HHsearch 1.5 NAME c6tdwC_ FAM FILE c6tdwC_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6tdwC_.a3m DATE Sat Nov 30 08:24:05 2019 LENG 157 match states, 157 columns in multiple alignment FILT 3 out of 7 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.6 EVD 0.3955 -1.7981 SEQ >ss_dssp CHHHHHHHHHHHHTSSCCSSSCCCCHHHHHTTTTSCHHHHHHHHHHHHTTTTSCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSCHHHHHTTTSSSSCGGGHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTCCHHHHHHHHHHHHHHC >sa_dssp EDEDCDDABCAACEEDEBEEEDDDDCEDACEEBEEDBCDDADEBBEDDBBEECEEEDDDEBDECADECBEDBDCCECEEDDCEEECADEECEEDBEDCBD ECDCEEBDDDBEECCEEEDEEEDACECBDECCDEEBEEEEDDDEEADECADDACEDD >ss_pred CCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCC >ss_conf 9126999999860025552037410242433004205888764222344431584542346789999999999877769999862024668678778889 877999999999853203540232899999999641007999899999999875329 >Consensus xxxKxxtLyxvLTGexhxknxvpvKxCNixxxFGaxWksdlxxxxxsxYAxxLpAxerxxxkxxLexxxxRvxlTRYTxxELxxYxxxxxGPxxvDAxax exxiexgkAxlxxxxxxxxxkxxGxxafxkxVxxExkxAnWxxxxxKxxxDxVxaax >c6tdwC_ DAVKFQTLYNVLTGKQHLKDQVPVKDCNLTAIFGASWKADLNKWFDSEYAPKLPAAERDSAKKSLDLYLKRVDLTRYTREELTTYGILACGPGKVDALTE KHLLETGKARLEELTAGLGNKDEGVNAFRKEVEQEGKYANWPAEKSKALADKVIAAS >UniRef50_Q4DZN8(28-161:162) Putative uncharacterized protein n=3 Tax=Trypanosoma RepID=Q4DZN8_TRYCR E=9e-40 s/c=1.22 id=42% cov=84% ---KMSTLYKVLTGELHFKNKVPVKECNIVYQFGEDWESEL-----SAYAKALSAQQ----KSVLERQMVRLKITRYTVAELSDYCGD--GPAHLDASAR EANIEQGVAFL---------KEKGIEAFEKYVAEEAVNANWKPADVKKFIDAVK--- >UniRef50_Q4Q0W8(27-159:160) Putative uncharacterized protein n=3 Tax=Leishmania RepID=Q4Q0W8_LEIMA E=3e-38 s/c=1.20 id=37% cov=85% ---KMASLHKLLTGEVQFRNNALLKTCNIEHNFGATWKSDIEA-----YAKCLPADERS----CLERQVARVMLTRYTTRELAEYCGE--GPEHVDAVAR EANIAQAKAHAQQY---------GADKLEAYVKAESKNAGWSEAETKSFLDAVKAA- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * D 1 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 A 2 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 V 3 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 K 4 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1667 0 0 F 5 * * * * 1242 * * * * * 793 * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1667 0 0 Q 6 1768 * * * * * * * * * * * * 1242 * 1818 * * * * 6 0 * * * * * * 1667 0 0 T 7 * * * * * * * * * * * * * * * 1768 501 * * * 7 0 * * * * * * 1667 0 0 L 8 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1667 0 0 Y 9 * * * * * * 1768 * * * * * * * * * * * * 501 9 0 * * * * * * 1667 0 0 N 10 * * * * * * * * 793 * * 1242 * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1667 0 0 V 11 * * * * * * * * * 1768 * * * * * * * 501 * * 11 0 * * * * * * 1667 0 0 L 12 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1667 0 0 T 13 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 13 0 * * * * * * 1667 0 0 G 14 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1667 0 0 K 15 * * * 793 * * * * 1242 * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1667 0 0 Q 16 * * * * * * * * * 1818 * * * 1242 * * * 1768 * * 16 0 * * * * * * 1667 0 0 H 17 * * * * * * 501 * * * * * * 1768 * * * * * * 17 0 * * * * * * 1667 0 0 L 18 * * * * 793 * * * * 1242 * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1667 0 0 K 19 * * * * * * * * 501 * * * * * 1768 * * * * * 19 0 * * * * * * 1667 0 0 D 20 * * 1242 * * * * * * * * 793 * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1667 0 0 Q 21 * * * * * * * * 1818 * * 1768 * 1242 * * * * * * 21 0 * * * * * * 1667 0 0 V 22 1768 * * * * * * * * * * * * * * * * 501 * * 22 0 * * * * * * 1667 0 0 P 23 * * * * * * * * * 1768 * * 501 * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1667 0 0 V 24 * * * * * * * * * 1768 * * * * * * * 501 * * 24 0 * * * * * * 1667 0 0 K 25 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1667 0 0 D 26 * * 1242 1818 * * * * * * * * * * * * 1768 * * * 26 0 * * * * * * 1667 0 0 C 27 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1667 0 0 N 28 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1667 0 0 L 29 * * * * * * * 793 * 1242 * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1667 0 0 T 30 * * * 1768 * * * * * * * * * * * * 1242 1818 * * 30 0 * * * * * * 1667 0 0 A 31 1242 * * * * * 1768 * * * * * * * * * * * * 1818 31 0 * * * * * * 1667 0 0 I 32 * * * * * * * 1242 * * * 1768 * 1818 * * * * * * 32 0 * * * * * * 1667 0 0 F 33 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1667 0 0 G 34 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1667 0 0 A 35 481 * * 1818 * * * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1667 0 0 S 36 * * 1818 * * * * * * * * * * * * 1242 1768 * * * 36 0 * * * * * * 1667 0 0 W 37 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 37 0 * * * * * * 1667 0 0 K 38 * * * 1818 * * * * 481 * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1667 0 0 A 39 1242 * * * * * * * * * * * * * * 793 * * * * 39 0 * * * * * * 1667 0 0 D 40 * * 481 1818 * * * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1667 0 0 L 41 * * * * * * * 1768 * 501 * * * * * * * * * * 41 481 * 1818 * * * * 1667 0 0 N 42 * * * 1202 * * * * * * * 823 * * * * * * * * 42 0 * * * * * 0 1450 0 1000 K 43 1202 * * * * * * * 823 * * * * * * * * * * * 43 823 * 1202 * * * 0 1450 0 1000 W 44 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 44 0 * * * * * 0 1000 0 1345 F 45 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * 0 1000 0 1345 D 46 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * 1000 1000 1000 0 1345 S 47 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 47 0 * * * * * 0 1405 0 1000 E 48 1205 * * 821 * * * * * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * 0 * 1405 0 1000 Y 49 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 49 0 * * * * * * 1667 0 0 A 50 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1667 0 0 P 51 * * * * * * * * 793 * * * 1242 * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1667 0 0 K 52 1818 1768 * * * * * * 1242 * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1667 0 0 L 53 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1667 0 0 P 54 * * * * * * * * * * * * 481 * * 1818 * * * * 54 0 * * * * * * 1667 0 0 A 55 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1667 0 0 A 56 1242 * 1768 * * * * * * * * * * 1818 * * * * * * 56 0 * * * * * * 1667 0 0 E 57 * * * 481 * * * * * * * * * 1818 * * * * * * 57 481 * 1818 * * * * 1667 0 0 R 58 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 58 0 * * * * * 0 1450 0 1000 D 59 * * 823 * * * * * * * * * * * * 1202 * * * * 59 823 * 1202 * * * 0 1450 0 1000 S 60 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 60 0 * * * * * 0 1000 0 1345 A 61 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * 1000 1000 1000 0 1345 K 62 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * 0 1405 0 1000 K 63 * * * * * * * * 821 * * * * * * 1205 * * * * 63 0 * * * * 0 * 1405 0 1000 S 64 * 1768 * * * * * * * * * * * * * 1242 * 1818 * * 64 0 * * * * * * 1667 0 0 L 65 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1667 0 0 D 66 * * 1242 793 * * * * * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1667 0 0 L 67 * * * * * * * * * 1242 * * * * 793 * * * * * 67 0 * * * * * * 1667 0 0 Y 68 * * * * * * * * * * * * * 793 * * * * * 1242 68 0 * * * * * * 1667 0 0 L 69 * * * * * * * * * 1242 1818 * * * * * * 1768 * * 69 0 * * * * * * 1667 0 0 K 70 1768 * * * * * * * 1242 * * * * * * * * 1818 * * 70 0 * * * * * * 1667 0 0 R 71 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 71 0 * * * * * * 1667 0 0 V 72 * * * * * * * * * 1818 * * * * * * * 481 * * 72 0 * * * * * * 1667 0 0 D 73 * * 1242 * * * * * 1818 * 1768 * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1667 0 0 L 74 * * * * * * * 1818 * 481 * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1667 0 0 T 75 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 75 0 * * * * * * 1667 0 0 R 76 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 76 0 * * * * * * 1667 0 0 Y 77 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 77 0 * * * * * * 1667 0 0 T 78 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 78 0 * * * * * * 1667 0 0 R 79 * * * * * * * * * * * * * * 1242 * 1768 1818 * * 79 0 * * * * * * 1667 0 0 E 80 1818 * * 1242 * * * * * * * * * * 1768 * * * * * 80 0 * * * * * * 1667 0 0 E 81 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1667 0 0 L 82 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1667 0 0 T 83 1768 * * * * * * * * * * * * * * 1818 1242 * * * 83 0 * * * * * * 1667 0 0 T 84 * * 1818 1768 * * * * * * * * * * * * 1242 * * * 84 0 * * * * * * 1667 0 0 Y 85 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 85 0 * * * * * * 1667 0 0 G 86 * 793 * * * 1242 * * * * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1667 0 0 I 87 * * * * * 793 * 1242 * * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1667 0 0 L 88 * * 1818 1768 * * * * * 1242 * * * * * * * * * * 88 1242 * 793 * * * * 1667 0 0 A 89 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * 0 1000 0 1345 C 90 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 90 0 * * * * 0 * 1000 0 1345 G 91 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1667 0 0 P 92 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1667 0 0 G 93 1818 * * 1768 * 1242 * * * * * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1667 0 0 K 94 * * * * * * 793 * 1242 * * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1667 0 0 V 95 * * * * * * * * * 1818 * * * * * * * 481 * * 95 0 * * * * * * 1667 0 0 D 96 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1667 0 0 A 97 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1667 0 0 L 98 * * * * * * * * * 1242 * * * * * 1818 * 1768 * * 98 0 * * * * * * 1667 0 0 T 99 793 * * * * * * * * * * * * * * * 1242 * * * 99 0 * * * * * * 1667 0 0 E 100 * * * 1242 * * * * * * * * * * 793 * * * * * 100 0 * * * * * * 1667 0 0 K 101 * * * 793 * * * * 1242 * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1667 0 0 H 102 793 * * * * * 1242 * * * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1667 0 0 L 103 * * * * * * * * * 1242 * 793 * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1667 0 0 L 104 * * * * * * * 793 * 1242 * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1667 0 0 E 105 1768 * * 501 * * * * * * * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1667 0 0 T 106 * * * * * * * * * * * * * 793 * * 1242 * * * 106 0 * * * * * * 1667 0 0 G 107 1768 * * * * 501 * * * * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1667 0 0 K 108 * * * * * * * * 481 * * * * * * * * 1818 * * 108 0 * * * * * * 1667 0 0 A 109 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1667 0 0 R 110 * * * * 1818 * 1768 * * * * * * * 1242 * * * * * 110 0 * * * * * * 1667 0 0 L 111 1768 * * * * * * * * 501 * * * * * * * * * * 111 481 * 1818 * * * * 1667 0 0 E 112 * * * 823 * * * * * * * * * 1202 * * * * * * 112 0 * * * * * 0 1450 0 1000 E 113 * * * 823 * * * * * * * * * 1202 * * * * * * 113 0 * * * * * 0 1450 0 1000 L 114 * * * * * * * * * 823 * * * * * * * * * 1202 114 823 * 1202 * * * 0 1450 0 1000 T 115 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 115 0 * * * * * 0 1000 0 1345 A 116 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * 0 1000 0 1345 G 117 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * 0 1000 0 1345 L 118 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * 0 1000 0 1345 G 119 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 119 0 * * * * * 0 1000 0 1345 N 120 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 120 0 * * * * 1000 1000 1000 0 1345 K 121 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * 0 1405 0 1000 D 122 * * 821 1205 * * * * * * * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * 0 1405 0 1000 E 123 * * * 821 * * * * 1205 * * * * * * * * * * * 123 0 * * * * 0 * 1405 0 1000 G 124 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1667 0 0 V 125 1768 * * * * * * 1818 * * * * * * * * * 1242 * * 125 0 * * * * * * 1667 0 0 N 126 * * 1768 1818 * * * * * * * 1242 * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1667 0 0 A 127 501 * * * * * * * 1768 * * * * * * * * * * * 127 0 * * * * * * 1667 0 0 F 128 * * * * 501 * * * * 1768 * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1667 0 0 R 129 * * * 793 * * * * * * * * * * 1242 * * * * * 129 0 * * * * * * 1667 0 0 K 130 1768 * * * * * * * 501 * * * * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 1667 0 0 E 131 * * * 1242 * * * * * * * * * * * * * * * 793 131 0 * * * * * * 1667 0 0 V 132 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 132 0 * * * * * * 1667 0 0 E 133 1818 * * 1242 * * * * 1768 * * * * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 1667 0 0 Q 134 1768 * * 1818 * * * * * * * * * 1242 * * * * * * 134 0 * * * * * * 1667 0 0 E 135 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 1667 0 0 G 136 1818 * * * * 1242 * * * * * * * * * 1768 * * * * 136 0 * * * * * * 1667 0 0 K 137 * * * * * * * * 481 * * * * * * * * 1818 * * 137 0 * * * * * * 1667 0 0 Y 138 * * * * * * * * * * * 793 * * * * * * * 1242 138 0 * * * * * * 1667 0 0 A 139 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 139 0 * * * * * * 1667 0 0 N 140 * * * * * 1768 * * * * * 501 * * * * * * * * 140 0 * * * * * * 1667 0 0 W 141 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 141 0 * * * * * * 1667 0 0 P 142 * * * * * * * * 1818 * * * 1242 * * 1768 * * * * 142 0 * * * * * * 1667 0 0 A 143 1242 * * 1768 * * * * * * * * 1818 * * * * * * * 143 0 * * * * * * 1667 0 0 E 144 793 * * 1242 * * * * * * * * * * * * * * * * 144 0 * * * * * * 1667 0 0 K 145 * * 1818 1768 * * * * 1242 * * * * * * * * * * * 145 0 * * * * * * 1667 0 0 S 146 * * * * * * * * * * * * * * * 1242 1768 1818 * * 146 0 * * * * * * 1667 0 0 K 147 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 147 0 * * * * * * 1667 0 0 A 148 1242 * * * * * * * 1818 * * * * * * 1768 * * * * 148 0 * * * * * * 1667 0 0 L 149 * * * * 793 * * * * 1242 * * * * * * * * * * 149 0 * * * * * * 1667 0 0 A 150 1242 * * * * * * 1818 * 1768 * * * * * * * * * * 150 0 * * * * * * 1667 0 0 D 151 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 151 0 * * * * * * 1667 0 0 K 152 793 * * * * * * * 1242 * * * * * * * * * * * 152 0 * * * * * * 1667 0 0 V 153 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 153 0 * * * * * * 1667 0 0 I 154 * * * * * * * 1242 793 * * * * * * * * * * * 154 0 * * * * * * 1667 0 0 A 155 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 155 0 * * * * * * 1450 0 0 A 156 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 156 0 * * * * * * 1450 0 0 S 157 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 157 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //