HHsearch 1.5 NAME c6p8sC_ FAM FILE c6p8sC_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6p8sC_.a3m DATE Sat Dec 28 08:19:42 2019 LENG 132 match states, 132 columns in multiple alignment FILT 4 out of 8 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 2.1 EVD 0.3986 -1.3108 SEQ >ss_dssp CCEEEEEEECTTTSCHHHHHHHHHHHHHTTCCSHHHHHHHHTHHHHHHHHHTTTTTTSCEEEECSSCEEEEEEECTHHHHHCTTCBCCCCSSCTTCSSCE EEEEECGGGHHHHHHHHHTTCSSEEEEEGGGC >sa_dssp EEECDBCBDADDDCDCEEAACCAADBABDEDEDECCDCADDABECABDAAEDDAADEAAABADCEDCDADACABADEDAEDCEECDCEEBECDABDEEBB ABAAABEECCEDADECAEEDBEDAEBCBDEEE >ss_pred CCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCEE EEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCC >ss_conf 9410012431534104678999999961377731489999999889987521067767689981488379999517210112134411011100377615 65027888989999984024661687542579 >Consensus xtxxxRxxxSiPxRxaxxTWxaIvdLltxxxxxxxrxxLxaaagVxaslIadexprxaPIVvxxxGprxrIYcxxxeDAlexxxxxexxLxxxplxgxWx xsxPxxxddlxwxxxxLxkxxsRIxxrDxxax >c6p8sC_ TTVVSRTFRSSPHRDALQTWDAIVELLTQGKDGTARSELRAVTGVAASLIADQAPKSAPIVATCDGPRTRIYCLFDEDAIDGDDANEEVLGFEPLKGDWG VSLPCPKEQLGWVQSALKKHSSRIIARDLSQG >UniRef50_Q120L6(2-134:159) Putative uncharacterized protein n=9 Tax=Proteobacteria RepID=Q120L6_POLSJ E=1e-49 s/c=1.48 id=62% cov=101% STVSRRDFRSIPHRDASATWAAIVDLLTNgGNDAGKRQELLKVAGVASSVIADQGPRESPIVVTCDGPRTRIYCSYDDDALDDSNSNEAKLGFDALKGDW QVSLPVTEEDLAWVQAALKKSSSRVVARDKDSG >UniRef50_Q1MH89(3-129:152) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 RepID=Q1MH89_RHIL3 E=1e-42 s/c=1.36 id=38% cov=97% ---VKRTIASIPKRSAAETWRTIRELIT-STGSVDVDKLVAAASVMESLIADEHPGAVPIVVKGVGSRLVIYCLYGEDAMEA-DLEVEKLTWNPTAGNWA MTAPTDADDVKWMNDTLAKRCSRITVHDVNAA >UniRef50_C7Q3J6(1-128:152) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Catenulispora acidiphila DSM 44928 RepID=C7Q3J6_CATAD E=7e-12 s/c=0.56 id=35% cov=96% --MTARRVASVPARTSTATWHAIIDLVAPLQGP-ARSVLSAATGVCAAIISEEYTRDAPIIIRpASGPQIRIYTVHGEDALEVLQ-DETPLSVQPLADpQ WTLSVPCGVDDIDDFGRVLAGD-GRISLRDLTA- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * T 1 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 1 0 * * * * * * 1300 0 0 T 2 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 2 0 * * * * * * 1300 0 0 V 3 * * * * * * * * * * 1416 * * * * * * 677 * * 3 0 * * * * * * 1798 0 0 V 4 * * * * * * * * * * * * * * * 2093 1854 1032 * * 4 0 * * * * * * 2157 0 0 S 5 1854 * * * * * * * 1895 * * * * * 2093 2184 * * * * 5 0 * * * * * * 2157 0 0 R 6 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 6 0 * * * * * * 2157 0 0 T 7 * * 2093 * * * * * * * * * * * 1854 * 1032 * * * 7 0 * * * * * * 2157 0 0 F 8 * * * * 1138 * * 1895 * * * * * * * * * 1854 * * 8 0 * * * * * * 2157 0 0 R 9 874 * * * * * * * * * * * * * 1138 * * * * * 9 0 * * * * * * 2157 0 0 S 10 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 10 0 * * * * * * 2157 0 0 S 11 * * * * * * * 991 * * * * * * * 2184 * 1854 * * 11 0 * * * * * * 2157 0 0 P 12 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 12 0 * * * * * * 2157 0 0 H 13 1854 * * * * * 1138 * 1895 * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 2157 0 0 R 14 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 14 0 * * * * * * 2157 0 0 D 15 * * 1138 * * * * * * * * * * * * 1895 1854 * * * 15 0 * * * * * * 2157 0 0 A 16 467 * * * * * * * * * * * * * * 1854 * * * * 16 0 * * * * * * 2157 0 0 L 17 1895 * * * * * * * * 2184 * * * * * 2093 1854 * * * 17 0 * * * * * * 2157 0 0 Q 18 968 * * 1895 * * * * * * * * * 2184 * * * * * * 18 0 * * * * * * 2157 0 0 T 19 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 19 0 * * * * * * 2157 0 0 W 20 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 20 0 * * * * * * 2157 0 0 D 21 2093 * 2184 * * * 1854 * * * * * * * 1895 * * * * * 21 0 * * * * * * 2157 0 0 A 22 452 * * * * * * * * * * * * * * * 1895 * * * 22 0 * * * * * * 2157 0 0 I 23 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 2157 0 0 V 24 * * * * * * * 1854 * * * * * * 1895 * * 1138 * * 24 0 * * * * * * 2157 0 0 E 25 * * 968 1032 * * * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 2157 0 0 L 26 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 2157 0 0 L 27 * * * * * * * 1895 * 1138 * * * * * * * 1854 * * 27 0 * * * * * * 2157 0 0 T 28 1854 * * * * * * * * * * * * * * * 467 * * * 28 452 * 1895 * * * * 2157 0 0 Q 29 * * * * * * * * * * * 1651 1416 1704 * * * * * * 29 553 1651 * 0 * 0 * 1798 1000 1000 G 30 * * * * * 1138 * * * 1854 * * * * * 1895 * * * * 30 0 * * * * * * 2157 0 0 K 31 * * * * * * * * 2184 * * 2093 * 1854 * * 1895 * * * 31 0 * * * * * * 2157 0 0 D 32 * * 1138 * * 874 * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 2157 0 0 G 33 2093 * * * * 2184 * * * * * * 1854 * * 1895 * * * * 33 467 * 1854 * * * * 2157 0 0 T 34 * * * * * 1651 * * * * * * * * * * 1695 1424 * * 34 0 * * * * 0 * 1764 0 1000 A 35 1009 * 1895 * * * * * 2093 * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 2157 0 0 R 36 * * * * * * * * * * * * * * 452 * * 1895 * * 36 0 * * * * * * 2157 0 0 S 37 * * 1895 * * * * * * * * * * 2093 * 1009 * * * * 37 0 * * * * * * 2157 0 0 E 38 * * * 1138 * * * * 1895 * * * * * * * * 1854 * * 38 0 * * * * * * 2157 0 0 L 39 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 2157 0 0 R 40 * * * * * * * * * 2093 * * * * 2184 1854 * 1895 * * 40 0 * * * * * * 2157 0 0 A 41 385 * * * * * * * 2093 * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 2157 0 0 V 42 874 * * * * * * * * * * * * * * * * 1138 * * 42 0 * * * * * * 2157 0 0 T 43 991 * * * * * * * * * * * * * * * 1009 * * * 43 0 * * * * * * 2157 0 0 G 44 * * * * * 452 * * * * * * * * * 1895 * * * * 44 0 * * * * * * 2157 0 0 V 45 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 45 0 * * * * * * 2157 0 0 A 46 1138 1854 * * * * * * * * 1895 * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 2157 0 0 A 47 1009 * * 1895 * * * * * * * * * * * 2093 * * * * 47 0 * * * * * * 2157 0 0 S 48 1854 * * * * * * * * * * * * * * 467 * * * * 48 0 * * * * * * 2157 0 0 L 49 * * * * * * * 1854 * 1032 * * * * * * * 2093 * * 49 0 * * * * * * 2157 0 0 I 50 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 2157 0 0 A 51 467 * * * * * * * * * * * * * * 1854 * * * * 51 0 * * * * * * 2157 0 0 D 52 * * 467 1854 * * * * * * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 2157 0 0 Q 53 * * * 874 * * * * * * * * * 1138 * * * * * * 53 0 * * * * * * 2157 0 0 A 54 2184 * * * * 2093 1895 * * * * * * * * * * * * 1854 54 0 * * * * * * 2157 0 0 P 55 * * * * * * * * * * * * 467 * * * 1854 * * * 55 0 * * * * * * 2157 0 0 K 56 * * * * * 1895 * * 2184 * * * * * 968 * * * * * 56 0 * * * * * * 2157 0 0 S 57 1895 * 1854 2093 * * * * * * * * * * * 2184 * * * * 57 0 * * * * * * 2157 0 0 A 58 1009 * * * * * * * * * * * * * * 2093 * 1895 * * 58 0 * * * * * * 2157 0 0 P 59 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 59 0 * * * * * * 2157 0 0 I 60 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 2157 0 0 V 61 * * * * * * * 1854 * * * * * * * * * 467 * * 61 0 * * * * * * 2157 0 0 A 62 2184 * * * * * * 1854 * * * * * * * * * 991 * * 62 0 * * * * * * 2157 0 0 T 63 * * * * * * * * 1895 * * * * * 1854 * 1138 * * * 63 467 1854 * 0 * * * 2157 1000 0 C 64 1854 1138 * * * 1895 * * * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 2157 0 0 D 65 * * 1138 * * * * * * * * * * * * 1854 * 1895 * * 65 0 * * * * * * 2157 0 0 G 66 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 2157 0 0 P 67 * * * * * * * * * * * * 452 * * 1895 * * * * 67 0 * * * * * * 2157 0 0 R 68 * * * * * * * * * * * * * 1854 467 * * * * * 68 0 * * * * * * 2157 0 0 T 69 * * * * * * * 1854 * 1895 * * * * * * 1138 * * * 69 0 * * * * * * 2157 0 0 R 70 * * * * * * * * * * * * * * 452 * * 1895 * * 70 0 * * * * * * 2157 0 0 I 71 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 2157 0 0 Y 72 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 72 0 * * * * * * 2157 0 0 C 73 * 467 * * * * * * * * * * * * * * 1854 * * * 73 0 * * * * * * 2157 0 0 L 74 * * * * * * * * * 1032 * * * * * 2093 * 1854 * * 74 0 * * * * * * 2157 0 0 F 75 * * * * 2184 * 1854 * * * * * * * * * * * * 991 75 0 * * * * * * 2157 0 0 D 76 * * 1138 * * 874 * * * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 2157 0 0 E 77 * * 2093 385 * * * * * * * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 2157 0 0 D 78 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 2157 0 0 A 79 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 2157 0 0 I 80 * * * * * * * 2184 * 968 1895 * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 2157 0 0 D 81 * * 1138 874 * * * * * * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 2157 0 0 G 82 1895 * 2093 * * 2184 * * * * * * * * * * * 1854 * * 82 452 * 1895 * * * * 2157 0 0 D 83 * * 1704 * * * * * * 1416 * * * * * 1651 * * * * 83 0 * * * * 0 * 1798 0 1000 D 84 * * 1032 * * * * * * * * 2093 * 1854 * * * * * * 84 467 * 1854 * * * * 2157 0 0 A 85 1695 * * * * * * * * 1424 * * * * * 1651 * * * * 85 0 * * * * 0 * 1764 0 1000 N 86 * * 1854 1895 * * * * * * * 1138 * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 2157 0 0 E 87 * * * 452 * * * * * * * * * * * * * 1895 * * 87 0 * * * * * * 2157 0 0 E 88 2093 * * 1032 * * * * * * * * * * * * 1854 * * * 88 0 * * * * * * 2157 0 0 V 89 * * * * * * * * 991 * * * 1854 * * * * 2184 * * 89 0 * * * * * * 2157 0 0 L 90 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 2157 0 0 G 91 * * * * * 1138 * * * * * * * * * 1854 1895 * * * 91 0 * * * * * * 2157 0 0 F 92 * * * * 1138 * * * * * * * * * * * * 1854 1895 * 92 0 * * * * * * 2157 0 0 E 93 * * 2093 2184 * * * * * * * 1895 * 1854 * * * * * * 93 0 * * * * * * 2157 0 0 P 94 2093 * * * * * * * * * * * 385 * * * * * * * 94 0 * * * * * * 2157 0 0 L 95 * * * * * * * * * 452 * * * * * * 1895 * * * 95 0 * * * * * * 2157 0 0 K 96 874 * * * * * * * 1138 * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 2157 0 0 G 97 * * 1854 * * 467 * * * * * * * * * * * * * * 97 467 1854 * 0 * * * 2157 1000 0 D 98 * * 1138 * * * * * * * * 1895 * 1854 * * * * * * 98 0 * * * * * * 2157 0 0 W 99 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 99 0 * * * * * * 2157 0 0 G 100 1895 * * * * 2184 * * * * * * * 2093 * * 1854 * * * 100 0 * * * * * * 2157 0 0 V 101 * * * * * * * * * 1854 1895 * * * * * * 1138 * * 101 0 * * * * * * 2157 0 0 S 102 * * * * * * * * * * * * * * * 452 1895 * * * 102 0 * * * * * * 2157 0 0 L 103 1895 * * * * * * * * 1138 * * * * * * * 1854 * * 103 0 * * * * * * 2157 0 0 P 104 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 104 0 * * * * * * 2157 0 0 C 105 * 1009 * * * * * * * * * * * * * * 1895 2093 * * 105 0 * * * * * * 2157 0 0 P 106 * * 1895 * * 1854 * * * * * * 2184 * * * 2093 * * * 106 0 * * * * * * 2157 0 0 K 107 1895 * * 2093 * * * * 2184 * * * * * * * * 1854 * * 107 0 * * * * * * 2157 0 0 E 108 * * 874 1138 * * * * * * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 2157 0 0 Q 109 * * 359 * * * * * * * * * * 2184 * * * * * * 109 0 * * * * * * 2157 0 0 L 110 * * * * * * * 1854 * 1138 * * * * * * * 1895 * * 110 0 * * * * * * 2157 0 0 G 111 2093 * 1854 * * 2184 * * 1895 * * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 2157 0 0 W 112 * * 1854 * * * * * * * * * * * * * * * 467 * 112 0 * * * * * * 2157 0 0 V 113 * * * * 1854 * * * * * 1895 * * * * * * 1138 * * 113 0 * * * * * * 2157 0 0 Q 114 * * * * * 1854 * * * * * 1895 * 1138 * * * * * * 114 0 * * * * * * 2157 0 0 S 115 2093 * 1895 * * * * * * * * * * * 1854 2184 * * * * 115 0 * * * * * * 2157 0 0 A 116 1138 * * * * * * * * * * * * * * * 1895 1854 * * 116 0 * * * * * * 2157 0 0 L 117 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 2157 0 0 K 118 874 * * * * * * * 1138 * * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 2157 0 0 K 119 * * * * * 1854 * * 467 * * * * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 2157 0 0 H 120 * * 1854 * * * 2184 * * * * * * * 1895 2093 * * * * 120 467 * 1854 * * * * 2157 0 0 S 121 * 1424 * * * * * * * * * * * * * 673 * * * * 121 0 * * * * 0 * 1764 0 1000 S 122 * * * * * 1854 * * * * * * * * * 467 * * * * 122 0 * * * * * * 2157 0 0 R 123 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 123 0 * * * * * * 2157 0 0 I 124 * * * * * * * 385 * * * * * * * * * 2093 * * 124 0 * * * * * * 2157 0 0 I 125 * * * * * * * 2184 * * * * * * * 1854 1895 2093 * * 125 0 * * * * * * 2157 0 0 A 126 1138 * * * * * * * * 1854 * * * * * * * 1895 * * 126 0 * * * * * * 2157 0 0 R 127 * * * * * * 1895 * * * * * * * 452 * * * * * 127 0 * * * * * * 2157 0 0 D 128 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 2157 0 0 L 129 * * * * * * * * 2093 1009 * * * * * * * 1895 * * 129 0 * * * * * * 2157 0 0 S 130 * * 2093 * * * * * * * * 1895 * * * 2184 1854 * * * 130 0 * * * * * * 2157 0 0 Q 131 874 * * * * * * * * * * * * 2184 * 2093 * * * * 131 0 * * * * * * 2157 0 0 G 132 1424 * * * * 673 * * * * * * * * * * * * * * 132 0 * * 0 * * * 1764 0 0 //