HHsearch 1.5 NAME c6qs0A_ FAM FILE c6qs0A_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6qs0A_.a3m DATE Sat Mar 21 09:02:34 2020 LENG 122 match states, 122 columns in multiple alignment FILT 5 out of 9 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.9 EVD 0.4004 -1.3045 SEQ >ss_dssp CCCCCTHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSTTTCHHHHHHTCCHHHHHHHHHHHHHTSCHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSHHHHHHHHHHHHH HHGGGGGTCCHHHHHHHHHTCC >sa_dssp EEDEDCBDECBEECEBDEDBDEABECABEAACDBAECDECAECBEEDDDDEBCABCAACDAADECEDECACDAADDABEBCCDBDEEEEDCEEACCDAAD BABBBBEECDBCEAADDACECD >ss_pred CCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHC >ss_conf 9641359999999378712466899999999853025312134776305489999999999998201049999999962534789898888899999999 9866886315723588865409 >Consensus xxxxxxxxxxxsxLxLsnxExxtLtFfvnaLKxelxkxxxgxHFxxxxxdxsKIExyVkkFllkLkxxkvKeLLxxIKxxkdnpxxDakelxxxesxLAs xFDnxFnxxxSxttxxxxkxtx >c6qs0A_ GAMGTPLEKLVSRLNLNNTEKETLTFLTNLLKEKLVDPNIGLHFKNSGGDESKIEESVQKFLSELKEDEIKDLLAKIKENKDKKEKDPEELNTYKSILAS GFDGIFNQADSKTTLNKLKDTI >UniRef50_B5RPG7(48-164:176) Putative lipoprotein n=2 Tax=Borrelia RepID=B5RPG7_BORDL E=6e-25 s/c=0.98 id=40% cov=88% -------------LNLNVDEKKTLDFFVETLKDEYAKTTSGtnVHFKQKVNNINKIEEYVEQFFLELKANaKAKELLHIVKDAKENPGV--GGLDTVKSS IASAFDNFFgttpeprsNKSKSISTFESIKTT- >UniRef50_Q0SL71(47-154:172) Putative uncharacterized protein n=4 Tax=Borrelia burgdorferi group RepID=Q0SL71_BORAP E=2e-06 s/c=0.50 id=40% cov=79% -----------SILGLSNEELDTLTFFVNALKNELPKAYTGaAHFNIYLKeDISQIEDYVKRFLFKLKDKgKVKELISYIKYGRDNQPNvegrdeqlgiD AKEHYRIESRLAGVFDNYF---------------- >UniRef50_C0RA68(75-188:223) Putative uncharacterized protein n=4 Tax=Borrelia burgdorferi RepID=C0RA68_BORBU E=0.0006 s/c=0.40 id=37% cov=84% -------------LGLSNKEFDTLIFFVNALKCELTKGyNKFPHFDIFLNrDASKIENYIKKFLLKLQGlGKVKELLSYIQYGRDNPPNvegkdeehgiD AKDLYKLESRLAYVFDNYFMLLNSPTS-------- >UniRef50_B5RPG5(48-161:197) Uncharacterized conserved protein n=15 Tax=Borrelia RepID=B5RPG5_BORDL E=5e-27 s/c=1.07 id=37% cov=77% -------------LKLSNDELGILTFFVNALKDELPKAhTSAAHFNiHLKGDLSKVEGYVKRFFLKLNDkDKVRELLGYIKYGIDNPPNvegrdahvgmD AKEHYRLERRLASVFDDYF---------------- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * G 1 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 A 2 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 M 3 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 G 4 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 T 5 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 P 6 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 L 7 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 E 8 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 K 9 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 L 10 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 V 11 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 S 12 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 12 0 * * * * * * 1516 0 0 R 13 * * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * * * 13 0 * * * * * * 1516 0 0 L 14 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 2057 0 0 N 15 * * * * * 1496 * * 2468 * * 1106 * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 2057 0 0 L 16 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 2057 0 0 N 17 * * * * * * * * * * * 1106 * * * 901 * * * * 17 0 * * * * * * 2057 0 0 N 18 * * * * * * * * * * * 370 * * * * * 2143 * * 18 0 * * * * * * 2057 0 0 T 19 * * 1296 2541 * * * * 2451 * * * * * * * 2070 * * * 19 0 * * * * * * 2057 0 0 E 20 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 2057 0 0 K 21 * * * * 2451 * * * 1106 1504 * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 2057 0 0 E 22 * * 1496 2070 * 2468 * * 2143 * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 2057 0 0 T 23 * * * * * * * 2468 * * * * * * * * 288 * * * 23 0 * * * * * * 2057 0 0 L 24 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 2057 0 0 T 25 * * 2143 * * * * 2451 * * * * * * * * 759 * * * 25 0 * * * * * * 2057 0 0 F 26 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 2057 0 0 L 27 * * * * 393 * * * * 2070 * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 2057 0 0 T 28 * * * * * * * * * * * * * * * * 2070 393 * * 28 0 * * * * * * 2057 0 0 N 29 * * * 2143 * * * * * * * 370 * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 2057 0 0 L 30 901 * * * * * * * * 2070 * * * * * * 2143 * * * 30 0 * * * * * * 2057 0 0 L 31 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 2057 0 0 K 32 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 2057 0 0 E 33 * 2451 1296 2070 * * * * * * * 2541 * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 2057 0 0 K 34 * * * 393 * * * * 2070 * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 2057 0 0 L 35 * * * * * * * * * 370 * * * * * * * * * 2143 35 0 * * * * * * 2057 0 0 V 36 2143 * * * * * * * * * * * 1504 * * * 2451 2070 * * 36 0 * * * * * * 2057 0 0 D 37 * * 2070 * * * * * 393 * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 2057 0 0 P 38 1504 * * * * 2451 * * * * * * 2070 * * * 2143 * * * 38 652 1460 * 0 * * * 2057 1317 0 N 39 * * * * * * * * * * * 1248 * * * * 1296 * * 2541 39 0 * * * * * * 2057 0 0 I 40 * * * * * * * 2070 2451 * * * * * * 1296 2541 * * * 40 0 * * * * * * 2057 0 0 G 41 2468 * * * 2451 652 * * * * * * * * * * * * * * 41 733 1328 * 669 1431 * * 2057 1503 0 L 42 1504 * * * * * * * * 2070 * * 2451 * * * * 2143 * * 42 0 * * * * * * 2057 0 0 H 43 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 2057 0 0 F 44 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 2057 0 0 K 45 * * 2451 * * * * * 1106 * * 1504 * * * * * * * * 45 288 2468 * 0 * * * 2057 1000 0 N 46 * * * * * * 2468 1496 * * * 2070 * 2143 * * * * * * 46 0 * * * * * * 2057 0 0 S 47 * * * * 2451 * * * 2143 2468 * * * * * 2070 * * * 2541 47 0 * * * * * * 2057 0 0 G 48 * * * * * 2070 * * 2468 1496 * * * * * * * 2143 * * 48 0 * * * * * * 2057 0 0 G 49 * * * * * 1255 * * 2541 * * 1289 * * * * * * * * 49 632 1496 * 0 * * * 2057 1250 0 D 50 * * 370 * * * * * * * * 2143 * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 2057 0 0 E 51 2451 * * 2070 * * * 1328 * 2468 * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 2057 0 0 S 52 * * * * * * * * * * * 2143 * * * 370 * * * * 52 0 * * * * * * 2057 0 0 K 53 * * * * * * * * 272 * * * * 2541 * * * * * * 53 0 * * * * * * 2057 0 0 I 54 * * * * * * * 288 * * * * * * * * * 2468 * * 54 0 * * * * * * 2057 0 0 E 55 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 2057 0 0 E 56 * * 2541 1106 * 2468 * * * * * 2451 * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 2057 0 0 S 57 * * * * * * * * * * * * * * * 2070 * * * 393 57 0 * * * * * * 2057 0 0 V 58 * * * * * * * 2451 * * * * * * * * * 291 * * 58 0 * * * * * * 2057 0 0 Q 59 * * * 2143 * * * * 901 * * * * 2070 * * * * * * 59 0 * * * * * * 2057 0 0 K 60 * * * * * * * * 1248 * * * * 2143 1504 * * * * * 60 0 * * * * * * 2057 0 0 F 61 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 2057 0 0 L 62 * * * * 1296 * * * * 754 * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 2057 0 0 S 63 * * * * 2541 * * * * 761 * * * * * 2070 * * * * 63 0 * * * * * * 2057 0 0 E 64 * * * 1106 * * * * 901 * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 2057 0 0 L 65 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 2057 0 0 K 66 * * * * * * * * 652 * * 2468 * 2451 * * * * * * 66 0 * * * * * * 2057 0 0 E 67 2143 * 1504 2070 * 2451 * * * * * * * * * * * * * * 67 652 1460 * 0 * * * 2057 1317 0 D 68 * * 1255 * * 2451 * * 2541 * * 2143 * * * * * * * * 68 733 1328 * 0 * * * 2057 1503 0 E 69 * * * 2070 * * * * 393 * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 2057 0 0 I 70 2143 * * * * * * 2070 * * * * * * * * * 901 * * 70 0 * * * * * * 2057 0 0 K 71 * * * * * * * * 288 * * * * * 2468 * * * * * 71 0 * * * * * * 2057 0 0 D 72 * * 2070 393 * * * * * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 2057 0 0 L 73 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 2057 0 0 L 74 * * * * * * * 2541 * 272 * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 2057 0 0 A 75 2070 * * * * 2468 2143 * * * * * * * * 1496 * * * * 75 0 * * * * * * 2057 0 0 K 76 * * * * * * * 2143 2070 * * * * * * * * * * 901 76 0 * * * * * * 2057 0 0 I 77 * * * * * * * 370 * * * * * * * * * 2143 * * 77 0 * * * * * * 2057 0 0 K 78 * * * * * * * * 291 * * * * 2451 * * * * * * 78 0 * * * * * * 2057 0 0 E 79 * * 2143 2070 * * * * * * * * * * * * * * * 901 79 0 * * * * * * 2057 0 0 N 80 2143 * * * * 901 * * * * * 2070 * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 2057 0 0 K 81 * * * * * * * 2468 1106 * * * * * 1496 * * * * * 81 0 * * * * * * 2057 0 0 D 82 * * 370 2143 * * * * * * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 2057 0 0 K 83 * * * * * * * * 2070 * * 393 * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 2057 0 0 K 84 * * * * * * * * 2070 * * * 761 2541 * * * * * * 84 0 * * * * * * 2057 0 0 E 85 * * * 2070 * 2143 * * * * * * 901 * * * * * * * 85 0 * * * * * * 2057 0 0 K 86 * * * * * * * * 2070 * * 901 * * * * * 2143 * * 86 2070 901 2143 3322 152 * * 2057 1416 0 D 87 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * 0 1811 0 1000 P 88 550 * * * * * * * * * * * 1657 * * * * * * * 88 0 * * * * 0 * 1811 0 1000 E 89 * * * 2070 * 2143 * * 901 * * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 2057 0 0 E 90 * * 2451 759 * 2143 * * * * * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 2057 0 0 L 91 * * * * * * 1504 * * 627 * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 2057 0 0 N 92 * * 2143 * * * * * * * * 2070 * * * * * * * 901 92 0 * * * * * * 2057 0 0 T 93 * * * * * * * * 2451 * * * * * 1504 * 1106 * * * 93 0 * * * * * * 2057 0 0 Y 94 * * * * * * * 2541 * 1460 * * * * * * * 2143 * 2070 94 0 * * * * * * 2057 0 0 K 95 * * * 901 * * * * 1106 * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 2057 0 0 S 96 * * * * * * * * * * * * * * 2468 288 * * * * 96 0 * * * * * * 2057 0 0 I 97 * * * * * * * 2070 * * * * * * 901 2143 * * * * 97 0 * * * * * * 2057 0 0 L 98 * * * * * * * 2143 * 370 * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 2057 0 0 A 99 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 2057 0 0 S 100 * * * * * 2541 * * * * * * * * * 632 * * * 2451 100 0 * * * * * * 2057 0 0 G 101 2143 * * * * 2070 * * * * * * * * * * * 901 * * 101 0 * * * * * * 2057 0 0 F 102 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 2057 0 0 D 103 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 2057 0 0 G 104 * * 2468 * * 2070 * * * * * 783 * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 2057 0 0 I 105 * * * * 2143 * * 2070 * * * * * * * * * * * 901 105 0 * * * * * * 2057 0 0 F 106 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 106 621 1516 * 3000 193 * * 2057 1000 0 N 107 * * * * * * * * * * 1543 607 * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1876 0 0 Q 108 * * * * * * * * 1628 1543 * * * 1585 * * * * * * 108 0 * * * * * * 1876 0 0 A 109 1585 * * * * * * * * 1543 * * * * * 1628 * * * * 109 0 * * * * * * 1876 0 0 D 110 * * 1585 * * * * * 1628 * * 1543 * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1876 0 0 S 111 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 111 0 * * * * * * 1876 0 0 K 112 * * * * * * * 1628 1585 * * * 1543 * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1876 0 0 T 113 * * * * * * * * * * * * * * * 1628 564 * * * 113 0 * * * * * * 1876 0 0 T 114 * * * * * * * * * * * * * * * 1543 607 * * * 114 0 * * * * * * 1876 0 0 L 115 * * * * 1027 * * * * 974 * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1498 0 0 N 116 * * * 1027 * * * * * * * 974 * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1498 0 0 K 117 * * * * * * * * 974 * * * * * * 1027 * * * * 117 0 * * * * * * 1498 0 0 L 118 * * * * * * * 1027 * 974 * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1498 0 0 K 119 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1498 0 0 D 120 * * 974 * * * * * * * * * * * * * 1027 * * * 120 0 * * * * * * 1498 0 0 T 121 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 121 0 * * * * * * 1498 0 0 I 122 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 122 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //