HHsearch 1.5 NAME c6oe6A_ FAM FILE c6oe6A_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6oe6A_.a3m DATE Sat Apr 20 08:18:46 2019 LENG 127 match states, 127 columns in multiple alignment FILT 3 out of 7 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.5 EVD 0.3970 -1.1688 SEQ >ss_dssp CCEEEEEEECCCCCGGGSEECCSSCEEETTSEEEEEEECSSCCCTTSCEEEEEEEESSSEEEEEEEEECCBTTTTEEEEEECSCCSEEEEEEEEETTEEE EEEEEEEECSSSCCCTTTCCTTSTTTC >sa_dssp EBDAABCDDEEEEEDECBEDDDCEBDBCDDDBABAAACBECEBDDEBDADBBBBDDEEDCDEDEDEECEADDECCABDCDCEECEDCDABACACCEEEED BDBDACBBDECEECEDEDCDEECEECD >ss_pred CCCEEEEEEEEEEEECCEEEEECCEEECCCCCEEEEEEEECCCCCCEEEEEEEEEEEECCEEEEEEECCCCCCCEEEECCCCCCCCCEEEEEEEECCCEE EEEEEEEECCCCCCEECCCCCHHHHCC >ss_conf 9732125221011100036641000107998099999961586751268998633561732323220178820100001103336541789998628710 001001003678610037886354119 >Consensus xGEFGWxLxxxxxTvxeYxixRxnLIFxxxxtIxYiYrFSRsxxxxaxxxvSLsrxqLxxxEmDvxrKRxxPxsxtIxxxFxxLxxGkYLlKixYEGDxi DEVeFxVrstxtpyiedxxsxxddiek >c6oe6A_ TGEFGWVLLDEEMTVGEYTITRKNLIFPDDKTICYIYRFSRSVSESAETYVSLSKFQLGYNEMDVLRKRPNPVSQTIEGSFQGLSPGKYLLKVAYEGDVI DEVEFLVRSTRTPYIEDTSSSADDIEK >UniRef50_Q04S73(33-169:172) Hypothetical lipoprotein n=4 Tax=Leptospira RepID=Q04S73_LEPBJ E=3e-54 s/c=1.55 id=87% cov=101% TGEFGWALLDEEklnilekkiMTVGEYTITRENLIFPDDKSIYYIYRFSRSVSETAVTYVSLSRFQLGYNEMDVLRKRPNPISKTIEGSFQGLTPGKYLL KIAYEGDVIDEVEFLVRSTQTPYIEDIPSPSDnDIEK >UniRef50_B0SJ78(33-162:190) Putative uncharacterized protein n=2 Tax=Leptospira biflexa serovar Patoc RepID=B0SJ78_LEPBP E=3e-47 s/c=1.35 id=40% cov=85% KGEFGWtttkmeemdILEQHIQTITDYKMMRDDLIFSPTDTIHYVYQFSRNPGLETDFHISLNRYELDFVEIDIKKKRAEPDTLAIRDEFSLLRTGEYLI KIVYEGDTVDEVKFRV-------------------- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * T 1 * * * * * * * * 1268 * * * * * * * 774 * * * 1 0 * * * * * * 1553 0 0 G 2 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1553 0 0 E 3 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1553 0 0 F 4 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1553 0 0 G 5 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1553 0 0 W 6 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 6 774 1268 * 3170 170 * * 1553 1000 0 V 7 1780 * * * * * * 1268 * * * * * * * * * 1768 * * 7 0 * * * * * * 1553 0 0 L 8 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1553 0 0 L 9 * * * 1268 * * * * * 774 * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1553 0 0 D 10 * * 774 * * * * * * * * * * 1268 * * * * * * 10 0 * * * * * * 1553 0 0 E 11 * * * 774 * * 1268 * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1553 0 0 E 12 * * * 774 * * * 1268 * * * * * * * * * * * * 12 497 1780 * 3170 170 * * 1553 1000 0 M 13 * * * * * * * * * * 774 * * 1268 * * * * * * 13 0 * * * * * * 1553 0 0 T 14 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 14 0 * * * * * * 1553 0 0 V 15 * * * * * * * 1268 * * * * * * * * * 774 * * 15 0 * * * * * * 1553 0 0 G 16 * * * * * 774 * * * * * * * * * * 1268 * * * 16 0 * * * * * * 1553 0 0 E 17 * * 1268 774 * * * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1553 0 0 Y 18 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 18 0 * * * * * * 1553 0 0 T 19 * * * * * * * * 1268 * * * * * * * 774 * * * 19 0 * * * * * * 1553 0 0 I 20 * * * * * * * 774 * * 1268 * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1553 0 0 T 21 * * * * * * * * * * 1268 * * * * * 774 * * * 21 0 * * * * * * 1553 0 0 R 22 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 22 0 * * * * * * 1553 0 0 K 23 * * 1268 1780 * * * * 1768 * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1553 0 0 N 24 * * 1268 * * * * * * * * 774 * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1553 0 0 L 25 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1553 0 0 I 26 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1553 0 0 F 27 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1553 0 0 P 28 * * * * * * * * * * * * 774 * * 1268 * * * * 28 0 * * * * * * 1553 0 0 D 29 * * 774 * * * * * * * * * 1268 * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1553 0 0 D 30 * * 774 * * * * * * * * * * * * * 1268 * * * 30 0 * * * * * * 1553 0 0 K 31 * * 1268 * * * * * 774 * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1553 0 0 T 32 * * * * * * * * * * * * * * * 1780 497 * * * 32 0 * * * * * * 1553 0 0 I 33 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1553 0 0 C 34 * 1768 * * * * 1268 * * * * * * * * * * * * 1780 34 0 * * * * * * 1553 0 0 Y 35 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 35 0 * * * * * * 1553 0 0 I 36 * * * * * * * 774 * * * * * * * * * 1268 * * 36 0 * * * * * * 1553 0 0 Y 37 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 37 0 * * * * * * 1553 0 0 R 38 * * * * * * * * * * * * * 1268 774 * * * * * 38 0 * * * * * * 1553 0 0 F 39 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1553 0 0 S 40 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 40 0 * * * * * * 1553 0 0 R 41 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 41 0 * * * * * * 1553 0 0 S 42 * * * * * * * * * * * 1268 * * * 774 * * * * 42 0 * * * * * * 1553 0 0 V 43 * * * * * * * * * * * * 1268 * * * * 774 * * 43 0 * * * * * * 1553 0 0 S 44 * * * * * 1268 * * * * * * * * * 774 * * * * 44 0 * * * * * * 1553 0 0 E 45 * * * 774 * * * * * 1268 * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1553 0 0 S 46 * * * 1268 * * * * * * * * * * * 1768 1780 * * * 46 0 * * * * * * 1553 0 0 A 47 774 * * * * * * * * * * * * * * * 1268 * * * 47 0 * * * * * * 1553 0 0 E 48 * * 1268 1768 * * * * * * * * * * * * * 1780 * * 48 0 * * * * * * 1553 0 0 T 49 * * * * 1268 * * * * * * * * * * * 774 * * * 49 0 * * * * * * 1553 0 0 Y 50 * * * * * * 1268 * * * * * * * * * * * * 774 50 0 * * * * * * 1553 0 0 V 51 * * * * * * * 1268 * * * * * * * * * 774 * * 51 0 * * * * * * 1553 0 0 S 52 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 52 0 * * * * * * 1553 0 0 L 53 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1553 0 0 S 54 * * * * * * * * * * * 1268 * * * 774 * * * * 54 0 * * * * * * 1553 0 0 K 55 * * * * * * * * 1768 * * * * * 501 * * * * * 55 0 * * * * * * 1553 0 0 F 56 * * * * 774 * * * * * * * * * * * * * * 1268 56 0 * * * * * * 1553 0 0 Q 57 * * * 1268 * * * * * * * * * 774 * * * * * * 57 0 * * * * * * 1553 0 0 L 58 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1553 0 0 G 59 * * 1268 * * 774 * * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1553 0 0 Y 60 * * * * 1268 * * * * * * * * * * * * * * 774 60 0 * * * * * * 1553 0 0 N 61 * * * * * * * * * * * 774 * * * * * 1268 * * 61 0 * * * * * * 1553 0 0 E 62 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1553 0 0 M 63 * * * * * * * 1268 * * 774 * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1553 0 0 D 64 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1553 0 0 V 65 * * * * * * * 1268 * * * * * * * * * 774 * * 65 0 * * * * * * 1553 0 0 L 66 * * * * * * * * 1268 774 * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1553 0 0 R 67 * * * * * * * * 1268 * * * * * 774 * * * * * 67 0 * * * * * * 1553 0 0 K 68 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1553 0 0 R 69 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 69 0 * * * * * * 1553 0 0 P 70 1268 * * * * * * * * * * * 774 * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1553 0 0 N 71 * * * 1268 * * * * * * * 774 * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1553 0 0 P 72 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1553 0 0 V 73 * * 1268 * * * * 1780 * * * * * * * * * 1768 * * 73 0 * * * * * * 1553 0 0 S 74 * * * * * * * * * * * * * * * 774 1268 * * * 74 0 * * * * * * 1553 0 0 Q 75 * * * * * * * * 1780 1268 * * * 1768 * * * * * * 75 0 * * * * * * 1553 0 0 T 76 1268 * * * * * * * * * * * * * * * 774 * * * 76 0 * * * * * * 1553 0 0 I 77 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1553 0 0 E 78 * * * 774 * * * * * * * * * * 1268 * * * * * 78 0 * * * * * * 1553 0 0 G 79 * * 1268 * * 774 * * * * * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1553 0 0 S 80 * * * 1268 * * * * * * * * * * * 774 * * * * 80 0 * * * * * * 1553 0 0 F 81 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1553 0 0 Q 82 * * * * * * * * * * * * * 774 * 1268 * * * * 82 0 * * * * * * 1553 0 0 G 83 * * * * * 774 * * * 1268 * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1553 0 0 L 84 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1553 0 0 S 85 * * * * * * * * * * * * * * 1268 1768 1780 * * * 85 0 * * * * * * 1553 0 0 P 86 * * * * * * * * * * * * 774 * * * 1268 * * * 86 0 * * * * * * 1553 0 0 G 87 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1553 0 0 K 88 * * * 1268 * * * * 774 * * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1553 0 0 Y 89 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 89 0 * * * * * * 1553 0 0 L 90 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1553 0 0 L 91 * * * * * * * 1268 * 774 * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1553 0 0 K 92 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1553 0 0 V 93 * * * * * * * 501 * * * * * * * * * 1768 * * 93 0 * * * * * * 1553 0 0 A 94 774 * * * * * * * * * * * * * * * * 1268 * * 94 0 * * * * * * 1553 0 0 Y 95 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 95 0 * * * * * * 1553 0 0 E 96 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1553 0 0 G 97 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1553 0 0 D 98 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1553 0 0 V 99 * * * * * * * * * * * * * * * * 1268 774 * * 99 0 * * * * * * 1553 0 0 I 100 * * * * * * * 774 * * * * * * * * * 1268 * * 100 0 * * * * * * 1553 0 0 D 101 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1553 0 0 E 102 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1553 0 0 V 103 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 103 0 * * * * * * 1553 0 0 E 104 * * * 774 * * * * 1268 * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1553 0 0 F 105 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1553 0 0 L 106 * * * * * * * * * 774 * * * * 1268 * * * * * 106 0 * * * * * * 1553 0 0 V 107 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 107 0 * * * * * * 1553 0 0 R 108 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 108 0 * * * * * * 1091 0 0 S 109 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 109 0 * * * * * * 1091 0 0 T 110 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 110 0 * * * * * * 1091 0 0 R 111 * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * 111 0 * * * * * * 1091 0 0 T 112 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 112 0 * * * * * * 1091 0 0 P 113 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1091 0 0 Y 114 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 114 0 * * * * * * 1091 0 0 I 115 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1091 0 0 E 116 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1091 0 0 D 117 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1091 0 0 T 118 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * 118 0 * * * * * * 1091 0 0 S 119 * * * * * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * 119 0 * * * * * * 1091 0 0 S 120 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 120 0 * * * * * * 1091 0 0 S 121 * * * * * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * 121 0 * * * * * * 1091 0 0 A 122 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 122 0 * * * * * * 1091 0 0 D 123 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 123 1000 1000 * 0 * * * 1091 1000 0 D 124 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1091 0 0 I 125 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 125 0 * * * * * * 1091 0 0 E 126 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1091 0 0 K 127 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 127 0 * * 0 * * * 1091 0 0 //