HHsearch 1.5 NAME c6p8rA_ FAM FILE c6p8rA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6p8rA_.a3m DATE Sat Dec 28 08:56:37 2019 LENG 167 match states, 167 columns in multiple alignment FILT 4 out of 8 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 2.1 EVD 0.3800 -1.9530 SEQ >ss_dssp CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTCCSHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHTCEEEEEEEEEETTTTEEEEEEEEEEEECCCCTTSCEEECCHHH HHHHHHHCCCCTTCEEEEEEEECTTCCCCTTCCCCCCCCCTTEEEEEEEEEEEETTEEEEEEEEEEC >sa_dssp EEEEEDEDECEDABDCAACCAADBADDBAEEBEBEDEDBEEDCEDBBEAACCBADDCCADCAAAAACCDEDEEBCBBBABCBDDDDEDBEDEEDDDDEDB DDABEECDECCEEBDBDCBCCCDEECDEBEECEEEEDCECEEBDDEECDCBACABCABADBBBCDDD >ss_pred CCEEEEEEEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEECCCCCEEEEEEEEEEEECCCCCCCCEEECHHHH HHHHHHCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHCCC >ss_conf 9514654210101010068899999999997399867752025666899998610476247777764555443688755568951336775223256571 0120006888867679999841788857676682001112115555302101366511100231029 >Consensus xAtsvxxytxThsatyVadnvxxslkxiIxxxglDPxxlxdxWxxxxxaixtWlxsgxLxxxilEvyxPxxxxlvxRwDxxIxYxxsdxDgxxwxDtdxl kyxixKagxxPaxxxYxxxlxxkpgRPxvxGwxxgsxrsxdgltxrsxGtxIxxxxixxsaxYxrxr >c6p8rA_ NASTVATYSYTHSVTYVTDNILKSLKDIILLSGLDPEHFADRWESNTRAIKTWLGTGDLRKVILEIYNPATDKLVTRWDIDIVYGWSDGDGSFWTDTEQL KYAIKKAGLLPSQAKYKLMLDTKPGRPDVEGWSKGSYRSTDGMVKQSLGSTVEHSGLAGQAGYWRQR >UniRef50_C7Q3J5(2-168:172) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Catenulispora acidiphila DSM 44928 RepID=C7Q3J5_CATAD E=3e-26 s/c=0.71 id=35% cov=98% -ATSVRVNTTTHAATHVATNMIRSLKQIIRAAGLDPAGLLGQWALLESGVSTWLQSGHLTTLVMEVFDPSdrtVTSLVGRFDFTIEYDYgADSDGDLWLD PDVIDYVIRKNGAYPSQCEYDFTVVNKPGRPAVPGWGKGQLRSSDHLTRRTAGTAITGGTIGASISYY--- >UniRef50_Q1MH90(2-165:165) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 RepID=Q1MH90_RHIL3 E=1e-15 s/c=0.51 id=32% cov=98% -AVSTHNYTRTNTAIYVSDKVRNLMRLLIINYNLDPTKLVDAWSDWVQdAARQWMEDGDLKSFIIEFYKPGASVASARWDFPIRYDGSDID-QMWIDTDF LKGTFAKAPSPPAGCTYRILLQpTATARP-LPGMSSASYLSLAGLTAREAGTVIGTPDIMASAKYYR-- >UniRef50_Q120L5(2-166:166) Putative uncharacterized protein n=4 Tax=Proteobacteria RepID=Q120L5_POLSJ E=9e-67 s/c=1.54 id=67% cov=99% --TTVAAYSYTHSVTYVADNVLKSLKDIIRLSGMDPTKLTDEWDSTHRAIKTWLESEHLEKVVLEVYNPATGSLVLRWDIDIVYQWSSSDGAFYTDTDQL RYHIKKAGVAPAEARYDILLKNKPGRPDVAGWGPGSFRATDGMVRQSLGSTIDHSGLGGSAAYWRTR # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * N 1 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 A 2 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 2008 0 0 S 3 * * * * * * * * * * * * * * * 2150 1041 1793 * * 3 0 * * * * * * 2103 0 0 T 4 * * * * * * * * * * * * * * * 837 1183 * * * 4 0 * * * * * * 2103 0 0 V 5 * * * * * * * * * * * * * * * * 1793 491 * * 5 0 * * * * * * 2103 0 0 A 6 1183 * * * * * 1793 * * * * * * * 1883 * * * * * 6 0 * * * * * * 2103 0 0 T 7 2217 * * * * * * * * * * 1793 * * * * 2150 1883 * * 7 0 * * * * * * 2103 0 0 Y 8 * * * * * * * * * * * 1883 * * * * * * * 456 8 0 * * * * * * 2103 0 0 S 9 * * * * * * * * * * * * * * * 1183 837 * * * 9 0 * * * * * * 2103 0 0 Y 10 * * * * * * * * * * * * * * 1793 * 1883 * * 1183 10 0 * * * * * * 2103 0 0 T 11 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 11 0 * * * * * * 2103 0 0 H 12 * * * * * * 491 * * * * 1793 * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 2103 0 0 S 13 1883 * * * * * * * * * * * * * * 1183 1793 * * * 13 0 * * * * * * 2103 0 0 V 14 837 * * * * * * * * * * * * * * * * 1183 * * 14 0 * * * * * * 2103 0 0 T 15 * * * * * * * 1793 * * * * * * * * 491 * * * 15 0 * * * * * * 2103 0 0 Y 16 * * * * * * 1883 * * * * * * * * * * * * 456 16 0 * * * * * * 2103 0 0 V 17 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 17 0 * * * * * * 2103 0 0 T 18 1041 * * * * * * * * * * * * * * 1793 2150 * * * 18 0 * * * * * * 2103 0 0 D 19 * * 456 * * * * * * * * * * * * * 1883 * * * 19 0 * * * * * * 2103 0 0 N 20 * * * * * * * * 1793 * * 491 * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 2103 0 0 I 21 * * * * * * * 2150 * * 1883 * * * * * * 990 * * 21 0 * * * * * * 2103 0 0 L 22 * * * * * * * 1883 * 1183 * * * * 1793 * * * * * 22 0 * * * * * * 2103 0 0 K 23 * * * * * * * * 1183 * * 1793 * * 1883 * * * * * 23 0 * * * * * * 2103 0 0 S 24 * * * * * * * * * 1793 * * * * * 491 * * * * 24 0 * * * * * * 2103 0 0 L 25 * * * * * * * * * 491 1793 * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 2103 0 0 K 26 * * * * * * * * 491 * * * * * 1793 * * * * * 26 0 * * * * * * 2103 0 0 D 27 * * 1183 * * * * * * 1793 * * * 1883 * * * * * * 27 0 * * * * * * 2103 0 0 I 28 * * * * * * * 491 * 1793 * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 2103 0 0 I 29 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 2103 0 0 L 30 * * * * * * * 1793 * 2150 * * * * 1041 * * * * * 30 0 * * * * * * 2103 0 0 L 31 1883 * * * * * * * * 1183 * 1793 * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 2103 0 0 S 32 1883 * * * * * * * * * * * * * * 1183 * * * 1793 32 0 * * * * * * 2103 0 0 G 33 * * * * * 491 * * * * * 1793 * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 2103 0 0 L 34 * * * * * * * * * 349 2217 * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 2103 0 0 D 35 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 2103 0 0 P 36 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 36 0 * * * * * * 2103 0 0 E 37 1883 * * 2150 * * * * * * * * * * * * 990 * * * 37 0 * * * * * * 2103 0 0 H 38 * * * * * 1883 2150 * 990 * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 2103 0 0 F 39 * * * * 2150 * * * * 368 * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 2103 0 0 A 40 2150 * * * * * * * * 1883 * * * * * * 2217 1793 * * 40 0 * * * * * * 2103 0 0 D 41 * * 456 * * 1883 * * * * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 2103 0 0 R 42 1793 * * 2217 * * * * * * * * * 1883 2150 * * * * * 42 0 * * * * * * 2103 0 0 W 43 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 43 0 * * * * * * 2103 0 0 E 44 1883 * 2217 2150 * * * * * * * * * * * 1793 * * * * 44 0 * * * * * * 2103 0 0 S 45 * * 1793 * * * * * * 1883 * * * * * 1183 * * * * 45 0 * * * * * * 2103 0 0 N 46 * * * * * * * * * 1883 * 2150 * * * * 2217 * 1793 * 46 0 * * * * * * 2103 0 0 T 47 * * * 1883 * * 2217 * * * * * * * * * 2150 1793 * * 47 0 * * * * * * 2103 0 0 R 48 * * * * * * * * * * * * * 1793 1183 1883 * * * * 48 491 1793 * 0 * * * 2103 1000 0 A 49 456 * * * * 1883 * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 2103 0 0 I 50 1793 * * * * * * 1183 * * * * * * * * * 1883 * * 50 0 * * * * * * 2103 0 0 K 51 * * * * * * * * 1183 * * * * * 1793 1883 * * * * 51 0 * * * * * * 2103 0 0 T 52 * * * * * * * * * * * * * 1793 * * 491 * * * 52 0 * * * * * * 2103 0 0 W 53 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 53 0 * * * * * * 2103 0 0 L 54 * * * * * * * * * 491 1793 * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 2103 0 0 G 55 * * * 990 * 2150 * * * * * * * 1883 * * * * * * 55 0 * * * * * * 2103 0 0 T 56 * * 1793 * * * * * * * * * * * * 1041 2150 * * * 56 0 * * * * * * 2103 0 0 G 57 * * * 2217 * 349 * * * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 2103 0 0 D 58 * * 960 * * * 1041 * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 2103 0 0 L 59 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 2103 0 0 R 60 * * * 2217 * * * * 1793 * * * * * 2150 * 1883 * * * 60 0 * * * * * * 2103 0 0 K 61 * * * * * * * * 1183 * * * * * * 1793 1883 * * * 61 0 * * * * * * 2103 0 0 V 62 * * * * 1793 * * * * 1883 * * * * * * * 1183 * * 62 0 * * * * * * 2103 0 0 I 63 * * * * * * * 960 * * * * * * * * * 1041 * * 63 0 * * * * * * 2103 0 0 L 64 * * * * * * * 1793 * 1183 1883 * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 2103 0 0 E 65 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 2103 0 0 I 66 * * * * 1793 * * 2150 * * * * * * * * * 1041 * * 66 0 * * * * * * 2103 0 0 Y 67 * * * * 1883 * * * * * * * * * * * * * * 456 67 0 * * * * * * 2103 0 0 N 68 * * 1883 * * * * * 1793 * * 1183 * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 2103 0 0 P 69 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 69 0 * * * * * * 2103 0 0 A 70 1183 * * * * 1793 * * * * * * * * * 1883 * * * * 70 456 1883 * 1585 585 * * 2103 1000 0 T 71 1793 * * * * * * * * * * * * * * * 1183 1883 * * 71 0 * * * * * * 2103 0 0 D 72 * * 2150 * * 2217 * * * * * * * * * 1793 1883 * * * 72 0 * * * * * * 2103 0 0 K 73 * * * * * * * * 2150 * * * * * * 1041 * 1793 * * 73 0 * * * * * * 2103 0 0 L 74 1793 * * * * * * * * 491 * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 2103 0 0 V 75 * * * * * * * * * * * * * * * 1793 * 491 * * 75 0 * * * * * * 2103 0 0 T 76 1793 * * * * 1883 * * * 2217 * * * * * * 2150 * * * 76 0 * * * * * * 2103 0 0 R 77 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 77 0 * * * * * * 2103 0 0 W 78 * * * * 1883 * * * * * * * * * * * * * 456 * 78 0 * * * * * * 2103 0 0 D 79 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 2103 0 0 I 80 * * * * 837 * * 1183 * * * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 2103 0 0 D 81 * * 1183 * * * * * * * * * 1793 * * * 1883 * * * 81 0 * * * * * * 2103 0 0 I 82 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 2103 0 0 V 83 * * * 1883 * * * * * * * * * * 1793 * * 1183 * * 83 0 * * * * * * 2103 0 0 Y 84 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 84 0 * * * * * * 2103 0 0 G 85 * * 837 * * 2150 * * * * * * * 2217 * * * * * * 85 0 * * * * * * 2103 0 0 W 86 * * * * * 1793 * * * * * * * * * * * * 1183 1883 86 456 1883 * 0 * * * 2103 1000 0 S 87 1883 * * * * * * * * * * * * * * 456 * * * * 87 0 * * * * * * 2103 0 0 D 88 * * 349 * * * * * * * * * * * * 2217 * * * * 88 0 * * * * * * 2103 0 0 G 89 * * * * * 2150 * 1793 * * * * * * * 1041 * * * * 89 0 * * * * * * 2103 0 0 D 90 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 90 491 * 1793 * * * * 2103 0 0 G 91 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 91 0 * * * * 0 * 1696 0 1000 S 92 2217 * 1883 * * * * * * * * * * 1793 * 2150 * * * * 92 0 * * * * * * 2103 0 0 F 93 * * * * 1183 * * * * 1883 1793 * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 2103 0 0 W 94 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 349 2217 94 0 * * * * * * 2103 0 0 T 95 * * * * * * * 1793 * 1883 * * * * * * 1183 * * * 95 0 * * * * * * 2103 0 0 D 96 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 2103 0 0 T 97 * * * * * * * * * * * * 1883 * * * 456 * * * 97 0 * * * * * * 2103 0 0 E 98 * * 368 2150 * * * * * * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 2103 0 0 Q 99 * * * * 1793 * * * * * * * * 1183 * * * 1883 * * 99 0 * * * * * * 2103 0 0 L 100 * * * * * * * 1883 * 456 * * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 2103 0 0 K 101 * * 1883 * * * * * 960 * * * * * 2217 * * * * * 101 0 * * * * * * 2103 0 0 Y 102 * * * * * 1793 * * * * * * * * * * * * * 491 102 0 * * * * * * 2103 0 0 A 103 2150 * * * * * 2217 * * * * * * * * * 1793 1883 * * 103 0 * * * * * * 2103 0 0 I 104 * * * * 1793 * * 491 * * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 2103 0 0 K 105 1793 * * * * * * * 1183 * * * * * 1883 * * * * * 105 0 * * * * * * 2103 0 0 K 106 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 2103 0 0 A 107 456 * * * * * * * * * * 1883 * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 2103 0 0 G 108 * * * * * 491 * * * * * * 1793 * * * * * * * 108 0 * * * * * * 2103 0 0 L 109 1883 * * * * * * * * 2150 * * * * * 1793 * 2217 * * 109 0 * * * * * * 2103 0 0 L 110 2217 * * * * * * * * 2150 * * 1793 * * * * * * 1883 110 0 * * * * * * 2103 0 0 P 111 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 111 0 * * * * * * 2103 0 0 S 112 990 * * * * * * * * * * * * * * 1010 * * * * 112 0 * * * * * * 2103 0 0 Q 113 * * * 2217 * 1793 * * * * * * * 1010 * * * * * * 113 0 * * * * * * 2103 0 0 A 114 1183 837 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 2103 0 0 K 115 * * * 1883 * * * * 2150 * * * * * 2217 * 1793 * * * 115 0 * * * * * * 2103 0 0 Y 116 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 116 0 * * * * * * 2103 0 0 K 117 * * 1041 * * * * * 2150 * * * * * 1793 * * * * * 117 0 * * * * * * 2103 0 0 L 118 * * * * 1883 * * 990 * 2150 * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 2103 0 0 M 119 * * * * * * * * * 990 2150 * * * * * 1883 * * * 119 0 * * * * * * 2103 0 0 L 120 * * * * * * * * * 456 * * * * * * * 1883 * * 120 0 * * * * * * 2103 0 0 D 121 * * 2150 * * * * * 2217 * * * * 1793 * * * 1883 * * 121 491 1793 * 0 * * * 2103 1000 0 T 122 * * * * * * * * * * * 1041 * * * * 960 * * * 122 0 * * * * * * 2103 0 0 K 123 1793 * * * * * * * 491 * * * * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 2103 0 0 P 124 * * * * * * * * * * * * 491 * * * 1793 * * * 124 0 * * * * * * 2103 0 0 G 125 1793 * * * * 491 * * * * * * * * * * * * * * 125 0 * * * * * * 2103 0 0 R 126 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 126 0 * * * * * * 2103 0 0 P 127 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 127 491 * 1793 * * * * 2103 0 0 D 128 1390 * 694 * * * * * * * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * 0 * 1696 0 1000 V 129 * * * * * * * * * 1793 * * * * * * * 491 * * 129 0 * * * * * * 2103 0 0 E 130 2217 * * 2150 * * * * * * * * 837 * * * * * * * 130 0 * * * * * * 2103 0 0 G 131 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 131 0 * * * * * * 2103 0 0 W 132 * * * * * * * * * * 1793 * * * * * * * 491 * 132 0 * * * * * * 2103 0 0 S 133 * * * * * 1041 * * * * * * * * * 960 * * * * 133 0 * * * * * * 2103 0 0 K 134 * * * * * * * * 1010 * * * 2217 * * 1793 * * * * 134 0 * * * * * * 2103 0 0 G 135 1793 * * * * 491 * * * * * * * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 2103 0 0 S 136 * * * * * * * * * * * * * 1883 * 456 * * * * 136 0 * * * * * * 2103 0 0 Y 137 * * * * 2217 * * * * 1883 * * * * * * * * * 960 137 0 * * * * * * 2103 0 0 R 138 * * * * * * * * * 1793 * * * * 491 * * * * * 138 0 * * * * * * 2103 0 0 S 139 2217 * * * * * * * * * * * * * * 349 * * * * 139 0 * * * * * * 2103 0 0 T 140 * * * * * * * * * 1793 * * * * * 1883 1183 * * * 140 0 * * * * * * 2103 0 0 D 141 1793 * 491 * * * * * * * * * * * * * * * * * 141 0 * * * * * * 2103 0 0 G 142 * * * * * 456 1883 * * * * * * * * * * * * * 142 0 * * * * * * 2103 0 0 M 143 * * * * * * * * * 837 1183 * * * * * * * * * 143 0 * * * * * * 2103 0 0 V 144 * * * * * * * * * * * * * * * * 837 1183 * * 144 0 * * * * * * 2103 0 0 K 145 1793 * * * * * * * 2150 * * * * * 1041 * * * * * 145 0 * * * * * * 2103 0 0 Q 146 * * * * * * * * * * * * * 1183 837 * * * * * 146 0 * * * * * * 2103 0 0 S 147 * * * 1793 * * * * * * * * * * * 1183 1883 * * * 147 0 * * * * * * 2103 0 0 L 148 837 * * * * * * * * 1183 * * * * * * * * * * 148 0 * * * * * * 2103 0 0 G 149 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 149 0 * * * * * * 2103 0 0 S 150 * * * * * * * * * * * * * * * 1183 837 * * * 150 0 * * * * * * 2103 0 0 T 151 1883 * * * * * * * * * * * * * * * 1183 1793 * * 151 0 * * * * * * 2103 0 0 V 152 * * * * * * * 368 * * * * * * * * * 2150 * * 152 0 * * * * * * 2103 0 0 E 153 * * 2217 2150 * 1793 * * * * * * * * * * 1883 * * * 153 0 * * * * * * 2103 0 0 H 154 * * * * * 1883 1183 * * * * * * * * * 1793 * * * 154 0 * * * * * * 2103 0 0 S 155 * * * * * 1883 * * * * * * 1793 * * 1183 * * * * 155 0 * * * * * * 2103 0 0 G 156 * * 1793 * * 1183 * * * * * * * * * * 1883 * * * 156 0 * * * * * * 2103 0 0 L 157 * * * * * * * 837 * 1183 * * * * * * * * * * 157 0 * * * * * * 2103 0 0 A 158 2150 * * * * 1041 * * * * 1793 * * * * * * * * * 158 0 * * * * * * 2103 0 0 G 159 837 * * * * 1183 * * * * * * * * * * * * * * 159 0 * * * * * * 2103 0 0 Q 160 * * * * * * * * * * * * * 2150 * 368 * * * * 160 0 * * * * * * 2103 0 0 A 161 456 * * * * * * 1883 * * * * * * * * * * * * 161 0 * * * * * * 2103 0 0 G 162 2217 * * * * 2150 * * 1793 * * * * * * 1883 * * * * 162 0 * * * * * * 2103 0 0 Y 163 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 163 0 * * * * * * 2103 0 0 W 164 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 1183 837 164 0 * * * * * * 2103 0 0 R 165 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 165 0 * * * * * * 1767 0 0 Q 166 * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * 166 0 * * * * * * 1255 0 0 R 167 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 167 0 * * 0 * * * 1255 0 0 //