HHsearch 1.5 NAME c6re86_ FAM FILE c6re86_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6re86_.a3m DATE Sat Jul 6 09:14:52 2019 LENG 124 match states, 124 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.3 EVD 0.4168 -0.6412 SEQ >ss_dssp CCCHHHHHHHHHHTSCSSSTTTTSHHHHHHSSCCCCCCCCCCCSCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSSSSCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSCHHHHHH HHHTTSHHHHSCCCCCCSSSSCCC >sa_dssp EEEDEDDDEECDEECEEEDDEECDEEBEEECDEEEEEEEEEEEEEEEDEEEEEDDEDEEEEDCEDCDEDEEEEDCDEDDEEEDDEEECDDEEDEEEDDEE EEDDEDEEDEEEEEEEEEEEDDEE >ss_pred CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCC >ss_conf 9503888996442101457898888777540666766200026203679999999999998723421121000010079999989999985311788998 873247422110122232210369 >Consensus exxsvaxxiksvxetsganllxslkxxxaxxxpxypxxaxxxgxsxqaxiaxxgxxswxlyrxdxqxxahewivdlxlxvlqaawxisfxslipfrxvxx axrgmapataxxxnglxsfssisl >c6re86_ EGNSVAGIIKSVNETSGANLLSSLKTIKAQAAPIYPAAASSTGYSTQAKIALFGALSWILYRADGQSKAHEWIVDLNLNVLQAAWLISFSSLIPFRAVYF AFRGMAPATASTLNGLKTFSSISL >UniRef50_A8IAL8(28-145:151) Mitochondrial F1F0 ATP synthase associated 13.3 kDa protein n=1 Tax=Chlamydomonas reinhardtii RepID=A8IAL8_CHLRE E=1e-37 s/c=1.33 id=61% cov=96% EESSVANLVKSVSETSGANLLASLKAEQAKLKPFYPEPAAAAGWSLQARVAVLGLISWTLYRLDTQARAHEWIVDLSLDVLQAAWYVSFLSLIPFRSVFV ALRGMAPATAAPFNGLRS------ # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * E 1 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1310 0 0 G 2 * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1310 0 0 N 3 * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * 3 0 * * * * * * 1310 0 0 S 4 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 4 0 * * * * * * 1310 0 0 V 5 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 5 0 * * * * * * 1310 0 0 A 6 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1310 0 0 G 7 * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1310 0 0 I 8 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1310 0 0 I 9 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 9 0 * * * * * * 1310 0 0 K 10 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1310 0 0 S 11 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 11 0 * * * * * * 1310 0 0 V 12 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 12 0 * * * * * * 1310 0 0 N 13 * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * 13 0 * * * * * * 1310 0 0 E 14 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1310 0 0 T 15 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 15 0 * * * * * * 1310 0 0 S 16 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 16 0 * * * * * * 1310 0 0 G 17 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1310 0 0 A 18 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1310 0 0 N 19 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1310 0 0 L 20 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1310 0 0 L 21 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1310 0 0 S 22 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 22 0 * * * * * * 1310 0 0 S 23 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 23 0 * * * * * * 1310 0 0 L 24 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1310 0 0 K 25 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1310 0 0 T 26 1000 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 26 0 * * * * * * 1310 0 0 I 27 * * * 1000 * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1310 0 0 K 28 * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * 28 0 * * * * * * 1310 0 0 A 29 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1310 0 0 Q 30 * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * 30 0 * * * * * * 1310 0 0 A 31 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1310 0 0 A 32 1000 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1310 0 0 P 33 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1310 0 0 I 34 * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1310 0 0 Y 35 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 35 0 * * * * * * 1310 0 0 P 36 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1310 0 0 A 37 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1310 0 0 A 38 1000 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1310 0 0 A 39 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1310 0 0 S 40 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 40 0 * * * * * * 1310 0 0 S 41 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 41 0 * * * * * * 1310 0 0 T 42 1000 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 42 0 * * * * * * 1310 0 0 G 43 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1310 0 0 Y 44 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 44 0 * * * * * * 1310 0 0 S 45 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 45 0 * * * * * * 1310 0 0 T 46 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * 46 0 * * * * * * 1310 0 0 Q 47 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 47 0 * * * * * * 1310 0 0 A 48 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1310 0 0 K 49 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 49 0 * * * * * * 1310 0 0 I 50 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 50 0 * * * * * * 1310 0 0 A 51 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1310 0 0 L 52 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * 52 0 * * * * * * 1310 0 0 F 53 * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1310 0 0 G 54 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1310 0 0 A 55 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1310 0 0 L 56 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1310 0 0 S 57 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 57 0 * * * * * * 1310 0 0 W 58 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 58 0 * * * * * * 1310 0 0 I 59 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * 59 0 * * * * * * 1310 0 0 L 60 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1310 0 0 Y 61 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 61 0 * * * * * * 1310 0 0 R 62 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 62 0 * * * * * * 1310 0 0 A 63 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1310 0 0 D 64 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1310 0 0 G 65 * * * * * 1000 * * * * * * * * * * 1000 * * * 65 0 * * * * * * 1310 0 0 Q 66 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 66 0 * * * * * * 1310 0 0 S 67 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 67 0 * * * * * * 1310 0 0 K 68 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 68 0 * * * * * * 1310 0 0 A 69 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1310 0 0 H 70 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1310 0 0 E 71 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1310 0 0 W 72 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 72 0 * * * * * * 1310 0 0 I 73 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1310 0 0 V 74 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 74 0 * * * * * * 1310 0 0 D 75 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1310 0 0 L 76 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1310 0 0 N 77 * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * 77 0 * * * * * * 1310 0 0 L 78 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1310 0 0 N 79 * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1310 0 0 V 80 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 80 0 * * * * * * 1310 0 0 L 81 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1310 0 0 Q 82 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 82 0 * * * * * * 1310 0 0 A 83 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1310 0 0 A 84 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1310 0 0 W 85 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 85 0 * * * * * * 1310 0 0 L 86 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 86 0 * * * * * * 1310 0 0 I 87 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 87 0 * * * * * * 1310 0 0 S 88 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 88 0 * * * * * * 1310 0 0 F 89 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1310 0 0 S 90 * * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * 90 0 * * * * * * 1310 0 0 S 91 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 91 0 * * * * * * 1310 0 0 L 92 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1310 0 0 I 93 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1310 0 0 P 94 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1310 0 0 F 95 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1310 0 0 R 96 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 96 0 * * * * * * 1310 0 0 A 97 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 97 0 * * * * * * 1310 0 0 V 98 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 98 0 * * * * * * 1310 0 0 Y 99 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 99 0 * * * * * * 1310 0 0 F 100 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * 100 0 * * * * * * 1310 0 0 A 101 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1310 0 0 F 102 * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1310 0 0 R 103 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 103 0 * * * * * * 1310 0 0 G 104 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1310 0 0 M 105 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1310 0 0 A 106 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1310 0 0 P 107 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1310 0 0 A 108 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1310 0 0 T 109 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 109 0 * * * * * * 1310 0 0 A 110 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1310 0 0 S 111 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 111 0 * * * * * * 1310 0 0 T 112 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * 112 0 * * * * * * 1310 0 0 L 113 * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1310 0 0 N 114 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1310 0 0 G 115 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1310 0 0 L 116 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1310 0 0 K 117 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 117 0 * * * * * * 1310 0 0 T 118 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 118 0 * * * * * * 1310 0 0 F 119 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1000 0 0 S 120 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 120 0 * * * * * * 1000 0 0 S 121 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 121 0 * * * * * * 1000 0 0 I 122 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1000 0 0 S 123 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 123 0 * * * * * * 1000 0 0 L 124 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 124 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //