HHsearch 1.5 NAME c6s4sE_ FAM FILE c6s4sE_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6s4sE_.a3m DATE Sat Jul 18 08:33:06 2020 LENG 139 match states, 139 columns in multiple alignment FILT 1 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.4295 0.3811 SEQ >ss_dssp CCCCEEEEECSEEEEESSSCSTTCCEEEEEETTCEEEEEECSSSEEEEEEEETTEEEEEEEEGGGEEEEEECTTSCEEEEECCEEEEESSTTCSSSSEEE EETTCEEEECCCTTSEEEEEEGGGTEEEEEEGGGEECCC >sa_dssp EEEECEBCACCBAAAACDCDBCEBECCCDCEDDCECEADDDDEDBBBBDCEDEEEDCDACABDCABEDEDEDEEEBBCACACBAABABCCDEBEDEDDCD AEDCCEBEADDCEDCCCCBECEEDEDDACABDCAADDEE >ss_pred CCCCEEEEEEEEECCCCCCHHHCCHHHHHHCCCCEEEEEECCCCEEEEEEECCCCEEEEEEEEHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEEEEECCCCCCCCCEEE HHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCEEECCCEEEECCC >ss_conf 9642028677400224583111704243203675679865057447778615864010110001322212677860454554125540465016764364 554025432444577022587323433750210120049 >Consensus mmeninivikdvgyfqdkpqflnsksvrqwkhgtkvkltkhnshwytgvvkdgnksvrgyiyhsmakvtsknsdgsvnatinahafcwdnkklnggdfin lkrgfkgithpasdgfyplyfasrkktfyiprymfdikk >c6s4sE_ MMENINIVIKDVGYFQDKPQFLNSKSVRQWKHGTKVKLTKHNSHWYTGVVKDGNKSVRGYIYHSMAKVTSKNSDGSVNATINAHAFCWDNKKLNGGDFIN LKRGFKGITHPASDGFYPLYFASRKKTFYIPRYMFDIKK # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * M 1 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 M 2 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 E 3 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 N 4 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 I 5 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 N 6 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 I 7 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 V 8 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 I 9 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 K 10 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 D 11 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 V 12 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 G 13 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 14 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 14 0 * * * * * * 1000 0 0 F 15 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 16 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 D 17 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 K 18 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 P 19 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 20 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 F 21 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 L 22 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 N 23 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 S 24 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 K 25 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 S 26 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 V 27 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 R 28 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 29 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 W 30 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 K 31 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 H 32 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 G 33 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 T 34 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 K 35 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 V 36 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 K 37 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 L 38 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 T 39 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 K 40 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 H 41 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 N 42 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 S 43 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 H 44 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 W 45 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 46 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 46 0 * * * * * * 1000 0 0 T 47 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 G 48 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 V 49 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 V 50 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 K 51 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 D 52 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 G 53 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 N 54 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 K 55 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 S 56 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 V 57 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 R 58 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 G 59 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 60 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 60 0 * * * * * * 1000 0 0 I 61 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 62 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 62 0 * * * * * * 1000 0 0 H 63 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1000 0 0 S 64 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 M 65 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1000 0 0 A 66 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 K 67 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 V 68 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 T 69 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 S 70 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 70 0 * * * * * * 1000 0 0 K 71 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1000 0 0 N 72 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 S 73 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 73 0 * * * * * * 1000 0 0 D 74 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1000 0 0 G 75 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1000 0 0 S 76 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 76 0 * * * * * * 1000 0 0 V 77 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 77 0 * * * * * * 1000 0 0 N 78 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1000 0 0 A 79 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1000 0 0 T 80 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 80 0 * * * * * * 1000 0 0 I 81 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1000 0 0 N 82 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1000 0 0 A 83 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1000 0 0 H 84 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1000 0 0 A 85 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1000 0 0 F 86 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1000 0 0 C 87 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1000 0 0 W 88 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 88 0 * * * * * * 1000 0 0 D 89 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1000 0 0 N 90 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1000 0 0 K 91 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1000 0 0 K 92 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1000 0 0 L 93 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1000 0 0 N 94 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1000 0 0 G 95 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1000 0 0 G 96 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1000 0 0 D 97 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1000 0 0 F 98 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1000 0 0 I 99 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1000 0 0 N 100 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1000 0 0 L 101 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1000 0 0 K 102 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1000 0 0 R 103 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 103 0 * * * * * * 1000 0 0 G 104 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1000 0 0 F 105 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1000 0 0 K 106 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1000 0 0 G 107 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1000 0 0 I 108 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1000 0 0 T 109 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 109 0 * * * * * * 1000 0 0 H 110 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1000 0 0 P 111 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1000 0 0 A 112 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1000 0 0 S 113 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 113 0 * * * * * * 1000 0 0 D 114 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1000 0 0 G 115 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1000 0 0 F 116 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 117 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 117 0 * * * * * * 1000 0 0 P 118 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1000 0 0 L 119 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 120 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 120 0 * * * * * * 1000 0 0 F 121 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1000 0 0 A 122 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1000 0 0 S 123 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 123 0 * * * * * * 1000 0 0 R 124 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 124 0 * * * * * * 1000 0 0 K 125 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 125 0 * * * * * * 1000 0 0 K 126 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1000 0 0 T 127 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 127 0 * * * * * * 1000 0 0 F 128 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 129 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 129 0 * * * * * * 1000 0 0 I 130 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 1000 0 0 P 131 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 131 0 * * * * * * 1000 0 0 R 132 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 132 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 133 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 133 0 * * * * * * 1000 0 0 M 134 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 134 0 * * * * * * 1000 0 0 F 135 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 1000 0 0 D 136 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 136 0 * * * * * * 1000 0 0 I 137 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 137 0 * * * * * * 1000 0 0 K 138 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 138 0 * * * * * * 1000 0 0 K 139 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 139 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //