HHsearch 1.5 NAME c6pxeB_ FAM FILE c6pxeB_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6pxeB_.a3m DATE Sat Jun 27 08:30:06 2020 LENG 145 match states, 145 columns in multiple alignment FILT 5 out of 9 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 2.1 EVD 0.4138 -0.0990 SEQ >ss_dssp CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHTCSEEEEEEEESTTTCCEEEEEEEEECCCGGGTTSCCSSEECCTTSHHHHHHHHTCCEEESSCCSSSSCSSCCTTCCEEE EEEEECTTSCEEEEEEEEESSSCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHC >sa_dssp EEDEBDDBAEDBACDABEDADBCAAAAACADDDDDBEDACBCCDDDECAECADEDECDDCECDDECDABDBAEEEDCBECEEDCBAAABEEEBEDBCBAB AABBDBEEEDBAAAAAAAACCEDDBDCEDADDCACDACDCABECD >ss_pred CCCCHHHHHHHHHHEEEEECCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCEECCCCCCCCEEEEEEE ECCCCCCCCEEEEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >ss_conf 9642025678542101452587679999843641224665442168773000513204865210058899860687422333100036788530355788 533112022133379999832888588789885237878753129 >Consensus rxxxFexaAxEqlxIvhxstxADfsxVfsfrPxnxNyfvdiiAxEgklpxxidxkxlggypinKTseeYxrHlxGxxyxsdxxxxylpxxxxxxxxxymy sCPyfNLdNiYaGsIxmxWxxkxxixxxxLxxiCnqaxRiLgRxr >c6pxeB_ RTARFESVALEQLQIVHISSEADFSAVYSFRPKNLNYFVDIIAYEGKLPSTISEKSLGGYPVDKTMDEYTVHLNGRHYYSNSKFAFLPTKKPTPEINYMY SCPYFNLDNIYAGTITMYWYRNDHISNDRLESICAQAARILGRAK >UniRef50_A7XFM4(71-218:218) T holin lysis mediator n=3 Tax=unclassified T4-like viruses RepID=A7XFM4_9CAUD E=8e-61 s/c=1.58 id=53% cov=101% KDRNFDNAAQEQLQIVHVSADADFSAVFSFRPKNLNYFVDLVAYEGKLPHTIDEKNLGGFPINKTSEEYRRHLLGKSYFTDKDFQYIPSREKKlenIDIG FMYSCPIFNLDNVYSGSIAISWKNKPDIDIENLDTLCNQSARILGRIR >UniRef50_Q56BB6(52-196:196) T holin n=1 Tax=Enterobacteria phage RB43 RepID=Q56BB6_9CAUD E=2e-59 s/c=1.58 id=55% cov=100% KAKKFESASIEQLNIVHLTTGADFSAVFGFRPNNVNYFVDIIAYEGKLPQQIDPKNLGGYPIDKTSEEYNRHINGLPYISDIASPYLPTKNLVPVV-YTF SCPYFNLENYYSGSILMEWYKqKPEVTDMKLMIVCNQAARILGRIR >UniRef50_Q56EE0(79-221:221) T protein n=3 Tax=unclassified T4-like viruses RepID=Q56EE0_9CAUD E=7e-59 s/c=1.59 id=52% cov=99% RDRKFEMAAQEQLQIAHVSSRADFSVVFSFRPRNMNYFVDMMATEGKTPTDLIGREKGGYPINKTSNEYMVHMSGRHFSNYKEFAYLPAGH--EDFEYMY SCPITNLDNIYAGSVSMFWKKKPVINENKLFVICNQAERLLSRAR >UniRef50_Q6QGP6(7-217:218) Lysis protein n=4 Tax=Siphoviridae RepID=Q6QGP6_BPT5 E=3e-13 s/c=0.36 id=34% cov=98% RIDNFPNVAREKSMVLFSQTGADAVFVVKYKPDAINDYSNIIAWESN--AQLDRADLADKAVNKTSELYRRHLEGFNYASDLTVkvnKYMGKNIPSFKnv iFNYIYTCPYFNLNNIYAGYIGIAW-RDKPVDiadseqfKEYLTKLCSPQQRSLGRS- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * R 1 * * * * * * * * 1453 * * * * * 656 * * * * * 1 0 * * * * * * 2156 0 0 T 2 2432 * 1403 * * * * 1972 * * * * * * * * 2461 * * * 2 0 * * * * * * 2156 0 0 A 3 2461 * 1972 * * * * * 2432 * * * * * 1403 * * * * * 3 0 * * * * * * 2156 0 0 R 4 * * * * * * * * 1382 * * 1202 * * 2461 * * * * * 4 0 * * * * * * 2156 0 0 F 5 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 2156 0 0 E 6 * * 2475 823 * * * * * * * * 1972 * * * * * * * 6 0 * * * * * * 2156 0 0 S 7 * * * * * * * * * * 2334 1202 * * * 1446 * * * * 7 0 * * * * * * 2156 0 0 V 8 828 * * * * * * * * * * * * * * * * 1196 * * 8 0 * * * * * * 2156 0 0 A 9 296 * * * * * * * * * * * * * * 2432 * * * * 9 0 * * * * * * 2156 0 0 L 10 * * * * * * * 2432 * 2461 * * * 1403 1972 * * * * * 10 0 * * * * * * 2156 0 0 E 11 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 2156 0 0 Q 12 * * * * * * * * 1972 * * * * 424 * * * * * * 12 0 * * * * * * 2156 0 0 L 13 * * * * * * * * * 424 * * * * * 1972 * * * * 13 0 * * * * * * 2156 0 0 Q 14 * * * * * * * * * * 1972 2432 * 837 * * * * * * 14 0 * * * * * * 2156 0 0 I 15 * * * * * * * 424 * * * * * * * * * 1972 * * 15 0 * * * * * * 2156 0 0 V 16 2334 * * * * * * * * 1972 * * * * * * * 871 * * 16 0 * * * * * * 2156 0 0 H 17 * * * * 1972 * 424 * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 2156 0 0 I 18 * * * * * * * 2461 * 2432 * * * * * 1972 * 1403 * * 18 0 * * * * * * 2156 0 0 S 19 * * * * * * * * * * * * * 1972 * 837 2432 * * * 19 0 * * * * * * 2156 0 0 S 20 2475 * * * * * * * * * * * * * * 1396 1184 * * * 20 0 * * * * * * 2156 0 0 E 21 * * 2475 2461 * 1184 * * * * * * * * 2334 * * * * * 21 0 * * * * * * 2156 0 0 A 22 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 2156 0 0 D 23 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 2156 0 0 F 24 1972 * * * 424 * * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 2156 0 0 S 25 * * * * * * * * * * * * * * * 424 * 1972 * * 25 0 * * * * * * 2156 0 0 A 26 871 * * * 1972 * * * * * * * * * * * * 2334 * * 26 0 * * * * * * 2156 0 0 V 27 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 27 0 * * * * * * 2156 0 0 Y 28 * * * * 828 * * * * * * * * * * * * 1972 * 2461 28 0 * * * * * * 2156 0 0 S 29 * * * * * 2432 * * 1972 * * * * * * 837 * * * * 29 0 * * * * * * 2156 0 0 F 30 * * * * 424 * * * * * * * * * * * * * * 1972 30 0 * * * * * * 2156 0 0 R 31 * * * * * * * * 1972 * * * * * 424 * * * * * 31 0 * * * * * * 2156 0 0 P 32 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 32 0 * * * * * * 2156 0 0 K 33 * * 1972 * * * * * 1468 * * 2432 * * 2334 * * * * * 33 0 * * * * * * 2156 0 0 N 34 1972 * * * * * * * * * * 424 * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 2156 0 0 L 35 * * * * * * * 1972 * 1468 2334 * * * * * * 2432 * * 35 0 * * * * * * 2156 0 0 N 36 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 2156 0 0 Y 37 * * 1972 * * * * * * * * * * * * * * * * 424 37 0 * * * * * * 2156 0 0 F 38 * * * * 424 * * * * * * * * * * * * * * 1972 38 0 * * * * * * 2156 0 0 V 39 * * * * * * * * * * * * * * * 1972 * 424 * * 39 0 * * * * * * 2156 0 0 D 40 * * 424 * * * * * * * * 1972 * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 2156 0 0 I 41 * * * * * * * 685 * 2475 2334 * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 2156 0 0 I 42 * * * * * * * 685 * * 2334 * * * * * * 2475 * * 42 0 * * * * * * 2156 0 0 A 43 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 2156 0 0 Y 44 * * * * * * * * * * * * * * * * 2334 * 1972 871 44 0 * * * * * * 2156 0 0 E 45 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 2156 0 0 G 46 * * * * * 424 * * * * * * * * * 1972 * * * * 46 0 * * * * * * 2156 0 0 K 47 * * * * * * * * 424 * * 1972 * * * * * * * * 47 424 * 1972 * * * * 2156 0 0 L 48 * * * * * * * * * 428 * * * * * * 1961 * * * 48 0 * * * * * 0 1776 0 1000 P 49 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 49 0 * * * * 0 * 1776 0 1000 S 50 1972 * * * * * 2475 * * * * * * 2432 * 2461 2334 * * * 50 0 * * * * * * 2156 0 0 T 51 * * 2334 * * * * * * * * * * 1184 * * 1468 * * * 51 0 * * * * * * 2156 0 0 I 52 * * * * * * * 871 * 1142 * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 2156 0 0 S 53 * * 689 * * * * 2334 * * * * * * * 2461 * * * * 53 0 * * * * * * 2156 0 0 E 54 * * * 1468 * 2334 * * * * * * 2432 * 1972 * * * * * 54 0 * * * * * * 2156 0 0 K 55 1972 * * * * * * * 871 * * * * * 2334 * * * * * 55 0 * * * * * * 2156 0 0 S 56 * * 1972 2334 * * * * * * * 1453 * * * 2461 * * * * 56 0 * * * * * * 2156 0 0 L 57 * * * * * * * * 2334 319 * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 2156 0 0 G 58 1972 * * * * 424 * * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 2156 0 0 G 59 * * 1972 * * 424 * * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 2156 0 0 Y 60 * * * * 2475 * * * 1972 * * * * * * * * * * 823 60 0 * * * * * * 2156 0 0 P 61 1972 * * * * * * * * * * * 424 * * * * * * * 61 0 * * * * * * 2156 0 0 V 62 * * * * * * * 828 * * * * * * * * * 1196 * * 62 0 * * * * * * 2156 0 0 D 63 * * 1446 * * * * * * * * 660 * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 2156 0 0 K 64 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 2156 0 0 T 65 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 65 0 * * * * * * 2156 0 0 M 66 * * * * * * * * * * 2461 * * * * 289 * * * * 66 0 * * * * * * 2156 0 0 D 67 * * 2461 689 * * * * * * * 2334 * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 2156 0 0 E 68 * * * 424 * * * * * 1972 * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 2156 0 0 Y 69 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 69 0 * * * * * * 2156 0 0 T 70 * * * * * * * * * * 2334 2432 * * 1202 * 2461 * * * 70 0 * * * * * * 2156 0 0 V 71 * * * * * * * * * * * * * * 689 * * 1396 * * 71 0 * * * * * * 2156 0 0 H 72 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 2156 0 0 L 73 * * * * * * * 2432 * 698 2334 * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 2156 0 0 N 74 * * * 1972 * * * * * 2475 * 1446 * * * 2334 * * * * 74 0 * * * * * * 2156 0 0 G 75 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 2156 0 0 R 76 * * * * 1972 * * * 2475 2432 * * * * 1396 * * * * * 76 0 * * * * * * 2156 0 0 H 77 * * * * * * 1396 * * * * 1972 2432 * * 2475 * * * * 77 0 * * * * * * 2156 0 0 Y 78 * * * * 2334 * * * * * * * * * * * * * * 319 78 0 * * * * * * 2156 0 0 Y 79 1972 * * * 2475 * * 2432 * * * * * * * 2334 * * * 2461 79 0 * * * * * * 2156 0 0 S 80 * * * * * * * * * * * 2334 * * * 685 2475 * * * 80 0 * * * * * * 2156 0 0 N 81 * * 689 * * * * * * * * 2461 * * * * * * * 2334 81 0 * * * * * * 2156 0 0 S 82 * * * * * * * 2432 1403 1972 * * * * * 2461 * * * * 82 0 * * * * * * 2156 0 0 K 83 2432 * 2475 2334 * * * * 2461 * * * * * * * 1972 * * * 83 0 * * * * * * 2156 0 0 F 84 * * * * 837 * * * * * * * * * * 2432 * 1972 * * 84 424 1972 * 1585 585 * * 2156 1000 0 A 85 1396 * * * * * * * 1972 * * * 2432 2475 * * * * * * 85 0 * * * * * * 2156 0 0 F 86 * * * * 2461 * * * * * * * * * * * * * * 289 86 0 * * * * * * 2156 0 0 L 87 * * * * * * * 2475 * 823 1972 * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 2156 0 0 P 88 * * * * * 1972 * * * * * * 424 * * * * * * * 88 0 * * * * * * 2156 0 0 T 89 2334 * * * * * * * 1972 * * * * * * 2475 1446 * * * 89 0 * * * * * * 2156 0 0 K 90 * * * * * 2334 * * 1446 * * 1972 * * 2475 * * * * * 90 0 * * * * * * 2156 0 0 K 91 * * * 2475 * * 2334 1972 2461 * * 2432 * * * * * * * * 91 319 * 2334 * * * * 2156 0 0 P 92 * * * * * * * * 2082 2107 * * 911 * * * * * * * 92 0 * * * * * 0 1979 0 1000 T 93 * * * * * * * * 2082 * * * * * * 1758 2082 2107 * * 93 389 2082 * 1585 585 0 * 1979 1000 1000 P 94 * * * 2334 1972 * * 2475 * * * * 1446 * * * * * * * 94 0 * * * * * * 2156 0 0 E 95 * * 1403 2461 * * * * 1972 * * * * * * * * 2432 * * 95 424 1972 * 1585 585 * * 2156 1000 0 I 96 * * * * 1142 * * 1468 * * * * * * * * * 2432 * * 96 296 * 2432 * * * * 2156 0 0 N 97 * * * 2058 * 2126 * * * * * 914 * * * * * * * * 97 0 * * * * 0 * 2026 0 1000 Y 98 * * * * 2475 * * * * * * * * * * * * * * 286 98 0 * * * * * * 2156 0 0 M 99 * * * * * * * 1972 * * 837 * * * * * 2432 * * * 99 0 * * * * * * 2156 0 0 Y 100 * * * * 2432 * * * * * * * * * * * * * * 296 100 0 * * * * * * 2156 0 0 S 101 * * * * * * * * * * * * * * * 424 1972 * * * 101 0 * * * * * * 2156 0 0 C 102 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 2156 0 0 P 103 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 103 0 * * * * * * 2156 0 0 Y 104 * * * * * * * 1403 * * * * * * * * * * * 685 104 0 * * * * * * 2156 0 0 F 105 * * * * 319 * * * * * * * * * * * 2334 * * * 105 0 * * * * * * 2156 0 0 N 106 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 2156 0 0 L 107 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 2156 0 0 D 108 * * 837 2432 * * * * * * * 1972 * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 2156 0 0 N 109 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 2156 0 0 I 110 * * * * * * * 656 * * * * * * * * * 2475 * 2432 110 0 * * * * * * 2156 0 0 Y 111 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 111 0 * * * * * * 2156 0 0 A 112 656 * * * * * * * * * * * * * * 1453 * * * * 112 0 * * * * * * 2156 0 0 G 113 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 2156 0 0 T 114 * * * * * * * * * * * * * * * 828 2461 * * 1972 114 0 * * * * * * 2156 0 0 I 115 * * * * * * * 319 * * * * * * * * * 2334 * * 115 0 * * * * * * 2156 0 0 T 116 2475 * * * * 1972 * * * 2432 * * * * * 2334 2461 * * * 116 0 * * * * * * 2156 0 0 M 117 * * * * * * * 1202 * * 823 * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 2156 0 0 Y 118 1972 * * 2432 2334 * * * * * * * * * * 2475 * * * 2461 118 0 * * * * * * 2156 0 0 W 119 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 119 424 * 1972 * * * * 2156 0 0 Y 120 * * * * * * * * 997 * * * * * * * * * * 1003 120 0 * * * * 0 * 1776 0 1000 R 121 * * * * * * * * 1382 * * 2475 * * 1196 * * * * * 121 296 2432 * 0 * * * 2156 1000 0 N 122 * * 1972 * * * * * 828 * * 2461 * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 2156 0 0 D 123 * * 2461 * * * * * 1972 * * * 828 * * * * * * * 123 0 * * * * * * 2156 0 0 H 124 * * 2475 2432 * * 2461 * * * * * 1972 * * * * 2334 * * 124 0 * * * * * * 2156 0 0 I 125 * * * * * * * 837 * * * * * * * * * 1184 * * 125 0 * * * * * * 2156 0 0 S 126 * * 1202 * * * * * * * * 2334 * * * 2461 2432 * * * 126 424 1972 * 2807 222 * * 2156 1000 0 N 127 * * 2432 2334 * * * 2475 1972 * * 2461 * * * * * * * * 127 0 * * * * * * 2156 0 0 D 128 * * 2461 1202 * * * * * * 2432 2334 * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 2156 0 0 R 129 * * * * * * * * 1382 * * 2475 * * 2461 * * * * 1972 129 0 * * * * * * 2156 0 0 L 130 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 2156 0 0 E 131 * * 2475 2461 2334 * * * * * 2432 * * * * * 1972 * * * 131 0 * * * * * * 2156 0 0 S 132 * * * * * * * 2432 1972 * * * * * * 2461 2475 2334 * * 132 0 * * * * * * 2156 0 0 I 133 * * * * * * * 1396 * 1202 * * * * * * * 2432 * * 133 0 * * * * * * 2156 0 0 C 134 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 134 0 * * * * * * 2156 0 0 A 135 2461 * * * * * * * * * * 828 * * * 1972 * * * * 135 0 * * * * * * 2156 0 0 Q 136 * * * * * * * * * * * * 1972 424 * * * * * * 136 0 * * * * * * 2156 0 0 A 137 823 * * * * * * * * * * * * 1972 * 2475 * * * * 137 0 * * * * * * 2156 0 0 A 138 871 * * 2334 * * * * * * * * * 1972 * * * * * * 138 0 * * * * * * 2156 0 0 R 139 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 139 0 * * * * * * 2156 0 0 I 140 * * * * * * * 871 * 2334 * * * * * 1972 * * * * 140 0 * * * * * * 2156 0 0 L 141 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 141 0 * * * * * * 2156 0 0 G 142 * * * * * 319 * * * * * * * * * 2334 * * * * 142 0 * * * * * * 2156 0 0 R 143 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 143 0 * * * * * * 2156 0 0 A 144 1396 * * * * * * 1453 * * * * * * * 1972 * * * * 144 0 * * * * * * 2156 0 0 K 145 * * * * * * * * 2007 * * * * * 413 * * * * * 145 0 * * 0 * * * 1776 0 0 //