HHsearch 1.5 NAME c6v86F_ FAM FILE c6v86F_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6v86F_.a3m DATE Sat Feb 22 08:25:08 2020 LENG 47 match states, 47 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.4 EVD 0.4413 1.1062 SEQ >ss_dssp CHHHHHHHHHTTCSCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHTTC >sa_dssp EDEEBCECBEECBEDEEDBDDDCEEBDECEDEEDBDDCCEDBDEDEE >ss_pred CHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC >ss_conf 90499999864326945789999999863324688999999975409 >Consensus xkxxlxqlaxdcxxkpxxxxexxxkixxasxeaqlxdxkxxiixsai >c6v86F_ LKITLEQLAKDCISKPKMREEYLLKINQASSEAQLIDLKKAIIRSAI >UniRef50_Q86606(349-395:395) Phosphoprotein n=10 Tax=Paramyxovirinae RepID=PHOSP_SV41 E=3e-12 s/c=1.55 id=50% cov=102% MKLMLIQLANDCMGKPDQKAEIVAKIHAATREAQLLDIKRSIIKSAI # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * L 1 * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1404 0 0 K 2 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1404 0 0 I 3 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1404 0 0 T 4 * * * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * 4 0 * * * * * * 1404 0 0 L 5 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1404 0 0 E 6 * * * 1000 * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1404 0 0 Q 7 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 7 0 * * * * * * 1404 0 0 L 8 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1404 0 0 A 9 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1404 0 0 K 10 * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1404 0 0 D 11 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1404 0 0 C 12 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1404 0 0 I 13 * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1404 0 0 S 14 * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * * 14 0 * * * * * * 1404 0 0 K 15 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1404 0 0 P 16 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1404 0 0 K 17 * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1404 0 0 M 18 * * * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * 18 0 * * * * * * 1404 0 0 R 19 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 19 0 * * * * * * 1404 0 0 E 20 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1404 0 0 E 21 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1404 0 0 Y 22 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 1000 22 0 * * * * * * 1404 0 0 L 23 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * 23 0 * * * * * * 1404 0 0 L 24 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1404 0 0 K 25 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1404 0 0 I 26 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1404 0 0 N 27 * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1404 0 0 Q 28 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 28 0 * * * * * * 1404 0 0 A 29 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1404 0 0 S 30 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 30 0 * * * * * * 1404 0 0 S 31 * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * 31 0 * * * * * * 1404 0 0 E 32 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1404 0 0 A 33 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1404 0 0 Q 34 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 34 0 * * * * * * 1404 0 0 L 35 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1404 0 0 I 36 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1404 0 0 D 37 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1404 0 0 L 38 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1404 0 0 K 39 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1404 0 0 K 40 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 40 0 * * * * * * 1404 0 0 A 41 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 41 0 * * * * * * 1404 0 0 I 42 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1404 0 0 I 43 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1404 0 0 R 44 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 44 0 * * * * * * 1404 0 0 S 45 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 45 0 * * * * * * 1404 0 0 A 46 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1404 0 0 I 47 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 47 0 * * 0 * * * 1404 0 0 //