0 R 97 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 97 0 * * * * * * 1293 0 0 W 98 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 98 0 * * * * * * 1293 0 0 I 99 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1293 0 0 K 100 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1293 0 0 E 101 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1293 0 0 F 102 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1293 0 0 S 103 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 103 0 * * * * * * 1293 0 0 E 104 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1293 0 0 E 105 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 105 0 * * 0 * * * 1293 0 0 //