HHsearch 1.5 NAME c6kyfA_ FAM FILE c6kyfA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6kyfA_.a3m DATE Sat Sep 26 15:11:07 2020 LENG 137 match states, 137 columns in multiple alignment FILT 3 out of 7 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.4 EVD 0.4397 1.2505 SEQ >ss_dssp CCTTTTCEEEEEEESSCCSSCCSCTTTSSEEEBSSHHHHHTTCSEEEEEEESSEECHHHHHHTSTTHHHHHHHHTTTCHHHHHHHTSTTCCCTTSCHHHH HHHHHHHHHHHTCSEEEEEETTEEEEEECTTSEEEEC >sa_dssp EEEDDEDCDABCBBEDEBEDBEEDEECCCCCBBDEDECBDEECECBADADABDCADCECADEECEDADECACECBEEDEEBAEBABDCCBECEECEDECA CDCABDAAEDCECBAACADDEDCDBBAABDEBDAEDE >ss_pred CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCHHHHHHHCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHH EEEEEEEEEEECCCEEEEECCCCCEEEEECCCEEECC >ss_conf 9743000121020145555476542200022132023444201036665201102223231111232211110134420167887656641146661012 0012131136404224520234834687348412039 >Consensus gplgsmsMkLfHGsYEkxaxIxkxGvFxGLFaxxerdiAaSHGxtlxRxixxxxxxxYALxxEixsAWxxxxDvaggdENxAxaIxaxxxxSDxxxxWEL QRLRGxxAxxLGxxsvEMxDEHGTtxLclpgctveki >c6kyfA_ GPLGSMSMELFHGSYEEISEIRDSGVFGGLFGAHEKETALSHGETLHRIISPLPLTDYALNYEIESAWEVALDVAGGDENVAEAIMAKACESDSNDGWEL QRLRGVLAVRLGYTSVEMEDEHGTTWLCLPGCTVEKI >UniRef50_B6ICJ3(1-148:157) Putative uncharacterized protein n=2 Tax=Enterobacteriaceae RepID=B6ICJ3_ECOSE E=2e-38 s/c=1.08 id=44% cov=85% -------MKLFHGTYEKTAPIIKLGefamsgnnVFDGLFACLDRDIAASHGNSIFiyhvdddkiaesRDLNARFQEVYAfLRNELDTAdveeiadrviWD NDSDI----ENFAD-ILSPRLDSDISGAysWELQRLRGRVAAYLGFDAIEMNDEHGTSYL---------- >UniRef50_B2U5W1(1-43:45) Putative uncharacterized protein n=2 Tax=Enterobacteriaceae RepID=B2U5W1_ECOLX E=0.0003 s/c=1.07 id=44% cov=26% -------MKLIHGAYEKAAPIIKIGEFamsgnnvsDGLFASPERDIAASH-------------------------------------------------- --------------------------------------------- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * G 1 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 P 2 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 L 3 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 G 4 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 S 5 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 M 6 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 S 7 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 M 8 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1549 0 0 E 9 * * * 1383 * * * * 697 * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1549 0 0 L 10 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1549 0 0 F 11 * * * * 539 * * 1681 * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1549 0 0 H 12 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1549 0 0 G 13 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1549 0 0 S 14 1681 * * * * * * * * * * * * * * 1383 1714 * * * 14 0 * * * * * * 1549 0 0 Y 15 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 15 0 * * * * * * 1549 0 0 E 16 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1549 0 0 E 17 * * * 1383 * * * * 697 * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1549 0 0 I 18 1681 * * * * * * 1383 * * * * * * * * 1714 * * * 18 0 * * * * * * 1549 0 0 S 19 697 * * * * * * * * * * * * * * 1383 * * * * 19 0 * * * * * * 1549 0 0 E 20 * * * 1383 * * * * * * * * 697 * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1549 0 0 I 21 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1549 0 0 R 22 * * * * * * * 697 * * * * * * 1383 * * * * * 22 0 * * * * * * 1549 0 0 D 23 * * 1383 * * * * * 697 * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1549 0 0 S 24 * * * * * * * 1681 * 1714 * * * * * 1383 * * * * 24 0 * * * * * * 1549 0 0 G 25 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 25 524 1714 * 3000 193 * * 1549 1000 0 V 26 * * * 1681 * * * * * * * * * * * * * 539 * * 26 0 * * * * * * 1549 0 0 F 27 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 27 539 1681 * 3000 193 * * 1549 1000 0 G 28 * * 697 * * 1383 * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1549 0 0 G 29 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1549 0 0 L 30 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1549 0 0 F 31 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1549 0 0 G 32 697 * * * * 1383 * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1549 0 0 A 33 1383 1714 * * * * * * * * * * * * * 1681 * * * * 33 0 * * * * * * 1549 0 0 H 34 * * * * * * 1383 * * 1714 * * 1681 * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1549 0 0 E 35 * * 1714 524 * * * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1549 0 0 K 36 * * * * * * * * 1383 * * * * * 697 * * * * * 36 0 * * * * * * 1549 0 0 E 37 * * 697 1383 * * * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1549 0 0 T 38 * * * * * * * 697 * * * * * * * * 1383 * * * 38 0 * * * * * * 1549 0 0 A 39 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1549 0 0 L 40 697 * * * * * * * * 1383 * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1549 0 0 S 41 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 41 0 * * * * * * 1549 0 0 H 42 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1549 0 0 G 43 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1447 0 0 E 44 * * * 941 * * * * * * * 1061 * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1447 0 0 T 45 * * * * * * * * * * * * * * * 1061 941 * * * 45 0 * * * * * * 1447 0 0 L 46 * * * * * * * 1061 * 941 * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1447 0 0 H 47 * * * * 1061 * 941 * * * * * * * * * * * * * 47 941 1061 * 3585 126 * * 1447 1000 0 R 48 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 48 0 * * * * * * 1447 0 0 I 49 * * 1061 * * * * 941 * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1447 0 0 I 50 * * * * * * * 941 * 1061 * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1447 0 0 S 51 * * * * * * * * * * * 1061 * * * 941 * * * * 51 0 * * * * * * 1447 0 0 P 52 1061 * * * * * * * * * * * 941 * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1447 0 0 L 53 * * * * * * * * * 941 * * * * 1061 * * * * * 53 0 * * * * * * 1447 0 0 P 54 * * * * 1061 * * * * * * * 941 * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1447 0 0 L 55 * * * * * * * * * 941 * * * 1061 * * * * * * 55 0 * * * * * * 1447 0 0 T 56 * * * 1061 * * * * * * * * * * * * 941 * * * 56 0 * * * * * * 1447 0 0 D 57 * * 941 * * * * * * * * * * * * * * 1061 * * 57 0 * * * * * * 1447 0 0 Y 58 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 58 0 * * * * * * 1447 0 0 A 59 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 59 941 1061 * 0 * * * 1447 1000 0 L 60 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1447 0 0 N 61 * * * * * * * * * * * 941 * * 1061 * * * * * 61 0 * * * * * * 1447 0 0 Y 62 * * * * * * * * * * * 1061 * * * * * * * 941 62 0 * * * * * * 1447 0 0 E 63 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1447 0 0 I 64 * * * * * * * 941 * 1061 * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1447 0 0 E 65 * * 1061 941 * * * * * * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1447 0 0 S 66 * * * * * * * * * * * * * * * 941 1061 * * * 66 0 * * * * * * 1447 0 0 A 67 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 67 941 1061 * 3322 152 * * 1447 1000 0 W 68 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 68 0 * * * * * * 1447 0 0 E 69 * * 1061 941 * * * * * * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1447 0 0 V 70 * * * * * * * * * * * 1061 * * * * * 941 * * 70 0 * * * * * * 1447 0 0 A 71 941 * 1061 * * * * * * * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1447 0 0 L 72 * * * * * * * * * 941 * * * * * 1061 * * * * 72 0 * * * * * * 1447 0 0 D 73 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1447 0 0 V 74 * * * * * * * 1061 * * * * * * * * * 941 * * 74 941 * 1061 * * * * 1447 0 0 A 75 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * 0 1000 0 1000 G 76 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * 0 1000 0 1000 G 77 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * 0 1000 0 1000 D 78 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * 0 * 1000 0 1000 E 79 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1447 0 0 N 80 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1447 0 0 V 81 * * * * 1061 * * * * * * * * * * * * 941 * * 81 0 * * * * * * 1447 0 0 A 82 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1447 0 0 E 83 * * 1061 941 * * * * * * * * * * * * * * * * 83 941 * 1061 * * * * 1447 0 0 A 84 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 84 0 * * * * 0 * 1000 0 1000 I 85 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1447 0 0 M 86 * * * * * * * * * 1061 941 * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1447 0 0 A 87 941 * * * * * * * * * * * * * * 1061 * * * * 87 0 * * * * * * 1447 0 0 K 88 * * * * * * * * 941 * * * 1061 * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1447 0 0 A 89 941 * * * * * * * * * * * * * 1061 * * * * * 89 0 * * * * * * 1447 0 0 C 90 * 941 * * * * * * * 1061 * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1447 0 0 E 91 * * 1061 941 * * * * * * * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1447 0 0 S 92 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 92 0 * * * * * * 1447 0 0 D 93 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1447 0 0 S 94 * * * * * * * 1061 * * * * * * * 941 * * * * 94 0 * * * * * * 1447 0 0 N 95 * * * * * * * * * * * 941 * * * 1061 * * * * 95 0 * * * * * * 1447 0 0 D 96 * * 941 * * 1061 * * * * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1447 0 0 G 97 1061 * * * * 941 * * * * * * * * * * * * * * 97 941 1061 * 1000 1000 * * 1447 1000 0 W 98 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 98 0 * * * * * * 1447 0 0 E 99 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1447 0 0 L 100 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1447 0 0 Q 101 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 101 0 * * * * * * 1447 0 0 R 102 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 102 0 * * * * * * 1447 0 0 L 103 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1447 0 0 R 104 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 104 0 * * * * * * 1447 0 0 G 105 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1447 0 0 V 106 * * * * * * * * * * * * * * 1061 * * 941 * * 106 0 * * * * * * 1447 0 0 L 107 * * * * * * * * * 941 * * * * * * * 1061 * * 107 0 * * * * * * 1447 0 0 A 108 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1447 0 0 V 109 1061 * * * * * * * * * * * * * * * * 941 * * 109 0 * * * * * * 1447 0 0 R 110 * * * * * * * * * * * * * * 941 * * * * 1061 110 0 * * * * * * 1447 0 0 L 111 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1447 0 0 G 112 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1447 0 0 Y 113 * * * * 1061 * * * * * * * * * * * * * * 941 113 0 * * * * * * 1447 0 0 T 114 * * 1061 * * * * * * * * * * * * * 941 * * * 114 0 * * * * * * 1447 0 0 S 115 1061 * * * * * * * * * * * * * * 941 * * * * 115 0 * * * * * * 1447 0 0 V 116 * * * * * * * 1061 * * * * * * * * * 941 * * 116 0 * * * * * * 1447 0 0 E 117 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1447 0 0 M 118 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1447 0 0 E 119 * * * 941 * * * * * * * 1061 * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1447 0 0 D 120 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1447 0 0 E 121 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1447 0 0 H 122 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1447 0 0 G 123 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 1447 0 0 T 124 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 124 0 * * * * * * 1447 0 0 T 125 * * * * * * * * * * * * * * * 1061 941 * * * 125 0 * * * * * * 1447 0 0 W 126 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 941 1061 126 0 * * * * * * 1447 0 0 L 127 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 127 0 * * * * * * 1447 0 0 C 128 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1000 0 0 L 129 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 129 0 * * * * * * 1000 0 0 P 130 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 130 0 * * * * * * 1000 0 0 G 131 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 131 0 * * * * * * 1000 0 0 C 132 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 132 0 * * * * * * 1000 0 0 T 133 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 133 0 * * * * * * 1000 0 0 V 134 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 134 0 * * * * * * 1000 0 0 E 135 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 1000 0 0 K 136 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 136 0 * * * * * * 1000 0 0 I 137 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 137 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //