HHsearch 1.5 NAME c6n63A_ FAM FILE c6n63A_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6n63A_.a3m DATE Sat Jul 20 08:19:49 2019 LENG 141 match states, 141 columns in multiple alignment FILT 3 out of 7 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.8 EVD 0.3858 -2.0578 SEQ >ss_dssp CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTCCSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTCCSCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHCCSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTC >sa_dssp EECBDBACECADCACDAADCABEBADDCBEECEEEECEECBDDBCDCADDACECADEABCBACDBCEDCEEEEEEDDEEBCDDBCECADEACDAACDABD BACEACEDAEDEECCECADDADECBDDABDCADDCBDDCEE >ss_pred CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHH HHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >ss_conf 9149999999853499999999999899853122057899998756898788679999998986555311000032401699999751666540787998 76455430048400237899999755319999999972049 >Consensus xxelxxxhaIfxrtkeaixxFmaxlxPxIexAxDdHeRLYyHHIyEEEEqRxxRLxxLiPxlEkxxxxadexlxsxsnxdfxrlLqdinLEkFGLHNFxE HldLsLfxfkdxExxxllxxlRxxtxxdYqxvKexlaxxnx >c6n63A_ KEELDAFHQIFTTTKEAIERFMAMLTPVIENAEDDHERLYYHHIYEEEEQRLSRLDVLIPLIEKFQDETDEGLFSPSNNAFNRLLQELNLEKFGLHNFIE HVDLALFSFTDEERQTLLKELRKDAYEGYQYVKEKLAEINA >UniRef50_C0ZHN3(2-138:199) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Brevibacillus brevis NBRC 100599 RepID=C0ZHN3_BREBN E=3e-26 s/c=0.87 id=43% cov=98% -QEITQLHAIFDRTRGYINNFMGVIQPIIDAATDEHTRLYYHHILEEEEQRMGRLQELVPYLEKL--SAGKSLDQLSDRDLSQMLSDVNLERFGLHNFRE HLELSLYEFKDDETRQLLDGMREKTHTDYLTVKEIMANMS- >UniRef50_C9RYB8(5-139:199) Putative uncharacterized protein n=4 Tax=Geobacillus RepID=C9RYB8_GEOSY E=1e-42 s/c=1.28 id=48% cov=96% ---LAEVSAILGRSKEALSQFQAILEPTIEKAADDHERLYWHHIYEEEEHRFDRLTALLPKLE--EALADEAFLSRENGDFLRLLQDISLEKFGLHNFLE HLDLSLFHYKGTEHEPPITALRDMTAADYQRMKAALETLN- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * K 1 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 E 2 * * * 979 * * * * * * * * * 1021 * * * * * * 2 0 * * * * * * 1475 0 0 E 3 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1475 0 0 L 4 * * * * * * * 1538 * 609 * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1791 0 0 D 5 1601 * 1617 * * * * * * * * * * * * * 1538 * * * 5 0 * * * * * * 1791 0 0 A 6 1617 * * 1601 * * * * * * * * * 1538 * * * * * * 6 0 * * * * * * 1791 0 0 F 7 * * * * 1617 * * * * 1538 * * * * * * * 1601 * * 7 0 * * * * * * 1791 0 0 H 8 * * * * * * 577 * * * * * * * * 1601 * * * * 8 0 * * * * * * 1791 0 0 Q 9 569 * * * * * * * * * * * * 1617 * * * * * * 9 0 * * * * * * 1791 0 0 I 10 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1791 0 0 F 11 * * * * 577 * * * * 1601 * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1791 0 0 T 12 * * 1538 * * 1601 * * * * * * * * * * 1617 * * * 12 0 * * * * * * 1791 0 0 T 13 * * * * * * * * * * * * * * 569 * 1617 * * * 13 0 * * * * * * 1791 0 0 T 14 * * * * * * * * * * * * * * * 1601 577 * * * 14 0 * * * * * * 1791 0 0 K 15 * * * * * * * * 609 * * * * * 1538 * * * * * 15 0 * * * * * * 1791 0 0 E 16 * * * 609 * 1538 * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1791 0 0 A 17 609 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 1538 17 0 * * * * * * 1791 0 0 I 18 * * * * * * * 577 * 1601 * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1791 0 0 E 19 * * * 1617 * * * * * * * 1538 * * * 1601 * * * * 19 0 * * * * * * 1791 0 0 R 20 * * * * * * * * * * * 1538 * 1601 1617 * * * * * 20 0 * * * * * * 1791 0 0 F 21 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1791 0 0 M 22 * * * * * * * * * * 577 * * 1601 * * * * * * 22 0 * * * * * * 1791 0 0 A 23 609 * * * * 1538 * * * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1791 0 0 M 24 * * * * * * * 1601 * * 1617 * * * * * * 1538 * * 24 0 * * * * * * 1791 0 0 L 25 * * * * * * * 1538 * 609 * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1791 0 0 T 26 * * * 1601 * * * * * * * * * 1538 * * 1617 * * * 26 0 * * * * * * 1791 0 0 P 27 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1791 0 0 V 28 * * * * * * * 1538 * * * * * * * * 1601 1617 * * 28 0 * * * * * * 1791 0 0 I 29 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1791 0 0 E 30 * * 1538 609 * * * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1791 0 0 N 31 1538 * * * * * * * 1601 * * 1617 * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1791 0 0 A 32 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1791 0 0 E 33 1601 * * 1617 * * * * * * * * * * * * 1538 * * * 33 0 * * * * * * 1791 0 0 D 34 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1791 0 0 D 35 * * 609 1538 * * * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1791 0 0 H 36 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1791 0 0 E 37 * * * 609 * * * * * * * * * * * * 1538 * * * 37 0 * * * * * * 1791 0 0 R 38 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 38 0 * * * * * * 1791 0 0 L 39 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1791 0 0 Y 40 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 40 0 * * * * * * 1791 0 0 Y 41 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 1601 577 41 0 * * * * * * 1791 0 0 H 42 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1791 0 0 H 43 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1791 0 0 I 44 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1791 0 0 Y 45 * * * * * * * * * 1538 * * * * * * * * * 609 45 0 * * * * * * 1791 0 0 E 46 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1791 0 0 E 47 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1791 0 0 E 48 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1791 0 0 E 49 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1791 0 0 Q 50 * * * * * * 1601 * * * * * * 577 * * * * * * 50 0 * * * * * * 1791 0 0 R 51 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 51 0 * * * * * * 1791 0 0 L 52 * * * * 1601 * * * * 1617 1538 * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1791 0 0 S 53 * * 1601 * * 1538 * * * * * * * * * 1617 * * * * 53 0 * * * * * * 1791 0 0 R 54 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 54 0 * * * * * * 1791 0 0 L 55 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1791 0 0 D 56 * * 1617 * * * * * * * * * * 1538 * * 1601 * * * 56 0 * * * * * * 1791 0 0 V 57 1601 * * 1538 * * * * * * * * * * * * * 1617 * * 57 0 * * * * * * 1791 0 0 L 58 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1791 0 0 I 59 * * * * * * * 1617 * 1601 * * * * * * * 1538 * * 59 0 * * * * * * 1791 0 0 P 60 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1791 0 0 L 61 * * * * * * * * 1601 1617 * * * * * * * * * 1538 61 0 * * * * * * 1791 0 0 I 62 * * * * * * * 1617 * 569 * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1791 0 0 E 63 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 63 577 * 1601 * * * * 1791 0 0 K 64 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * 0 1475 0 1000 F 65 * * * * 979 * * * * 1021 * * * * * * * * * * 65 979 * 1021 * * 0 * 1475 0 1000 Q 66 * * * 1021 * * * * * * * * * 979 * * * * * * 66 0 * * * * * 0 1425 0 1000 D 67 1021 * 979 * * * * * * * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * 0 * 1425 0 1000 E 68 * * * 1617 * * * * * 1601 * * * * * 1538 * * * * 68 0 * * * * * * 1791 0 0 T 69 569 * * * * * * * * * * * * * * * 1617 * * * 69 0 * * * * * * 1791 0 0 D 70 * * 609 * * 1538 * * * * * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1791 0 0 E 71 * * * 609 * * * * 1538 * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1791 0 0 G 72 1601 * * * * 1617 * * * * * * * * * 1538 * * * * 72 0 * * * * * * 1791 0 0 L 73 * * * * 1601 * * * * 577 * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1791 0 0 F 74 * * 1538 * 1617 * * * * 1601 * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1791 0 0 S 75 * * * * * * * * * * * * * 1538 * 609 * * * * 75 0 * * * * * * 1791 0 0 P 76 * * * * * * * * * 1538 * * 1617 * 1601 * * * * * 76 0 * * * * * * 1791 0 0 S 77 * * * 1601 * * * * * * * * * * * 577 * * * * 77 0 * * * * * * 1791 0 0 N 78 * * 1538 * * * * * * * * 609 * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1791 0 0 N 79 * * * * * 1601 * * * * * 1617 * * 1538 * * * * * 79 0 * * * * * * 1791 0 0 A 80 1617 * 569 * * * * * * * * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1791 0 0 F 81 * * * * 609 * * * * 1538 * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1791 0 0 N 82 * * * * * * * * * 1601 * 1617 * * * 1538 * * * * 82 0 * * * * * * 1791 0 0 R 83 * * * * * * * * * * * * * 1538 609 * * * * * 83 0 * * * * * * 1791 0 0 L 84 * * * * * * * * * 609 1538 * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1791 0 0 L 85 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1791 0 0 Q 86 * * * * * * * * * * * * * 609 * 1538 * * * * 86 0 * * * * * * 1791 0 0 E 87 * * 569 1617 * * * * * * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1791 0 0 L 88 * * * * * * * 1601 * 1617 * * * * * * * 1538 * * 88 0 * * * * * * 1791 0 0 N 89 * * * * * * * * * * * 577 * * * 1601 * * * * 89 0 * * * * * * 1791 0 0 L 90 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1791 0 0 E 91 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1791 0 0 K 92 * * * * * * * * 609 * * * * * 1538 * * * * * 92 0 * * * * * * 1791 0 0 F 93 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1791 0 0 G 94 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1791 0 0 L 95 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1791 0 0 H 96 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1791 0 0 N 97 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1791 0 0 F 98 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1791 0 0 I 99 * * * * * * * 1617 * 1601 * * * * 1538 * * * * * 99 0 * * * * * * 1791 0 0 E 100 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1791 0 0 H 101 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1791 0 0 V 102 * * * * * * * * * 569 * * * * * * * 1617 * * 102 0 * * * * * * 1791 0 0 D 103 * * 609 1538 * * * * * * * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1791 0 0 L 104 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1791 0 0 A 105 1617 * * * * * * * * * * * * * * 569 * * * * 105 0 * * * * * * 1791 0 0 L 106 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1791 0 0 F 107 * * * * 609 * * * * * * * * * * * * * * 1538 107 0 * * * * * * 1791 0 0 S 108 * * * 1538 * * 1601 * * * * * * * * 1617 * * * * 108 0 * * * * * * 1791 0 0 F 109 * * * * 577 * * * * * * * * * * * * * * 1601 109 0 * * * * * * 1791 0 0 T 110 * * * * * * * * 569 * * * * * * * 1617 * * * 110 0 * * * * * * 1791 0 0 D 111 * * 577 * * 1601 * * * * * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1791 0 0 E 112 * * 1538 1617 * * * * * * * * * * * * 1601 * * * 112 0 * * * * * * 1791 0 0 E 113 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1791 0 0 R 114 * * * * * * 1601 * * * * * * * 1617 * 1538 * * * 114 0 * * * * * * 1791 0 0 Q 115 * * * 1601 * * * * * * * * * 1617 1538 * * * * * 115 0 * * * * * * 1791 0 0 T 116 * * * * * * * * * * * * 1601 1538 * * 1617 * * * 116 0 * * * * * * 1791 0 0 L 117 * * * * * * * * * 577 * * 1601 * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1791 0 0 L 118 * * * * * * * 1601 * 577 * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1791 0 0 K 119 * * 1538 * * * * * 1617 * * * * * * * 1601 * * * 119 0 * * * * * * 1791 0 0 E 120 1601 * * 1617 * 1538 * * * * * * * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1791 0 0 L 121 * * * * * * * * * 609 1538 * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1791 0 0 R 122 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 122 0 * * * * * * 1791 0 0 K 123 * * 1601 1538 * * * * 1617 * * * * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 1791 0 0 D 124 * * 1617 * * * * * 1538 * 1601 * * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1791 0 0 A 125 1617 * * * * * * * * * * * * * * * 569 * * * 125 0 * * * * * * 1791 0 0 Y 126 1601 * * * * * 1538 * * * * * * * * * * * * 1617 126 0 * * * * * * 1791 0 0 E 127 1601 * * 1617 * * * * * * * * * * * * 1538 * * * 127 0 * * * * * * 1791 0 0 G 128 * * 569 * * 1617 * * * * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1791 0 0 Y 129 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 129 0 * * * * * * 1791 0 0 Q 130 * * * * * * * * * 1538 * * * 609 * * * * * * 130 0 * * * * * * 1791 0 0 Y 131 * * * * * * * * * * * * * * 1601 * 1538 * * 1617 131 0 * * * * * * 1791 0 0 V 132 * * * * * * * * * * 1601 * * * * * * 577 * * 132 0 * * * * * * 1791 0 0 K 133 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 1791 0 0 E 134 1601 * * 577 * * * * * * * * * * * * * * * * 134 0 * * * * * * 1791 0 0 K 135 1601 * * * * * * 1538 1617 * * * * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 1791 0 0 L 136 * * * * * * * * * 609 1538 * * * * * * * * * 136 0 * * * * * * 1791 0 0 A 137 577 * * 1601 * * * * * * * * * * * * * * * * 137 0 * * * * * * 1791 0 0 E 138 * * * 1617 * * * * * * * 1538 * * * * 1601 * * * 138 0 * * * * * * 1791 0 0 I 139 * * * * * * * 1617 * 1601 1538 * * * * * * * * * 139 0 * * * * * * 1791 0 0 N 140 * * * * * * * * * * * 609 * * * 1538 * * * * 140 0 * * * * * * 1791 0 0 A 141 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 141 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //