HHsearch 1.5 NAME c6i86B_ FAM FILE c6i86B_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6i86B_.a3m DATE Sat Mar 16 08:34:14 2019 LENG 156 match states, 156 columns in multiple alignment FILT 1 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.4195 -0.2316 SEQ >ss_dssp CCCEEEEEEEEEEESSEEEEEETTSGGGSGGGGGSSCHHHHHHHHHHTTSEEEEECSSCEEEEEEEEEESSSCSSCCTTCSEEEEEEEEESSCEEEEEET TSTTSCEEEEECCSEEEEEEEEECHHHHHHHTTCCCSTTSCTTSCCSEEEEEECCC >sa_dssp ECEDEDECDBCBDBCDBAAAAACDBDADDEEBCEEEDCEDCBDDBCEDDDABBADAEDEBCABACABBCCDDCEEEBEEDEDEDECBADAECADABAABC DDCDECDEBBDBEEDDBCABBBBBDECADDADEBECCEEBCEECDBAABAAABCDE >ss_pred CCHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEECCCCHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCEEEEEC CCCCCCEEEEEECCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCC >ss_conf 9325667654213550599994144547850101430243211121256888989885121467999834883100001458766554105884889714 88743215786188755765532024211122233112265544897078844579 >Consensus gamaeevaeiilpastwilffdascsinspafwstndavdriwrlkiahelvllqvvlegyfkvrcilrssapafemvnadvselvsivlpsgrlvactt deptlnrhvltvppgryrvlrewsvheeskhydvesaeaypadegpdgiitlwper >c6i86B_ GAMAEEVAEIILPASTWILFFDASCSINSPAFWSTNDAVDRIWRLKIAHELVLLQVVLEGYFKVRCILRSSAPAFEMVNADVSELVSIVLPSGRLVACTT DEPTLNRHVLTVPPGRYRVLREWSVHEESKHYDVESAEAYPADEGPDGIITLWPER # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * G 1 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 A 2 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 M 3 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 A 4 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 E 5 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 E 6 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 V 7 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 A 8 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 E 9 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 I 10 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 I 11 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 L 12 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 P 13 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 A 14 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 S 15 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 T 16 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 W 17 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 I 18 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 L 19 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 F 20 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 F 21 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 D 22 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 A 23 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 S 24 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 C 25 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 S 26 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 I 27 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 N 28 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 S 29 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 P 30 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 A 31 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 F 32 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 W 33 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 S 34 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 T 35 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 N 36 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 D 37 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 A 38 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 V 39 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 D 40 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 R 41 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 I 42 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 W 43 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 R 44 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 L 45 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 K 46 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 I 47 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 A 48 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 H 49 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 E 50 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 L 51 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 V 52 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 L 53 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 L 54 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 55 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 V 56 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 V 57 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 L 58 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 E 59 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 G 60 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 61 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 61 0 * * * * * * 1000 0 0 F 62 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1000 0 0 K 63 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1000 0 0 V 64 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 R 65 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 65 0 * * * * * * 1000 0 0 C 66 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 I 67 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 L 68 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 R 69 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 S 70 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 70 0 * * * * * * 1000 0 0 S 71 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 71 0 * * * * * * 1000 0 0 A 72 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 P 73 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1000 0 0 A 74 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1000 0 0 F 75 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1000 0 0 E 76 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1000 0 0 M 77 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1000 0 0 V 78 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 78 0 * * * * * * 1000 0 0 N 79 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1000 0 0 A 80 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1000 0 0 D 81 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1000 0 0 V 82 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 82 0 * * * * * * 1000 0 0 S 83 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 83 0 * * * * * * 1000 0 0 E 84 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1000 0 0 L 85 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1000 0 0 V 86 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 86 0 * * * * * * 1000 0 0 S 87 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 87 0 * * * * * * 1000 0 0 I 88 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1000 0 0 V 89 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 89 0 * * * * * * 1000 0 0 L 90 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1000 0 0 P 91 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1000 0 0 S 92 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 92 0 * * * * * * 1000 0 0 G 93 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1000 0 0 R 94 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 94 0 * * * * * * 1000 0 0 L 95 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1000 0 0 V 96 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 96 0 * * * * * * 1000 0 0 A 97 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1000 0 0 C 98 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1000 0 0 T 99 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 99 0 * * * * * * 1000 0 0 T 100 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 100 0 * * * * * * 1000 0 0 D 101 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1000 0 0 E 102 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1000 0 0 P 103 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1000 0 0 T 104 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 104 0 * * * * * * 1000 0 0 L 105 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1000 0 0 N 106 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1000 0 0 R 107 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 107 0 * * * * * * 1000 0 0 H 108 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1000 0 0 V 109 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 109 0 * * * * * * 1000 0 0 L 110 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1000 0 0 T 111 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 111 0 * * * * * * 1000 0 0 V 112 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 112 0 * * * * * * 1000 0 0 P 113 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1000 0 0 P 114 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1000 0 0 G 115 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1000 0 0 R 116 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 116 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 117 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 117 0 * * * * * * 1000 0 0 R 118 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 118 0 * * * * * * 1000 0 0 V 119 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 119 0 * * * * * * 1000 0 0 L 120 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1000 0 0 R 121 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 121 0 * * * * * * 1000 0 0 E 122 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1000 0 0 W 123 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 123 0 * * * * * * 1000 0 0 S 124 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 124 0 * * * * * * 1000 0 0 V 125 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 125 0 * * * * * * 1000 0 0 H 126 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1000 0 0 E 127 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 127 0 * * * * * * 1000 0 0 E 128 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1000 0 0 S 129 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 129 0 * * * * * * 1000 0 0 K 130 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 1000 0 0 H 131 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 131 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 132 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 132 0 * * * * * * 1000 0 0 D 133 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 1000 0 0 V 134 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 134 0 * * * * * * 1000 0 0 E 135 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 1000 0 0 S 136 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 136 0 * * * * * * 1000 0 0 A 137 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 137 0 * * * * * * 1000 0 0 E 138 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 138 0 * * * * * * 1000 0 0 A 139 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 139 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 140 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 140 0 * * * * * * 1000 0 0 P 141 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 141 0 * * * * * * 1000 0 0 A 142 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 142 0 * * * * * * 1000 0 0 D 143 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 143 0 * * * * * * 1000 0 0 E 144 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 144 0 * * * * * * 1000 0 0 G 145 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 145 0 * * * * * * 1000 0 0 P 146 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 146 0 * * * * * * 1000 0 0 D 147 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 147 0 * * * * * * 1000 0 0 G 148 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 148 0 * * * * * * 1000 0 0 I 149 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 149 0 * * * * * * 1000 0 0 I 150 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 150 0 * * * * * * 1000 0 0 T 151 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 151 0 * * * * * * 1000 0 0 L 152 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 152 0 * * * * * * 1000 0 0 W 153 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 153 0 * * * * * * 1000 0 0 P 154 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 154 0 * * * * * * 1000 0 0 E 155 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 155 0 * * * * * * 1000 0 0 R 156 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 156 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //