HHsearch 1.5 NAME c6k7wA_ FAM FILE c6k7wA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6k7wA_.a3m DATE Sat Jun 13 08:19:53 2020 LENG 92 match states, 92 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.4 EVD 0.4323 0.9711 SEQ >ss_dssp CCSSSCEEEECSSEEEEEECCCSSSCCGGGBCCEEETTEEEECBSSSCCEEEECSSCCSSTTCCEEECSSSCEEEEEECSSTTCCCSSSSCC >sa_dssp ECEECCCCECDDDCCABCADCEDEEDCEDABDCDBDDDCBCBCBBDECECCBEBECDBEEACDDEBCDEDECACADBDEBCCEEEDEDEDCE >ss_pred CCCEEEEHHCCCEEEEEEEEECCCCHHHHCCHHCCCCCEEEEECCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHEEECCCCEEEEEEECCCCCCCCHHHHCC >ss_conf 97366431026106789998357520011000001365068982798513015346566323210110373899984034751115264219 >Consensus tpxxxxdwxqxxxevxvxlrxgxgxxxxedvxxxftdxxcxvxfxxgxqwxxxxxxeixxscxxvqxrkgxxlhlxxxkkipxxtwpsllve >c6k7wA_ TPELALDWRQSAEEVIVKLRVGVGPLQLEDVDAAFTDTDCVVRFAGGQQWGGVFYAEIKSSCAKVQTRKGSLLHLTLPKKVPMLTWPSLLVE >UniRef50_Q4T1P8(162-249:1677) Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase (Fragment) n=3 Tax=Euteleostomi RepID=Q4T1P8_TETNG E=2e-38 s/c=1.81 id=48% cov=96% --DVFVDWKQNVNEVTVRLRCGDGIQRKEDVSTSFTDKSCHVSFPDGRQWSCQLQEEIEASCSRVQYReKGGFLHLIMQKKIPFHTWPSL--- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * T 1 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 P 2 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 E 3 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1431 0 0 L 4 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * 4 0 * * * * * * 1431 0 0 A 5 1000 * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1431 0 0 L 6 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * 6 0 * * * * * * 1431 0 0 D 7 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1431 0 0 W 8 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 8 0 * * * * * * 1431 0 0 R 9 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 9 0 * * * * * * 1431 0 0 Q 10 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 10 0 * * * * * * 1431 0 0 S 11 * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * 11 0 * * * * * * 1431 0 0 A 12 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 12 0 * * * * * * 1431 0 0 E 13 * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1431 0 0 E 14 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1431 0 0 V 15 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 15 0 * * * * * * 1431 0 0 I 16 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * 16 0 * * * * * * 1431 0 0 V 17 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 17 0 * * * * * * 1431 0 0 K 18 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 18 0 * * * * * * 1431 0 0 L 19 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1431 0 0 R 20 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 20 0 * * * * * * 1431 0 0 V 21 * 1000 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 21 0 * * * * * * 1431 0 0 G 22 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1431 0 0 V 23 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 23 0 * * * * * * 1431 0 0 G 24 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1431 0 0 P 25 * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1431 0 0 L 26 * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * * * 26 0 * * * * * * 1431 0 0 Q 27 * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * 27 0 * * * * * * 1431 0 0 L 28 * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1431 0 0 E 29 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1431 0 0 D 30 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1431 0 0 V 31 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 31 0 * * * * * * 1431 0 0 D 32 * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 32 0 * * * * * * 1431 0 0 A 33 1000 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 33 0 * * * * * * 1431 0 0 A 34 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 34 0 * * * * * * 1431 0 0 F 35 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1431 0 0 T 36 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 36 0 * * * * * * 1431 0 0 D 37 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1431 0 0 T 38 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * 38 0 * * * * * * 1431 0 0 D 39 * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 39 0 * * * * * * 1431 0 0 C 40 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1431 0 0 V 41 * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * 1000 * * 41 0 * * * * * * 1431 0 0 V 42 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 42 0 * * * * * * 1431 0 0 R 43 * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * 43 0 * * * * * * 1431 0 0 F 44 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1431 0 0 A 45 1000 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1431 0 0 G 46 * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1431 0 0 G 47 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1431 0 0 Q 48 * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * 48 0 * * * * * * 1431 0 0 Q 49 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 49 0 * * * * * * 1431 0 0 W 50 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 50 0 * * * * * * 1431 0 0 G 51 * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * * 51 0 * * * * * * 1431 0 0 G 52 * 1000 * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1431 0 0 V 53 * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * 53 0 * * * * * * 1431 0 0 F 54 * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1431 0 0 Y 55 * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 55 0 * * * * * * 1431 0 0 A 56 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1431 0 0 E 57 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1431 0 0 I 58 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1431 0 0 K 59 * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1431 0 0 S 60 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 60 0 * * * * * * 1431 0 0 S 61 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 61 0 * * * * * * 1431 0 0 C 62 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1431 0 0 A 63 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 63 0 * * * * * * 1431 0 0 K 64 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 64 0 * * * * * * 1431 0 0 V 65 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 65 0 * * * * * * 1431 0 0 Q 66 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 66 0 * * * * * * 1431 0 0 T 67 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 1000 67 0 * * * * * * 1431 0 0 R 68 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 68 1000 1000 * 0 * * * 1431 1000 0 K 69 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1431 0 0 G 70 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1431 0 0 S 71 * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * * 71 0 * * * * * * 1431 0 0 L 72 * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1431 0 0 L 73 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1431 0 0 H 74 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1431 0 0 L 75 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1431 0 0 T 76 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * 76 0 * * * * * * 1431 0 0 L 77 * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1431 0 0 P 78 * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * 78 0 * * * * * * 1431 0 0 K 79 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1431 0 0 K 80 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1431 0 0 V 81 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 81 0 * * * * * * 1431 0 0 P 82 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1431 0 0 M 83 * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1431 0 0 L 84 * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1431 0 0 T 85 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 85 0 * * * * * * 1431 0 0 W 86 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 86 0 * * * * * * 1431 0 0 P 87 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1431 0 0 S 88 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 88 0 * * * * * * 1431 0 0 L 89 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1431 0 0 L 90 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1000 0 0 V 91 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 91 0 * * * * * * 1000 0 0 E 92 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 92 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //