HHsearch 1.5 NAME c6niiA_ FAM FILE c6niiA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6niiA_.a3m DATE Sat May 25 08:24:00 2019 LENG 167 match states, 167 columns in multiple alignment FILT 1 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.4072 -1.0801 SEQ >ss_dssp CHHHHHHHHHHHHHSCEEEECCCCCCCCCGGGGTTSCGGGEEEEECCSCHHHHHHHHHHSCTTCEEEEEEECSSSCCEEEEEEEEGGGTEEEEEEETTEE EECBCTTSCBCHHHHTTCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHTCHHHHHHHHHHCCSCCTTEEEEC >sa_dssp DBBDBACCAADDDDEBDADBDDEEEECEACDAAEDBDEECCDEBEBCEECEDAAECADEBEDECBBAACBCEEEDEDDBAAABCCEEDDABBABBBEEDE CCABCEEDDBCEDADEBCDCABAACACDCAABBAAABABACCDEDEEBACECBDEDEEBCEDADDEE >ss_pred CHHHHHHHHHHHEECCCCCCEEEEEEEEECCEEEECCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCEEEEEEEEECCCCEEEEECCCCE EEEECCCCEEEECCCEEEEEEEEECCCCHHEEEECCEEEEEEECCCEEEEEEEEECCCCCCCCCCCC >ss_conf 9345777653210226665125567885151443457753069873687667788763036650799962377777226999995035412464056642 8996178616432740367887532640002431228999972575145555430651071000039 >Consensus caemmikkaaqlilgsdldfeytdiqvdlgpafmfspdeektlwvsgknqetlekdlatlnkssvyffrtgtqggaghwqvlyyeaaksgwvsyssqsnh fqvtdsngkltasgkgllyafllvnasaeniihaanfvyilrtqnevaaieycalnhefhpeikrta >c6niiA_ CAEMMIKKAAQLILGSDLDFEYTDIQVDLGPAFMFSPDEEKTLWVSGKNQETLEKDLATLNKSSVYFFRTGTQGGAGHWQVLYYEAAKSGWVSYSSQSNH FQVTDSNGKLTASGKGLLYAFLLVNASAENIIHAANFVYILRTQNEVAAIEYCALNHEFHPEIKRTA # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * C 1 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 A 2 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 E 3 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 M 4 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 M 5 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 I 6 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 K 7 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 K 8 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 A 9 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 A 10 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 11 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 L 12 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 I 13 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 L 14 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 G 15 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 S 16 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 D 17 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 L 18 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 D 19 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 F 20 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 E 21 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 22 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 22 0 * * * * * * 1000 0 0 T 23 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 D 24 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 I 25 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 26 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 V 27 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 D 28 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 L 29 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 G 30 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 P 31 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 A 32 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 F 33 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 M 34 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 F 35 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 S 36 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 P 37 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 D 38 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 E 39 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 E 40 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 K 41 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 T 42 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 L 43 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 W 44 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 V 45 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 S 46 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 G 47 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 K 48 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 N 49 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 50 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 E 51 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 T 52 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 L 53 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 E 54 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 K 55 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 D 56 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 L 57 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 A 58 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 T 59 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 L 60 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 N 61 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1000 0 0 K 62 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1000 0 0 S 63 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 63 0 * * * * * * 1000 0 0 S 64 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 V 65 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 65 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 66 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 66 0 * * * * * * 1000 0 0 F 67 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 F 68 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 R 69 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 T 70 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 70 0 * * * * * * 1000 0 0 G 71 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1000 0 0 T 72 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 73 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 73 0 * * * * * * 1000 0 0 G 74 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1000 0 0 G 75 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1000 0 0 A 76 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1000 0 0 G 77 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1000 0 0 H 78 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1000 0 0 W 79 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 79 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 80 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 80 0 * * * * * * 1000 0 0 V 81 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 81 0 * * * * * * 1000 0 0 L 82 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 83 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 83 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 84 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 84 0 * * * * * * 1000 0 0 E 85 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1000 0 0 A 86 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1000 0 0 A 87 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1000 0 0 K 88 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1000 0 0 S 89 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 89 0 * * * * * * 1000 0 0 G 90 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1000 0 0 W 91 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 91 0 * * * * * * 1000 0 0 V 92 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 92 0 * * * * * * 1000 0 0 S 93 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 93 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 94 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 94 0 * * * * * * 1000 0 0 S 95 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 95 0 * * * * * * 1000 0 0 S 96 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 96 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 97 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 97 0 * * * * * * 1000 0 0 S 98 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 98 0 * * * * * * 1000 0 0 N 99 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1000 0 0 H 100 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1000 0 0 F 101 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 102 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 102 0 * * * * * * 1000 0 0 V 103 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 103 0 * * * * * * 1000 0 0 T 104 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 104 0 * * * * * * 1000 0 0 D 105 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1000 0 0 S 106 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 106 0 * * * * * * 1000 0 0 N 107 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1000 0 0 G 108 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1000 0 0 K 109 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1000 0 0 L 110 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1000 0 0 T 111 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 111 0 * * * * * * 1000 0 0 A 112 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1000 0 0 S 113 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 113 0 * * * * * * 1000 0 0 G 114 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1000 0 0 K 115 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1000 0 0 G 116 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1000 0 0 L 117 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1000 0 0 L 118 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 119 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 119 0 * * * * * * 1000 0 0 A 120 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1000 0 0 F 121 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1000 0 0 L 122 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1000 0 0 L 123 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 1000 0 0 V 124 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 124 0 * * * * * * 1000 0 0 N 125 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 125 0 * * * * * * 1000 0 0 A 126 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1000 0 0 S 127 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 127 0 * * * * * * 1000 0 0 A 128 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1000 0 0 E 129 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 129 0 * * * * * * 1000 0 0 N 130 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 1000 0 0 I 131 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 131 0 * * * * * * 1000 0 0 I 132 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 132 0 * * * * * * 1000 0 0 H 133 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 1000 0 0 A 134 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 134 0 * * * * * * 1000 0 0 A 135 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 1000 0 0 N 136 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 136 0 * * * * * * 1000 0 0 F 137 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 137 0 * * * * * * 1000 0 0 V 138 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 138 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 139 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 139 0 * * * * * * 1000 0 0 I 140 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 140 0 * * * * * * 1000 0 0 L 141 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 141 0 * * * * * * 1000 0 0 R 142 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 142 0 * * * * * * 1000 0 0 T 143 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 143 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 144 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 144 0 * * * * * * 1000 0 0 N 145 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 145 0 * * * * * * 1000 0 0 E 146 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 146 0 * * * * * * 1000 0 0 V 147 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 147 0 * * * * * * 1000 0 0 A 148 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 148 0 * * * * * * 1000 0 0 A 149 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 149 0 * * * * * * 1000 0 0 I 150 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 150 0 * * * * * * 1000 0 0 E 151 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 151 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 152 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 152 0 * * * * * * 1000 0 0 C 153 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 153 0 * * * * * * 1000 0 0 A 154 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 154 0 * * * * * * 1000 0 0 L 155 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 155 0 * * * * * * 1000 0 0 N 156 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 156 0 * * * * * * 1000 0 0 H 157 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 157 0 * * * * * * 1000 0 0 E 158 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 158 0 * * * * * * 1000 0 0 F 159 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 159 0 * * * * * * 1000 0 0 H 160 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 160 0 * * * * * * 1000 0 0 P 161 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 161 0 * * * * * * 1000 0 0 E 162 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 162 0 * * * * * * 1000 0 0 I 163 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 163 0 * * * * * * 1000 0 0 K 164 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 164 0 * * * * * * 1000 0 0 R 165 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 165 0 * * * * * * 1000 0 0 T 166 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 166 0 * * * * * * 1000 0 0 A 167 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 167 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //