HHsearch 1.5 NAME c6pirC_ FAM FILE c6pirC_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6pirC_.a3m DATE Sat May 9 08:16:34 2020 LENG 132 match states, 132 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.5 EVD 0.4274 -0.0488 SEQ >ss_dssp CGGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSCHHHHHHHHHHHCCCCCGGGGSTTGGGSCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSCSCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HTTTCCTTCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGGGC >sa_dssp EEEDCCCBDAABCAACCACDABDDEDDECDDCDEECEEECCBDECBCECEEBDECCCECACCAACBAACCBCEECDEDEEECDDDBDDACDCABDECACE AACEBDEEDBBDBACDCADEBCCEBDDDDEED >ss_pred CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCHH HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >ss_conf 9526888999999999999996417778999987416415563038662330799999999999999999999730743010888899999999741201 10358877889999841689999999863159 >Consensus xxxTxFExxFixxxLxxLxxILaxdrxLxdAIxxFTQPRYqixsrIxNAxxWSxxdxxqFsaAxaExIxxixxxYxxxssxsxEQIxaArxixxxxYiPx iTxxTxxxxRixSixExxxxxxxxxxxxxxxx >c6pirC_ SNATRFERNFLINSLMFLETILSVDKKLDDAIHHFTQPRYQINSRITNADDWSKEDKLKFTSAIAEAIALVSEKYENPTSETTEQIQSARNILLDNYVPL LTANTDPENRLKSVRENSSQIRKELIAKLKDE >UniRef50_C6N3L9(2-119:170) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Legionella drancourtii LLAP12 RepID=C6N3L9_9GAMM E=5e-41 s/c=1.42 id=33% cov=86% ---TQFECEFITKCLATLSHILADERELTEAINAFTQnddknPRYELRTKIPNALYWSHHELRQFSAAYSEMIFRIISFYKQNSTISNEQINAAKILFEQ MYIPGITKETQAGQRISSIIE---------------- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * S 1 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 N 2 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 A 3 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 T 4 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 4 0 * * * * * * 1584 0 0 R 5 * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * 5 0 * * * * * * 1584 0 0 F 6 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1584 0 0 E 7 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1584 0 0 R 8 * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * * 8 0 * * * * * * 1584 0 0 N 9 * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1584 0 0 F 10 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1584 0 0 L 11 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1584 0 0 I 12 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * 12 0 * * * * * * 1584 0 0 N 13 * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1584 0 0 S 14 * 1000 * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 14 0 * * * * * * 1584 0 0 L 15 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1584 0 0 M 16 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1584 0 0 F 17 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 1000 * * * 17 0 * * * * * * 1584 0 0 L 18 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1584 0 0 E 19 * * * 1000 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 19 0 * * * * * * 1584 0 0 T 20 * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * 20 0 * * * * * * 1584 0 0 I 21 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1584 0 0 L 22 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1584 0 0 S 23 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 23 0 * * * * * * 1584 0 0 V 24 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 24 0 * * * * * * 1584 0 0 D 25 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1584 0 0 K 26 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 26 0 * * * * * * 1584 0 0 K 27 * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1584 0 0 L 28 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1584 0 0 D 29 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 29 0 * * * * * * 1584 0 0 D 30 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1584 0 0 A 31 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1584 0 0 I 32 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1584 0 0 H 33 * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1584 0 0 H 34 1000 * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1584 0 0 F 35 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1584 0 0 T 36 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 36 0 * * * * * * 1584 0 0 Q 37 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 37 1000 1000 * 2322 322 * * 1584 1000 0 P 38 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1584 0 0 R 39 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 39 0 * * * * * * 1584 0 0 Y 40 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 40 0 * * * * * * 1584 0 0 Q 41 * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 41 0 * * * * * * 1584 0 0 I 42 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1584 0 0 N 43 * * * * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * 43 0 * * * * * * 1584 0 0 S 44 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 44 0 * * * * * * 1584 0 0 R 45 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 45 0 * * * * * * 1584 0 0 I 46 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1584 0 0 T 47 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * 47 0 * * * * * * 1584 0 0 N 48 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1584 0 0 A 49 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1584 0 0 D 50 * * 1000 * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1584 0 0 D 51 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 51 0 * * * * * * 1584 0 0 W 52 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 52 0 * * * * * * 1584 0 0 S 53 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 53 0 * * * * * * 1584 0 0 K 54 * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1584 0 0 E 55 * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1584 0 0 D 56 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1584 0 0 K 57 * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1584 0 0 L 58 * * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * 58 0 * * * * * * 1584 0 0 K 59 * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * 59 0 * * * * * * 1584 0 0 F 60 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1584 0 0 T 61 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 61 0 * * * * * * 1584 0 0 S 62 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 62 0 * * * * * * 1584 0 0 A 63 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1584 0 0 I 64 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 1000 64 0 * * * * * * 1584 0 0 A 65 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 65 0 * * * * * * 1584 0 0 E 66 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1584 0 0 A 67 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1584 0 0 I 68 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1584 0 0 A 69 1000 * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1584 0 0 L 70 * * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * 70 0 * * * * * * 1584 0 0 V 71 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 71 0 * * * * * * 1584 0 0 S 72 * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * * 72 0 * * * * * * 1584 0 0 E 73 * * * 1000 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 73 0 * * * * * * 1584 0 0 K 74 * * * * 1000 * * * 1000 * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1584 0 0 Y 75 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 75 0 * * * * * * 1584 0 0 E 76 * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1584 0 0 N 77 * * * * * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * 77 0 * * * * * * 1584 0 0 P 78 * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1584 0 0 T 79 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 79 0 * * * * * * 1584 0 0 S 80 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 80 0 * * * * * * 1584 0 0 E 81 * * * 1000 * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1584 0 0 T 82 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 82 0 * * * * * * 1584 0 0 T 83 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * 83 0 * * * * * * 1584 0 0 E 84 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1584 0 0 Q 85 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 85 0 * * * * * * 1584 0 0 I 86 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1584 0 0 Q 87 * * * * * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * 87 0 * * * * * * 1584 0 0 S 88 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 88 0 * * * * * * 1584 0 0 A 89 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1584 0 0 R 90 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 90 0 * * * * * * 1584 0 0 N 91 * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1584 0 0 I 92 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1584 0 0 L 93 * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1584 0 0 L 94 * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1584 0 0 D 95 * * 1000 * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 95 0 * * * * * * 1584 0 0 N 96 * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1584 0 0 Y 97 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 97 0 * * * * * * 1584 0 0 V 98 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 98 0 * * * * * * 1584 0 0 P 99 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1584 0 0 L 100 * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1584 0 0 L 101 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1584 0 0 T 102 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 102 0 * * * * * * 1584 0 0 A 103 1000 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1584 0 0 N 104 * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1584 0 0 T 105 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 105 0 * * * * * * 1584 0 0 D 106 * * 1000 * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 106 0 * * * * * * 1584 0 0 P 107 1000 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1584 0 0 E 108 * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1584 0 0 N 109 * * * * * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * 109 0 * * * * * * 1584 0 0 R 110 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 110 0 * * * * * * 1584 0 0 L 111 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1584 0 0 K 112 * * * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * * 112 0 * * * * * * 1584 0 0 S 113 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 113 0 * * * * * * 1584 0 0 V 114 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 114 0 * * * * * * 1584 0 0 R 115 * * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * * * 115 0 * * * * * * 1584 0 0 E 116 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1584 0 0 N 117 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1000 0 0 S 118 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 118 0 * * * * * * 1000 0 0 S 119 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 119 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 120 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 120 0 * * * * * * 1000 0 0 I 121 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1000 0 0 R 122 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 122 0 * * * * * * 1000 0 0 K 123 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 1000 0 0 E 124 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1000 0 0 L 125 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 125 0 * * * * * * 1000 0 0 I 126 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1000 0 0 A 127 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 127 0 * * * * * * 1000 0 0 K 128 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1000 0 0 L 129 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 129 0 * * * * * * 1000 0 0 K 130 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 1000 0 0 D 131 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 131 0 * * * * * * 1000 0 0 E 132 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 132 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //