HHsearch 1.5 NAME c6tdnB_ FAM FILE c6tdnB_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6tdnB_.a3m DATE Sat Aug 15 08:20:11 2020 LENG 87 match states, 87 columns in multiple alignment FILT 1 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.4607 2.1080 SEQ >ss_dssp CCCCCCCSTHHHHHHHHCCHHHHHHHHGGGSCCCCCCCCCSCCSCCCCCCCCSSSHHHHHHHHHHHSCHHHHHHHHHHHHHHHTTCC >sa_dssp EEEEEEEEDECBDDACECEEECBDEDBDEECDEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEDEDECCDCEDCCEEBDEBCDCABDECDEECDEEDE >ss_pred CCCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >ss_conf 987646420126765176612389999699986067678887877677876544711579999974245468999999879775329 >Consensus gpgsyapldtelseieglqdddlaallgkefiregggsgggsgggsmnkptssdgwkddylsrlsrlsknqlmalalklkqqqleqg >c6tdnB_ GPGSYAPLDTELSEIEGLQDDDLAALLGKEFIREGGGSGGGSGGGSMNKPTSSDGWKDDYLSRLSRLSKNQLMALALKLKQQQLEQG # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * G 1 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 P 2 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 G 3 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 S 4 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 5 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 5 0 * * * * * * 1000 0 0 A 6 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 P 7 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 L 8 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 D 9 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 T 10 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 E 11 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 L 12 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 S 13 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 E 14 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 I 15 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 E 16 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 G 17 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 L 18 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 19 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 D 20 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 D 21 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 D 22 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 L 23 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 A 24 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 A 25 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 L 26 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 L 27 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 G 28 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 K 29 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 E 30 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 F 31 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 I 32 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 R 33 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 E 34 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 G 35 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 G 36 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 G 37 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 S 38 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 G 39 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 G 40 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 G 41 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 S 42 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 G 43 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 G 44 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 G 45 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 S 46 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 M 47 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 N 48 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 K 49 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 P 50 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 T 51 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 S 52 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 S 53 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 D 54 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 G 55 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 W 56 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 K 57 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 D 58 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 D 59 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 60 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 60 0 * * * * * * 1000 0 0 L 61 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1000 0 0 S 62 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 62 0 * * * * * * 1000 0 0 R 63 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 63 0 * * * * * * 1000 0 0 L 64 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 S 65 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 65 0 * * * * * * 1000 0 0 R 66 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 L 67 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 S 68 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 K 69 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 N 70 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 71 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 71 0 * * * * * * 1000 0 0 L 72 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 M 73 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1000 0 0 A 74 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1000 0 0 L 75 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1000 0 0 A 76 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1000 0 0 L 77 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1000 0 0 K 78 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1000 0 0 L 79 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1000 0 0 K 80 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 81 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 81 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 82 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 82 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 83 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 83 0 * * * * * * 1000 0 0 L 84 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1000 0 0 E 85 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 86 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 86 0 * * * * * * 1000 0 0 G 87 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 87 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //