HHsearch 1.5 NAME c6jhcA_ FAM FILE c6jhcA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6jhcA_.a3m DATE Sat Feb 22 08:26:16 2020 LENG 162 match states, 162 columns in multiple alignment FILT 1 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.3758 -2.8055 SEQ >ss_dssp CCGGGSCCCCCCCHHHHHTTCSEEEEEESSSTTTTCEEEEECCCTTCSSCCCEEEEEETTEEEEEEEEEEGGGEEEEEETTTCCEEEEEEEEEEEEETTE EEEEEEEEETTEEEEEEEEESSTTCCHHHHHHHHHHTTSTTGGGCEESCSSCCCCSSCSSCC >sa_dssp ECADEBDCCEDCEDDDBBEACDACABCABDEDBCBBBBCBDDCCEEBEEDBCCACBCCCEEECCACCDEDEEDABDBCBDEDDEEBDBCBBBCDBDDEDC AAAABACCEDDDACBAAAAADBECEBEDADEBBDDADEBDCAEDBDDACEEDDEEEEDEBDD >ss_pred CCHHHCCHHHCCHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEEEEEEEEEEECCCCCCCCCCEEEEECCCEEEEEEECCCCCCCCCHHHCCCCCCEEEEEEEEEEEECCC CCEEEEEECCCEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCCCEEEC >ss_conf 9853565331034889742896216888751133113799830111355687135412425888730268876420121026883389998632240488 71368863763599998316888877576777777650788654676001797534401109 >Consensus ltcdqlpkaainpiqefidsnplefeyvltetfecttriyvqparwsttkaptaldikgtqimaydfvggpensahlnechtgdkqvwyfqytnlltdng ssycayrcngteiieykcasnnngtdplqhqamevaktvpngdkihyaksncpethgcfafy >c6jhcA_ LTCDQLPKAAINPIQEFIDSNPLEFEYVLTETFECTTRIYVQPARWSTTKAPTALDIKGTQIMAYDFVGGPENSAHLNECHTGDKQVWYFQYTNLLTDNG SSYCAYRCNGTEIIEYKCASNNNGTDPLQHQAMEVAKTVPNGDKIHYAKSNCPETHGCFAFY # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * L 1 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 T 2 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 C 3 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 D 4 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 5 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 L 6 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 P 7 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 K 8 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 A 9 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 A 10 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 I 11 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 N 12 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 P 13 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 I 14 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 15 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 E 16 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 F 17 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 I 18 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 D 19 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 S 20 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 N 21 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 P 22 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 L 23 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 E 24 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 F 25 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 E 26 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 27 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 27 0 * * * * * * 1000 0 0 V 28 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 L 29 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 T 30 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 E 31 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 T 32 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 F 33 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 E 34 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 C 35 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 T 36 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 T 37 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 R 38 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 I 39 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 40 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 40 0 * * * * * * 1000 0 0 V 41 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 42 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 P 43 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 A 44 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 R 45 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 W 46 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 S 47 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 T 48 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 T 49 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 K 50 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 A 51 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 P 52 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 T 53 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 A 54 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 L 55 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 D 56 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 I 57 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 K 58 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 G 59 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 T 60 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 61 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 61 0 * * * * * * 1000 0 0 I 62 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1000 0 0 M 63 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1000 0 0 A 64 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 65 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 65 0 * * * * * * 1000 0 0 D 66 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 F 67 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 V 68 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 G 69 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 G 70 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1000 0 0 P 71 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1000 0 0 E 72 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 N 73 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1000 0 0 S 74 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 74 0 * * * * * * 1000 0 0 A 75 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1000 0 0 H 76 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1000 0 0 L 77 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1000 0 0 N 78 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1000 0 0 E 79 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1000 0 0 C 80 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1000 0 0 H 81 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1000 0 0 T 82 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 82 0 * * * * * * 1000 0 0 G 83 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1000 0 0 D 84 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1000 0 0 K 85 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 86 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 86 0 * * * * * * 1000 0 0 V 87 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 87 0 * * * * * * 1000 0 0 W 88 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 88 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 89 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 89 0 * * * * * * 1000 0 0 F 90 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 91 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 91 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 92 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 92 0 * * * * * * 1000 0 0 T 93 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 93 0 * * * * * * 1000 0 0 N 94 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1000 0 0 L 95 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1000 0 0 L 96 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1000 0 0 T 97 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 97 0 * * * * * * 1000 0 0 D 98 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1000 0 0 N 99 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1000 0 0 G 100 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1000 0 0 S 101 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 101 0 * * * * * * 1000 0 0 S 102 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 102 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 103 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 103 0 * * * * * * 1000 0 0 C 104 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1000 0 0 A 105 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 106 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 106 0 * * * * * * 1000 0 0 R 107 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 107 0 * * * * * * 1000 0 0 C 108 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1000 0 0 N 109 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1000 0 0 G 110 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1000 0 0 T 111 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 111 0 * * * * * * 1000 0 0 E 112 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1000 0 0 I 113 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1000 0 0 I 114 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1000 0 0 E 115 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 116 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 116 0 * * * * * * 1000 0 0 K 117 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1000 0 0 C 118 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1000 0 0 A 119 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1000 0 0 S 120 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 120 0 * * * * * * 1000 0 0 N 121 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1000 0 0 N 122 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1000 0 0 N 123 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 1000 0 0 G 124 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1000 0 0 T 125 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 125 0 * * * * * * 1000 0 0 D 126 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1000 0 0 P 127 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 127 0 * * * * * * 1000 0 0 L 128 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 129 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 129 0 * * * * * * 1000 0 0 H 130 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 131 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 131 0 * * * * * * 1000 0 0 A 132 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 132 0 * * * * * * 1000 0 0 M 133 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 1000 0 0 E 134 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 134 0 * * * * * * 1000 0 0 V 135 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 135 0 * * * * * * 1000 0 0 A 136 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 136 0 * * * * * * 1000 0 0 K 137 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 137 0 * * * * * * 1000 0 0 T 138 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 138 0 * * * * * * 1000 0 0 V 139 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 139 0 * * * * * * 1000 0 0 P 140 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 140 0 * * * * * * 1000 0 0 N 141 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 141 0 * * * * * * 1000 0 0 G 142 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 142 0 * * * * * * 1000 0 0 D 143 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 143 0 * * * * * * 1000 0 0 K 144 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 144 0 * * * * * * 1000 0 0 I 145 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 145 0 * * * * * * 1000 0 0 H 146 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 146 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 147 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 147 0 * * * * * * 1000 0 0 A 148 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 148 0 * * * * * * 1000 0 0 K 149 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 149 0 * * * * * * 1000 0 0 S 150 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 150 0 * * * * * * 1000 0 0 N 151 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 151 0 * * * * * * 1000 0 0 C 152 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 152 0 * * * * * * 1000 0 0 P 153 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 153 0 * * * * * * 1000 0 0 E 154 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 154 0 * * * * * * 1000 0 0 T 155 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 155 0 * * * * * * 1000 0 0 H 156 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 156 0 * * * * * * 1000 0 0 G 157 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 157 0 * * * * * * 1000 0 0 C 158 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 158 0 * * * * * * 1000 0 0 F 159 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 159 0 * * * * * * 1000 0 0 A 160 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 160 0 * * * * * * 1000 0 0 F 161 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 161 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 162 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 162 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //