HHsearch 1.5 NAME c6so5F_ FAM FILE c6so5F_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6so5F_.a3m DATE Sat Sep 12 08:35:58 2020 LENG 101 match states, 101 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.1 EVD 0.3988 -1.7246 SEQ >ss_dssp CHHHHHHHHHHHHHHHHHSSCCSCSHHHHHHHHHHHHHTTTTCCCCCCCCCSCHHHHHHHSCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH C >sa_dssp EBEEDBCEEBDECCEDCDEEDEEEBDEEBDEDBEDBDDDDEEDDEDEDEEDEEDEDCEEEDEDEEDCDECDDEECEDCCDECBEDCBEEBDDDBEEDEEE E >ss_pred CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC C >ss_conf 9479999999999999999999989999999999989987542377889999999999628809997423666888999999999999999999998611 9 >Consensus FRxxxxxxLAxxVRxFVCxYLSIFAPFLTLxLxxMGLxKYfpksekkikttvltaalllsgipaevinrsmdtyskmgevftdlcvyfftfifchelldy w >c6so5F_ FRLVGCALLALGVRAFVCKYLSIFAPFLTLQLAYMGLYKYFPKSEKKIKTTVLTAALLLSGIPAEVINRSMDTYSKMGEVFTDLCVYFFTFIFCHELLDY W >UniRef50_Q6NZ16(147-186:274) Zgc:77424 n=6 Tax=Danio rerio RepID=Q6NZ16_DANRE E=2e-07 s/c=1.43 id=63% cov=41% FRTTASVTLAVFVRIFVCQYLSIFAPFLTLELGFMGLHKY------------------------------------------------------------ - # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * F 1 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1275 0 0 R 2 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 2 0 * * * * * * 1275 0 0 L 3 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * 3 0 * * * * * * 1275 0 0 V 4 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * 4 0 * * * * * * 1275 0 0 G 5 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1275 0 0 C 6 * 1000 * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 6 0 * * * * * * 1275 0 0 A 7 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 7 0 * * * * * * 1275 0 0 L 8 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * 8 0 * * * * * * 1275 0 0 L 9 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1275 0 0 A 10 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1275 0 0 L 11 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * 11 0 * * * * * * 1275 0 0 G 12 * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1275 0 0 V 13 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 13 0 * * * * * * 1275 0 0 R 14 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 14 0 * * * * * * 1275 0 0 A 15 1000 * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1275 0 0 F 16 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1275 0 0 V 17 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 17 0 * * * * * * 1275 0 0 C 18 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1275 0 0 K 19 * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * 19 0 * * * * * * 1275 0 0 Y 20 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 20 0 * * * * * * 1275 0 0 L 21 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1275 0 0 S 22 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 22 0 * * * * * * 1275 0 0 I 23 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1275 0 0 F 24 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1275 0 0 A 25 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1275 0 0 P 26 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1275 0 0 F 27 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1275 0 0 L 28 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1275 0 0 T 29 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 29 0 * * * * * * 1275 0 0 L 30 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1275 0 0 Q 31 * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 31 0 * * * * * * 1275 0 0 L 32 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1275 0 0 A 33 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1275 0 0 Y 34 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 34 0 * * * * * * 1275 0 0 M 35 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1275 0 0 G 36 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1275 0 0 L 37 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1275 0 0 Y 38 * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 38 0 * * * * * * 1275 0 0 K 39 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1275 0 0 Y 40 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 40 0 * * * * * * 1275 0 0 F 41 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 P 42 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 K 43 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 S 44 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 E 45 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 K 46 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 K 47 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 I 48 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 K 49 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 T 50 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 T 51 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 V 52 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 L 53 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 T 54 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 A 55 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 A 56 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 L 57 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 L 58 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 L 59 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 S 60 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 G 61 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1000 0 0 I 62 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1000 0 0 P 63 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1000 0 0 A 64 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 E 65 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1000 0 0 V 66 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 I 67 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 N 68 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 R 69 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 S 70 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 70 0 * * * * * * 1000 0 0 M 71 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1000 0 0 D 72 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 T 73 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 73 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 74 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 74 0 * * * * * * 1000 0 0 S 75 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 75 0 * * * * * * 1000 0 0 K 76 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1000 0 0 M 77 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1000 0 0 G 78 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1000 0 0 E 79 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1000 0 0 V 80 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 80 0 * * * * * * 1000 0 0 F 81 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1000 0 0 T 82 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 82 0 * * * * * * 1000 0 0 D 83 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1000 0 0 L 84 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1000 0 0 C 85 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1000 0 0 V 86 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 86 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 87 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 87 0 * * * * * * 1000 0 0 F 88 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1000 0 0 F 89 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1000 0 0 T 90 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 90 0 * * * * * * 1000 0 0 F 91 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1000 0 0 I 92 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1000 0 0 F 93 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1000 0 0 C 94 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1000 0 0 H 95 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1000 0 0 E 96 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1000 0 0 L 97 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1000 0 0 L 98 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1000 0 0 D 99 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 100 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 100 0 * * * * * * 1000 0 0 W 101 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 101 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //