HHsearch 1.5 NAME c6j8lB_ FAM FILE c6j8lB_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6j8lB_.a3m DATE Sat Feb 9 08:23:06 2019 LENG 132 match states, 132 columns in multiple alignment FILT 1 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.4128 -0.8708 SEQ >ss_dssp CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCSSCCHHHHHHHTTHHHHGGGGGGSTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHTCCHHHH HHHTTGGGGGGGGGGSTTHHHHHHHHHHHHCC >sa_dssp EDEDEDBBEDADDBBEDCDEDECEEEDDDDCDECBEDBBEEBCDDBCECEEBCACDABECACADECDEDAEDBCACDABDDABECBDEDBDEEEBCBEDA CECACADEDEEEADEBDACECBDEBCDEDEEE >ss_pred CCCCCEEHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH HHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCC >ss_conf 9852200342455566642372203578999998642257899998520477857888763534323232478874799999999999852165675688 87642554302488999881589999998449 >Consensus lgyntvqlwrmrrtanklmngklttqkeaalkkwmasqqdkflakwlksssvypdqvysklgltklgasaksspnyqlyekyteallqrwtnfkaspdtv ykslrldklgakapqspsypmyekylqtffrn >c6j8lB_ LGYNTVQLWRMRRTANKLMNGKLTTQKEAALKKWMASQQDKFLAKWLKSSSVYPDQVYSKLGLTKLGASAKSSPNYQLYEKYTEALLQRWTNFKASPDTV YKSLRLDKLGAKAPQSPSYPMYEKYLQTFFRN # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * L 1 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 G 2 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 3 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 3 0 * * * * * * 1000 0 0 N 4 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 T 5 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 V 6 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 7 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 L 8 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 W 9 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 R 10 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 M 11 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 R 12 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 R 13 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 T 14 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 A 15 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 N 16 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 K 17 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 L 18 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 M 19 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 N 20 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 G 21 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 K 22 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 L 23 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 T 24 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 T 25 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 26 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 K 27 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 E 28 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 A 29 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 A 30 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 L 31 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 K 32 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 K 33 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 W 34 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 M 35 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 A 36 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 S 37 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 38 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 39 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 D 40 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 K 41 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 F 42 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 L 43 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 A 44 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 K 45 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 W 46 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 L 47 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 K 48 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 S 49 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 S 50 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 S 51 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 V 52 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 53 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 53 0 * * * * * * 1000 0 0 P 54 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 D 55 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 56 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 V 57 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 58 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 58 0 * * * * * * 1000 0 0 S 59 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 K 60 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 L 61 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1000 0 0 G 62 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1000 0 0 L 63 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1000 0 0 T 64 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 K 65 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1000 0 0 L 66 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 G 67 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 A 68 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 S 69 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 A 70 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1000 0 0 K 71 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1000 0 0 S 72 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 S 73 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 73 0 * * * * * * 1000 0 0 P 74 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1000 0 0 N 75 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 76 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 76 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 77 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 77 0 * * * * * * 1000 0 0 L 78 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 79 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 79 0 * * * * * * 1000 0 0 E 80 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1000 0 0 K 81 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 82 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 82 0 * * * * * * 1000 0 0 T 83 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 83 0 * * * * * * 1000 0 0 E 84 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1000 0 0 A 85 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1000 0 0 L 86 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1000 0 0 L 87 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 88 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 88 0 * * * * * * 1000 0 0 R 89 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 89 0 * * * * * * 1000 0 0 W 90 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 90 0 * * * * * * 1000 0 0 T 91 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 91 0 * * * * * * 1000 0 0 N 92 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1000 0 0 F 93 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1000 0 0 K 94 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1000 0 0 A 95 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1000 0 0 S 96 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 96 0 * * * * * * 1000 0 0 P 97 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1000 0 0 D 98 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1000 0 0 T 99 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 99 0 * * * * * * 1000 0 0 V 100 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 100 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 101 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 101 0 * * * * * * 1000 0 0 K 102 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1000 0 0 S 103 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 103 0 * * * * * * 1000 0 0 L 104 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1000 0 0 R 105 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 105 0 * * * * * * 1000 0 0 L 106 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1000 0 0 D 107 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1000 0 0 K 108 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1000 0 0 L 109 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1000 0 0 G 110 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1000 0 0 A 111 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1000 0 0 K 112 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1000 0 0 A 113 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1000 0 0 P 114 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 115 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 115 0 * * * * * * 1000 0 0 S 116 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 116 0 * * * * * * 1000 0 0 P 117 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1000 0 0 S 118 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 118 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 119 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 119 0 * * * * * * 1000 0 0 P 120 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1000 0 0 M 121 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 122 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 122 0 * * * * * * 1000 0 0 E 123 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 1000 0 0 K 124 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 125 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 125 0 * * * * * * 1000 0 0 L 126 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 127 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 127 0 * * * * * * 1000 0 0 T 128 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 128 0 * * * * * * 1000 0 0 F 129 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 129 0 * * * * * * 1000 0 0 F 130 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 1000 0 0 R 131 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 131 0 * * * * * * 1000 0 0 N 132 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 132 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //