HHsearch 1.5 NAME c6tdvd_ FAM FILE c6tdvd_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6tdvd_.a3m DATE Sat Nov 30 08:22:49 2019 LENG 186 match states, 186 columns in multiple alignment FILT 1 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.4092 -1.0676 SEQ >ss_dssp CCHHHHHHHHHHHHHHTGGGCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGGGCCHHHHHHHHSTTTTTTTTSCTHHHHSTTSSCHHHHHHHSCCSHHH HHHHHHHTSCCCCCCTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTCCSHHHHHHHHHHHTCCHHHHHHHHHHHHHHHTSCCC >sa_dssp EEBCECAEBACEABEECEECCDEDADDACCDACDBDEEADECCEECCBEBBADBACDECADCDBDACDDBDEEDECCBCEEEEDCEEEDDDECBDDDEEB ECAEEBDEDECEDDEEDEEBECCADECBDECCDCDCCDACDDBBEDACEBEBBAABAACBBDEEDECEDACECACDDADEEEEDEE >ss_pred CCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCHHHCCCCCHHHHHHCCCCCHHH HHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >ss_conf 9740343108999999997653455555303437689999999998762464334523554330711020000002201213654577832207787199 99999863433100003034554444567766423567640146777645666899999985154201468899999888862679 >Consensus thaelhlfdldefmqtykrlqtrqdwlienkckksrlfsyvaaviaftvgksatmsdeailakidpyvtsevrvqrgawwrsgyftkeevemmtpkgpia ryykfllgvrrfplkhgalswacgfvpawltftslnhwaqnrrlnryltqesvfgemarelvrgktadeattsvmarvekeilgvh >c6tdvd_ THAELHLFDLDEFMQTYKRLQTRQDWLIENKCKKSRLFSYVAAVIAFTVGKSATMSDEAILAKIDPYVTSEVRVQRGAWWRSGYFTKEEVEMMTPKGPIA RYYKFLLGVRRFPLKHGALSWACGFVPAWLTFTSLNHWAQNRRLNRYLTQESVFGEMARELVRGKTADEATTSVMARVEKEILGVH # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * T 1 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 H 2 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 A 3 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 E 4 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 L 5 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 H 6 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 L 7 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 F 8 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 D 9 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 L 10 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 D 11 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 E 12 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 F 13 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 M 14 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 15 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 T 16 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 17 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 17 0 * * * * * * 1000 0 0 K 18 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 R 19 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 L 20 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 21 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 T 22 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 R 23 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 24 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 D 25 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 W 26 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 L 27 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 I 28 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 E 29 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 N 30 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 K 31 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 C 32 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 K 33 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 K 34 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 S 35 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 R 36 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 L 37 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 F 38 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 S 39 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 40 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 40 0 * * * * * * 1000 0 0 V 41 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 A 42 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 A 43 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 V 44 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 I 45 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 A 46 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 F 47 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 T 48 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 V 49 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 G 50 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 K 51 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 S 52 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 A 53 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 T 54 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 M 55 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 S 56 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 D 57 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 E 58 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 A 59 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 I 60 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 L 61 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1000 0 0 A 62 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1000 0 0 K 63 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1000 0 0 I 64 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 D 65 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1000 0 0 P 66 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 67 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 67 0 * * * * * * 1000 0 0 V 68 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 T 69 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 S 70 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 70 0 * * * * * * 1000 0 0 E 71 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1000 0 0 V 72 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 R 73 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 73 0 * * * * * * 1000 0 0 V 74 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 74 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 75 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 75 0 * * * * * * 1000 0 0 R 76 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 76 0 * * * * * * 1000 0 0 G 77 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1000 0 0 A 78 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1000 0 0 W 79 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 79 0 * * * * * * 1000 0 0 W 80 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 80 0 * * * * * * 1000 0 0 R 81 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 81 0 * * * * * * 1000 0 0 S 82 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 82 0 * * * * * * 1000 0 0 G 83 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 84 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 84 0 * * * * * * 1000 0 0 F 85 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1000 0 0 T 86 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 86 0 * * * * * * 1000 0 0 K 87 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1000 0 0 E 88 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1000 0 0 E 89 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1000 0 0 V 90 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 90 0 * * * * * * 1000 0 0 E 91 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1000 0 0 M 92 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1000 0 0 M 93 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1000 0 0 T 94 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 94 0 * * * * * * 1000 0 0 P 95 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1000 0 0 K 96 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1000 0 0 G 97 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1000 0 0 P 98 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1000 0 0 I 99 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1000 0 0 A 100 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1000 0 0 R 101 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 101 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 102 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 102 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 103 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 103 0 * * * * * * 1000 0 0 K 104 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1000 0 0 F 105 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1000 0 0 L 106 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1000 0 0 L 107 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1000 0 0 G 108 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1000 0 0 V 109 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 109 0 * * * * * * 1000 0 0 R 110 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 110 0 * * * * * * 1000 0 0 R 111 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 111 0 * * * * * * 1000 0 0 F 112 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1000 0 0 P 113 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1000 0 0 L 114 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1000 0 0 K 115 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1000 0 0 H 116 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1000 0 0 G 117 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1000 0 0 A 118 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1000 0 0 L 119 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1000 0 0 S 120 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 120 0 * * * * * * 1000 0 0 W 121 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 121 0 * * * * * * 1000 0 0 A 122 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1000 0 0 C 123 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 1000 0 0 G 124 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1000 0 0 F 125 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 125 0 * * * * * * 1000 0 0 V 126 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 126 0 * * * * * * 1000 0 0 P 127 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 127 0 * * * * * * 1000 0 0 A 128 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1000 0 0 W 129 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 129 0 * * * * * * 1000 0 0 L 130 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 1000 0 0 T 131 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 131 0 * * * * * * 1000 0 0 F 132 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 132 0 * * * * * * 1000 0 0 T 133 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 133 0 * * * * * * 1000 0 0 S 134 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 134 0 * * * * * * 1000 0 0 L 135 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 1000 0 0 N 136 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 136 0 * * * * * * 1000 0 0 H 137 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 137 0 * * * * * * 1000 0 0 W 138 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 138 0 * * * * * * 1000 0 0 A 139 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 139 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 140 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 140 0 * * * * * * 1000 0 0 N 141 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 141 0 * * * * * * 1000 0 0 R 142 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 142 0 * * * * * * 1000 0 0 R 143 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 143 0 * * * * * * 1000 0 0 L 144 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 144 0 * * * * * * 1000 0 0 N 145 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 145 0 * * * * * * 1000 0 0 R 146 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 146 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 147 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 147 0 * * * * * * 1000 0 0 L 148 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 148 0 * * * * * * 1000 0 0 T 149 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 149 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 150 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 150 0 * * * * * * 1000 0 0 E 151 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 151 0 * * * * * * 1000 0 0 S 152 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 152 0 * * * * * * 1000 0 0 V 153 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 153 0 * * * * * * 1000 0 0 F 154 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 154 0 * * * * * * 1000 0 0 G 155 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 155 0 * * * * * * 1000 0 0 E 156 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 156 0 * * * * * * 1000 0 0 M 157 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 157 0 * * * * * * 1000 0 0 A 158 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 158 0 * * * * * * 1000 0 0 R 159 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 159 0 * * * * * * 1000 0 0 E 160 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 160 0 * * * * * * 1000 0 0 L 161 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 161 0 * * * * * * 1000 0 0 V 162 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 162 0 * * * * * * 1000 0 0 R 163 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 163 0 * * * * * * 1000 0 0 G 164 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 164 0 * * * * * * 1000 0 0 K 165 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 165 0 * * * * * * 1000 0 0 T 166 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 166 0 * * * * * * 1000 0 0 A 167 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 167 0 * * * * * * 1000 0 0 D 168 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 168 0 * * * * * * 1000 0 0 E 169 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 169 0 * * * * * * 1000 0 0 A 170 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 170 0 * * * * * * 1000 0 0 T 171 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 171 0 * * * * * * 1000 0 0 T 172 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 172 0 * * * * * * 1000 0 0 S 173 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 173 0 * * * * * * 1000 0 0 V 174 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 174 0 * * * * * * 1000 0 0 M 175 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 175 0 * * * * * * 1000 0 0 A 176 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 176 0 * * * * * * 1000 0 0 R 177 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 177 0 * * * * * * 1000 0 0 V 178 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 178 0 * * * * * * 1000 0 0 E 179 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 179 0 * * * * * * 1000 0 0 K 180 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 180 0 * * * * * * 1000 0 0 E 181 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 181 0 * * * * * * 1000 0 0 I 182 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 182 0 * * * * * * 1000 0 0 L 183 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 183 0 * * * * * * 1000 0 0 G 184 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 184 0 * * * * * * 1000 0 0 V 185 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 185 0 * * * * * * 1000 0 0 H 186 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 186 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //