HHsearch 1.5 NAME c6oj0Z_ FAM FILE c6oj0Z_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6oj0Z_.a3m DATE Sat Oct 5 08:19:17 2019 LENG 180 match states, 180 columns in multiple alignment FILT 1 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.4239 -0.6268 SEQ >ss_dssp CEEEEEEECSSSEECCSSSSEEEEEEESCEEEEEEESSSEECTHHHHSSSEEEEETTEEEEECCCTHHHHBTBBTBCCCTTCCSBEEBTTTTCEEEBCCC CCSCCCBEEEEETTTBEESSBCCSSCEEECSEEEEEESSEEETTTCCCSSSSCTTSSSEEEEECCEEEESSEEEEEEECC >sa_dssp EDECEDDCDEEECECDEDDEDECBDBEDEBDACCADCCBDBCBBBCCCCDCBADBDEEDDBDDCBCBBBBBBBBBECEBDECCBBBBBBBBBBBCBECEE EDCEEBBBCBCBCCCCCBDCADCEEDCEBEECABABCDCBBCBBBCCEBEEEDEEDECCBECCBBBDCDCDACBCADBDE >ss_pred CCEEEEEEEEEEEECCCCEEEEEEEECCCEEEEEEEEEECCCCCEEEEEEEEEEECCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCCEEEEECC CCCCCEEEEEECCCCCCCCEECCCCCCCCEEEEEEEEEEEEECCCCCCCCCEEECCCEEECCCCCCCCCEEEEEEEEECC >ss_conf 9315410000000014430489885428658999999853876033235888850728998551024344543554414676423675522520788456 55463036763245530001034456442001554457886034666755303216624025876666027988764049 >Consensus ysyvhnittqtnidlssqqtihlasingkgyiiflrffcegssacftnvkfsvkanglvlysfryiqllelgqaiataipsssqgfstllsnynvlissp igtlpqltlydsydnrygamlqpafplpfvntlsldvdilpvsqssydpipyslndnqistnaptgkgnisieyllyncl >c6oj0Z_ YSYVHNITTQTNIDLSSQQTIHLASINGKGYIIFLRFFCEGSSACFTNVKFSVKANGLVLYSFRYIQLLELGQAIATAIPSSSQGFSTLLSNYNVLISSP IGTLPQLTLYDSYDNRYGAMLQPAFPLPFVNTLSLDVDILPVSQSSYDPIPYSLNDNQISTNAPTGKGNISIEYLLYNCL # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * Y 1 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 1 0 * * * * * * 1000 0 0 S 2 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 3 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 3 0 * * * * * * 1000 0 0 V 4 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 H 5 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 N 6 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 I 7 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 T 8 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 T 9 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 10 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 T 11 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 N 12 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 I 13 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 D 14 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 L 15 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 S 16 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 S 17 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 18 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 19 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 T 20 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 I 21 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 H 22 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 L 23 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 A 24 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 S 25 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 I 26 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 N 27 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 G 28 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 K 29 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 G 30 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 31 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 31 0 * * * * * * 1000 0 0 I 32 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 I 33 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 F 34 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 L 35 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 R 36 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 F 37 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 F 38 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 C 39 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 E 40 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 G 41 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 S 42 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 S 43 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 A 44 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 C 45 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 F 46 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 T 47 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 N 48 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 V 49 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 K 50 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 F 51 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 S 52 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 V 53 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 K 54 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 A 55 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 N 56 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 G 57 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 L 58 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 V 59 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 L 60 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 61 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 61 0 * * * * * * 1000 0 0 S 62 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 62 0 * * * * * * 1000 0 0 F 63 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1000 0 0 R 64 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 65 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 65 0 * * * * * * 1000 0 0 I 66 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 67 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 L 68 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 L 69 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 E 70 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1000 0 0 L 71 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1000 0 0 G 72 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 73 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 73 0 * * * * * * 1000 0 0 A 74 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1000 0 0 I 75 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1000 0 0 A 76 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1000 0 0 T 77 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 77 0 * * * * * * 1000 0 0 A 78 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1000 0 0 I 79 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1000 0 0 P 80 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1000 0 0 S 81 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 81 0 * * * * * * 1000 0 0 S 82 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 82 0 * * * * * * 1000 0 0 S 83 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 83 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 84 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 84 0 * * * * * * 1000 0 0 G 85 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1000 0 0 F 86 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1000 0 0 S 87 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 87 0 * * * * * * 1000 0 0 T 88 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 88 0 * * * * * * 1000 0 0 L 89 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1000 0 0 L 90 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1000 0 0 S 91 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 91 0 * * * * * * 1000 0 0 N 92 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 93 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 93 0 * * * * * * 1000 0 0 N 94 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1000 0 0 V 95 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 95 0 * * * * * * 1000 0 0 L 96 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1000 0 0 I 97 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1000 0 0 S 98 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 98 0 * * * * * * 1000 0 0 S 99 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 99 0 * * * * * * 1000 0 0 P 100 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1000 0 0 I 101 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1000 0 0 G 102 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1000 0 0 T 103 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 103 0 * * * * * * 1000 0 0 L 104 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1000 0 0 P 105 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 106 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 106 0 * * * * * * 1000 0 0 L 107 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1000 0 0 T 108 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 108 0 * * * * * * 1000 0 0 L 109 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 110 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 110 0 * * * * * * 1000 0 0 D 111 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1000 0 0 S 112 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 112 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 113 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 113 0 * * * * * * 1000 0 0 D 114 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1000 0 0 N 115 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1000 0 0 R 116 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 116 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 117 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 117 0 * * * * * * 1000 0 0 G 118 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1000 0 0 A 119 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1000 0 0 M 120 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1000 0 0 L 121 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 122 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 122 0 * * * * * * 1000 0 0 P 123 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 123 0 * * * * * * 1000 0 0 A 124 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1000 0 0 F 125 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 125 0 * * * * * * 1000 0 0 P 126 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1000 0 0 L 127 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 127 0 * * * * * * 1000 0 0 P 128 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1000 0 0 F 129 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 129 0 * * * * * * 1000 0 0 V 130 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 130 0 * * * * * * 1000 0 0 N 131 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 131 0 * * * * * * 1000 0 0 T 132 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 132 0 * * * * * * 1000 0 0 L 133 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 1000 0 0 S 134 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 134 0 * * * * * * 1000 0 0 L 135 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 1000 0 0 D 136 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 136 0 * * * * * * 1000 0 0 V 137 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 137 0 * * * * * * 1000 0 0 D 138 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 138 0 * * * * * * 1000 0 0 I 139 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 139 0 * * * * * * 1000 0 0 L 140 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 140 0 * * * * * * 1000 0 0 P 141 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 141 0 * * * * * * 1000 0 0 V 142 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 142 0 * * * * * * 1000 0 0 S 143 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 143 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 144 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 144 0 * * * * * * 1000 0 0 S 145 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 145 0 * * * * * * 1000 0 0 S 146 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 146 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 147 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 147 0 * * * * * * 1000 0 0 D 148 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 148 0 * * * * * * 1000 0 0 P 149 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 149 0 * * * * * * 1000 0 0 I 150 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 150 0 * * * * * * 1000 0 0 P 151 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 151 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 152 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 152 0 * * * * * * 1000 0 0 S 153 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 153 0 * * * * * * 1000 0 0 L 154 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 154 0 * * * * * * 1000 0 0 N 155 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 155 0 * * * * * * 1000 0 0 D 156 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 156 0 * * * * * * 1000 0 0 N 157 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 157 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 158 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 158 0 * * * * * * 1000 0 0 I 159 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 159 0 * * * * * * 1000 0 0 S 160 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 160 0 * * * * * * 1000 0 0 T 161 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 161 0 * * * * * * 1000 0 0 N 162 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 162 0 * * * * * * 1000 0 0 A 163 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 163 0 * * * * * * 1000 0 0 P 164 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 164 0 * * * * * * 1000 0 0 T 165 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 165 0 * * * * * * 1000 0 0 G 166 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 166 0 * * * * * * 1000 0 0 K 167 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 167 0 * * * * * * 1000 0 0 G 168 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 168 0 * * * * * * 1000 0 0 N 169 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 169 0 * * * * * * 1000 0 0 I 170 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 170 0 * * * * * * 1000 0 0 S 171 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 171 0 * * * * * * 1000 0 0 I 172 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 172 0 * * * * * * 1000 0 0 E 173 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 173 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 174 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 174 0 * * * * * * 1000 0 0 L 175 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 175 0 * * * * * * 1000 0 0 L 176 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 176 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 177 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 177 0 * * * * * * 1000 0 0 N 178 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 178 0 * * * * * * 1000 0 0 C 179 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 179 0 * * * * * * 1000 0 0 L 180 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 180 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //