HHsearch 1.5 NAME c6ly5B_ FAM FILE c6ly5B_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6ly5B_.a3m DATE Sat Oct 24 08:43:40 2020 LENG 132 match states, 132 columns in multiple alignment FILT 4 out of 8 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.7 EVD 0.4172 -0.1522 SEQ >ss_dssp CCSSCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTCCCSSCSSBCCHHHHCGGGEEETTEECBHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSCCTTSCCSCCCCSSHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTCCHHHHHHHHC >sa_dssp EEDECECCCCCEBCEBCDCCECCDDBCECDEEDECEEDEDDCDCEEECEEBCEEEEDBCDCBECECEECDDEDEDEDDEDDEEDEEEDDDDEEEEEDDCB EEBDEBCECCECBEECCEEDEDEDCDBBEEEE >ss_pred CCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEECHHHCCEEEECCCCCCCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCE ECCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCC >ss_conf 9777311101167104699999999987401765768420231565211353157875446717999720599999999984577767538998313300 00412899999999766407873568753069 >Consensus GwGxtvxAErWNGRHaMFGwffxxxtaYxkGhGLiPDxxxxLdlxqWGxlaxxxxxxxItnxRAiiLvAxxHxxxvSixAxixPxxFxDxLxxLTxeAEx iNGRlAMlGlixlxxaxxxtxxxxlDvvNxwx >c6ly5B_ GWGPSVHAEKWNGRHAMFGWFFICCTAYAKGHGLIPDMDVPLNLKEWGTLATITGKGTITNGRAVILLANAHFFAISLMATICPLPFGDSLLLLTEEAEM INGRLAMLGLISLIFATAIEQKPMLDIVNEWT >UniRef50_B7FNY6(1-224:224) Early light induced protein n=3 Tax=root RepID=B7FNY6_PHATR E=2e-90 s/c=0.84 id=77% cov=101% GWGPSVQAEKWNGRHAMFGWFFICATAYCKGHGLIPDPEMLLDLKQWGTLATISGKDTISNERAIILVANAHFFALSLAATICPLPFGDSLFVdpnhpny eamaernkngfgylpalkfgLTEEAEIINGRLAMLGLVMLIGATATSGQNMLDIVNEWV >UniRef50_Q7XZ09(11-181:181) Low molecular mass early light-inducible protein HV60 n=2 Tax=Griffithsia japonica RepID=Q7XZ09_GRIJA E=6e-60 s/c=1.26 id=49% cov=101% GWGATVKAERWNGRHVMFGWLVFWITAYCKGHGLLPDPSVLLDLSQWGPVASLGDSTPISQQRAIVLVAHIHVLFVSIAAAIAPFSFQDKLLLepgeadd apaglfppmapgLTKDAEIWNGRVAMVGLICLVAQAVGTKTPILDVVNMWF >UniRef50_Q5K264(19-189:189) Putative low molecular mass early light-inducible protein HV60 (Fragment) n=1 Tax=Guillardia theta RepID=Q5K264_GUITH E=3e-54 s/c=1.14 id=46% cov=101% GLGVTTNAERWNGRHAMFGIFFMVLSSYLHGRGLIPDGDKILDVSQWGPLVNGGFNAPITNERAIILVAHVHVLFVSILAAFAPFGFQDTLVKdqgykpe apaglippfktgLTAEAELINGRLAMLGVISITTAALFTGTSVTDVINLGL # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * G 1 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1726 0 0 W 2 * * * * * * * * * 1848 * * * * * * * * 469 * 2 0 * * * * * * 1726 0 0 G 3 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1726 0 0 P 4 1922 * * * * * * * * * * * 1126 * * * * 1848 * * 4 0 * * * * * * 1726 0 0 S 5 * * * * * * * * * * * * * * * 1126 885 * * * 5 0 * * * * * * 1726 0 0 V 6 * * * * * * * * * * * * * * * * 1848 469 * * 6 0 * * * * * * 1726 0 0 H 7 * * * * * * 2098 * 1922 * * 1848 * 2154 * * * * * * 7 0 * * * * * * 1726 0 0 A 8 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1726 0 0 E 9 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1726 0 0 K 10 * * * * * * * * 1126 * * * * * 885 * * * * * 10 0 * * * * * * 1726 0 0 W 11 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 11 0 * * * * * * 1726 0 0 N 12 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1726 0 0 G 13 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1726 0 0 R 14 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 14 0 * * * * * * 1726 0 0 H 15 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1726 0 0 A 16 442 * * * * * * * * * * * * * * * * 1922 * * 16 0 * * * * * * 1726 0 0 M 17 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1726 0 0 F 18 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1726 0 0 G 19 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1726 0 0 W 20 * * * * * * * 1848 * * * * * * * * * * 469 * 20 0 * * * * * * 1726 0 0 F 21 * * * * 442 * * * * 1922 * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1726 0 0 F 22 * * * * 442 * * * * * * * * * * * * 1922 * * 22 0 * * * * * * 1726 0 0 I 23 * * * * 1922 * * 1126 * * 1848 * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1726 0 0 C 24 * 1126 * * * * * * * * * * * * * * * 1848 1922 * 24 0 * * * * * * 1726 0 0 C 25 2154 2098 * * * * * 1922 * 1848 * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1726 0 0 T 26 * * * * * * * * * * * * * * * 1848 469 * * * 26 0 * * * * * * 1726 0 0 A 27 469 * * * * * * * * * * * * * * 1848 * * * * 27 0 * * * * * * 1726 0 0 Y 28 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 28 0 * * * * * * 1726 0 0 A 29 2098 1033 * * * * * * * 1848 * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1726 0 0 K 30 * * * * * * 1848 * 469 * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1726 0 0 G 31 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1726 0 0 H 32 * * * * * * 469 * * * * * * * 1848 * * * * * 32 0 * * * * * * 1726 0 0 G 33 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1726 0 0 L 34 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1726 0 0 I 35 * * * * * * * 442 * 1922 * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1726 0 0 P 36 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1726 0 0 D 37 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1726 0 0 M 38 * * * * * 1848 * * * * 2098 * 1033 * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1726 0 0 D 39 * * 968 2154 * * * * * * * * * * * 1922 * * * * 39 0 * * * * * * 1726 0 0 V 40 * * * * * * * * 1848 * 2154 * * * * * * 1007 * * 40 0 * * * * * * 1726 0 0 P 41 * * * * * * * 1848 * 1033 * * 2098 * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1726 0 0 L 42 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1726 0 0 N 43 * * 384 * * * * * * * * 2098 * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1726 0 0 L 44 * * * * * * * * * 469 * * * * * * * 1848 * * 44 0 * * * * * * 1726 0 0 K 45 * * * * * * * * 1126 * * * * * * 885 * * * * 45 0 * * * * * * 1726 0 0 E 46 * * * 2098 * * * * * * * * * 384 * * * * * * 46 0 * * * * * * 1726 0 0 W 47 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 47 0 * * * * * * 1726 0 0 G 48 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1726 0 0 T 49 * * * * * * * * * * * * 885 * * * 1126 * * * 49 0 * * * * * * 1726 0 0 L 50 * * * * * * * * * 442 * * * * * * * 1922 * * 50 0 * * * * * * 1726 0 0 A 51 469 * * * * * * * * * * * * * * * * 1848 * * 51 0 * * * * * * 1726 0 0 T 52 * * * * * * * * * * * 1848 * * * 1922 1126 * * * 52 0 * * * * * * 1726 0 0 I 53 * * * * * 1848 * 1126 * 1922 * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1726 0 0 T 54 * * * * * 885 * * * * * * * * * 2154 2098 * * * 54 0 * * * * * * 1726 0 0 G 55 * * 1922 * 1848 1126 * * * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1726 0 0 K 56 * * * * * * * * 1126 * * 1848 * * * 1922 * * * * 56 0 * * * * * * 1726 0 0 G 57 1848 * 2154 * * 2098 * * * * * * * * * * 1922 * * * 57 0 * * * * * * 1726 0 0 T 58 * * * * * * * * * * * * 885 * * * 1126 * * * 58 0 * * * * * * 1726 0 0 I 59 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1726 0 0 T 60 * * * * * * * * * * * * * * * 1033 968 * * * 60 0 * * * * * * 1726 0 0 N 61 * * * * * * * * * * * 442 * 1922 * * * * * * 61 0 * * * * * * 1726 0 0 G 62 * * * 993 * 2098 * * * * * * * 1922 * * * * * * 62 0 * * * * * * 1726 0 0 R 63 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 63 0 * * * * * * 1726 0 0 A 64 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1726 0 0 V 65 * * * * * * * 384 * * * * * * * * * 2098 * * 65 0 * * * * * * 1726 0 0 I 66 * * * * * * * 442 * * * * * * * * * 1922 * * 66 0 * * * * * * 1726 0 0 L 67 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1726 0 0 L 68 * * * * * * * * * 2098 * * * * * * * 384 * * 68 0 * * * * * * 1726 0 0 A 69 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1726 0 0 N 70 * * * * * * 885 * * * * 1126 * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1726 0 0 A 71 1126 * * * * * * 1922 * * * * * * * * * 1848 * * 71 0 * * * * * * 1726 0 0 H 72 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1726 0 0 F 73 * * * * 1126 * * * * * * * * * * * * 885 * * 73 0 * * * * * * 1726 0 0 F 74 * * * * 1126 * * * * 885 * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1726 0 0 A 75 1126 * * * 885 * * * * * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1726 0 0 I 76 * * * * * * * 2098 * 2154 * * * * * * * 885 * * 76 0 * * * * * * 1726 0 0 S 77 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 77 0 * * * * * * 1726 0 0 L 78 * * * * * * * 885 * 1126 * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1726 0 0 M 79 1033 * * * * * * * * 1848 2098 * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1726 0 0 A 80 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1726 0 0 T 81 885 * * * * * * * * * * * * * * * 1126 * * * 81 0 * * * * * * 1726 0 0 I 82 * * * * 1848 * * 469 * * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1726 0 0 C 83 885 1126 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1726 0 0 P 84 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1726 0 0 L 85 * * * * 885 * * * * 1126 * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1726 0 0 P 86 * * * * * 1848 * * * * * * 1126 * * 1922 * * * * 86 0 * * * * * * 1726 0 0 F 87 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1726 0 0 G 88 * * * * * 1126 * * * * * * * 885 * * * * * * 88 0 * * * * * * 1726 0 0 D 89 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1726 0 0 S 90 * * * * * * * * 1922 * * * * * * 1126 1848 * * * 90 0 * * * * * * 1726 0 0 L 91 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1726 0 0 L 92 * * * * 2154 * * * * 1007 * * * * * * * 1848 * * 92 0 * * * * * * 1726 0 0 L 93 * * * * * * * * 1848 1007 * * * * * * * 2154 * * 93 2098 384 * 4416 69 * * 1726 1637 0 L 94 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1726 0 0 T 95 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 95 0 * * * * * * 1726 0 0 E 96 1848 * * 1126 * * * * 1922 * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1726 0 0 E 97 * * 1922 442 * * * * * * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1726 0 0 A 98 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1726 0 0 E 99 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1726 0 0 M 100 * * * * * * * 1033 * 1848 2098 * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1726 0 0 I 101 * * * * * * * 442 * * * * * * * * * * 1922 * 101 0 * * * * * * 1726 0 0 N 102 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1726 0 0 G 103 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1726 0 0 R 104 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 104 0 * * * * * * 1726 0 0 L 105 * * * * * * * * * 442 * * * * * * * 1922 * * 105 0 * * * * * * 1726 0 0 A 106 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1726 0 0 M 107 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1726 0 0 L 108 * * * * * * * * * 442 * * * * * * * 1922 * * 108 0 * * * * * * 1726 0 0 G 109 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1726 0 0 L 110 * * * * * * * * * 469 * * * * * * * 1848 * * 110 0 * * * * * * 1726 0 0 I 111 * * * * * * * 367 * * * * * * * * * 2154 * * 111 0 * * * * * * 1726 0 0 S 112 * 1922 * * * * * * * * 2154 * * * * 968 * * * * 112 0 * * * * * * 1726 0 0 L 113 * * * * * * * 1848 * 469 * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1726 0 0 I 114 * * * * * * * 1126 * * * * * * * * 1848 1922 * * 114 0 * * * * * * 1726 0 0 F 115 1922 * * * 2098 2154 * * * * * * * * * * 1848 * * * 115 0 * * * * * * 1726 0 0 A 116 442 * * * * * * * * * * * * 1922 * * * * * * 116 0 * * * * * * 1726 0 0 T 117 885 * * * * * * * * * * * * * * * 1126 * * * 117 0 * * * * * * 1726 0 0 A 118 1126 * * * * * * * * 1848 * * * * * * * 1922 * * 118 0 * * * * * * 1726 0 0 I 119 * * * * 1848 1922 * 2098 * * * * * * * * 2154 * * * 119 0 * * * * * * 1726 0 0 E 120 * * * 2098 * * * * * * * * * * * 2154 885 * * * 120 0 * * * * * * 1726 0 0 Q 121 * * * * * 993 * * 1922 * * * * 2098 * * * * * * 121 0 * * * * * * 1726 0 0 K 122 * * * * * * * * 2098 * * * * 2154 * * 885 * * * 122 0 * * * * * * 1726 0 0 P 123 * * * * * * * * * * * 2154 1007 * * 1848 * * * * 123 0 * * * * * * 1726 0 0 M 124 * * * * * * * 1922 * * 1126 * * * * * * 1848 * * 124 0 * * * * * * 1726 0 0 L 125 * * * * * * * * * 469 * * * * * * 1848 * * * 125 0 * * * * * * 1726 0 0 D 126 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1726 0 0 I 127 * * * * * * * 1126 * * * * * * * * * 885 * * 127 0 * * * * * * 1726 0 0 V 128 * * * * * * * 1848 * * * * * * * * * 469 * * 128 0 * * * * * * 1726 0 0 N 129 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 129 0 * * * * * * 1726 0 0 E 130 * * * 1126 * * * * * 1848 1922 * * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 1726 0 0 W 131 * * * * * 1848 * * * * * * * * * * * * 469 * 131 0 * * * * * * 1726 0 0 T 132 * * * * 1922 * * * * 1848 * * * * * * 2098 2154 * * 132 0 * * 0 * * * 1726 0 0 //