HHsearch 1.5 NAME c6usmB_ FAM FILE c6usmB_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6usmB_.a3m DATE Mon Jan 4 15:22:30 2021 LENG 164 match states, 164 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.4 EVD 0.3881 -1.8450 SEQ >ss_dssp CEEEEECHHHHHTBCHHHHCCCCCCCCTTSCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHTCCGGGTTCCCEEEEEECSSSSSEEEEECCCTTCCTTTHHHHHHHHHH HHHTTTBSSCCCCCEEECBCTTSCBCCCHHHHHHHTGGGCCCCCEEEECSTTSTTTTTCHHHHC >sa_dssp CBCADBDCDBBEBCCEEADECECECDDECBEECEEDCCAAAAAACCABEEBEECEEDBDEBEBABAABDCEEEECBCABBCEDEECCCECCCECBCDBAC EBAEEBBEDEBEBEBECCDCEEEECCECCDEBADEDABECDEBBBACBCCEECDECBCBCEEBE >ss_pred CCEEEEECCEEECCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHEEEEECCCCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHH HHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHCC >ss_conf 9159960540311578736999960445272445724668999987887533788715541302003055115754899960688684567898854577 7888752882589980342445720127899999852201317898520367899887654049 >Consensus rgvxqvxxnxxdxandnwwcxxxxldxxdwxxlxxxxrlmaxyxxxvaxxldxxxgpxxgcxyfxqvexnxfxxgxhihvvggpxlxprnxxxxvegxfn xvlxxfxsxxixxxfxpxxsxkgkyxrdgxxfixxylmxkxnvixxvtnxxxyxxxcxsxxxrr >c6usmB_ RGVLQVSSNVLDCANDNWWCSLLDLDTSDWEPLTHTNRLMAIYLSSVASKLDLTGGPLAGCLYFFQVECNKFEEGYHIHVVGGPGLNPRNLTVCVEGLFN NVLYHFVTENVKLKFLPGMTTKGKYFRDGEQFIENYLMKKINVVWCVTNIDGYIDTCISATFRR >UniRef50_Q88271(5-171:687) NS1 n=6 Tax=Erythrovirus RepID=Q88271_9VIRU E=8e-41 s/c=1.00 id=51% cov=101% RGVIQVNANFTDFANDNWWCCFFQLDVDDWPELRGPERLMAHYICKVAALLDTPSGPFLGCKYFLQVEGNHFDNGFHIHVViGGPFLTPRNVCSAVEGGF NKVLADFTSPTITVQFKPAVSKKGKYHRDGFDFVTYYLMPKLypNVIYSVTNLEEYQYVCNSLCYRR # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * R 1 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 1 0 * * * * * * 1402 0 0 G 2 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1402 0 0 V 3 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 3 0 * * * * * * 1402 0 0 L 4 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1402 0 0 Q 5 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 5 0 * * * * * * 1402 0 0 V 6 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 6 0 * * * * * * 1402 0 0 S 7 * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * 7 0 * * * * * * 1402 0 0 S 8 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 8 0 * * * * * * 1402 0 0 N 9 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1402 0 0 V 10 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * 10 0 * * * * * * 1402 0 0 L 11 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * 11 0 * * * * * * 1402 0 0 D 12 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1402 0 0 C 13 * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1402 0 0 A 14 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1402 0 0 N 15 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1402 0 0 D 16 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1402 0 0 N 17 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1402 0 0 W 18 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 18 0 * * * * * * 1402 0 0 W 19 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 19 0 * * * * * * 1402 0 0 C 20 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1402 0 0 S 21 * 1000 * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 21 0 * * * * * * 1402 0 0 L 22 * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1402 0 0 L 23 * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1402 0 0 D 24 * * 1000 * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 24 0 * * * * * * 1402 0 0 L 25 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1402 0 0 D 26 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1402 0 0 T 27 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * 27 0 * * * * * * 1402 0 0 S 28 * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 28 0 * * * * * * 1402 0 0 D 29 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1402 0 0 W 30 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 30 0 * * * * * * 1402 0 0 E 31 * * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1402 0 0 P 32 * * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1402 0 0 L 33 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1402 0 0 T 34 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * 1000 * * * 34 0 * * * * * * 1402 0 0 H 35 * * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1402 0 0 T 36 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * 36 0 * * * * * * 1402 0 0 N 37 * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1402 0 0 R 38 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 38 0 * * * * * * 1402 0 0 L 39 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1402 0 0 M 40 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1402 0 0 A 41 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1402 0 0 I 42 * * * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1402 0 0 Y 43 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 43 0 * * * * * * 1402 0 0 L 44 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1402 0 0 S 45 * 1000 * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 45 0 * * * * * * 1402 0 0 S 46 * * * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * * 46 0 * * * * * * 1402 0 0 V 47 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 47 0 * * * * * * 1402 0 0 A 48 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1402 0 0 S 49 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 49 0 * * * * * * 1402 0 0 K 50 * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1402 0 0 L 51 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1402 0 0 D 52 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1402 0 0 L 53 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * 53 0 * * * * * * 1402 0 0 T 54 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * 54 0 * * * * * * 1402 0 0 G 55 * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * * 55 0 * * * * * * 1402 0 0 G 56 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1402 0 0 P 57 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1402 0 0 L 58 * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1402 0 0 A 59 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1402 0 0 G 60 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1402 0 0 C 61 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1402 0 0 L 62 * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1402 0 0 Y 63 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 63 0 * * * * * * 1402 0 0 F 64 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1402 0 0 F 65 * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1402 0 0 Q 66 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 66 0 * * * * * * 1402 0 0 V 67 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 67 0 * * * * * * 1402 0 0 E 68 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1402 0 0 C 69 * 1000 * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1402 0 0 N 70 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1402 0 0 K 71 * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1402 0 0 F 72 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1402 0 0 E 73 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1402 0 0 E 74 * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1402 0 0 G 75 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1402 0 0 Y 76 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 76 0 * * * * * * 1402 0 0 H 77 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1402 0 0 I 78 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1402 0 0 H 79 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1402 0 0 V 80 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 80 0 * * * * * * 1402 0 0 V 81 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 81 1000 1000 * 0 * * * 1402 1000 0 G 82 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1402 0 0 G 83 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1402 0 0 P 84 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1402 0 0 G 85 * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1402 0 0 L 86 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1402 0 0 N 87 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * 87 0 * * * * * * 1402 0 0 P 88 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1402 0 0 R 89 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 89 0 * * * * * * 1402 0 0 N 90 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1402 0 0 L 91 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * 91 0 * * * * * * 1402 0 0 T 92 * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 92 0 * * * * * * 1402 0 0 V 93 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * 1000 * * 93 0 * * * * * * 1402 0 0 C 94 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1402 0 0 V 95 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 95 0 * * * * * * 1402 0 0 E 96 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1402 0 0 G 97 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1402 0 0 L 98 * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1402 0 0 F 99 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1402 0 0 N 100 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1402 0 0 N 101 * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1402 0 0 V 102 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 102 0 * * * * * * 1402 0 0 L 103 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1402 0 0 Y 104 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 104 0 * * * * * * 1402 0 0 H 105 * * 1000 * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1402 0 0 F 106 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1402 0 0 V 107 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * 107 0 * * * * * * 1402 0 0 T 108 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 108 0 * * * * * * 1402 0 0 E 109 * * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1402 0 0 N 110 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * 110 0 * * * * * * 1402 0 0 V 111 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 111 0 * * * * * * 1402 0 0 K 112 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * 112 0 * * * * * * 1402 0 0 L 113 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * 113 0 * * * * * * 1402 0 0 K 114 * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * 114 0 * * * * * * 1402 0 0 F 115 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1402 0 0 L 116 * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1402 0 0 P 117 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1402 0 0 G 118 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1402 0 0 M 119 * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * 119 0 * * * * * * 1402 0 0 T 120 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 120 0 * * * * * * 1402 0 0 T 121 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * 121 0 * * * * * * 1402 0 0 K 122 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1402 0 0 G 123 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 1402 0 0 K 124 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1402 0 0 Y 125 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 125 0 * * * * * * 1402 0 0 F 126 * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1402 0 0 R 127 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 127 0 * * * * * * 1402 0 0 D 128 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1402 0 0 G 129 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 129 0 * * * * * * 1402 0 0 E 130 * * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 1402 0 0 Q 131 * * 1000 * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 131 0 * * * * * * 1402 0 0 F 132 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 132 0 * * * * * * 1402 0 0 I 133 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 133 0 * * * * * * 1402 0 0 E 134 * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 134 0 * * * * * * 1402 0 0 N 135 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 135 0 * * * * * * 1402 0 0 Y 136 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 136 0 * * * * * * 1402 0 0 L 137 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 137 0 * * * * * * 1402 0 0 M 138 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 138 0 * * * * * * 1402 0 0 K 139 * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * * * * 139 0 * * * * * * 1402 0 0 K 140 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 140 0 * * * * * * 1402 0 0 I 141 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 141 1000 1000 * 1000 1000 * * 1402 1000 0 N 142 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 142 0 * * * * * * 1402 0 0 V 143 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 143 0 * * * * * * 1402 0 0 V 144 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 144 0 * * * * * * 1402 0 0 W 145 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 145 0 * * * * * * 1402 0 0 C 146 * 1000 * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 146 0 * * * * * * 1402 0 0 V 147 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 147 0 * * * * * * 1402 0 0 T 148 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 148 0 * * * * * * 1402 0 0 N 149 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 149 0 * * * * * * 1402 0 0 I 150 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 150 0 * * * * * * 1402 0 0 D 151 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 151 0 * * * * * * 1402 0 0 G 152 * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 152 0 * * * * * * 1402 0 0 Y 153 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 153 0 * * * * * * 1402 0 0 I 154 * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * * 154 0 * * * * * * 1402 0 0 D 155 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 155 0 * * * * * * 1402 0 0 T 156 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * 156 0 * * * * * * 1402 0 0 C 157 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 157 0 * * * * * * 1402 0 0 I 158 * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * * * * * 158 0 * * * * * * 1402 0 0 S 159 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 159 0 * * * * * * 1402 0 0 A 160 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * 160 0 * * * * * * 1402 0 0 T 161 * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 161 0 * * * * * * 1402 0 0 F 162 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 162 0 * * * * * * 1402 0 0 R 163 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 163 0 * * * * * * 1402 0 0 R 164 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 164 0 * * 0 * * * 1402 0 0 //