HHsearch 1.5 NAME c6u08E_ FAM FILE c6u08E_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6u08E_.a3m DATE Sat Jul 18 08:35:45 2020 LENG 132 match states, 132 columns in multiple alignment FILT 1 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.4145 -0.4803 SEQ >ss_dssp CEEETTEEECCCCCCCCSSSCEEEEEEECTTSCEEEEEEESSCCCSCTTSTTTTSHHHHHHHHHHHTTCCEEEEEECCTTCBCHHHHHHHHHHSCTTCEE EEECCTTCCCCSTTCBSSCEEEECCSCCCCCC >sa_dssp ECEAEEDEBEECECEEDEEDBCABACBCCEEDCDDDDEBDCEDECECEDCDAABCABACAABCACEEEBEDAAAAABCDDBACCEACECACCAACEEBDA BABBCEEBEDEEEECCCECDDADBCEEDBEDE >ss_pred CCCCCCEEECCCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCEEEECCCCCCEEEEECCHHHCCCCCCCE EEECCCCCCEEECCCCCCEEEEECCCCCCCCC >ss_conf 9421651514762555278246789998256751000000688888887446431155403555046842222573179862357642201016565632 45368875100116776415884588888898 >Consensus syalgpyqisapqlpayngqtvgtfyyvndaggleskvfssggptpypnyanaghvegqsalfxrdngiseglvfhnnpegtcgfcvnxtetllpenakx tvvppegaipvkrgatgetkvftgnsnspksp >c6u08E_ SYALGPYQISAPQLPAYNGQTVGTFYYVNDAGGLESKVFSSGGPTPYPNYANAGHVEGQSALFXRDNGISEGLVFHNNPEGTCGFCVNXTETLLPENAKX TVVPPEGAIPVKRGATGETKVFTGNSNSPKSP # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * S 1 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 2 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 2 0 * * * * * * 1000 0 0 A 3 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 L 4 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 G 5 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 P 6 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 7 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 7 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 8 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 I 9 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 S 10 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 A 11 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 P 12 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 13 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 L 14 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 P 15 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 A 16 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 17 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 17 0 * * * * * * 1000 0 0 N 18 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 G 19 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 20 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 T 21 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 V 22 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 G 23 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 T 24 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 F 25 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 26 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 26 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 27 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 27 0 * * * * * * 1000 0 0 V 28 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 N 29 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 D 30 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 A 31 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 G 32 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 G 33 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 L 34 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 E 35 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 S 36 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 K 37 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 V 38 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 F 39 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 S 40 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 S 41 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 G 42 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 G 43 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 P 44 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 T 45 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 P 46 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 47 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 47 0 * * * * * * 1000 0 0 P 48 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 N 49 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 50 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 50 0 * * * * * * 1000 0 0 A 51 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 N 52 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 A 53 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 G 54 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 H 55 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 V 56 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 E 57 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 G 58 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 59 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 S 60 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 A 61 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1000 0 0 L 62 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1000 0 0 F 63 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1000 0 0 X 64 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 64 * * * * * * * 1000 0 0 R 65 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 65 0 * * * * * * 1000 0 0 D 66 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 N 67 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 G 68 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 I 69 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 S 70 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 70 0 * * * * * * 1000 0 0 E 71 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1000 0 0 G 72 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 L 73 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1000 0 0 V 74 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 74 0 * * * * * * 1000 0 0 F 75 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1000 0 0 H 76 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1000 0 0 N 77 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1000 0 0 N 78 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1000 0 0 P 79 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1000 0 0 E 80 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1000 0 0 G 81 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1000 0 0 T 82 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 82 0 * * * * * * 1000 0 0 C 83 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1000 0 0 G 84 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1000 0 0 F 85 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1000 0 0 C 86 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1000 0 0 V 87 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 87 0 * * * * * * 1000 0 0 N 88 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1000 0 0 X 89 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 89 * * * * * * * 1000 0 0 T 90 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 90 0 * * * * * * 1000 0 0 E 91 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1000 0 0 T 92 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 92 0 * * * * * * 1000 0 0 L 93 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1000 0 0 L 94 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1000 0 0 P 95 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1000 0 0 E 96 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1000 0 0 N 97 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1000 0 0 A 98 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1000 0 0 K 99 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1000 0 0 X 100 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 100 * * * * * * * 1000 0 0 T 101 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 101 0 * * * * * * 1000 0 0 V 102 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 102 0 * * * * * * 1000 0 0 V 103 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 103 0 * * * * * * 1000 0 0 P 104 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1000 0 0 P 105 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1000 0 0 E 106 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1000 0 0 G 107 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1000 0 0 A 108 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1000 0 0 I 109 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1000 0 0 P 110 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1000 0 0 V 111 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 111 0 * * * * * * 1000 0 0 K 112 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1000 0 0 R 113 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 113 0 * * * * * * 1000 0 0 G 114 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1000 0 0 A 115 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1000 0 0 T 116 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 116 0 * * * * * * 1000 0 0 G 117 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1000 0 0 E 118 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1000 0 0 T 119 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 119 0 * * * * * * 1000 0 0 K 120 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1000 0 0 V 121 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 121 0 * * * * * * 1000 0 0 F 122 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1000 0 0 T 123 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 123 0 * * * * * * 1000 0 0 G 124 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1000 0 0 N 125 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 125 0 * * * * * * 1000 0 0 S 126 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 126 0 * * * * * * 1000 0 0 N 127 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 127 0 * * * * * * 1000 0 0 S 128 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 128 0 * * * * * * 1000 0 0 P 129 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 129 0 * * * * * * 1000 0 0 K 130 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 1000 0 0 S 131 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 131 0 * * * * * * 1000 0 0 P 132 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 132 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //